Binary compatibility report for the CDK library between 1.0.1 and 1.0.2 versions

Test Info

Library NameCDK
Version #11.0.1
Version #21.0.2

Test Results

Total Java ARchives1
Total Methods / Classes42539 / 4227
VerdictIncompatible
(23.2%)

Problem Summary

SeverityCount
Added Methods-44
Removed MethodsHigh9863
Problems with
Data Types		High820
Medium0
Low0
Problems with
Methods		High0
Medium0
Low0

Added Methods (44)

cdk-1.0.2.jar, AtomContainerComparator.class
package org.openscience.cdk.tools.manipulator
AtomContainerComparator.AtomContainerComparator ( )
AtomContainerComparator.compare ( Object o1, Object o2 )  :  int

cdk-1.0.2.jar, AtomContainerManipulator.class
package org.openscience.cdk.tools.manipulator
AtomContainerManipulator.countExplicitHydrogens ( IAtomContainer atomContainer, IAtom atom ) [static]  :  int
AtomContainerManipulator.countHydrogens ( IAtomContainer atomContainer, IAtom atom ) [static]  :  int

cdk-1.0.2.jar, AtomContainerSetManipulator.class
package org.openscience.cdk.tools.manipulator
AtomContainerSetManipulator.sort ( IAtomContainerSet atomContainerSet ) [static]  :  void

cdk-1.0.2.jar, ChiralityAtom.class
package org.openscience.cdk.isomorphism.matchers.smarts
ChiralityAtom.ChiralityAtom ( )
ChiralityAtom.getDegree ( )  :  int
ChiralityAtom.isClockwise ( )  :  boolean
ChiralityAtom.isUnspecified ( )  :  boolean
ChiralityAtom.matches ( IAtom atom )  :  boolean
ChiralityAtom.setClockwise ( boolean clockwise )  :  void
ChiralityAtom.setDegree ( int degree )  :  void
ChiralityAtom.setUnspecified ( boolean unspecified )  :  void

cdk-1.0.2.jar, GenerateFragments.class
package org.openscience.cdk.tools
GenerateFragments.isSmilesToUpperCase ( )  :  boolean
GenerateFragments.setSmilesToUpperCase ( boolean smilesToUpperCase )  :  void

cdk-1.0.2.jar, HydrogenAtom.class
package org.openscience.cdk.isomorphism.matchers.smarts
HydrogenAtom.getAtomContainer ( )  :  IAtomContainer
HydrogenAtom.HydrogenAtom ( )
HydrogenAtom.matches ( IAtom atom )  :  boolean
HydrogenAtom.setAtomContainer ( IAtomContainer atomContainer )  :  void

cdk-1.0.2.jar, MDLRXNV2000Reader.class
package org.openscience.cdk.io
MDLRXNV2000Reader.accepts ( Class classObject )  :  boolean
MDLRXNV2000Reader.accepts ( IChemObject object )  :  boolean
MDLRXNV2000Reader.close ( )  :  void
MDLRXNV2000Reader.getFormat ( )  :  IResourceFormat
MDLRXNV2000Reader.MDLRXNV2000Reader ( )
MDLRXNV2000Reader.MDLRXNV2000Reader ( InputStream input )
MDLRXNV2000Reader.MDLRXNV2000Reader ( Reader in )
MDLRXNV2000Reader.read ( IChemObject object )  :  IChemObject
MDLRXNV2000Reader.setReader ( InputStream input )  :  void
MDLRXNV2000Reader.setReader ( Reader input )  :  void

cdk-1.0.2.jar, MorganNumbersTools.class
package org.openscience.cdk.graph.invariant
MorganNumbersTools.getLongMorganNumbers ( IAtomContainer atomContainer ) [static]  :  long[ ]

cdk-1.0.2.jar, QueryAtomContainerCreator.class
package org.openscience.cdk.isomorphism.matchers
QueryAtomContainerCreator.createAnyAtomForPseudoAtomQueryContainer ( IAtomContainer container ) [static]  :  QueryAtomContainer

cdk-1.0.2.jar, RecursiveSmartsAtom.class
package org.openscience.cdk.isomorphism.matchers.smarts
RecursiveSmartsAtom.getAtomContainer ( )  :  IAtomContainer
RecursiveSmartsAtom.getRecursiveQuery ( )  :  IQueryAtomContainer
RecursiveSmartsAtom.matches ( IAtom atom )  :  boolean
RecursiveSmartsAtom.RecursiveSmartsAtom ( IQueryAtomContainer query )
RecursiveSmartsAtom.setAtomContainer ( IAtomContainer atomContainer )  :  void
RecursiveSmartsAtom.setRecursiveQuery ( IQueryAtomContainer query )  :  void

cdk-1.0.2.jar, SmilesGenerator.class
package org.openscience.cdk.smiles
SmilesGenerator.setUseAromaticityFlag ( boolean useAromaticityFlag )  :  void

cdk-1.0.2.jar, StructureDiagramGenerator.class
package org.openscience.cdk.layout
StructureDiagramGenerator.getOtherBondAtom ( IAtom atom, IBond bond )  :  IAtom

cdk-1.0.2.jar, TemplateHandler.class
package org.openscience.cdk.layout
TemplateHandler.addMolecule ( IAtomContainer molecule )  :  void
TemplateHandler.getMappedSubstructures ( IAtomContainer molecule )  :  IAtomContainerSet
TemplateHandler.mapTemplateExact ( IAtomContainer molecule )  :  boolean
TemplateHandler.mapTemplates ( IAtomContainer molecule )  :  boolean
TemplateHandler.removeMolecule ( IAtomContainer molecule )  :  IMolecule

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Removed Methods (9863)

cdk-1.0.1.jar, AbstractDataSink.class
package weka.gui.beans
AbstractDataSink.AbstractDataSink ( )
AbstractDataSink.acceptDataSet ( DataSetEvent p1 ) [abstract]  :  void
AbstractDataSink.acceptInstance ( InstanceEvent p1 ) [abstract]  :  void
AbstractDataSink.acceptTestSet ( TestSetEvent p1 ) [abstract]  :  void
AbstractDataSink.acceptTrainingSet ( TrainingSetEvent p1 ) [abstract]  :  void
AbstractDataSink.connectionAllowed ( EventSetDescriptor p1 )  :  boolean
AbstractDataSink.connectionAllowed ( String p1 )  :  boolean
AbstractDataSink.connectionNotification ( String p1, Object p2 )  :  void
AbstractDataSink.disconnectionNotification ( String p1, Object p2 )  :  void
AbstractDataSink.getVisual ( )  :  BeanVisual
AbstractDataSink.setLog ( Logger p1 )  :  void
AbstractDataSink.setVisual ( BeanVisual p1 )  :  void
AbstractDataSink.stop ( ) [abstract]  :  void
AbstractDataSink.useDefaultVisual ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, AbstractDataSinkBeanInfo.class
package weka.gui.beans
AbstractDataSinkBeanInfo.AbstractDataSinkBeanInfo ( )
AbstractDataSinkBeanInfo.getEventSetDescriptors ( )  :  EventSetDescriptor[ ]

cdk-1.0.1.jar, AbstractDataSource.class
package weka.gui.beans
AbstractDataSource.AbstractDataSource ( )
AbstractDataSource.addDataSourceListener ( DataSourceListener p1 )  :  void
AbstractDataSource.addInstanceListener ( InstanceListener p1 )  :  void
AbstractDataSource.addPropertyChangeListener ( String p1, PropertyChangeListener p2 )  :  void
AbstractDataSource.addVetoableChangeListener ( String p1, VetoableChangeListener p2 )  :  void
AbstractDataSource.getBeanContext ( )  :  BeanContext
AbstractDataSource.getVisual ( )  :  BeanVisual
AbstractDataSource.removeDataSourceListener ( DataSourceListener p1 )  :  void
AbstractDataSource.removeInstanceListener ( InstanceListener p1 )  :  void
AbstractDataSource.removePropertyChangeListener ( String p1, PropertyChangeListener p2 )  :  void
AbstractDataSource.removeVetoableChangeListener ( String p1, VetoableChangeListener p2 )  :  void
AbstractDataSource.setBeanContext ( BeanContext p1 )  :  void
AbstractDataSource.setVisual ( BeanVisual p1 )  :  void
AbstractDataSource.useDefaultVisual ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, AbstractDataSourceBeanInfo.class
package weka.gui.beans
AbstractDataSourceBeanInfo.AbstractDataSourceBeanInfo ( )
AbstractDataSourceBeanInfo.getEventSetDescriptors ( )  :  EventSetDescriptor[ ]

cdk-1.0.1.jar, AbstractEvaluator.class
package weka.gui.beans
AbstractEvaluator.AbstractEvaluator ( )
AbstractEvaluator.connectionAllowed ( EventSetDescriptor p1 )  :  boolean
AbstractEvaluator.connectionAllowed ( String p1 )  :  boolean
AbstractEvaluator.connectionNotification ( String p1, Object p2 )  :  void
AbstractEvaluator.disconnectionNotification ( String p1, Object p2 )  :  void
AbstractEvaluator.getVisual ( )  :  BeanVisual
AbstractEvaluator.setLog ( Logger p1 )  :  void
AbstractEvaluator.setVisual ( BeanVisual p1 )  :  void
AbstractEvaluator.stop ( ) [abstract]  :  void
AbstractEvaluator.useDefaultVisual ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, AbstractFileSaver.class
package weka.core.converters
AbstractFileSaver.AbstractFileSaver ( )
AbstractFileSaver.cancel ( )  :  void
AbstractFileSaver.filePrefix ( )  :  String
AbstractFileSaver.getFileDescription ( ) [abstract]  :  String
AbstractFileSaver.getFileExtension ( )  :  String
AbstractFileSaver.getOptions ( )  :  String[ ]
AbstractFileSaver.getWriter ( )  :  BufferedWriter
AbstractFileSaver.listOptions ( )  :  Enumeration
AbstractFileSaver.resetOptions ( )  :  void
AbstractFileSaver.resetWriter ( )  :  void
AbstractFileSaver.retrieveDir ( )  :  String
AbstractFileSaver.retrieveFile ( )  :  File
AbstractFileSaver.setDestination ( File p1 )  :  void
AbstractFileSaver.setDestination ( OutputStream p1 )  :  void
AbstractFileSaver.setDir ( String p1 )  :  void
AbstractFileSaver.setDirAndPrefix ( String p1, String p2 )  :  void
AbstractFileSaver.setFile ( File p1 )  :  void
AbstractFileSaver.setFileExtension ( String p1 )  :  void
AbstractFileSaver.setFilePrefix ( String p1 )  :  void
AbstractFileSaver.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, AbstractLoader.class
package weka.core.converters
AbstractLoader.AbstractLoader ( )
AbstractLoader.getDataSet ( ) [abstract]  :  Instances
AbstractLoader.getNextInstance ( ) [abstract]  :  Instance
AbstractLoader.getRetrieval ( )  :  int
AbstractLoader.getStructure ( ) [abstract]  :  Instances
AbstractLoader.reset ( )  :  void
AbstractLoader.setRetrieval ( int p1 )  :  void
AbstractLoader.setSource ( File p1 )  :  void
AbstractLoader.setSource ( InputStream p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, AbstractSaver.class
package weka.core.converters
AbstractSaver.AbstractSaver ( )
AbstractSaver.cancel ( )  :  void
AbstractSaver.filePrefix ( )  :  String
AbstractSaver.getFileExtension ( )  :  String
AbstractSaver.getInstances ( )  :  Instances
AbstractSaver.getRetrieval ( )  :  int
AbstractSaver.getWriteMode ( )  :  int
AbstractSaver.resetOptions ( )  :  void
AbstractSaver.resetStructure ( )  :  void
AbstractSaver.retrieveDir ( )  :  String
AbstractSaver.setDestination ( File p1 )  :  void
AbstractSaver.setDestination ( OutputStream p1 )  :  void
AbstractSaver.setDir ( String p1 )  :  void
AbstractSaver.setDirAndPrefix ( String p1, String p2 )  :  void
AbstractSaver.setFile ( File p1 )  :  void
AbstractSaver.setFilePrefix ( String p1 )  :  void
AbstractSaver.setInstances ( Instances p1 )  :  void
AbstractSaver.setRetrieval ( int p1 )  :  void
AbstractSaver.setStructure ( Instances p1 )  :  int
AbstractSaver.setWriteMode ( int p1 )  :  void
AbstractSaver.writeBatch ( ) [abstract]  :  void
AbstractSaver.writeIncremental ( Instance p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, AbstractTestSetProducer.class
package weka.gui.beans
AbstractTestSetProducer.AbstractTestSetProducer ( )
AbstractTestSetProducer.addTestSetListener ( TestSetListener p1 )  :  void
AbstractTestSetProducer.connectionAllowed ( EventSetDescriptor p1 )  :  boolean
AbstractTestSetProducer.connectionAllowed ( String p1 )  :  boolean
AbstractTestSetProducer.connectionNotification ( String p1, Object p2 )  :  void
AbstractTestSetProducer.disconnectionNotification ( String p1, Object p2 )  :  void
AbstractTestSetProducer.getVisual ( )  :  BeanVisual
AbstractTestSetProducer.removeTestSetListener ( TestSetListener p1 )  :  void
AbstractTestSetProducer.setLog ( Logger p1 )  :  void
AbstractTestSetProducer.setVisual ( BeanVisual p1 )  :  void
AbstractTestSetProducer.stop ( ) [abstract]  :  void
AbstractTestSetProducer.useDefaultVisual ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, AbstractTestSetProducerBeanInfo.class
package weka.gui.beans
AbstractTestSetProducerBeanInfo.AbstractTestSetProducerBeanInfo ( )
AbstractTestSetProducerBeanInfo.getEventSetDescriptors ( )  :  EventSetDescriptor[ ]

cdk-1.0.1.jar, AbstractTimeSeries.class
package weka.filters.unsupervised.attribute
AbstractTimeSeries.AbstractTimeSeries ( )
AbstractTimeSeries.attributeIndicesTipText ( )  :  String
AbstractTimeSeries.batchFinished ( )  :  boolean
AbstractTimeSeries.fillWithMissingTipText ( )  :  String
AbstractTimeSeries.getAttributeIndices ( )  :  String
AbstractTimeSeries.getFillWithMissing ( )  :  boolean
AbstractTimeSeries.getInstanceRange ( )  :  int
AbstractTimeSeries.getInvertSelection ( )  :  boolean
AbstractTimeSeries.getOptions ( )  :  String[ ]
AbstractTimeSeries.historyInput ( Instance p1 )  :  Instance
AbstractTimeSeries.input ( Instance p1 )  :  boolean
AbstractTimeSeries.instanceRangeTipText ( )  :  String
AbstractTimeSeries.invertSelectionTipText ( )  :  String
AbstractTimeSeries.listOptions ( )  :  Enumeration
AbstractTimeSeries.mergeInstances ( Instance p1, Instance p2 ) [abstract]  :  Instance
AbstractTimeSeries.resetHistory ( )  :  void
AbstractTimeSeries.setAttributeIndices ( String p1 )  :  void
AbstractTimeSeries.setAttributeIndicesArray ( int[ ] p1 )  :  void
AbstractTimeSeries.setFillWithMissing ( boolean p1 )  :  void
AbstractTimeSeries.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
AbstractTimeSeries.setInstanceRange ( int p1 )  :  void
AbstractTimeSeries.setInvertSelection ( boolean p1 )  :  void
AbstractTimeSeries.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, AbstractTrainAndTestSetProducer.class
package weka.gui.beans
AbstractTrainAndTestSetProducer.AbstractTrainAndTestSetProducer ( )
AbstractTrainAndTestSetProducer.acceptDataSet ( DataSetEvent p1 ) [abstract]  :  void
AbstractTrainAndTestSetProducer.addTestSetListener ( TestSetListener p1 )  :  void
AbstractTrainAndTestSetProducer.addTrainingSetListener ( TrainingSetListener p1 )  :  void
AbstractTrainAndTestSetProducer.connectionAllowed ( EventSetDescriptor p1 )  :  boolean
AbstractTrainAndTestSetProducer.connectionAllowed ( String p1 )  :  boolean
AbstractTrainAndTestSetProducer.connectionNotification ( String p1, Object p2 )  :  void
AbstractTrainAndTestSetProducer.disconnectionNotification ( String p1, Object p2 )  :  void
AbstractTrainAndTestSetProducer.getVisual ( )  :  BeanVisual
AbstractTrainAndTestSetProducer.removeTestSetListener ( TestSetListener p1 )  :  void
AbstractTrainAndTestSetProducer.removeTrainingSetListener ( TrainingSetListener p1 )  :  void
AbstractTrainAndTestSetProducer.setLog ( Logger p1 )  :  void
AbstractTrainAndTestSetProducer.setVisual ( BeanVisual p1 )  :  void
AbstractTrainAndTestSetProducer.stop ( ) [abstract]  :  void
AbstractTrainAndTestSetProducer.useDefaultVisual ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, AbstractTrainAndTestSetProducerBeanInfo.class
package weka.gui.beans
AbstractTrainAndTestSetProducerBeanInfo.AbstractTrainAndTestSetProducerBeanInfo ( )
AbstractTrainAndTestSetProducerBeanInfo.getEventSetDescriptors ( )  :  EventSetDescriptor[ ]

cdk-1.0.1.jar, AbstractTrainingSetProducer.class
package weka.gui.beans
AbstractTrainingSetProducer.AbstractTrainingSetProducer ( )
AbstractTrainingSetProducer.addTrainingSetListener ( TrainingSetListener p1 )  :  void
AbstractTrainingSetProducer.connectionAllowed ( EventSetDescriptor p1 )  :  boolean
AbstractTrainingSetProducer.connectionAllowed ( String p1 )  :  boolean
AbstractTrainingSetProducer.connectionNotification ( String p1, Object p2 )  :  void
AbstractTrainingSetProducer.disconnectionNotification ( String p1, Object p2 )  :  void
AbstractTrainingSetProducer.getVisual ( )  :  BeanVisual
AbstractTrainingSetProducer.removeTrainingSetListener ( TrainingSetListener p1 )  :  void
AbstractTrainingSetProducer.setLog ( Logger p1 )  :  void
AbstractTrainingSetProducer.setVisual ( BeanVisual p1 )  :  void
AbstractTrainingSetProducer.stop ( ) [abstract]  :  void
AbstractTrainingSetProducer.useDefaultVisual ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, AbstractTrainingSetProducerBeanInfo.class
package weka.gui.beans
AbstractTrainingSetProducerBeanInfo.AbstractTrainingSetProducerBeanInfo ( )
AbstractTrainingSetProducerBeanInfo.getEventSetDescriptors ( )  :  EventSetDescriptor[ ]

cdk-1.0.1.jar, AdaBoostM1.class
package weka.classifiers.meta
AdaBoostM1.AdaBoostM1 ( )
AdaBoostM1.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
AdaBoostM1.buildClassifierUsingResampling ( Instances p1 )  :  void
AdaBoostM1.buildClassifierWithWeights ( Instances p1 )  :  void
AdaBoostM1.defaultClassifierString ( )  :  String
AdaBoostM1.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
AdaBoostM1.getOptions ( )  :  String[ ]
AdaBoostM1.getUseResampling ( )  :  boolean
AdaBoostM1.getWeightThreshold ( )  :  int
AdaBoostM1.globalInfo ( )  :  String
AdaBoostM1.listOptions ( )  :  Enumeration
AdaBoostM1.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
AdaBoostM1.selectWeightQuantile ( Instances p1, double p2 )  :  Instances
AdaBoostM1.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
AdaBoostM1.setUseResampling ( boolean p1 )  :  void
AdaBoostM1.setWeights ( Instances p1, double p2 )  :  void
AdaBoostM1.setWeightThreshold ( int p1 )  :  void
AdaBoostM1.toSource ( String p1 )  :  String
AdaBoostM1.toString ( )  :  String
AdaBoostM1.useResamplingTipText ( )  :  String
AdaBoostM1.weightThresholdTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, Add.class
package weka.filters.unsupervised.attribute
Add.Add ( )
Add.attributeIndexTipText ( )  :  String
Add.attributeNameTipText ( )  :  String
Add.getAttributeIndex ( )  :  String
Add.getAttributeName ( )  :  String
Add.getNominalLabels ( )  :  String
Add.getOptions ( )  :  String[ ]
Add.globalInfo ( )  :  String
Add.input ( Instance p1 )  :  boolean
Add.listOptions ( )  :  Enumeration
Add.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Add.nominalLabelsTipText ( )  :  String
Add.setAttributeIndex ( String p1 )  :  void
Add.setAttributeName ( String p1 )  :  void
Add.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
Add.setNominalLabels ( String p1 )  :  void
Add.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, AddCluster.class
package weka.filters.unsupervised.attribute
AddCluster.AddCluster ( )
AddCluster.batchFinished ( )  :  boolean
AddCluster.clustererTipText ( )  :  String
AddCluster.convertInstance ( Instance p1 )  :  void
AddCluster.getClusterer ( )  :  Clusterer
AddCluster.getClustererSpec ( )  :  String
AddCluster.getIgnoredAttributeIndices ( )  :  String
AddCluster.getOptions ( )  :  String[ ]
AddCluster.globalInfo ( )  :  String
AddCluster.ignoredAttributeIndicesTipText ( )  :  String
AddCluster.input ( Instance p1 )  :  boolean
AddCluster.listOptions ( )  :  Enumeration
AddCluster.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
AddCluster.setClusterer ( Clusterer p1 )  :  void
AddCluster.setIgnoredAttributeIndices ( String p1 )  :  void
AddCluster.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
AddCluster.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, AddExpression.class
package weka.filters.unsupervised.attribute
AddExpression.AddExpression ( )
AddExpression.debugTipText ( )  :  String
AddExpression.expressionTipText ( )  :  String
AddExpression.getDebug ( )  :  boolean
AddExpression.getExpression ( )  :  String
AddExpression.getName ( )  :  String
AddExpression.getOptions ( )  :  String[ ]
AddExpression.globalInfo ( )  :  String
AddExpression.input ( Instance p1 )  :  boolean
AddExpression.listOptions ( )  :  Enumeration
AddExpression.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
AddExpression.nameTipText ( )  :  String
AddExpression.setDebug ( boolean p1 )  :  void
AddExpression.setExpression ( String p1 )  :  void
AddExpression.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
AddExpression.setName ( String p1 )  :  void
AddExpression.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, AdditionalMeasureProducer.class
package weka.core
AdditionalMeasureProducer.enumerateMeasures ( ) [abstract]  :  Enumeration
AdditionalMeasureProducer.getMeasure ( String p1 ) [abstract]  :  double

cdk-1.0.1.jar, AdditiveRegression.class
package weka.classifiers.meta
AdditiveRegression.AdditiveRegression ( )
AdditiveRegression.AdditiveRegression ( Classifier p1 )
AdditiveRegression.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
AdditiveRegression.classifyInstance ( Instance p1 )  :  double
AdditiveRegression.defaultClassifierString ( )  :  String
AdditiveRegression.enumerateMeasures ( )  :  Enumeration
AdditiveRegression.getMeasure ( String p1 )  :  double
AdditiveRegression.getOptions ( )  :  String[ ]
AdditiveRegression.getShrinkage ( )  :  double
AdditiveRegression.globalInfo ( )  :  String
AdditiveRegression.listOptions ( )  :  Enumeration
AdditiveRegression.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
AdditiveRegression.measureNumIterations ( )  :  double
AdditiveRegression.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
AdditiveRegression.setShrinkage ( double p1 )  :  void
AdditiveRegression.shrinkageTipText ( )  :  String
AdditiveRegression.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, AddNoise.class
package weka.filters.unsupervised.attribute
AddNoise.AddNoise ( )
AddNoise.addNoise ( Instances p1, int p2, int p3, int p4, boolean p5 )  :  void
AddNoise.attIndexSetTipText ( )  :  String
AddNoise.batchFinished ( )  :  boolean
AddNoise.getAttributeIndex ( )  :  String
AddNoise.getOptions ( )  :  String[ ]
AddNoise.getPercent ( )  :  int
AddNoise.getRandomSeed ( )  :  int
AddNoise.getUseMissing ( )  :  boolean
AddNoise.globalInfo ( )  :  String
AddNoise.input ( Instance p1 )  :  boolean
AddNoise.listOptions ( )  :  Enumeration
AddNoise.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
AddNoise.percentTipText ( )  :  String
AddNoise.randomSeedTipText ( )  :  String
AddNoise.setAttributeIndex ( String p1 )  :  void
AddNoise.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
AddNoise.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
AddNoise.setPercent ( int p1 )  :  void
AddNoise.setRandomSeed ( int p1 )  :  void
AddNoise.setUseMissing ( boolean p1 )  :  void
AddNoise.useMissingTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, ADNode.class
package weka.classifiers.bayes.net
ADNode.ADNode ( )
ADNode.getCounts ( int[ ] p1, int[ ] p2, int[ ] p3, int p4, int p5, boolean p6 )  :  void
ADNode.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
ADNode.makeADTree ( Instances p1 ) [static]  :  ADNode
ADNode.makeADTree ( int p1, FastVector p2, Instances p3 ) [static]  :  ADNode
ADNode.makeVaryNode ( int p1, FastVector p2, Instances p3 ) [static]  :  VaryNode
ADNode.print ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ADTree.class
package weka.classifiers.trees
ADTree.ADTree ( )
ADTree.boost ( )  :  void
ADTree.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
ADTree.clone ( )  :  Object
ADTree.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
ADTree.done ( )  :  void
ADTree.enumerateMeasures ( )  :  Enumeration
ADTree.getMeasure ( String p1 )  :  double
ADTree.getNumOfBoostingIterations ( )  :  int
ADTree.getOptions ( )  :  String[ ]
ADTree.getRandom ( int p1 )  :  int
ADTree.getRandomSeed ( )  :  int
ADTree.getSaveInstanceData ( )  :  boolean
ADTree.getSearchPath ( )  :  SelectedTag
ADTree.globalInfo ( )  :  String
ADTree.graph ( )  :  String
ADTree.graphTraverse ( PredictionNode p1, StringBuffer p2, int p3, int p4, Instances p5 )  :  void
ADTree.graphType ( )  :  int
ADTree.initClassifier ( Instances p1 )  :  void
ADTree.legend ( )  :  String
ADTree.listOptions ( )  :  Enumeration
ADTree.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
ADTree.measureExamplesProcessed ( )  :  double
ADTree.measureNodesExpanded ( )  :  double
ADTree.measureNumLeaves ( )  :  double
ADTree.measureNumPredictionLeaves ( )  :  double
ADTree.measureTreeSize ( )  :  double
ADTree.merge ( ADTree p1 )  :  void
ADTree.next ( int p1 )  :  void
ADTree.nextSplitAddedOrder ( )  :  int
ADTree.numOfAllNodes ( PredictionNode p1 )  :  int
ADTree.numOfBoostingIterationsTipText ( )  :  String
ADTree.numOfPredictionLeafNodes ( PredictionNode p1 )  :  int
ADTree.numOfPredictionNodes ( PredictionNode p1 )  :  int
ADTree.predictionValueForInstance ( Instance p1, PredictionNode p2, double p3 )  :  double
ADTree.randomSeedTipText ( )  :  String
ADTree.saveInstanceDataTipText ( )  :  String
ADTree.searchPathTipText ( )  :  String
ADTree.setNumOfBoostingIterations ( int p1 )  :  void
ADTree.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
ADTree.setRandomSeed ( int p1 )  :  void
ADTree.setSaveInstanceData ( boolean p1 )  :  void
ADTree.setSearchPath ( SelectedTag p1 )  :  void
ADTree.toString ( )  :  String
ADTree.toString ( PredictionNode p1, int p2 )  :  String

cdk-1.0.1.jar, AlgorithmListPanel.class
package weka.gui.experiment
AlgorithmListPanel.actionPerformed ( ActionEvent p1 )  :  void
AlgorithmListPanel.AlgorithmListPanel ( )
AlgorithmListPanel.AlgorithmListPanel ( Experiment p1 )
AlgorithmListPanel.copyObject ( Object p1 )  :  Object
AlgorithmListPanel.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
AlgorithmListPanel.setExperiment ( Experiment p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, AliphaticSymbolAtom.class
package org.openscience.cdk.isomorphism.matchers.smarts
AliphaticSymbolAtom.AliphaticSymbolAtom ( )
AliphaticSymbolAtom.matches ( IAtom atom )  :  boolean

cdk-1.0.1.jar, AllFilter.class
package weka.filters
AllFilter.AllFilter ( )
AllFilter.globalInfo ( )  :  String
AllFilter.input ( Instance p1 )  :  boolean
AllFilter.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
AllFilter.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean

cdk-1.0.1.jar, AODE.class
package weka.classifiers.bayes
AODE.AODE ( )
AODE.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
AODE.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
AODE.getOptions ( )  :  String[ ]
AODE.globalInfo ( )  :  String
AODE.listOptions ( )  :  Enumeration
AODE.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
AODE.NBconditionalProb ( Instance p1, int p2 )  :  double
AODE.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
AODE.toString ( )  :  String
AODE.updateClassifier ( Instance p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, Apriori.class
package weka.associations
Apriori.Apriori ( )
Apriori.buildAssociations ( Instances p1 )  :  void
Apriori.deltaTipText ( )  :  String
Apriori.getDelta ( )  :  double
Apriori.getLowerBoundMinSupport ( )  :  double
Apriori.getMetricType ( )  :  SelectedTag
Apriori.getMinMetric ( )  :  double
Apriori.getNumRules ( )  :  int
Apriori.getOptions ( )  :  String[ ]
Apriori.getRemoveAllMissingCols ( )  :  boolean
Apriori.getSignificanceLevel ( )  :  double
Apriori.getUpperBoundMinSupport ( )  :  double
Apriori.globalInfo ( )  :  String
Apriori.listOptions ( )  :  Enumeration
Apriori.lowerBoundMinSupportTipText ( )  :  String
Apriori.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Apriori.metricTypeTipText ( )  :  String
Apriori.minMetricTipText ( )  :  String
Apriori.numRulesTipText ( )  :  String
Apriori.removeAllMissingColsTipText ( )  :  String
Apriori.removeMissingColumns ( Instances p1 )  :  Instances
Apriori.resetOptions ( )  :  void
Apriori.setDelta ( double p1 )  :  void
Apriori.setLowerBoundMinSupport ( double p1 )  :  void
Apriori.setMetricType ( SelectedTag p1 )  :  void
Apriori.setMinMetric ( double p1 )  :  void
Apriori.setNumRules ( int p1 )  :  void
Apriori.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
Apriori.setRemoveAllMissingCols ( boolean p1 )  :  void
Apriori.setSignificanceLevel ( double p1 )  :  void
Apriori.setUpperBoundMinSupport ( double p1 )  :  void
Apriori.significanceLevelTipText ( )  :  String
Apriori.toString ( )  :  String
Apriori.upperBoundMinSupportTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, AprioriItemSet.class
package weka.associations
AprioriItemSet.AprioriItemSet ( int p1 )
AprioriItemSet.confidenceForRule ( AprioriItemSet p1, AprioriItemSet p2 ) [static]  :  double
AprioriItemSet.convictionForRule ( AprioriItemSet p1, AprioriItemSet p2, int p3, int p4 )  :  double
AprioriItemSet.generateRules ( double p1, FastVector p2, int p3 )  :  FastVector[ ]
AprioriItemSet.generateRulesBruteForce ( double p1, int p2, FastVector p3, int p4, int p5, double p6 )  :  FastVector[ ]
AprioriItemSet.leverageForRule ( AprioriItemSet p1, AprioriItemSet p2, int p3, int p4 )  :  double
AprioriItemSet.liftForRule ( AprioriItemSet p1, AprioriItemSet p2, int p3 )  :  double
AprioriItemSet.mergeAllItemSets ( FastVector p1, int p2, int p3 ) [static]  :  FastVector
AprioriItemSet.singletons ( Instances p1 ) [static]  :  FastVector
AprioriItemSet.subtract ( AprioriItemSet p1 )  :  AprioriItemSet
AprioriItemSet.toString ( Instances p1 )  :  String

cdk-1.0.1.jar, ArffLoader.class
package weka.core.converters
ArffLoader.ArffLoader ( )
ArffLoader.getDataSet ( )  :  Instances
ArffLoader.getFileDescription ( )  :  String
ArffLoader.getFileExtension ( )  :  String
ArffLoader.getNextInstance ( )  :  Instance
ArffLoader.getStructure ( )  :  Instances
ArffLoader.globalInfo ( )  :  String
ArffLoader.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
ArffLoader.reset ( )  :  void
ArffLoader.retrieveFile ( )  :  File
ArffLoader.setFile ( File p1 )  :  void
ArffLoader.setSource ( File p1 )  :  void
ArffLoader.setSource ( InputStream p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ArffPanel.class
package weka.gui.arffviewer
ArffPanel.actionPerformed ( ActionEvent p1 )  :  void
ArffPanel.addChangeListener ( ChangeListener p1 )  :  void
ArffPanel.addUndoPoint ( )  :  void
ArffPanel.ArffPanel ( )
ArffPanel.ArffPanel ( Instances p1 )
ArffPanel.ArffPanel ( String p1 )
ArffPanel.canUndo ( )  :  boolean
ArffPanel.clearSearch ( )  :  void
ArffPanel.clearUndo ( )  :  void
ArffPanel.copyContent ( )  :  void
ArffPanel.createPanel ( )  :  void
ArffPanel.deleteAttribute ( )  :  void
ArffPanel.deleteAttributes ( )  :  void
ArffPanel.deleteInstance ( )  :  void
ArffPanel.deleteInstances ( )  :  void
ArffPanel.getAttributes ( )  :  Vector
ArffPanel.getFilename ( )  :  String
ArffPanel.getInstances ( )  :  Instances
ArffPanel.getTable ( )  :  ArffTable
ArffPanel.getTitle ( )  :  String
ArffPanel.initialize ( )  :  void
ArffPanel.isChanged ( )  :  boolean
ArffPanel.isUndoEnabled ( )  :  boolean
ArffPanel.mouseClicked ( MouseEvent p1 )  :  void
ArffPanel.mouseEntered ( MouseEvent p1 )  :  void
ArffPanel.mouseExited ( MouseEvent p1 )  :  void
ArffPanel.mousePressed ( MouseEvent p1 )  :  void
ArffPanel.mouseReleased ( MouseEvent p1 )  :  void
ArffPanel.notifyListener ( )  :  void
ArffPanel.removeChangeListener ( ChangeListener p1 )  :  void
ArffPanel.renameAttribute ( )  :  void
ArffPanel.search ( )  :  void
ArffPanel.setChanged ( boolean p1 )  :  void
ArffPanel.setFilename ( String p1 )  :  void
ArffPanel.setInstances ( Instances p1 )  :  void
ArffPanel.setUndoEnabled ( boolean p1 )  :  void
ArffPanel.sortInstances ( )  :  void
ArffPanel.stateChanged ( ChangeEvent p1 )  :  void
ArffPanel.undo ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ArffSaver.class
package weka.core.converters
ArffSaver.ArffSaver ( )
ArffSaver.getFileDescription ( )  :  String
ArffSaver.globalInfo ( )  :  String
ArffSaver.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
ArffSaver.resetOptions ( )  :  void
ArffSaver.writeBatch ( )  :  void
ArffSaver.writeIncremental ( Instance p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ArffTable.class
package weka.gui.arffviewer
ArffTable.addChangeListener ( ChangeListener p1 )  :  void
ArffTable.ArffTable ( )
ArffTable.ArffTable ( TableModel p1 )
ArffTable.getPlainColumnName ( int p1 )  :  String
ArffTable.getSearchString ( )  :  String
ArffTable.getStringSelection ( )  :  StringSelection
ArffTable.removeChangeListener ( ChangeListener p1 )  :  void
ArffTable.setModel ( TableModel p1 )  :  void
ArffTable.setSearchString ( String p1 )  :  void
ArffTable.setSelectedColumn ( int p1 )  :  void
ArffTable.tableChanged ( TableModelEvent p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ArffTableCellRenderer.class
package weka.gui.arffviewer
ArffTableCellRenderer.ArffTableCellRenderer ( )
ArffTableCellRenderer.ArffTableCellRenderer ( Color p1, Color p2 )
ArffTableCellRenderer.ArffTableCellRenderer ( Color p1, Color p2, Color p3, Color p4 )
ArffTableCellRenderer.getTableCellRendererComponent ( JTable p1, Object p2, boolean p3, boolean p4, int p5, int p6 )  :  Component

cdk-1.0.1.jar, ArffTableModel.class
package weka.gui.arffviewer
ArffTableModel.addTableModelListener ( TableModelListener p1 )  :  void
ArffTableModel.addUndoPoint ( )  :  void
ArffTableModel.ArffTableModel ( Instances p1 )
ArffTableModel.ArffTableModel ( String p1 )
ArffTableModel.canUndo ( )  :  boolean
ArffTableModel.clearUndo ( )  :  void
ArffTableModel.deleteAttributeAt ( int p1 )  :  void
ArffTableModel.deleteAttributeAt ( int p1, boolean p2 )  :  void
ArffTableModel.deleteAttributes ( int[ ] p1 )  :  void
ArffTableModel.deleteInstanceAt ( int p1 )  :  void
ArffTableModel.deleteInstanceAt ( int p1, boolean p2 )  :  void
ArffTableModel.deleteInstances ( int[ ] p1 )  :  void
ArffTableModel.getAttributeAt ( int p1 )  :  Attribute
ArffTableModel.getAttributeColumn ( String p1 )  :  int
ArffTableModel.getColumnClass ( int p1 )  :  Class
ArffTableModel.getColumnCount ( )  :  int
ArffTableModel.getColumnName ( int p1 )  :  String
ArffTableModel.getInstances ( )  :  Instances
ArffTableModel.getRowCount ( )  :  int
ArffTableModel.getType ( int p1 )  :  int
ArffTableModel.getType ( int p1, int p2 )  :  int
ArffTableModel.getValueAt ( int p1, int p2 )  :  Object
ArffTableModel.isCellEditable ( int p1, int p2 )  :  boolean
ArffTableModel.isMissingAt ( int p1, int p2 )  :  boolean
ArffTableModel.isNotificationEnabled ( )  :  boolean
ArffTableModel.isUndoEnabled ( )  :  boolean
ArffTableModel.notifyListener ( TableModelEvent p1 )  :  void
ArffTableModel.removeTableModelListener ( TableModelListener p1 )  :  void
ArffTableModel.renameAttributeAt ( int p1, String p2 )  :  void
ArffTableModel.setInstances ( Instances p1 )  :  void
ArffTableModel.setNotificationEnabled ( boolean p1 )  :  void
ArffTableModel.setUndoEnabled ( boolean p1 )  :  void
ArffTableModel.setValueAt ( Object p1, int p2, int p3 )  :  void
ArffTableModel.setValueAt ( Object p1, int p2, int p3, boolean p4 )  :  void
ArffTableModel.sortInstances ( int p1 )  :  void
ArffTableModel.undo ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ArffTableSorter.class
package weka.gui.arffviewer
ArffTableSorter.addTableModelListener ( TableModelListener p1 )  :  void
ArffTableSorter.addUndoPoint ( )  :  void
ArffTableSorter.ArffTableSorter ( Instances p1 )
ArffTableSorter.ArffTableSorter ( String p1 )
ArffTableSorter.ArffTableSorter ( TableModel p1 )
ArffTableSorter.canUndo ( )  :  boolean
ArffTableSorter.clearUndo ( )  :  void
ArffTableSorter.deleteAttributeAt ( int p1 )  :  void
ArffTableSorter.deleteAttributes ( int[ ] p1 )  :  void
ArffTableSorter.deleteInstanceAt ( int p1 )  :  void
ArffTableSorter.deleteInstances ( int[ ] p1 )  :  void
ArffTableSorter.getAttributeAt ( int p1 )  :  Attribute
ArffTableSorter.getAttributeColumn ( String p1 )  :  int
ArffTableSorter.getInstances ( )  :  Instances
ArffTableSorter.getModelValueAt ( int p1, int p2 )  :  Object
ArffTableSorter.getType ( int p1 )  :  int
ArffTableSorter.getType ( int p1, int p2 )  :  int
ArffTableSorter.isMissingAt ( int p1, int p2 )  :  boolean
ArffTableSorter.isNotificationEnabled ( )  :  boolean
ArffTableSorter.isUndoEnabled ( )  :  boolean
ArffTableSorter.notifyListener ( TableModelEvent p1 )  :  void
ArffTableSorter.removeTableModelListener ( TableModelListener p1 )  :  void
ArffTableSorter.renameAttributeAt ( int p1, String p2 )  :  void
ArffTableSorter.setInstances ( Instances p1 )  :  void
ArffTableSorter.setNotificationEnabled ( boolean p1 )  :  void
ArffTableSorter.setUndoEnabled ( boolean p1 )  :  void
ArffTableSorter.sortInstances ( int p1 )  :  void
ArffTableSorter.undo ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ArffViewer.class
package weka.gui.arffviewer
ArffViewer.ArffViewer ( )
ArffViewer.createFrame ( )  :  void
ArffViewer.getCenteredLeft ( )  :  int
ArffViewer.getCenteredTop ( )  :  int
ArffViewer.getConfirmExit ( )  :  boolean
ArffViewer.getExitOnClose ( )  :  boolean
ArffViewer.getMainPanel ( )  :  ArffViewerMainPanel
ArffViewer.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
ArffViewer.refresh ( )  :  void
ArffViewer.setCenteredLocation ( )  :  void
ArffViewer.setConfirmExit ( boolean p1 )  :  void
ArffViewer.setExitOnClose ( boolean p1 )  :  void
ArffViewer.toString ( )  :  String
ArffViewer.windowActivated ( WindowEvent p1 )  :  void
ArffViewer.windowClosed ( WindowEvent p1 )  :  void
ArffViewer.windowClosing ( WindowEvent p1 )  :  void
ArffViewer.windowDeactivated ( WindowEvent p1 )  :  void
ArffViewer.windowDeiconified ( WindowEvent p1 )  :  void
ArffViewer.windowIconified ( WindowEvent p1 )  :  void
ArffViewer.windowOpened ( WindowEvent p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ArffViewerMainPanel.class
package weka.gui.arffviewer
ArffViewerMainPanel.actionPerformed ( ActionEvent p1 )  :  void
ArffViewerMainPanel.ArffViewerMainPanel ( JFrame p1 )
ArffViewerMainPanel.clearSearch ( )  :  void
ArffViewerMainPanel.close ( )  :  void
ArffViewerMainPanel.closeAllFiles ( )  :  void
ArffViewerMainPanel.closeFile ( )  :  void
ArffViewerMainPanel.closeFile ( boolean p1 )  :  void
ArffViewerMainPanel.copyContent ( )  :  void
ArffViewerMainPanel.createPanel ( )  :  void
ArffViewerMainPanel.deleteAttribute ( boolean p1 )  :  void
ArffViewerMainPanel.deleteInstance ( boolean p1 )  :  void
ArffViewerMainPanel.getConfirmExit ( )  :  boolean
ArffViewerMainPanel.getCurrentFilename ( )  :  String
ArffViewerMainPanel.getCurrentIndex ( )  :  int
ArffViewerMainPanel.getCurrentPanel ( )  :  ArffPanel
ArffViewerMainPanel.getExitOnClose ( )  :  boolean
ArffViewerMainPanel.getFilename ( int p1 )  :  String
ArffViewerMainPanel.getFrameTitle ( )  :  String
ArffViewerMainPanel.getMenu ( )  :  JMenuBar
ArffViewerMainPanel.getPanel ( int p1 )  :  ArffPanel
ArffViewerMainPanel.getPanelCount ( )  :  int
ArffViewerMainPanel.getTabbedPane ( )  :  JTabbedPane
ArffViewerMainPanel.isPanelSelected ( )  :  boolean
ArffViewerMainPanel.loadFile ( )  :  void
ArffViewerMainPanel.loadFile ( String p1 )  :  void
ArffViewerMainPanel.refresh ( )  :  void
ArffViewerMainPanel.renameAttribute ( )  :  void
ArffViewerMainPanel.saveChanges ( )  :  boolean
ArffViewerMainPanel.saveChanges ( boolean p1 )  :  boolean
ArffViewerMainPanel.saveFile ( )  :  void
ArffViewerMainPanel.saveFileAs ( )  :  void
ArffViewerMainPanel.search ( )  :  void
ArffViewerMainPanel.setConfirmExit ( boolean p1 )  :  void
ArffViewerMainPanel.setCurrentFilename ( String p1 )  :  void
ArffViewerMainPanel.setExitOnClose ( boolean p1 )  :  void
ArffViewerMainPanel.setFilename ( int p1, String p2 )  :  void
ArffViewerMainPanel.setTabTitle ( JComponent p1 )  :  void
ArffViewerMainPanel.showAttributes ( )  :  String
ArffViewerMainPanel.showProperties ( )  :  void
ArffViewerMainPanel.showValues ( )  :  void
ArffViewerMainPanel.sortInstances ( )  :  void
ArffViewerMainPanel.stateChanged ( ChangeEvent p1 )  :  void
ArffViewerMainPanel.toString ( )  :  String
ArffViewerMainPanel.undo ( )  :  void
ArffViewerMainPanel.updateFrameTitle ( )  :  void
ArffViewerMainPanel.updateMenu ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, AromaticSymbolAtom.class
package org.openscience.cdk.isomorphism.matchers.smarts
AromaticSymbolAtom.AromaticSymbolAtom ( )
AromaticSymbolAtom.matches ( IAtom atom )  :  boolean

cdk-1.0.1.jar, ASEvaluation.class
package weka.attributeSelection
ASEvaluation.ASEvaluation ( )
ASEvaluation.buildEvaluator ( Instances p1 ) [abstract]  :  void
ASEvaluation.forName ( String p1, String[ ] p2 ) [static]  :  attributeSelection.ASEvaluation
ASEvaluation.makeCopies ( attributeSelection.ASEvaluation p1, int p2 ) [static]  :  attributeSelection.ASEvaluation[ ]
ASEvaluation.postProcess ( int[ ] p1 )  :  int[ ]

cdk-1.0.1.jar, ASSearch.class
package weka.attributeSelection
ASSearch.ASSearch ( )
ASSearch.forName ( String p1, String[ ] p2 ) [static]  :  attributeSelection.ASSearch
ASSearch.search ( attributeSelection.ASEvaluation p1, Instances p2 ) [abstract]  :  int[ ]

cdk-1.0.1.jar, AssociationsPanel.class
package weka.gui.explorer
AssociationsPanel.AssociationsPanel ( )
AssociationsPanel.historyRightClickPopup ( String p1, int p2, int p3 )  :  void
AssociationsPanel.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
AssociationsPanel.saveBuffer ( String p1 )  :  void
AssociationsPanel.setInstances ( Instances p1 )  :  void
AssociationsPanel.setLog ( Logger p1 )  :  void
AssociationsPanel.startAssociator ( )  :  void
AssociationsPanel.stopAssociator ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, Associator.class
package weka.associations
Associator.Associator ( )
Associator.buildAssociations ( Instances p1 ) [abstract]  :  void
Associator.forName ( String p1, String[ ] p2 ) [static]  :  Associator
Associator.makeCopies ( Associator p1, int p2 ) [static]  :  Associator[ ]

cdk-1.0.1.jar, ASTAliphatic.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTAliphatic.ASTAliphatic ( int id )
ASTAliphatic.ASTAliphatic ( SMARTSParser p, int id )
ASTAliphatic.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object

cdk-1.0.1.jar, ASTAnyAtom.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTAnyAtom.ASTAnyAtom ( int id )
ASTAnyAtom.ASTAnyAtom ( SMARTSParser p, int id )
ASTAnyAtom.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object

cdk-1.0.1.jar, ASTAromatic.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTAromatic.ASTAromatic ( int id )
ASTAromatic.ASTAromatic ( SMARTSParser p, int id )
ASTAromatic.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object

cdk-1.0.1.jar, ASTAtom.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTAtom.ASTAtom ( int id )
ASTAtom.ASTAtom ( SMARTSParser p, int id )
ASTAtom.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object

cdk-1.0.1.jar, ASTAtomicMass.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTAtomicMass.ASTAtomicMass ( int id )
ASTAtomicMass.ASTAtomicMass ( SMARTSParser p, int id )
ASTAtomicMass.getMass ( )  :  int
ASTAtomicMass.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object
ASTAtomicMass.setMass ( int mass )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ASTAtomicNumber.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTAtomicNumber.ASTAtomicNumber ( int id )
ASTAtomicNumber.ASTAtomicNumber ( SMARTSParser p, int id )
ASTAtomicNumber.getNumber ( )  :  int
ASTAtomicNumber.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object
ASTAtomicNumber.setNumber ( int number )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ASTCharge.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTCharge.ASTCharge ( int id )
ASTCharge.ASTCharge ( SMARTSParser p, int id )
ASTCharge.getCharge ( )  :  int
ASTCharge.isPositive ( )  :  boolean
ASTCharge.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object
ASTCharge.setCharge ( int charge )  :  void
ASTCharge.setPositive ( boolean isPositive )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ASTChirality.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTChirality.ASTChirality ( int id )
ASTChirality.ASTChirality ( SMARTSParser p, int id )
ASTChirality.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object

cdk-1.0.1.jar, ASTElement.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTElement.ASTElement ( int id )
ASTElement.ASTElement ( SMARTSParser p, int id )
ASTElement.getSymbol ( )  :  String
ASTElement.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object
ASTElement.setSymbol ( String symbol )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ASTExplicitAtom.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTExplicitAtom.ASTExplicitAtom ( int id )
ASTExplicitAtom.ASTExplicitAtom ( SMARTSParser p, int id )
ASTExplicitAtom.getSymbol ( )  :  String
ASTExplicitAtom.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object
ASTExplicitAtom.setSymbol ( String symbol )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ASTExplicitConnectivity.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTExplicitConnectivity.ASTExplicitConnectivity ( int id )
ASTExplicitConnectivity.ASTExplicitConnectivity ( SMARTSParser p, int id )
ASTExplicitConnectivity.getNumOfConnection ( )  :  int
ASTExplicitConnectivity.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object
ASTExplicitConnectivity.setNumOfConnection ( int degree )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ASTExplicitHighAndBond.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTExplicitHighAndBond.ASTExplicitHighAndBond ( int id )
ASTExplicitHighAndBond.ASTExplicitHighAndBond ( SMARTSParser p, int id )
ASTExplicitHighAndBond.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object

cdk-1.0.1.jar, ASTExplicitHighAndExpression.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTExplicitHighAndExpression.ASTExplicitHighAndExpression ( int id )
ASTExplicitHighAndExpression.ASTExplicitHighAndExpression ( SMARTSParser p, int id )
ASTExplicitHighAndExpression.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object

cdk-1.0.1.jar, ASTGroup.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTGroup.ASTGroup ( int id )
ASTGroup.ASTGroup ( SMARTSParser p, int id )
ASTGroup.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object

cdk-1.0.1.jar, ASTImplicitHCount.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTImplicitHCount.ASTImplicitHCount ( int id )
ASTImplicitHCount.ASTImplicitHCount ( SMARTSParser p, int id )
ASTImplicitHCount.getCount ( )  :  int
ASTImplicitHCount.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object
ASTImplicitHCount.setCount ( int count )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ASTImplicitHighAndBond.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTImplicitHighAndBond.ASTImplicitHighAndBond ( int id )
ASTImplicitHighAndBond.ASTImplicitHighAndBond ( SMARTSParser p, int id )
ASTImplicitHighAndBond.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object

cdk-1.0.1.jar, ASTImplicitHighAndExpression.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTImplicitHighAndExpression.ASTImplicitHighAndExpression ( int id )
ASTImplicitHighAndExpression.ASTImplicitHighAndExpression ( SMARTSParser p, int id )
ASTImplicitHighAndExpression.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object

cdk-1.0.1.jar, ASTLowAndBond.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTLowAndBond.ASTLowAndBond ( int id )
ASTLowAndBond.ASTLowAndBond ( SMARTSParser p, int id )
ASTLowAndBond.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object

cdk-1.0.1.jar, ASTLowAndExpression.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTLowAndExpression.ASTLowAndExpression ( int id )
ASTLowAndExpression.ASTLowAndExpression ( SMARTSParser p, int id )
ASTLowAndExpression.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object

cdk-1.0.1.jar, ASTNotBond.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTNotBond.ASTNotBond ( int id )
ASTNotBond.ASTNotBond ( SMARTSParser p, int id )
ASTNotBond.getType ( )  :  int
ASTNotBond.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object
ASTNotBond.setType ( int type )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ASTNotExpression.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTNotExpression.ASTNotExpression ( int id )
ASTNotExpression.ASTNotExpression ( SMARTSParser p, int id )
ASTNotExpression.getType ( )  :  int
ASTNotExpression.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object
ASTNotExpression.setType ( int type )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ASTOrBond.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTOrBond.ASTOrBond ( int id )
ASTOrBond.ASTOrBond ( SMARTSParser p, int id )
ASTOrBond.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object

cdk-1.0.1.jar, ASTOrExpression.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTOrExpression.ASTOrExpression ( int id )
ASTOrExpression.ASTOrExpression ( SMARTSParser p, int id )
ASTOrExpression.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object

cdk-1.0.1.jar, ASTPrimitiveAtomExpression.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTPrimitiveAtomExpression.ASTPrimitiveAtomExpression ( int id )
ASTPrimitiveAtomExpression.ASTPrimitiveAtomExpression ( SMARTSParser p, int id )
ASTPrimitiveAtomExpression.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object

cdk-1.0.1.jar, ASTReaction.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTReaction.ASTReaction ( int id )
ASTReaction.ASTReaction ( SMARTSParser p, int id )
ASTReaction.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object

cdk-1.0.1.jar, ASTRecursiveSmartsExpression.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTRecursiveSmartsExpression.ASTRecursiveSmartsExpression ( int id )
ASTRecursiveSmartsExpression.ASTRecursiveSmartsExpression ( SMARTSParser p, int id )
ASTRecursiveSmartsExpression.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object

cdk-1.0.1.jar, ASTRingConnectivity.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTRingConnectivity.ASTRingConnectivity ( int id )
ASTRingConnectivity.ASTRingConnectivity ( SMARTSParser p, int id )
ASTRingConnectivity.getNumOfConnection ( )  :  int
ASTRingConnectivity.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object
ASTRingConnectivity.setNumOfConnection ( int numOfConnection )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ASTRingIdentifier.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTRingIdentifier.ASTRingIdentifier ( int id )
ASTRingIdentifier.ASTRingIdentifier ( SMARTSParser p, int id )
ASTRingIdentifier.getRingId ( )  :  int
ASTRingIdentifier.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object
ASTRingIdentifier.setRingId ( int ringId )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ASTRingMembership.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTRingMembership.ASTRingMembership ( int id )
ASTRingMembership.ASTRingMembership ( SMARTSParser p, int id )
ASTRingMembership.getNumOfMembership ( )  :  int
ASTRingMembership.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object
ASTRingMembership.setNumOfMembership ( int numOfMembership )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ASTSimpleBond.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTSimpleBond.ASTSimpleBond ( int id )
ASTSimpleBond.ASTSimpleBond ( SMARTSParser p, int id )
ASTSimpleBond.getBondType ( )  :  int
ASTSimpleBond.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object
ASTSimpleBond.setBondType ( int bondType )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ASTSmallestRingSize.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTSmallestRingSize.ASTSmallestRingSize ( int id )
ASTSmallestRingSize.ASTSmallestRingSize ( SMARTSParser p, int id )
ASTSmallestRingSize.getSize ( )  :  int
ASTSmallestRingSize.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object
ASTSmallestRingSize.setSize ( int size )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ASTSmarts.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTSmarts.ASTSmarts ( int id )
ASTSmarts.ASTSmarts ( SMARTSParser p, int id )
ASTSmarts.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object

cdk-1.0.1.jar, ASTStart.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTStart.ASTStart ( int id )
ASTStart.ASTStart ( SMARTSParser p, int id )
ASTStart.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object

cdk-1.0.1.jar, ASTTotalConnectivity.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTTotalConnectivity.ASTTotalConnectivity ( int id )
ASTTotalConnectivity.ASTTotalConnectivity ( SMARTSParser p, int id )
ASTTotalConnectivity.getNumOfConnection ( )  :  int
ASTTotalConnectivity.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object
ASTTotalConnectivity.setNumOfConnection ( int numOfConnection )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ASTTotalHCount.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTTotalHCount.ASTTotalHCount ( int id )
ASTTotalHCount.ASTTotalHCount ( SMARTSParser p, int id )
ASTTotalHCount.getCount ( )  :  int
ASTTotalHCount.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object
ASTTotalHCount.setCount ( int count )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ASTValence.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ASTValence.ASTValence ( int id )
ASTValence.ASTValence ( SMARTSParser p, int id )
ASTValence.getOrder ( )  :  int
ASTValence.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object
ASTValence.setOrder ( int order )  :  void

cdk-1.0.1.jar, AtomicNumberAtom.class
package org.openscience.cdk.isomorphism.matchers.smarts
AtomicNumberAtom.AtomicNumberAtom ( int atomicNumber )
AtomicNumberAtom.matches ( IAtom atom )  :  boolean

cdk-1.0.1.jar, Attribute.class
package weka.core
Attribute.addStringValue ( Attribute p1, int p2 )  :  int
Attribute.addStringValue ( String p1 )  :  int
Attribute.Attribute ( String p1 )
Attribute.Attribute ( String p1, FastVector p2 )
Attribute.Attribute ( String p1, FastVector p2, ProtectedProperties p3 )
Attribute.Attribute ( String p1, ProtectedProperties p2 )
Attribute.Attribute ( String p1, String p2 )
Attribute.Attribute ( String p1, String p2, ProtectedProperties p3 )
Attribute.copy ( )  :  Object
Attribute.enumerateValues ( )  :  Enumeration
Attribute.equals ( Object p1 )  :  boolean
Attribute.formatDate ( double p1 )  :  String
Attribute.getLowerNumericBound ( )  :  double
Attribute.getMetadata ( )  :  ProtectedProperties
Attribute.getUpperNumericBound ( )  :  double
Attribute.hasZeropoint ( )  :  boolean
Attribute.index ( )  :  int
Attribute.indexOfValue ( String p1 )  :  int
Attribute.isAveragable ( )  :  boolean
Attribute.isDate ( )  :  boolean
Attribute.isInRange ( double p1 )  :  boolean
Attribute.isNominal ( )  :  boolean
Attribute.isNumeric ( )  :  boolean
Attribute.isRegular ( )  :  boolean
Attribute.isString ( )  :  boolean
Attribute.lowerNumericBoundIsOpen ( )  :  boolean
Attribute.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Attribute.name ( )  :  String
Attribute.numValues ( )  :  int
Attribute.ordering ( )  :  int
Attribute.parseDate ( String p1 )  :  double
Attribute.toString ( )  :  String
Attribute.type ( )  :  int
Attribute.upperNumericBoundIsOpen ( )  :  boolean
Attribute.value ( int p1 )  :  String
Attribute.weight ( )  :  double

cdk-1.0.1.jar, AttributeEvaluator.class
package weka.attributeSelection
AttributeEvaluator.AttributeEvaluator ( )
AttributeEvaluator.evaluateAttribute ( int p1 ) [abstract]  :  double

cdk-1.0.1.jar, AttributeListPanel.class
package weka.gui
AttributeListPanel.AttributeListPanel ( )
AttributeListPanel.getSelectionModel ( )  :  ListSelectionModel
AttributeListPanel.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
AttributeListPanel.setInstances ( Instances p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, AttributePanel.class
package weka.gui.visualize
AttributePanel.addAttributePanelListener ( AttributePanelListener p1 )  :  void
AttributePanel.AttributePanel ( )
AttributePanel.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
AttributePanel.setCindex ( int p1 )  :  void
AttributePanel.setCindex ( int p1, double p2, double p3 )  :  void
AttributePanel.setColours ( FastVector p1 )  :  void
AttributePanel.setInstances ( Instances p1 )  :  void
AttributePanel.setX ( int p1 )  :  void
AttributePanel.setY ( int p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, AttributePanelEvent.class
package weka.gui.visualize
AttributePanelEvent.AttributePanelEvent ( boolean p1, boolean p2, int p3 )

cdk-1.0.1.jar, AttributePanelListener.class
package weka.gui.visualize
AttributePanelListener.attributeSelectionChange ( AttributePanelEvent p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, AttributeSelectedClassifier.class
package weka.classifiers.meta
AttributeSelectedClassifier.AttributeSelectedClassifier ( )
AttributeSelectedClassifier.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
AttributeSelectedClassifier.defaultClassifierString ( )  :  String
AttributeSelectedClassifier.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
AttributeSelectedClassifier.enumerateMeasures ( )  :  Enumeration
AttributeSelectedClassifier.evaluatorTipText ( )  :  String
AttributeSelectedClassifier.getEvaluator ( )  :  attributeSelection.ASEvaluation
AttributeSelectedClassifier.getEvaluatorSpec ( )  :  String
AttributeSelectedClassifier.getMeasure ( String p1 )  :  double
AttributeSelectedClassifier.getOptions ( )  :  String[ ]
AttributeSelectedClassifier.getSearch ( )  :  attributeSelection.ASSearch
AttributeSelectedClassifier.getSearchSpec ( )  :  String
AttributeSelectedClassifier.globalInfo ( )  :  String
AttributeSelectedClassifier.graph ( )  :  String
AttributeSelectedClassifier.graphType ( )  :  int
AttributeSelectedClassifier.listOptions ( )  :  Enumeration
AttributeSelectedClassifier.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
AttributeSelectedClassifier.measureNumAttributesSelected ( )  :  double
AttributeSelectedClassifier.measureSelectionTime ( )  :  double
AttributeSelectedClassifier.measureTime ( )  :  double
AttributeSelectedClassifier.searchTipText ( )  :  String
AttributeSelectedClassifier.setEvaluator ( attributeSelection.ASEvaluation p1 )  :  void
AttributeSelectedClassifier.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
AttributeSelectedClassifier.setSearch ( attributeSelection.ASSearch p1 )  :  void
AttributeSelectedClassifier.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, AttributeSelection.class
package weka.attributeSelection
AttributeSelection.AttributeSelection ( )
AttributeSelection.CrossValidateAttributes ( )  :  String
AttributeSelection.CVResultsString ( )  :  String
AttributeSelection.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
AttributeSelection.numberAttributesSelected ( )  :  int
AttributeSelection.rankedAttributes ( )  :  double[ ][ ]
AttributeSelection.reduceDimensionality ( Instance p1 )  :  Instance
AttributeSelection.reduceDimensionality ( Instances p1 )  :  Instances
AttributeSelection.SelectAttributes ( attributeSelection.ASEvaluation p1, String[ ] p2 ) [static]  :  String
AttributeSelection.SelectAttributes ( attributeSelection.ASEvaluation p1, String[ ] p2, Instances p3 ) [static]  :  String
AttributeSelection.SelectAttributes ( Instances p1 )  :  void
AttributeSelection.selectAttributesCVSplit ( Instances p1 )  :  void
AttributeSelection.selectedAttributes ( )  :  int[ ]
AttributeSelection.setEvaluator ( attributeSelection.ASEvaluation p1 )  :  void
AttributeSelection.setFolds ( int p1 )  :  void
AttributeSelection.setRanking ( boolean p1 )  :  void
AttributeSelection.setSearch ( attributeSelection.ASSearch p1 )  :  void
AttributeSelection.setSeed ( int p1 )  :  void
AttributeSelection.setThreshold ( double p1 )  :  void
AttributeSelection.setXval ( boolean p1 )  :  void
AttributeSelection.toResultsString ( )  :  String
package weka.filters.supervised.attribute
AttributeSelection.AttributeSelection ( )
AttributeSelection.batchFinished ( )  :  boolean
AttributeSelection.convertInstance ( Instance p1 )  :  void
AttributeSelection.evaluatorTipText ( )  :  String
AttributeSelection.getEvaluator ( )  :  attributeSelection.ASEvaluation
AttributeSelection.getOptions ( )  :  String[ ]
AttributeSelection.getSearch ( )  :  attributeSelection.ASSearch
AttributeSelection.globalInfo ( )  :  String
AttributeSelection.input ( Instance p1 )  :  boolean
AttributeSelection.listOptions ( )  :  Enumeration
AttributeSelection.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
AttributeSelection.resetOptions ( )  :  void
AttributeSelection.searchTipText ( )  :  String
AttributeSelection.setEvaluator ( attributeSelection.ASEvaluation p1 )  :  void
AttributeSelection.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
AttributeSelection.setOutputFormat ( )  :  void
AttributeSelection.setSearch ( attributeSelection.ASSearch p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, AttributeSelectionPanel.class
package weka.gui
AttributeSelectionPanel.AttributeSelectionPanel ( )
AttributeSelectionPanel.getSelectedAttributes ( )  :  int[ ]
AttributeSelectionPanel.getSelectionModel ( )  :  ListSelectionModel
AttributeSelectionPanel.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
AttributeSelectionPanel.setInstances ( Instances p1 )  :  void
package weka.gui.explorer
AttributeSelectionPanel.AttributeSelectionPanel ( )
AttributeSelectionPanel.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
AttributeSelectionPanel.saveBuffer ( String p1 )  :  void
AttributeSelectionPanel.setInstances ( Instances p1 )  :  void
AttributeSelectionPanel.setLog ( Logger p1 )  :  void
AttributeSelectionPanel.startAttributeSelection ( )  :  void
AttributeSelectionPanel.stopAttributeSelection ( )  :  void
AttributeSelectionPanel.updateRadioLinks ( )  :  void
AttributeSelectionPanel.visualize ( String p1, int p2, int p3 )  :  void
AttributeSelectionPanel.visualizeTransformedData ( Instances p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, AttributeSpacing.class
package weka.gui.visualize
AttributePanel.AttributeSpacing.AttributePanel.AttributeSpacing ( AttributePanel p1, Attribute p2, int p3 )
AttributePanel.AttributeSpacing.paintComponent ( Graphics p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, AttributeStats.class
package weka.core
AttributeStats.addDistinct ( double p1, int p2 )  :  void
AttributeStats.AttributeStats ( )
AttributeStats.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, AttributeSummarizer.class
package weka.gui.beans
AttributeSummarizer.appearanceDesign ( )  :  void
AttributeSummarizer.appearanceFinal ( )  :  void
AttributeSummarizer.AttributeSummarizer ( )
AttributeSummarizer.enumerateRequests ( )  :  Enumeration
AttributeSummarizer.getColoringIndex ( )  :  int
AttributeSummarizer.getGridWidth ( )  :  int
AttributeSummarizer.getMaxPlots ( )  :  int
AttributeSummarizer.globalInfo ( )  :  String
AttributeSummarizer.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
AttributeSummarizer.performRequest ( String p1 )  :  void
AttributeSummarizer.setBeanContext ( BeanContext p1 )  :  void
AttributeSummarizer.setColoringIndex ( int p1 )  :  void
AttributeSummarizer.setDesign ( boolean p1 )  :  void
AttributeSummarizer.setGridWidth ( int p1 )  :  void
AttributeSummarizer.setInstances ( Instances p1 )  :  void
AttributeSummarizer.setMaxPlots ( int p1 )  :  void
AttributeSummarizer.setUpFinal ( )  :  void
AttributeSummarizer.useDefaultVisual ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, AttributeSummarizerBeanInfo.class
package weka.gui.beans
AttributeSummarizerBeanInfo.AttributeSummarizerBeanInfo ( )
AttributeSummarizerBeanInfo.getEventSetDescriptors ( )  :  EventSetDescriptor[ ]

cdk-1.0.1.jar, AttributeSummaryPanel.class
package weka.gui
AttributeSummaryPanel.AttributeSummaryPanel ( )
AttributeSummaryPanel.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
AttributeSummaryPanel.setAttribute ( int p1 )  :  void
AttributeSummaryPanel.setDerived ( int p1 )  :  void
AttributeSummaryPanel.setHeader ( int p1 )  :  void
AttributeSummaryPanel.setInstances ( Instances p1 )  :  void
AttributeSummaryPanel.setTable ( AttributeStats p1, int p2 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, AttributeTransformer.class
package weka.attributeSelection
AttributeTransformer.convertInstance ( Instance p1 ) [abstract]  :  Instance
AttributeTransformer.transformedData ( ) [abstract]  :  Instances
AttributeTransformer.transformedHeader ( ) [abstract]  :  Instances

cdk-1.0.1.jar, AttributeValueLiteral.class
package weka.associations.tertius
AttributeValueLiteral.AttributeValueLiteral ( Predicate p1, String p2, int p3, int p4, int p5 )
AttributeValueLiteral.negationSatisfies ( Instance p1 )  :  boolean
AttributeValueLiteral.satisfies ( Instance p1 )  :  boolean
AttributeValueLiteral.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, AttributeVisualizationPanel.class
package weka.gui
AttributeVisualizationPanel.AttributeVisualizationPanel ( )
AttributeVisualizationPanel.AttributeVisualizationPanel ( boolean p1 )
AttributeVisualizationPanel.calcGraph ( )  :  void
AttributeVisualizationPanel.getColorBox ( )  :  JComboBox
AttributeVisualizationPanel.getColoringIndex ( )  :  int
AttributeVisualizationPanel.getToolTipText ( MouseEvent p1 )  :  String
AttributeVisualizationPanel.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
AttributeVisualizationPanel.paintComponent ( Graphics p1 )  :  void
AttributeVisualizationPanel.setAttribute ( int p1 )  :  void
AttributeVisualizationPanel.setColoringIndex ( int p1 )  :  void
AttributeVisualizationPanel.setInstances ( Instances p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, AveragingResultProducer.class
package weka.experiment
AveragingResultProducer.acceptResult ( ResultProducer p1, Object[ ] p2, Object[ ] p3 )  :  void
AveragingResultProducer.AveragingResultProducer ( )
AveragingResultProducer.calculateStdDevsTipText ( )  :  String
AveragingResultProducer.checkForDuplicateKeys ( Object[ ] p1 )  :  void
AveragingResultProducer.checkForMultipleDifferences ( )  :  void
AveragingResultProducer.determineColumnConstraints ( ResultProducer p1 )  :  String[ ]
AveragingResultProducer.determineTemplate ( int p1 )  :  Object[ ]
AveragingResultProducer.doAverageResult ( Object[ ] p1 )  :  void
AveragingResultProducer.doRun ( int p1 )  :  void
AveragingResultProducer.doRunKeys ( int p1 )  :  void
AveragingResultProducer.enumerateMeasures ( )  :  Enumeration
AveragingResultProducer.expectedResultsPerAverageTipText ( )  :  String
AveragingResultProducer.findKeyIndex ( )  :  int
AveragingResultProducer.getCalculateStdDevs ( )  :  boolean
AveragingResultProducer.getCompatibilityState ( )  :  String
AveragingResultProducer.getExpectedResultsPerAverage ( )  :  int
AveragingResultProducer.getKeyFieldName ( )  :  String
AveragingResultProducer.getKeyNames ( )  :  String[ ]
AveragingResultProducer.getKeyTypes ( )  :  Object[ ]
AveragingResultProducer.getMeasure ( String p1 )  :  double
AveragingResultProducer.getOptions ( )  :  String[ ]
AveragingResultProducer.getResultNames ( )  :  String[ ]
AveragingResultProducer.getResultProducer ( )  :  ResultProducer
AveragingResultProducer.getResultTypes ( )  :  Object[ ]
AveragingResultProducer.globalInfo ( )  :  String
AveragingResultProducer.isResultRequired ( ResultProducer p1, Object[ ] p2 )  :  boolean
AveragingResultProducer.keyFieldNameTipText ( )  :  String
AveragingResultProducer.listOptions ( )  :  Enumeration
AveragingResultProducer.matchesTemplate ( Object[ ] p1, Object[ ] p2 )  :  boolean
AveragingResultProducer.postProcess ( )  :  void
AveragingResultProducer.postProcess ( ResultProducer p1 )  :  void
AveragingResultProducer.preProcess ( )  :  void
AveragingResultProducer.preProcess ( ResultProducer p1 )  :  void
AveragingResultProducer.resultProducerTipText ( )  :  String
AveragingResultProducer.setAdditionalMeasures ( String[ ] p1 )  :  void
AveragingResultProducer.setCalculateStdDevs ( boolean p1 )  :  void
AveragingResultProducer.setExpectedResultsPerAverage ( int p1 )  :  void
AveragingResultProducer.setInstances ( Instances p1 )  :  void
AveragingResultProducer.setKeyFieldName ( String p1 )  :  void
AveragingResultProducer.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
AveragingResultProducer.setResultListener ( ResultListener p1 )  :  void
AveragingResultProducer.setResultProducer ( ResultProducer p1 )  :  void
AveragingResultProducer.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, Bagging.class
package weka.classifiers.meta
Bagging.Bagging ( )
Bagging.bagSizePercentTipText ( )  :  String
Bagging.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
Bagging.calcOutOfBagTipText ( )  :  String
Bagging.defaultClassifierString ( )  :  String
Bagging.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
Bagging.enumerateMeasures ( )  :  Enumeration
Bagging.getBagSizePercent ( )  :  int
Bagging.getCalcOutOfBag ( )  :  boolean
Bagging.getMeasure ( String p1 )  :  double
Bagging.getOptions ( )  :  String[ ]
Bagging.globalInfo ( )  :  String
Bagging.listOptions ( )  :  Enumeration
Bagging.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Bagging.measureOutOfBagError ( )  :  double
Bagging.resampleWithWeights ( Instances p1, Random p2, boolean[ ] p3 )  :  Instances
Bagging.setBagSizePercent ( int p1 )  :  void
Bagging.setCalcOutOfBag ( boolean p1 )  :  void
Bagging.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
Bagging.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, BatchClassifierEvent.class
package weka.gui.beans
BatchClassifierEvent.BatchClassifierEvent ( Object p1, Classifier p2, DataSetEvent p3, int p4, int p5 )
BatchClassifierEvent.getClassifier ( )  :  Classifier
BatchClassifierEvent.getMaxSetNumber ( )  :  int
BatchClassifierEvent.getSetNumber ( )  :  int
BatchClassifierEvent.getTestSet ( )  :  DataSetEvent

cdk-1.0.1.jar, BatchClassifierListener.class
package weka.gui.beans
BatchClassifierListener.acceptClassifier ( BatchClassifierEvent p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, BatchClustererEvent.class
package weka.gui.beans
BatchClustererEvent.BatchClustererEvent ( Object p1, Clusterer p2, DataSetEvent p3, int p4, int p5, int p6 )
BatchClustererEvent.getClusterer ( )  :  Clusterer
BatchClustererEvent.getMaxSetNumber ( )  :  int
BatchClustererEvent.getSetNumber ( )  :  int
BatchClustererEvent.getTestOrTrain ( )  :  int
BatchClustererEvent.getTestSet ( )  :  DataSetEvent

cdk-1.0.1.jar, BatchClustererListener.class
package weka.gui.beans
BatchClustererListener.acceptClusterer ( BatchClustererEvent p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, BayesNet.class
package weka.classifiers.bayes
BayesNet.BayesNet ( )
BayesNet.BIFFileTipText ( )  :  String
BayesNet.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
BayesNet.buildStructure ( )  :  void
BayesNet.countsForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
BayesNet.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
BayesNet.enumerateMeasures ( )  :  Enumeration
BayesNet.estimateCPTs ( )  :  void
BayesNet.estimatorTipText ( )  :  String
BayesNet.getADTree ( )  :  ADNode
BayesNet.getBIFFile ( )  :  String
BayesNet.getCardinality ( int p1 )  :  int
BayesNet.getDistributions ( )  :  Estimator[ ][ ]
BayesNet.getEstimator ( )  :  BayesNetEstimator
BayesNet.getMeasure ( String p1 )  :  double
BayesNet.getName ( )  :  String
BayesNet.getNodeName ( int p1 )  :  String
BayesNet.getNodeValue ( int p1, int p2 )  :  String
BayesNet.getNrOfNodes ( )  :  int
BayesNet.getNrOfParents ( int p1 )  :  int
BayesNet.getOptions ( )  :  String[ ]
BayesNet.getParent ( int p1, int p2 )  :  int
BayesNet.getParentCardinality ( int p1 )  :  int
BayesNet.getParentSet ( int p1 )  :  ParentSet
BayesNet.getParentSets ( )  :  ParentSet[ ]
BayesNet.getProbability ( int p1, int p2, int p3 )  :  double
BayesNet.getSearchAlgorithm ( )  :  SearchAlgorithm
BayesNet.getUseADTree ( )  :  boolean
BayesNet.globalInfo ( )  :  String
BayesNet.graph ( )  :  String
BayesNet.graphType ( )  :  int
BayesNet.initCPTs ( )  :  void
BayesNet.initStructure ( )  :  void
BayesNet.listOptions ( )  :  Enumeration
BayesNet.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
BayesNet.measureAICScore ( )  :  double
BayesNet.measureBayesScore ( )  :  double
BayesNet.measureBDeuScore ( )  :  double
BayesNet.measureDivergence ( )  :  double
BayesNet.measureEntropyScore ( )  :  double
BayesNet.measureExtraArcs ( )  :  double
BayesNet.measureMDLScore ( )  :  double
BayesNet.measureMissingArcs ( )  :  double
BayesNet.measureReversedArcs ( )  :  double
BayesNet.partitionOptions ( String[ ] p1 ) [static]  :  String[ ]
BayesNet.searchAlgorithmTipText ( )  :  String
BayesNet.setBIFFile ( String p1 )  :  void
BayesNet.setEstimator ( BayesNetEstimator p1 )  :  void
BayesNet.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
BayesNet.setSearchAlgorithm ( SearchAlgorithm p1 )  :  void
BayesNet.setUseADTree ( boolean p1 )  :  void
BayesNet.toString ( )  :  String
BayesNet.toXMLBIF03 ( )  :  String
BayesNet.updateClassifier ( Instance p1 )  :  void
BayesNet.useADTreeTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, BayesNetEstimator.class
package weka.classifiers.bayes.net.estimate
BayesNetEstimator.alphaTipText ( )  :  String
BayesNetEstimator.BayesNetEstimator ( )
BayesNetEstimator.distributionForInstance ( BayesNet p1, Instance p2 )  :  double[ ]
BayesNetEstimator.estimateCPTs ( BayesNet p1 )  :  void
BayesNetEstimator.getAlpha ( )  :  double
BayesNetEstimator.getOptions ( )  :  String[ ]
BayesNetEstimator.globalInfo ( )  :  String
BayesNetEstimator.initCPTs ( BayesNet p1 )  :  void
BayesNetEstimator.listOptions ( )  :  Enumeration
BayesNetEstimator.setAlpha ( double p1 )  :  void
BayesNetEstimator.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
BayesNetEstimator.updateClassifier ( BayesNet p1, Instance p2 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, BayesNetGenerator.class
package weka.classifiers.bayes.net
BayesNetGenerator.BayesNetGenerator ( )
BayesNetGenerator.generateInstances ( )  :  void
BayesNetGenerator.generateRandomNetwork ( )  :  void
BayesNetGenerator.generateRandomNetworkStructure ( int p1, int p2 )  :  void
BayesNetGenerator.getOptions ( )  :  String[ ]
BayesNetGenerator.Init ( int p1, int p2 )  :  void
BayesNetGenerator.listOptions ( )  :  Enumeration
BayesNetGenerator.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
BayesNetGenerator.printOptions ( OptionHandler p1 ) [static]  :  void
BayesNetGenerator.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
BayesNetGenerator.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, BeanCommon.class
package weka.gui.beans
BeanCommon.connectionAllowed ( EventSetDescriptor p1 ) [abstract]  :  boolean
BeanCommon.connectionAllowed ( String p1 ) [abstract]  :  boolean
BeanCommon.connectionNotification ( String p1, Object p2 ) [abstract]  :  void
BeanCommon.disconnectionNotification ( String p1, Object p2 ) [abstract]  :  void
BeanCommon.setLog ( Logger p1 ) [abstract]  :  void
BeanCommon.stop ( ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, BeanConnection.class
package weka.gui.beans
BeanConnection.associatedConnections ( Vector p1 ) [static]  :  Vector
BeanConnection.BeanConnection ( BeanInstance p1, BeanInstance p2, EventSetDescriptor p3 )
BeanConnection.doMetaConnection ( BeanInstance p1, BeanInstance p2, EventSetDescriptor p3, JComponent p4 ) [static]  :  void
BeanConnection.getClosestConnections ( Point p1, int p2 ) [static]  :  Vector
BeanConnection.getConnections ( ) [static]  :  Vector
BeanConnection.getEventName ( )  :  String
BeanConnection.getSource ( )  :  BeanInstance
BeanConnection.getSourceEventSetDescriptor ( )  :  EventSetDescriptor
BeanConnection.getTarget ( )  :  BeanInstance
BeanConnection.inputs ( Vector p1 ) [static]  :  Vector
BeanConnection.isHidden ( )  :  boolean
BeanConnection.outputs ( Vector p1 ) [static]  :  Vector
BeanConnection.paintConnections ( Graphics p1 ) [static]  :  void
BeanConnection.remove ( )  :  void
BeanConnection.removeConnections ( BeanInstance p1 ) [static]  :  void
BeanConnection.reset ( ) [static]  :  void
BeanConnection.setConnections ( Vector p1 ) [static]  :  void
BeanConnection.setHidden ( boolean p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, BeanInstance.class
package weka.gui.beans
BeanInstance.addAllBeansToContainer ( JComponent p1 ) [static]  :  void
BeanInstance.addBean ( JComponent p1 )  :  void
BeanInstance.BeanInstance ( JComponent p1, Object p2, int p3, int p4 )
BeanInstance.BeanInstance ( JComponent p1, String p2, int p3, int p4 )
BeanInstance.findInstance ( Point p1 ) [static]  :  BeanInstance
BeanInstance.findInstances ( Rectangle p1 ) [static]  :  Vector
BeanInstance.getBean ( )  :  Object
BeanInstance.getBeanInstances ( ) [static]  :  Vector
BeanInstance.getHeight ( )  :  int
BeanInstance.getWidth ( )  :  int
BeanInstance.getX ( )  :  int
BeanInstance.getY ( )  :  int
BeanInstance.paintLabels ( Graphics p1 ) [static]  :  void
BeanInstance.removeAllBeansFromContainer ( JComponent p1 ) [static]  :  void
BeanInstance.removeBean ( JComponent p1 )  :  void
BeanInstance.reset ( JComponent p1 ) [static]  :  void
BeanInstance.setBeanInstances ( Vector p1, JComponent p2 ) [static]  :  void
BeanInstance.setX ( int p1 )  :  void
BeanInstance.setXY ( int p1, int p2 )  :  void
BeanInstance.setY ( int p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, BeanLayout.class
package weka.gui.beans
KnowledgeFlowApp.BeanLayout.doLayout ( )  :  void
KnowledgeFlowApp.BeanLayout.KnowledgeFlowApp.BeanLayout ( KnowledgeFlowApp p1 )
KnowledgeFlowApp.BeanLayout.paintComponent ( Graphics p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, BeanVisual.class
package weka.gui.beans
BeanVisual.addPropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
BeanVisual.BeanVisual ( String p1, String p2, String p3 )
BeanVisual.getAnimatedIcon ( )  :  ImageIcon
BeanVisual.getAnimatedIconPath ( )  :  String
BeanVisual.getClosestConnectorPoint ( Point p1 )  :  Point
BeanVisual.getConnectorPoint ( int p1 )  :  Point
BeanVisual.getIconPath ( )  :  String
BeanVisual.getStaticIcon ( )  :  ImageIcon
BeanVisual.getText ( )  :  String
BeanVisual.loadIcons ( String p1, String p2 )  :  boolean
BeanVisual.paintComponent ( Graphics p1 )  :  void
BeanVisual.removePropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
BeanVisual.scale ( int p1 )  :  void
BeanVisual.setAnimated ( )  :  void
BeanVisual.setDisplayConnectors ( boolean p1 )  :  void
BeanVisual.setDisplayConnectors ( boolean p1, Color p2 )  :  void
BeanVisual.setStatic ( )  :  void
BeanVisual.setText ( String p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, BestFirst.class
package weka.attributeSelection
BestFirst.attributeList ( BitSet p1 )  :  int[ ]
BestFirst.BestFirst ( )
BestFirst.directionTipText ( )  :  String
BestFirst.getDirection ( )  :  SelectedTag
BestFirst.getLookupCacheSize ( )  :  int
BestFirst.getOptions ( )  :  String[ ]
BestFirst.getSearchTermination ( )  :  int
BestFirst.getStartSet ( )  :  String
BestFirst.globalInfo ( )  :  String
BestFirst.listOptions ( )  :  Enumeration
BestFirst.lookupCacheSizeTipText ( )  :  String
BestFirst.printGroup ( BitSet p1, int p2 )  :  void
BestFirst.resetOptions ( )  :  void
BestFirst.search ( attributeSelection.ASEvaluation p1, Instances p2 )  :  int[ ]
BestFirst.searchTerminationTipText ( )  :  String
BestFirst.setDirection ( SelectedTag p1 )  :  void
BestFirst.setLookupCacheSize ( int p1 )  :  void
BestFirst.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
BestFirst.setSearchTermination ( int p1 )  :  void
BestFirst.setStartSet ( String p1 )  :  void
BestFirst.startSetTipText ( )  :  String
BestFirst.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, BIFFormatException.class
package weka.gui.graphvisualizer
BIFFormatException.BIFFormatException ( String p1 )

cdk-1.0.1.jar, BIFParser.class
package weka.gui.graphvisualizer
BIFParser.BIFParser ( InputStream p1, FastVector p2, FastVector p3 )
BIFParser.BIFParser ( String p1, FastVector p2, FastVector p3 )
BIFParser.parse ( )  :  String
BIFParser.writeXMLBIF03 ( String p1, String p2, FastVector p3, FastVector p4 ) [static]  :  void

cdk-1.0.1.jar, BIFReader.class
package weka.classifiers.bayes.net
BIFReader.BIFReader ( )
BIFReader.divergence ( BayesNet p1 )  :  double
BIFReader.extraArcs ( BayesNet p1 )  :  int
BIFReader.getFileName ( )  :  String
BIFReader.getNode ( String p1 )  :  int
BIFReader.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
BIFReader.missingArcs ( BayesNet p1 )  :  int
BIFReader.processFile ( String p1 )  :  BIFReader
BIFReader.reversedArcs ( BayesNet p1 )  :  int
BIFReader.Sync ( BayesNet p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, BinarySMO.class
package weka.classifiers.functions
SMO.BinarySMO.buildClassifier ( Instances p1, int p2, int p3, boolean p4, int p5, int p6 )  :  void
SMO.BinarySMO.checkClassifier ( )  :  void
SMO.BinarySMO.examineExample ( int p1 )  :  boolean
SMO.BinarySMO.fitLogistic ( Instances p1, int p2, int p3, int p4, Random p5 )  :  void
SMO.BinarySMO.SMO.BinarySMO ( SMO p1 )
SMO.BinarySMO.SVMOutput ( int p1, Instance p2 )  :  double
SMO.BinarySMO.takeStep ( int p1, int p2, double p3 )  :  boolean
SMO.BinarySMO.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, BinarySparseInstance.class
package weka.core
BinarySparseInstance.BinarySparseInstance ( double p1, double[ ] p2 )
BinarySparseInstance.BinarySparseInstance ( double p1, int[ ] p2, int p3 )
BinarySparseInstance.BinarySparseInstance ( Instance p1 )
BinarySparseInstance.BinarySparseInstance ( int p1 )
BinarySparseInstance.BinarySparseInstance ( SparseInstance p1 )
BinarySparseInstance.copy ( )  :  Object
BinarySparseInstance.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
BinarySparseInstance.mergeInstance ( Instance p1 )  :  Instance
BinarySparseInstance.replaceMissingValues ( double[ ] p1 )  :  void
BinarySparseInstance.setValue ( int p1, double p2 )  :  void
BinarySparseInstance.setValueSparse ( int p1, double p2 )  :  void
BinarySparseInstance.toDoubleArray ( )  :  double[ ]
BinarySparseInstance.toString ( )  :  String
BinarySparseInstance.value ( int p1 )  :  double
BinarySparseInstance.valueSparse ( int p1 )  :  double

cdk-1.0.1.jar, BinC45ModelSelection.class
package weka.classifiers.trees.j48
BinC45ModelSelection.BinC45ModelSelection ( int p1, Instances p2 )
BinC45ModelSelection.cleanup ( )  :  void
BinC45ModelSelection.selectModel ( Instances p1 )  :  ClassifierSplitModel
BinC45ModelSelection.selectModel ( Instances p1, Instances p2 )  :  ClassifierSplitModel

cdk-1.0.1.jar, BinC45Split.class
package weka.classifiers.trees.j48
BinC45Split.attIndex ( )  :  int
BinC45Split.BinC45Split ( int p1, int p2, double p3 )
BinC45Split.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
BinC45Split.classProb ( int p1, Instance p2, int p3 )  :  double
BinC45Split.gainRatio ( )  :  double
BinC45Split.infoGain ( )  :  double
BinC45Split.leftSide ( Instances p1 )  :  String
BinC45Split.resetDistribution ( Instances p1 )  :  void
BinC45Split.rightSide ( int p1, Instances p2 )  :  String
BinC45Split.setSplitPoint ( Instances p1 )  :  void
BinC45Split.sourceExpression ( int p1, Instances p2 )  :  String
BinC45Split.weights ( Instance p1 )  :  double[ ]
BinC45Split.whichSubset ( Instance p1 )  :  int

cdk-1.0.1.jar, BIRCHCluster.class
package weka.datagenerators
BIRCHCluster.BIRCHCluster ( )
BIRCHCluster.defineDataFormat ( )  :  Instances
BIRCHCluster.generateExample ( )  :  Instance
BIRCHCluster.generateExamples ( )  :  Instances
BIRCHCluster.generateExamples ( Random p1, Instances p2 )  :  Instances
BIRCHCluster.generateFinished ( )  :  String
BIRCHCluster.generateStart ( )  :  String
BIRCHCluster.getDatasetFormat ( )  :  Instances
BIRCHCluster.getDistMult ( )  :  double
BIRCHCluster.getGridFlag ( )  :  boolean
BIRCHCluster.getInputOrder ( )  :  int
BIRCHCluster.getInstNums ( )  :  String
BIRCHCluster.getMaxInstNum ( )  :  int
BIRCHCluster.getMaxRadius ( )  :  double
BIRCHCluster.getMinInstNum ( )  :  int
BIRCHCluster.getMinRadius ( )  :  double
BIRCHCluster.getNoiseRate ( )  :  double
BIRCHCluster.getNumCycles ( )  :  int
BIRCHCluster.getOptions ( )  :  String[ ]
BIRCHCluster.getOrderedFlag ( )  :  boolean
BIRCHCluster.getPattern ( )  :  int
BIRCHCluster.getRadiuses ( )  :  String
BIRCHCluster.getRandom ( )  :  Random
BIRCHCluster.getSeed ( )  :  int
BIRCHCluster.getSineFlag ( )  :  boolean
BIRCHCluster.getSingleModeFlag ( )  :  boolean
BIRCHCluster.globalInfo ( )  :  String
BIRCHCluster.listOptions ( )  :  Enumeration
BIRCHCluster.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
BIRCHCluster.setDatasetFormat ( Instances p1 )  :  void
BIRCHCluster.setDefaultOptions ( )  :  void
BIRCHCluster.setDistMult ( double p1 )  :  void
BIRCHCluster.setInputOrder ( int p1 )  :  void
BIRCHCluster.setInstNums ( String p1 )  :  void
BIRCHCluster.setMaxInstNum ( int p1 )  :  void
BIRCHCluster.setMaxRadius ( double p1 )  :  void
BIRCHCluster.setMinInstNum ( int p1 )  :  void
BIRCHCluster.setMinRadius ( double p1 )  :  void
BIRCHCluster.setNoiseRate ( double p1 )  :  void
BIRCHCluster.setNumCycles ( int p1 )  :  void
BIRCHCluster.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
BIRCHCluster.setPattern ( int p1 )  :  void
BIRCHCluster.setRadiuses ( String p1 )  :  void
BIRCHCluster.setRandom ( Random p1 )  :  void
BIRCHCluster.setSeed ( int p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, BMAEstimator.class
package weka.classifiers.bayes.net.estimate
BMAEstimator.BMAEstimator ( )
BMAEstimator.estimateCPTs ( BayesNet p1 )  :  void
BMAEstimator.initCPTs ( BayesNet p1 )  :  void
BMAEstimator.isUseK2Prior ( )  :  boolean
BMAEstimator.setUseK2Prior ( boolean p1 )  :  void
BMAEstimator.updateClassifier ( BayesNet p1, Instance p2 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, Body.class
package weka.associations.tertius
Body.Body ( )
Body.Body ( Instances p1 )
Body.canKeep ( Instance p1, Literal p2 )  :  boolean
Body.isIncludedIn ( Rule p1 )  :  boolean
Body.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, BoundaryPanel.class
package weka.gui.boundaryvisualizer
BoundaryPanel.addActionListener ( ActionListener p1 )  :  void
BoundaryPanel.BoundaryPanel ( int p1, int p2 )
BoundaryPanel.computeMinMaxAtts ( )  :  void
BoundaryPanel.getColors ( )  :  FastVector
BoundaryPanel.getGeneratorSamplesBase ( )  :  double
BoundaryPanel.getNumSamplesPerRegion ( )  :  int
BoundaryPanel.getPlotTrainingData ( )  :  boolean
BoundaryPanel.initialize ( )  :  void
BoundaryPanel.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
BoundaryPanel.plotPoint ( int p1, int p2, double[ ] p3, boolean p4 )  :  void
BoundaryPanel.plotTrainingData ( )  :  void
BoundaryPanel.removeActionListener ( ActionListener p1 )  :  void
BoundaryPanel.replot ( )  :  void
BoundaryPanel.saveImage ( String p1 )  :  void
BoundaryPanel.setClassifier ( Classifier p1 )  :  void
BoundaryPanel.setColors ( FastVector p1 )  :  void
BoundaryPanel.setDataGenerator ( DataGenerator p1 )  :  void
BoundaryPanel.setGeneratorSamplesBase ( double p1 )  :  void
BoundaryPanel.setNumSamplesPerRegion ( int p1 )  :  void
BoundaryPanel.setPlotTrainingData ( boolean p1 )  :  void
BoundaryPanel.setTrainingData ( Instances p1 )  :  void
BoundaryPanel.setXAttribute ( int p1 )  :  void
BoundaryPanel.setYAttribute ( int p1 )  :  void
BoundaryPanel.start ( )  :  void
BoundaryPanel.stopPlotting ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, BoundaryPanelDistributed.class
package weka.gui.boundaryvisualizer
BoundaryPanelDistributed.addRemoteExperimentListener ( RemoteExperimentListener p1 )  :  void
BoundaryPanelDistributed.availableHost ( int p1 )  :  void
BoundaryPanelDistributed.BoundaryPanelDistributed ( int p1, int p2 )
BoundaryPanelDistributed.incrementFailed ( int p1 )  :  void
BoundaryPanelDistributed.incrementFinished ( )  :  void
BoundaryPanelDistributed.initialize ( )  :  void
BoundaryPanelDistributed.launchNext ( int p1, int p2 )  :  void
BoundaryPanelDistributed.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
BoundaryPanelDistributed.setRemoteHosts ( Vector p1 )  :  void
BoundaryPanelDistributed.start ( )  :  void
BoundaryPanelDistributed.waitingTask ( int p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, BoundaryVisualizer.class
package weka.gui.boundaryvisualizer
BoundaryVisualizer.BoundaryVisualizer ( )
BoundaryVisualizer.getInstances ( )  :  Instances
BoundaryVisualizer.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
BoundaryVisualizer.setClassifier ( Classifier p1 )  :  void
BoundaryVisualizer.setInstances ( Instances p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, BVDecompose.class
package weka.classifiers
BVDecompose.BVDecompose ( )
BVDecompose.decompose ( )  :  void
BVDecompose.getBias ( )  :  double
BVDecompose.getClassifier ( )  :  Classifier
BVDecompose.getClassIndex ( )  :  int
BVDecompose.getDataFileName ( )  :  String
BVDecompose.getDebug ( )  :  boolean
BVDecompose.getError ( )  :  double
BVDecompose.getOptions ( )  :  String[ ]
BVDecompose.getSeed ( )  :  int
BVDecompose.getSigma ( )  :  double
BVDecompose.getTrainIterations ( )  :  int
BVDecompose.getTrainPoolSize ( )  :  int
BVDecompose.getVariance ( )  :  double
BVDecompose.listOptions ( )  :  Enumeration
BVDecompose.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
BVDecompose.setClassifier ( Classifier p1 )  :  void
BVDecompose.setClassIndex ( int p1 )  :  void
BVDecompose.setDataFileName ( String p1 )  :  void
BVDecompose.setDebug ( boolean p1 )  :  void
BVDecompose.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
BVDecompose.setSeed ( int p1 )  :  void
BVDecompose.setTrainIterations ( int p1 )  :  void
BVDecompose.setTrainPoolSize ( int p1 )  :  void
BVDecompose.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, BVDecomposeSegCVSub.class
package weka.classifiers
BVDecomposeSegCVSub.BVDecomposeSegCVSub ( )
BVDecomposeSegCVSub.decompose ( )  :  void
BVDecomposeSegCVSub.findCentralTendencies ( double[ ] p1 )  :  Vector
BVDecomposeSegCVSub.getClassifier ( )  :  Classifier
BVDecomposeSegCVSub.getClassifyIterations ( )  :  int
BVDecomposeSegCVSub.getClassIndex ( )  :  int
BVDecomposeSegCVSub.getDataFileName ( )  :  String
BVDecomposeSegCVSub.getDebug ( )  :  boolean
BVDecomposeSegCVSub.getError ( )  :  double
BVDecomposeSegCVSub.getKWBias ( )  :  double
BVDecomposeSegCVSub.getKWSigma ( )  :  double
BVDecomposeSegCVSub.getKWVariance ( )  :  double
BVDecomposeSegCVSub.getOptions ( )  :  String[ ]
BVDecomposeSegCVSub.getP ( )  :  double
BVDecomposeSegCVSub.getSeed ( )  :  int
BVDecomposeSegCVSub.getTrainSize ( )  :  int
BVDecomposeSegCVSub.getWBias ( )  :  double
BVDecomposeSegCVSub.getWVariance ( )  :  double
BVDecomposeSegCVSub.listOptions ( )  :  Enumeration
BVDecomposeSegCVSub.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
BVDecomposeSegCVSub.randomize ( int[ ] p1, Random p2 )  :  void
BVDecomposeSegCVSub.setClassifier ( Classifier p1 )  :  void
BVDecomposeSegCVSub.setClassifyIterations ( int p1 )  :  void
BVDecomposeSegCVSub.setClassIndex ( int p1 )  :  void
BVDecomposeSegCVSub.setDataFileName ( String p1 )  :  void
BVDecomposeSegCVSub.setDebug ( boolean p1 )  :  void
BVDecomposeSegCVSub.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
BVDecomposeSegCVSub.setP ( double p1 )  :  void
BVDecomposeSegCVSub.setSeed ( int p1 )  :  void
BVDecomposeSegCVSub.setTrainSize ( int p1 )  :  void
BVDecomposeSegCVSub.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, C45Loader.class
package weka.core.converters
C45Loader.C45Loader ( )
C45Loader.getDataSet ( )  :  Instances
C45Loader.getFileDescription ( )  :  String
C45Loader.getFileExtension ( )  :  String
C45Loader.getNextInstance ( )  :  Instance
C45Loader.getStructure ( )  :  Instances
C45Loader.globalInfo ( )  :  String
C45Loader.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
C45Loader.reset ( )  :  void
C45Loader.retrieveFile ( )  :  File
C45Loader.setFile ( File p1 )  :  void
C45Loader.setSource ( File p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, C45ModelSelection.class
package weka.classifiers.trees.j48
C45ModelSelection.C45ModelSelection ( int p1, Instances p2 )
C45ModelSelection.cleanup ( )  :  void
C45ModelSelection.selectModel ( Instances p1 )  :  ClassifierSplitModel
C45ModelSelection.selectModel ( Instances p1, Instances p2 )  :  ClassifierSplitModel

cdk-1.0.1.jar, C45PruneableClassifierTree.class
package weka.classifiers.trees.j48
C45PruneableClassifierTree.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
C45PruneableClassifierTree.C45PruneableClassifierTree ( ModelSelection p1, boolean p2, float p3, boolean p4, boolean p5 )
C45PruneableClassifierTree.collapse ( )  :  void
C45PruneableClassifierTree.getNewTree ( Instances p1 )  :  ClassifierTree
C45PruneableClassifierTree.prune ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, C45PruneableDecList.class
package weka.classifiers.rules.part
C45PruneableDecList.buildDecList ( Instances p1, boolean p2 )  :  void
C45PruneableDecList.C45PruneableDecList ( ModelSelection p1, double p2, int p3 )
C45PruneableDecList.getEstimatedErrorsForLeaf ( )  :  double
C45PruneableDecList.getNewDecList ( Instances p1, boolean p2 )  :  ClassifierDecList
C45PruneableDecList.pruneEnd ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, C45Saver.class
package weka.core.converters
C45Saver.C45Saver ( )
C45Saver.getFileDescription ( )  :  String
C45Saver.getOptions ( )  :  String[ ]
C45Saver.globalInfo ( )  :  String
C45Saver.listOptions ( )  :  Enumeration
C45Saver.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
C45Saver.resetOptions ( )  :  void
C45Saver.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
C45Saver.writeBatch ( )  :  void
C45Saver.writeIncremental ( Instance p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, C45Split.class
package weka.classifiers.trees.j48
C45Split.attIndex ( )  :  int
C45Split.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
C45Split.C45Split ( int p1, int p2, double p3 )
C45Split.classProb ( int p1, Instance p2, int p3 )  :  double
C45Split.codingCost ( )  :  double
C45Split.gainRatio ( )  :  double
C45Split.infoGain ( )  :  double
C45Split.leftSide ( Instances p1 )  :  String
C45Split.minsAndMaxs ( Instances p1, double[ ][ ] p2, int p3 )  :  double[ ][ ]
C45Split.resetDistribution ( Instances p1 )  :  void
C45Split.rightSide ( int p1, Instances p2 )  :  String
C45Split.setSplitPoint ( Instances p1 )  :  void
C45Split.sourceExpression ( int p1, Instances p2 )  :  String
C45Split.weights ( Instance p1 )  :  double[ ]
C45Split.whichSubset ( Instance p1 )  :  int

cdk-1.0.1.jar, CachedKernel.class
package weka.classifiers.functions.supportVector
CachedKernel.CachedKernel ( Instances p1, int p2 )
CachedKernel.clean ( )  :  void
CachedKernel.dotProd ( Instance p1, Instance p2 )  :  double
CachedKernel.eval ( int p1, int p2, Instance p3 )  :  double
CachedKernel.evaluate ( int p1, int p2, Instance p3 ) [abstract]  :  double
CachedKernel.numCacheHits ( )  :  int
CachedKernel.numEvals ( )  :  int

cdk-1.0.1.jar, CacheTable.class
package weka.classifiers.lazy.kstar
KStarCache.CacheTable.clear ( )  :  void
KStarCache.CacheTable.containsKey ( double p1 )  :  boolean
KStarCache.CacheTable.getEntry ( double p1 )  :  KStarCache.TableEntry
KStarCache.CacheTable.insert ( double p1, double p2, double p3 )  :  void
KStarCache.CacheTable.isEmpty ( )  :  boolean
KStarCache.CacheTable.KStarCache.CacheTable ( KStarCache p1 )
KStarCache.CacheTable.KStarCache.CacheTable ( KStarCache p1, int p2, float p3 )
KStarCache.CacheTable.size ( )  :  int

cdk-1.0.1.jar, CDKUtilities.class
package org.openscience.cdk.tools
CDKUtilities.removeHydrogens ( IMolecule m ) [static]  :  void

cdk-1.0.1.jar, CfsSubsetEval.class
package weka.attributeSelection
CfsSubsetEval.buildEvaluator ( Instances p1 )  :  void
CfsSubsetEval.CfsSubsetEval ( )
CfsSubsetEval.evaluateSubset ( BitSet p1 )  :  double
CfsSubsetEval.getLocallyPredictive ( )  :  boolean
CfsSubsetEval.getMissingSeperate ( )  :  boolean
CfsSubsetEval.getOptions ( )  :  String[ ]
CfsSubsetEval.globalInfo ( )  :  String
CfsSubsetEval.listOptions ( )  :  Enumeration
CfsSubsetEval.locallyPredictiveTipText ( )  :  String
CfsSubsetEval.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
CfsSubsetEval.missingSeperateTipText ( )  :  String
CfsSubsetEval.postProcess ( int[ ] p1 )  :  int[ ]
CfsSubsetEval.resetOptions ( )  :  void
CfsSubsetEval.setLocallyPredictive ( boolean p1 )  :  void
CfsSubsetEval.setMissingSeperate ( boolean p1 )  :  void
CfsSubsetEval.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
CfsSubsetEval.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, ChangeDateFormat.class
package weka.filters.unsupervised.attribute
ChangeDateFormat.attributeIndexTipText ( )  :  String
ChangeDateFormat.ChangeDateFormat ( )
ChangeDateFormat.dateFormatTipText ( )  :  String
ChangeDateFormat.getAttributeIndex ( )  :  String
ChangeDateFormat.getDateFormat ( )  :  SimpleDateFormat
ChangeDateFormat.getOptions ( )  :  String[ ]
ChangeDateFormat.globalInfo ( )  :  String
ChangeDateFormat.input ( Instance p1 )  :  boolean
ChangeDateFormat.listOptions ( )  :  Enumeration
ChangeDateFormat.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
ChangeDateFormat.setAttributeIndex ( String p1 )  :  void
ChangeDateFormat.setDateFormat ( SimpleDateFormat p1 )  :  void
ChangeDateFormat.setDateFormat ( String p1 )  :  void
ChangeDateFormat.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
ChangeDateFormat.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ChartEvent.class
package weka.gui.beans
ChartEvent.ChartEvent ( Object p1 )
ChartEvent.ChartEvent ( Object p1, Vector p2, double p3, double p4, double[ ] p5, boolean p6 )
ChartEvent.getDataPoint ( )  :  double[ ]
ChartEvent.getLegendText ( )  :  Vector
ChartEvent.getMax ( )  :  double
ChartEvent.getMin ( )  :  double
ChartEvent.getReset ( )  :  boolean
ChartEvent.setDataPoint ( double[ ] p1 )  :  void
ChartEvent.setLegendText ( Vector p1 )  :  void
ChartEvent.setMax ( double p1 )  :  void
ChartEvent.setMin ( double p1 )  :  void
ChartEvent.setReset ( boolean p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ChartListener.class
package weka.gui.beans
ChartListener.acceptDataPoint ( ChartEvent p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, CheckClassifier.class
package weka.classifiers
CheckClassifier.addMissing ( Instances p1, int p2, boolean p3, boolean p4 )  :  void
CheckClassifier.canHandleMissing ( boolean p1, boolean p2, boolean p3, boolean p4, boolean p5, boolean p6, int p7 )  :  boolean[ ]
CheckClassifier.canHandleNClasses ( boolean p1, boolean p2, boolean p3, int p4 )  :  boolean[ ]
CheckClassifier.canHandleZeroTraining ( boolean p1, boolean p2, boolean p3, boolean p4 )  :  boolean[ ]
CheckClassifier.canPredict ( boolean p1, boolean p2, boolean p3, boolean p4 )  :  boolean[ ]
CheckClassifier.canTakeOptions ( )  :  boolean[ ]
CheckClassifier.CheckClassifier ( )
CheckClassifier.compareDatasets ( Instances p1, Instances p2 )  :  void
CheckClassifier.correctBuildInitialisation ( boolean p1, boolean p2, boolean p3, boolean p4 )  :  boolean[ ]
CheckClassifier.datasetIntegrity ( boolean p1, boolean p2, boolean p3, boolean p4, boolean p5, boolean p6 )  :  boolean[ ]
CheckClassifier.doesntUseTestClassVal ( boolean p1, boolean p2, boolean p3, boolean p4 )  :  boolean[ ]
CheckClassifier.doTests ( )  :  void
CheckClassifier.getClassifier ( )  :  Classifier
CheckClassifier.getDebug ( )  :  boolean
CheckClassifier.getNumInstances ( )  :  int
CheckClassifier.getOptions ( )  :  String[ ]
CheckClassifier.getSilent ( )  :  boolean
CheckClassifier.instanceWeights ( boolean p1, boolean p2, boolean p3, boolean p4 )  :  boolean[ ]
CheckClassifier.listOptions ( )  :  Enumeration
CheckClassifier.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
CheckClassifier.makeTestDataset ( int p1, int p2, int p3, int p4, int p5, int p6, boolean p7 )  :  Instances
CheckClassifier.print ( Object p1 )  :  void
CheckClassifier.printAttributeSummary ( boolean p1, boolean p2, boolean p3, boolean p4 )  :  void
CheckClassifier.println ( )  :  void
CheckClassifier.println ( Object p1 )  :  void
CheckClassifier.runBasicTest ( boolean p1, boolean p2, boolean p3, boolean p4, int p5, boolean p6, boolean p7, int p8, int p9, int p10, FastVector p11 )  :  boolean[ ]
CheckClassifier.setClassifier ( Classifier p1 )  :  void
CheckClassifier.setDebug ( boolean p1 )  :  void
CheckClassifier.setNumInstances ( int p1 )  :  void
CheckClassifier.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
CheckClassifier.setSilent ( boolean p1 )  :  void
CheckClassifier.testsPerClassType ( boolean p1, boolean p2, boolean p3 )  :  void
CheckClassifier.testWRTZeroR ( Classifier p1, Evaluation p2, Instances p3, Instances p4 )  :  boolean[ ]
CheckClassifier.updateableClassifier ( )  :  boolean[ ]
CheckClassifier.updatingEquality ( boolean p1, boolean p2, boolean p3, boolean p4 )  :  boolean[ ]
CheckClassifier.weightedInstancesHandler ( )  :  boolean[ ]

cdk-1.0.1.jar, CheckOptionHandler.class
package weka.core
CheckOptionHandler.CheckOptionHandler ( )
CheckOptionHandler.checkOptionHandler ( OptionHandler p1, String[ ] p2 ) [static]  :  void
CheckOptionHandler.compareOptions ( String[ ] p1, String[ ] p2 ) [static]  :  void
CheckOptionHandler.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
CheckOptionHandler.printOptions ( String[ ] p1 ) [static]  :  String

cdk-1.0.1.jar, ChisqMixture.class
package weka.classifiers.functions.pace
ChisqMixture.ChisqMixture ( )
ChisqMixture.f ( double p1 )  :  double
ChisqMixture.f ( DoubleVector p1 )  :  DoubleVector
ChisqMixture.fittingIntervals ( DoubleVector p1 )  :  PaceMatrix
ChisqMixture.getSeparatingThreshold ( )  :  double
ChisqMixture.getTrimingThreshold ( )  :  double
ChisqMixture.h ( double p1 )  :  double
ChisqMixture.h ( DoubleVector p1 )  :  DoubleVector
ChisqMixture.hf ( double p1 )  :  double
ChisqMixture.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
ChisqMixture.pace2 ( DoubleVector p1 )  :  DoubleVector
ChisqMixture.pace4 ( DoubleVector p1 )  :  DoubleVector
ChisqMixture.pace6 ( double p1 )  :  double
ChisqMixture.pace6 ( DoubleVector p1 )  :  DoubleVector
ChisqMixture.probabilityMatrix ( DoubleVector p1, PaceMatrix p2 )  :  PaceMatrix
ChisqMixture.separable ( DoubleVector p1, int p2, int p3, double p4 )  :  boolean
ChisqMixture.setSeparatingThreshold ( double p1 )  :  void
ChisqMixture.setTrimingThreshold ( double p1 )  :  void
ChisqMixture.supportPoints ( DoubleVector p1, int p2 )  :  DoubleVector
ChisqMixture.toString ( )  :  String
ChisqMixture.trim ( DoubleVector p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ChiSquaredAttributeEval.class
package weka.attributeSelection
ChiSquaredAttributeEval.binarizeNumericAttributesTipText ( )  :  String
ChiSquaredAttributeEval.buildEvaluator ( Instances p1 )  :  void
ChiSquaredAttributeEval.ChiSquaredAttributeEval ( )
ChiSquaredAttributeEval.evaluateAttribute ( int p1 )  :  double
ChiSquaredAttributeEval.getBinarizeNumericAttributes ( )  :  boolean
ChiSquaredAttributeEval.getMissingMerge ( )  :  boolean
ChiSquaredAttributeEval.getOptions ( )  :  String[ ]
ChiSquaredAttributeEval.globalInfo ( )  :  String
ChiSquaredAttributeEval.listOptions ( )  :  Enumeration
ChiSquaredAttributeEval.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
ChiSquaredAttributeEval.missingMergeTipText ( )  :  String
ChiSquaredAttributeEval.resetOptions ( )  :  void
ChiSquaredAttributeEval.setBinarizeNumericAttributes ( boolean p1 )  :  void
ChiSquaredAttributeEval.setMissingMerge ( boolean p1 )  :  void
ChiSquaredAttributeEval.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
ChiSquaredAttributeEval.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, CholeskyDecomposition.class
package weka.core.matrix
CholeskyDecomposition.CholeskyDecomposition ( Matrix p1 )
CholeskyDecomposition.getL ( )  :  Matrix
CholeskyDecomposition.isSPD ( )  :  boolean
CholeskyDecomposition.solve ( Matrix p1 )  :  Matrix

cdk-1.0.1.jar, CISearchAlgorithm.class
package weka.classifiers.bayes.net.search.ci
CISearchAlgorithm.CISearchAlgorithm ( )
CISearchAlgorithm.isConditionalIndependent ( int p1, int p2, int[ ] p3, int p4 )  :  boolean

cdk-1.0.1.jar, ClassAssigner.class
package weka.gui.beans
ClassAssigner.acceptDataSet ( DataSetEvent p1 )  :  void
ClassAssigner.acceptInstance ( InstanceEvent p1 )  :  void
ClassAssigner.acceptTestSet ( TestSetEvent p1 )  :  void
ClassAssigner.acceptTrainingSet ( TrainingSetEvent p1 )  :  void
ClassAssigner.addDataFormatListener ( DataFormatListener p1 )  :  void
ClassAssigner.addDataSourceListener ( DataSourceListener p1 )  :  void
ClassAssigner.addInstanceListener ( InstanceListener p1 )  :  void
ClassAssigner.addTestSetListener ( TestSetListener p1 )  :  void
ClassAssigner.addTrainingSetListener ( TrainingSetListener p1 )  :  void
ClassAssigner.ClassAssigner ( )
ClassAssigner.classColumnTipText ( )  :  String
ClassAssigner.connectionAllowed ( EventSetDescriptor p1 )  :  boolean
ClassAssigner.connectionAllowed ( String p1 )  :  boolean
ClassAssigner.connectionNotification ( String p1, Object p2 )  :  void
ClassAssigner.disconnectionNotification ( String p1, Object p2 )  :  void
ClassAssigner.eventGeneratable ( String p1 )  :  boolean
ClassAssigner.getClassColumn ( )  :  String
ClassAssigner.getConnectedFormat ( )  :  Instances
ClassAssigner.getVisual ( )  :  BeanVisual
ClassAssigner.globalInfo ( )  :  String
ClassAssigner.notifyDataFormatListeners ( )  :  void
ClassAssigner.notifyDataListeners ( DataSetEvent p1 )  :  void
ClassAssigner.notifyInstanceListeners ( InstanceEvent p1 )  :  void
ClassAssigner.notifyTestListeners ( TestSetEvent p1 )  :  void
ClassAssigner.notifyTrainingListeners ( TrainingSetEvent p1 )  :  void
ClassAssigner.removeDataFormatListener ( DataFormatListener p1 )  :  void
ClassAssigner.removeDataSourceListener ( DataSourceListener p1 )  :  void
ClassAssigner.removeInstanceListener ( InstanceListener p1 )  :  void
ClassAssigner.removeTestSetListener ( TestSetListener p1 )  :  void
ClassAssigner.removeTrainingSetListener ( TrainingSetListener p1 )  :  void
ClassAssigner.setClassColumn ( String p1 )  :  void
ClassAssigner.setLog ( Logger p1 )  :  void
ClassAssigner.setVisual ( BeanVisual p1 )  :  void
ClassAssigner.stop ( )  :  void
ClassAssigner.useDefaultVisual ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ClassAssignerBeanInfo.class
package weka.gui.beans
ClassAssignerBeanInfo.ClassAssignerBeanInfo ( )
ClassAssignerBeanInfo.getBeanDescriptor ( )  :  BeanDescriptor
ClassAssignerBeanInfo.getEventSetDescriptors ( )  :  EventSetDescriptor[ ]
ClassAssignerBeanInfo.getPropertyDescriptors ( )  :  PropertyDescriptor[ ]

cdk-1.0.1.jar, ClassAssignerCustomizer.class
package weka.gui.beans
ClassAssignerCustomizer.addPropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
ClassAssignerCustomizer.ClassAssignerCustomizer ( )
ClassAssignerCustomizer.customizerClosing ( )  :  void
ClassAssignerCustomizer.newDataFormat ( DataSetEvent p1 )  :  void
ClassAssignerCustomizer.removePropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
ClassAssignerCustomizer.setObject ( Object p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ClassificationViaRegression.class
package weka.classifiers.meta
ClassificationViaRegression.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
ClassificationViaRegression.ClassificationViaRegression ( )
ClassificationViaRegression.defaultClassifierString ( )  :  String
ClassificationViaRegression.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
ClassificationViaRegression.globalInfo ( )  :  String
ClassificationViaRegression.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
ClassificationViaRegression.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, Classifier.class
package weka.classifiers
Classifier.buildClassifier ( Instances p1 ) [abstract]  :  void
Classifier.Classifier ( )
Classifier.classifyInstance ( Instance p1 )  :  double
Classifier.debugTipText ( )  :  String
Classifier.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
Classifier.forName ( String p1, String[ ] p2 ) [static]  :  Classifier
Classifier.getDebug ( )  :  boolean
Classifier.getOptions ( )  :  String[ ]
Classifier.listOptions ( )  :  Enumeration
Classifier.makeCopies ( Classifier p1, int p2 ) [static]  :  Classifier[ ]
Classifier.makeCopy ( Classifier p1 ) [static]  :  Classifier
Classifier.setDebug ( boolean p1 )  :  void
Classifier.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
package weka.gui.beans
Classifier.acceptInstance ( InstanceEvent p1 )  :  void
Classifier.acceptTestSet ( TestSetEvent p1 )  :  void
Classifier.acceptTrainingSet ( TrainingSetEvent p1 )  :  void
Classifier.addBatchClassifierListener ( BatchClassifierListener p1 )  :  void
Classifier.addGraphListener ( GraphListener p1 )  :  void
Classifier.addIncrementalClassifierListener ( IncrementalClassifierListener p1 )  :  void
Classifier.addTextListener ( TextListener p1 )  :  void
Classifier.Classifier ( )
Classifier.connectionAllowed ( EventSetDescriptor p1 )  :  boolean
Classifier.connectionAllowed ( String p1 )  :  boolean
Classifier.connectionNotification ( String p1, Object p2 )  :  void
Classifier.disconnectionNotification ( String p1, Object p2 )  :  void
Classifier.enumerateRequests ( )  :  Enumeration
Classifier.eventGeneratable ( EventSetDescriptor p1 )  :  boolean
Classifier.eventGeneratable ( String p1 )  :  boolean
Classifier.getClassifier ( )  :  Classifier
Classifier.getUpdateIncrementalClassifier ( )  :  boolean
Classifier.getVisual ( )  :  BeanVisual
Classifier.getWrappedAlgorithm ( )  :  Object
Classifier.globalInfo ( )  :  String
Classifier.hasIncomingBatchInstances ( )  :  boolean
Classifier.hasIncomingStreamInstances ( )  :  boolean
Classifier.performRequest ( String p1 )  :  void
Classifier.removeBatchClassifierListener ( BatchClassifierListener p1 )  :  void
Classifier.removeGraphListener ( GraphListener p1 )  :  void
Classifier.removeIncrementalClassifierListener ( IncrementalClassifierListener p1 )  :  void
Classifier.removeTextListener ( TextListener p1 )  :  void
Classifier.setClassifier ( Classifier p1 )  :  void
Classifier.setLog ( Logger p1 )  :  void
Classifier.setUpdateIncrementalClassifier ( boolean p1 )  :  void
Classifier.setVisual ( BeanVisual p1 )  :  void
Classifier.setWrappedAlgorithm ( Object p1 )  :  void
Classifier.stop ( )  :  void
Classifier.useDefaultVisual ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ClassifierBeanInfo.class
package weka.gui.beans
ClassifierBeanInfo.ClassifierBeanInfo ( )
ClassifierBeanInfo.getBeanDescriptor ( )  :  BeanDescriptor
ClassifierBeanInfo.getEventSetDescriptors ( )  :  EventSetDescriptor[ ]

cdk-1.0.1.jar, ClassifierCustomizer.class
package weka.gui.beans
ClassifierCustomizer.addPropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
ClassifierCustomizer.ClassifierCustomizer ( )
ClassifierCustomizer.removePropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
ClassifierCustomizer.setObject ( Object p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ClassifierDecList.class
package weka.classifiers.rules.part
ClassifierDecList.buildDecList ( Instances p1, boolean p2 )  :  void
ClassifierDecList.buildRule ( Instances p1 )  :  void
ClassifierDecList.chooseIndex ( )  :  int
ClassifierDecList.chooseLastIndex ( )  :  int
ClassifierDecList.ClassifierDecList ( ModelSelection p1, int p2 )
ClassifierDecList.classifyInstance ( Instance p1 )  :  double
ClassifierDecList.cleanup ( Instances p1 )  :  void
ClassifierDecList.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
ClassifierDecList.getNewDecList ( Instances p1, boolean p2 )  :  ClassifierDecList
ClassifierDecList.getSizeOfBranch ( )  :  double
ClassifierDecList.localModel ( )  :  ClassifierSplitModel
ClassifierDecList.son ( int p1 )  :  ClassifierDecList
ClassifierDecList.toString ( )  :  String
ClassifierDecList.weight ( Instance p1 )  :  double

cdk-1.0.1.jar, ClassifierPanel.class
package weka.gui.explorer
ClassifierPanel.ClassifierPanel ( )
ClassifierPanel.loadClassifier ( )  :  void
ClassifierPanel.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
ClassifierPanel.predictionText ( Classifier p1, Instance p2, int p3 )  :  String
ClassifierPanel.processClassifierPrediction ( Instance p1, Classifier p2, Evaluation p3, FastVector p4, Instances p5, FastVector p6, FastVector p7 ) [static]  :  void
ClassifierPanel.reevaluateModel ( String p1, Classifier p2, Instances p3 )  :  void
ClassifierPanel.saveBuffer ( String p1 )  :  void
ClassifierPanel.saveClassifier ( String p1, Classifier p2, Instances p3 )  :  void
ClassifierPanel.setInstances ( Instances p1 )  :  void
ClassifierPanel.setLog ( Logger p1 )  :  void
ClassifierPanel.setTestSet ( )  :  void
ClassifierPanel.setUpVisualizableInstances ( Instances p1 ) [static]  :  Instances
ClassifierPanel.startClassifier ( )  :  void
ClassifierPanel.stopClassifier ( )  :  void
ClassifierPanel.updateRadioLinks ( )  :  void
ClassifierPanel.visualize ( String p1, int p2, int p3 )  :  void
ClassifierPanel.visualizeBayesNet ( String p1, String p2 )  :  void
ClassifierPanel.visualizeClassifierErrors ( VisualizePanel p1 )  :  void
ClassifierPanel.visualizeTree ( String p1, String p2 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ClassifierPerformanceEvaluator.class
package weka.gui.beans
ClassifierPerformanceEvaluator.acceptClassifier ( BatchClassifierEvent p1 )  :  void
ClassifierPerformanceEvaluator.addTextListener ( TextListener p1 )  :  void
ClassifierPerformanceEvaluator.addThresholdDataListener ( ThresholdDataListener p1 )  :  void
ClassifierPerformanceEvaluator.addVisualizableErrorListener ( VisualizableErrorListener p1 )  :  void
ClassifierPerformanceEvaluator.ClassifierPerformanceEvaluator ( )
ClassifierPerformanceEvaluator.enumerateRequests ( )  :  Enumeration
ClassifierPerformanceEvaluator.eventGeneratable ( String p1 )  :  boolean
ClassifierPerformanceEvaluator.globalInfo ( )  :  String
ClassifierPerformanceEvaluator.performRequest ( String p1 )  :  void
ClassifierPerformanceEvaluator.removeTextListener ( TextListener p1 )  :  void
ClassifierPerformanceEvaluator.removeThresholdDataListener ( ThresholdDataListener p1 )  :  void
ClassifierPerformanceEvaluator.removeVisualizableErrorListener ( VisualizableErrorListener p1 )  :  void
ClassifierPerformanceEvaluator.stop ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ClassifierPerformanceEvaluatorBeanInfo.class
package weka.gui.beans
ClassifierPerformanceEvaluatorBeanInfo.ClassifierPerformanceEvaluatorBeanInfo ( )
ClassifierPerformanceEvaluatorBeanInfo.getEventSetDescriptors ( )  :  EventSetDescriptor[ ]

cdk-1.0.1.jar, ClassifierSplitEvaluator.class
package weka.experiment
ClassifierSplitEvaluator.ClassifierSplitEvaluator ( )
ClassifierSplitEvaluator.classifierTipText ( )  :  String
ClassifierSplitEvaluator.enumerateMeasures ( )  :  Enumeration
ClassifierSplitEvaluator.getAttributeID ( )  :  int
ClassifierSplitEvaluator.getClassForIRStatistics ( )  :  int
ClassifierSplitEvaluator.getClassifier ( )  :  Classifier
ClassifierSplitEvaluator.getKey ( )  :  Object[ ]
ClassifierSplitEvaluator.getKeyNames ( )  :  String[ ]
ClassifierSplitEvaluator.getKeyTypes ( )  :  Object[ ]
ClassifierSplitEvaluator.getMeasure ( String p1 )  :  double
ClassifierSplitEvaluator.getOptions ( )  :  String[ ]
ClassifierSplitEvaluator.getPredTargetColumn ( )  :  boolean
ClassifierSplitEvaluator.getRawResultOutput ( )  :  String
ClassifierSplitEvaluator.getResult ( Instances p1, Instances p2 )  :  Object[ ]
ClassifierSplitEvaluator.getResultNames ( )  :  String[ ]
ClassifierSplitEvaluator.getResultTypes ( )  :  Object[ ]
ClassifierSplitEvaluator.globalInfo ( )  :  String
ClassifierSplitEvaluator.listOptions ( )  :  Enumeration
ClassifierSplitEvaluator.setAdditionalMeasures ( String[ ] p1 )  :  void
ClassifierSplitEvaluator.setAttributeID ( int p1 )  :  void
ClassifierSplitEvaluator.setClassForIRStatistics ( int p1 )  :  void
ClassifierSplitEvaluator.setClassifier ( Classifier p1 )  :  void
ClassifierSplitEvaluator.setClassifierName ( String p1 )  :  void
ClassifierSplitEvaluator.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
ClassifierSplitEvaluator.setPredTargetColumn ( boolean p1 )  :  void
ClassifierSplitEvaluator.toString ( )  :  String
ClassifierSplitEvaluator.updateOptions ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ClassifierSplitModel.class
package weka.classifiers.trees.j48
ClassifierSplitModel.buildClassifier ( Instances p1 ) [abstract]  :  void
ClassifierSplitModel.checkModel ( )  :  boolean
ClassifierSplitModel.ClassifierSplitModel ( )
ClassifierSplitModel.classifyInstance ( Instance p1 )  :  double
ClassifierSplitModel.classProb ( int p1, Instance p2, int p3 )  :  double
ClassifierSplitModel.classProbLaplace ( int p1, Instance p2, int p3 )  :  double
ClassifierSplitModel.clone ( )  :  Object
ClassifierSplitModel.codingCost ( )  :  double
ClassifierSplitModel.distribution ( )  :  Distribution
ClassifierSplitModel.dumpLabel ( int p1, Instances p2 )  :  String
ClassifierSplitModel.dumpModel ( Instances p1 )  :  String
ClassifierSplitModel.leftSide ( Instances p1 ) [abstract]  :  String
ClassifierSplitModel.numSubsets ( )  :  int
ClassifierSplitModel.resetDistribution ( Instances p1 )  :  void
ClassifierSplitModel.rightSide ( int p1, Instances p2 ) [abstract]  :  String
ClassifierSplitModel.sourceClass ( int p1, Instances p2 )  :  String
ClassifierSplitModel.sourceExpression ( int p1, Instances p2 ) [abstract]  :  String
ClassifierSplitModel.split ( Instances p1 )  :  Instances[ ]
ClassifierSplitModel.weights ( Instance p1 ) [abstract]  :  double[ ]
ClassifierSplitModel.whichSubset ( Instance p1 ) [abstract]  :  int

cdk-1.0.1.jar, ClassifierSubsetEval.class
package weka.attributeSelection
ClassifierSubsetEval.buildEvaluator ( Instances p1 )  :  void
ClassifierSubsetEval.ClassifierSubsetEval ( )
ClassifierSubsetEval.classifierTipText ( )  :  String
ClassifierSubsetEval.evaluateSubset ( BitSet p1 )  :  double
ClassifierSubsetEval.evaluateSubset ( BitSet p1, Instance p2, boolean p3 )  :  double
ClassifierSubsetEval.evaluateSubset ( BitSet p1, Instances p2 )  :  double
ClassifierSubsetEval.getClassifier ( )  :  Classifier
ClassifierSubsetEval.getHoldOutFile ( )  :  File
ClassifierSubsetEval.getOptions ( )  :  String[ ]
ClassifierSubsetEval.getUseTraining ( )  :  boolean
ClassifierSubsetEval.globalInfo ( )  :  String
ClassifierSubsetEval.holdOutFileTipText ( )  :  String
ClassifierSubsetEval.listOptions ( )  :  Enumeration
ClassifierSubsetEval.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
ClassifierSubsetEval.resetOptions ( )  :  void
ClassifierSubsetEval.setClassifier ( Classifier p1 )  :  void
ClassifierSubsetEval.setHoldOutFile ( File p1 )  :  void
ClassifierSubsetEval.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
ClassifierSubsetEval.setUseTraining ( boolean p1 )  :  void
ClassifierSubsetEval.toString ( )  :  String
ClassifierSubsetEval.useTrainingTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, ClassifierTree.class
package weka.classifiers.trees.j48
ClassifierTree.assignIDs ( int p1 )  :  int
ClassifierTree.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
ClassifierTree.buildTree ( Instances p1, boolean p2 )  :  void
ClassifierTree.buildTree ( Instances p1, Instances p2, boolean p3 )  :  void
ClassifierTree.ClassifierTree ( ModelSelection p1 )
ClassifierTree.classifyInstance ( Instance p1 )  :  double
ClassifierTree.cleanup ( Instances p1 )  :  void
ClassifierTree.distributionForInstance ( Instance p1, boolean p2 )  :  double[ ]
ClassifierTree.getNewTree ( Instances p1 )  :  ClassifierTree
ClassifierTree.getNewTree ( Instances p1, Instances p2 )  :  ClassifierTree
ClassifierTree.graph ( )  :  String
ClassifierTree.graphType ( )  :  int
ClassifierTree.nextID ( ) [static]  :  long
ClassifierTree.numLeaves ( )  :  int
ClassifierTree.numNodes ( )  :  int
ClassifierTree.prefix ( )  :  String
ClassifierTree.resetID ( ) [static]  :  void
ClassifierTree.toSource ( String p1 )  :  StringBuffer[ ]
ClassifierTree.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, ClassOrder.class
package weka.filters.supervised.attribute
ClassOrder.batchFinished ( )  :  boolean
ClassOrder.ClassOrder ( )
ClassOrder.classOrderTipText ( )  :  String
ClassOrder.distributionsByOriginalIndex ( double[ ] p1 )  :  double[ ]
ClassOrder.getClassCounts ( )  :  double[ ]
ClassOrder.getClassOrder ( )  :  int
ClassOrder.getOptions ( )  :  String[ ]
ClassOrder.getSeed ( )  :  long
ClassOrder.globalInfo ( )  :  String
ClassOrder.input ( Instance p1 )  :  boolean
ClassOrder.listOptions ( )  :  Enumeration
ClassOrder.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
ClassOrder.originalValue ( double p1 )  :  double
ClassOrder.seedTipText ( )  :  String
ClassOrder.setClassOrder ( int p1 )  :  void
ClassOrder.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
ClassOrder.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
ClassOrder.setSeed ( long p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ClassPanel.class
package weka.gui.visualize
ClassPanel.addActionListener ( ActionListener p1 )  :  void
ClassPanel.addRepaintNotify ( Component p1 )  :  void
ClassPanel.ClassPanel ( )
ClassPanel.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
ClassPanel.paintComponent ( Graphics p1 )  :  void
ClassPanel.paintNominal ( Graphics p1 )  :  void
ClassPanel.paintNumeric ( Graphics p1 )  :  void
ClassPanel.setCindex ( int p1 )  :  void
ClassPanel.setColours ( FastVector p1 )  :  void
ClassPanel.setInstances ( Instances p1 )  :  void
ClassPanel.setNominal ( )  :  void
ClassPanel.setNumeric ( )  :  void
ClassPanel.setOn ( boolean p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ClassValuePicker.class
package weka.gui.beans
ClassValuePicker.acceptDataSet ( DataSetEvent p1 )  :  void
ClassValuePicker.addDataFormatListener ( DataFormatListener p1 )  :  void
ClassValuePicker.addDataSourceListener ( DataSourceListener p1 )  :  void
ClassValuePicker.ClassValuePicker ( )
ClassValuePicker.connectionAllowed ( EventSetDescriptor p1 )  :  boolean
ClassValuePicker.connectionAllowed ( String p1 )  :  boolean
ClassValuePicker.connectionNotification ( String p1, Object p2 )  :  void
ClassValuePicker.disconnectionNotification ( String p1, Object p2 )  :  void
ClassValuePicker.eventGeneratable ( String p1 )  :  boolean
ClassValuePicker.getClassValueIndex ( )  :  int
ClassValuePicker.getConnectedFormat ( )  :  Instances
ClassValuePicker.getVisual ( )  :  BeanVisual
ClassValuePicker.globalInfo ( )  :  String
ClassValuePicker.notifyDataFormatListeners ( )  :  void
ClassValuePicker.notifyDataListeners ( DataSetEvent p1 )  :  void
ClassValuePicker.removeDataFormatListener ( DataFormatListener p1 )  :  void
ClassValuePicker.removeDataSourceListener ( DataSourceListener p1 )  :  void
ClassValuePicker.setClassValueIndex ( int p1 )  :  void
ClassValuePicker.setLog ( Logger p1 )  :  void
ClassValuePicker.setVisual ( BeanVisual p1 )  :  void
ClassValuePicker.stop ( )  :  void
ClassValuePicker.useDefaultVisual ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ClassValuePickerBeanInfo.class
package weka.gui.beans
ClassValuePickerBeanInfo.ClassValuePickerBeanInfo ( )
ClassValuePickerBeanInfo.getBeanDescriptor ( )  :  BeanDescriptor
ClassValuePickerBeanInfo.getEventSetDescriptors ( )  :  EventSetDescriptor[ ]
ClassValuePickerBeanInfo.getPropertyDescriptors ( )  :  PropertyDescriptor[ ]

cdk-1.0.1.jar, ClassValuePickerCustomizer.class
package weka.gui.beans
ClassValuePickerCustomizer.addPropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
ClassValuePickerCustomizer.ClassValuePickerCustomizer ( )
ClassValuePickerCustomizer.customizerClosing ( )  :  void
ClassValuePickerCustomizer.newDataFormat ( DataSetEvent p1 )  :  void
ClassValuePickerCustomizer.removePropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
ClassValuePickerCustomizer.setObject ( Object p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, Clusterer.class
package weka.clusterers
Clusterer.buildClusterer ( Instances p1 ) [abstract]  :  void
Clusterer.Clusterer ( )
Clusterer.clusterInstance ( Instance p1 )  :  int
Clusterer.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
Clusterer.forName ( String p1, String[ ] p2 ) [static]  :  Clusterer
Clusterer.makeCopies ( Clusterer p1, int p2 ) [static]  :  Clusterer[ ]
Clusterer.numberOfClusters ( ) [abstract]  :  int
package weka.gui.beans
Clusterer.acceptTestSet ( TestSetEvent p1 )  :  void
Clusterer.acceptTrainingSet ( TrainingSetEvent p1 )  :  void
Clusterer.addBatchClustererListener ( BatchClustererListener p1 )  :  void
Clusterer.addGraphListener ( GraphListener p1 )  :  void
Clusterer.addTextListener ( TextListener p1 )  :  void
Clusterer.Clusterer ( )
Clusterer.connectionAllowed ( EventSetDescriptor p1 )  :  boolean
Clusterer.connectionAllowed ( String p1 )  :  boolean
Clusterer.connectionNotification ( String p1, Object p2 )  :  void
Clusterer.disconnectionNotification ( String p1, Object p2 )  :  void
Clusterer.enumerateRequests ( )  :  Enumeration
Clusterer.eventGeneratable ( EventSetDescriptor p1 )  :  boolean
Clusterer.eventGeneratable ( String p1 )  :  boolean
Clusterer.getClusterer ( )  :  Clusterer
Clusterer.getVisual ( )  :  BeanVisual
Clusterer.getWrappedAlgorithm ( )  :  Object
Clusterer.globalInfo ( )  :  String
Clusterer.hasIncomingBatchInstances ( )  :  boolean
Clusterer.performRequest ( String p1 )  :  void
Clusterer.removeBatchClustererListener ( BatchClustererListener p1 )  :  void
Clusterer.removeGraphListener ( GraphListener p1 )  :  void
Clusterer.removeTextListener ( TextListener p1 )  :  void
Clusterer.setClusterer ( Clusterer p1 )  :  void
Clusterer.setLog ( Logger p1 )  :  void
Clusterer.setVisual ( BeanVisual p1 )  :  void
Clusterer.setWrappedAlgorithm ( Object p1 )  :  void
Clusterer.stop ( )  :  void
Clusterer.useDefaultVisual ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ClustererBeanInfo.class
package weka.gui.beans
ClustererBeanInfo.ClustererBeanInfo ( )
ClustererBeanInfo.getBeanDescriptor ( )  :  BeanDescriptor
ClustererBeanInfo.getEventSetDescriptors ( )  :  EventSetDescriptor[ ]

cdk-1.0.1.jar, ClustererCustomizer.class
package weka.gui.beans
ClustererCustomizer.addPropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
ClustererCustomizer.ClustererCustomizer ( )
ClustererCustomizer.removePropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
ClustererCustomizer.setObject ( Object p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ClustererPanel.class
package weka.gui.explorer
ClustererPanel.ClustererPanel ( )
ClustererPanel.loadClusterer ( )  :  void
ClustererPanel.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
ClustererPanel.reevaluateModel ( String p1, Clusterer p2, Instances p3, int[ ] p4 )  :  void
ClustererPanel.saveBuffer ( String p1 )  :  void
ClustererPanel.saveClusterer ( String p1, Clusterer p2, Instances p3, int[ ] p4 )  :  void
ClustererPanel.setInstances ( Instances p1 )  :  void
ClustererPanel.setLog ( Logger p1 )  :  void
ClustererPanel.setTestSet ( )  :  void
ClustererPanel.setUpVisualizableInstances ( Instances p1, ClusterEvaluation p2 ) [static]  :  PlotData2D
ClustererPanel.startClusterer ( )  :  void
ClustererPanel.stopClusterer ( )  :  void
ClustererPanel.updateRadioLinks ( )  :  void
ClustererPanel.visualizeClusterAssignments ( VisualizePanel p1 )  :  void
ClustererPanel.visualizeClusterer ( String p1, int p2, int p3 )  :  void
ClustererPanel.visualizeTree ( String p1, String p2 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ClustererPerformanceEvaluator.class
package weka.gui.beans
ClustererPerformanceEvaluator.acceptClusterer ( BatchClustererEvent p1 )  :  void
ClustererPerformanceEvaluator.addTextListener ( TextListener p1 )  :  void
ClustererPerformanceEvaluator.ClustererPerformanceEvaluator ( )
ClustererPerformanceEvaluator.enumerateRequests ( )  :  Enumeration
ClustererPerformanceEvaluator.eventGeneratable ( String p1 )  :  boolean
ClustererPerformanceEvaluator.globalInfo ( )  :  String
ClustererPerformanceEvaluator.performRequest ( String p1 )  :  void
ClustererPerformanceEvaluator.removeTextListener ( TextListener p1 )  :  void
ClustererPerformanceEvaluator.stop ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ClustererPerformanceEvaluatorBeanInfo.class
package weka.gui.beans
ClustererPerformanceEvaluatorBeanInfo.ClustererPerformanceEvaluatorBeanInfo ( )
ClustererPerformanceEvaluatorBeanInfo.getEventSetDescriptors ( )  :  EventSetDescriptor[ ]

cdk-1.0.1.jar, ClusterEvaluation.class
package weka.clusterers
ClusterEvaluation.ClusterEvaluation ( )
ClusterEvaluation.clusterResultsToString ( )  :  String
ClusterEvaluation.crossValidateModel ( DensityBasedClusterer p1, Instances p2, int p3, Random p4 ) [static]  :  double
ClusterEvaluation.crossValidateModel ( String p1, Instances p2, int p3, String[ ] p4, Random p5 ) [static]  :  String
ClusterEvaluation.evaluateClusterer ( Clusterer p1, String[ ] p2 ) [static]  :  String
ClusterEvaluation.evaluateClusterer ( Instances p1 )  :  void
ClusterEvaluation.getClassesToClusters ( )  :  int[ ]
ClusterEvaluation.getClusterAssignments ( )  :  double[ ]
ClusterEvaluation.getLogLikelihood ( )  :  double
ClusterEvaluation.getNumClusters ( )  :  int
ClusterEvaluation.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
ClusterEvaluation.setClusterer ( Clusterer p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ClusterGenerator.class
package weka.datagenerators
ClusterGenerator.ClusterGenerator ( )
ClusterGenerator.getClassFlag ( )  :  boolean
ClusterGenerator.getDebug ( )  :  boolean
ClusterGenerator.getFormat ( )  :  Instances
ClusterGenerator.getNumAttributes ( )  :  int
ClusterGenerator.getNumClusters ( )  :  int
ClusterGenerator.getNumExamplesAct ( )  :  int
ClusterGenerator.getOutput ( )  :  PrintWriter
ClusterGenerator.getRelationName ( )  :  String
ClusterGenerator.makeData ( ClusterGenerator p1, String[ ] p2 ) [static]  :  void
ClusterGenerator.setClassFlag ( boolean p1 )  :  void
ClusterGenerator.setDebug ( boolean p1 )  :  void
ClusterGenerator.setFormat ( Instances p1 )  :  void
ClusterGenerator.setNumAttributes ( int p1 )  :  void
ClusterGenerator.setNumClusters ( int p1 )  :  void
ClusterGenerator.setNumExamplesAct ( int p1 )  :  void
ClusterGenerator.setOutput ( PrintWriter p1 )  :  void
ClusterGenerator.setRelationName ( String p1 )  :  void
ClusterGenerator.toStringFormat ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, ClusterMembership.class
package weka.filters.unsupervised.attribute
ClusterMembership.batchFinished ( )  :  boolean
ClusterMembership.clustererTipText ( )  :  String
ClusterMembership.ClusterMembership ( )
ClusterMembership.convertInstance ( Instance p1 )  :  void
ClusterMembership.getDensityBasedClusterer ( )  :  DensityBasedClusterer
ClusterMembership.getIgnoredAttributeIndices ( )  :  String
ClusterMembership.getOptions ( )  :  String[ ]
ClusterMembership.globalInfo ( )  :  String
ClusterMembership.ignoredAttributeIndicesTipText ( )  :  String
ClusterMembership.input ( Instance p1 )  :  boolean
ClusterMembership.listOptions ( )  :  Enumeration
ClusterMembership.logs2densities ( int p1, Instance p2 )  :  double[ ]
ClusterMembership.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
ClusterMembership.setDensityBasedClusterer ( DensityBasedClusterer p1 )  :  void
ClusterMembership.setIgnoredAttributeIndices ( String p1 )  :  void
ClusterMembership.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
ClusterMembership.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, CNNClassificationModel.class
package org.openscience.cdk.qsar.model.R
CNNClassificationModel.build ( )  :  void
CNNClassificationModel.CNNClassificationModel ( )
CNNClassificationModel.CNNClassificationModel ( double[ ][ ] x, String[ ] y, int size )
CNNClassificationModel.CNNClassificationModel ( double[ ][ ] x, String[ ][ ] y, int size )
CNNClassificationModel.getFitFitted ( )  :  double[ ][ ]
CNNClassificationModel.getFitHessian ( )  :  double[ ][ ]
CNNClassificationModel.getFitResiduals ( )  :  double[ ][ ]
CNNClassificationModel.getFitValue ( )  :  double
CNNClassificationModel.getFitWeights ( )  :  double[ ]
CNNClassificationModel.getPredictPredictedClass ( )  :  String[ ]
CNNClassificationModel.getPredictPredictedRaw ( )  :  double[ ][ ]
CNNClassificationModel.loadModel ( String fileName )  :  void
CNNClassificationModel.loadModel ( String serializedModel, String modelName )  :  void
CNNClassificationModel.predict ( )  :  void
CNNClassificationModel.setParameters ( String key, Object obj )  :  void

cdk-1.0.1.jar, CNNClassificationModelFit.class
package org.openscience.cdk.qsar.model.R
CNNClassificationModelFit.CNNClassificationModelFit ( int noutput, int nobs, double[ ] weights, double[ ] fitted, double[ ] residual, double value )
CNNClassificationModelFit.CNNClassificationModelFit ( int noutput, int nobs, double[ ] weights, double[ ] fitted, double[ ] residual, double value, double[ ] hessian )
CNNClassificationModelFit.getFitted ( )  :  double[ ][ ]
CNNClassificationModelFit.getHessian ( )  :  double[ ][ ]
CNNClassificationModelFit.getResiduals ( )  :  double[ ][ ]
CNNClassificationModelFit.getValue ( )  :  double
CNNClassificationModelFit.getWeights ( )  :  double[ ]
CNNClassificationModelFit.setFitted ( double[ ][ ] fitted )  :  void
CNNClassificationModelFit.setHessian ( double[ ][ ] theHessian )  :  void
CNNClassificationModelFit.setResiduals ( double[ ][ ] residuals )  :  void
CNNClassificationModelFit.setValue ( double value )  :  void
CNNClassificationModelFit.setWeights ( double[ ] weights )  :  void

cdk-1.0.1.jar, CNNClassificationModelPredict.class
package org.openscience.cdk.qsar.model.R
CNNClassificationModelPredict.CNNClassificationModelPredict ( int noutput, double values )
CNNClassificationModelPredict.CNNClassificationModelPredict ( int noutput, double[ ] values )
CNNClassificationModelPredict.CNNClassificationModelPredict ( String values )
CNNClassificationModelPredict.CNNClassificationModelPredict ( String[ ] values )
CNNClassificationModelPredict.getPredictedClass ( )  :  String[ ]
CNNClassificationModelPredict.getPredictedRaw ( )  :  double[ ][ ]
CNNClassificationModelPredict.setPredictedRaw ( double[ ][ ] predicted )  :  void

cdk-1.0.1.jar, CNNRegressionModel.class
package org.openscience.cdk.qsar.model.R
CNNRegressionModel.build ( )  :  void
CNNRegressionModel.CNNRegressionModel ( )
CNNRegressionModel.CNNRegressionModel ( double[ ][ ] x, double[ ] y, int size )
CNNRegressionModel.CNNRegressionModel ( double[ ][ ] x, double[ ][ ] y, int size )
CNNRegressionModel.getFitFitted ( )  :  double[ ][ ]
CNNRegressionModel.getFitHessian ( )  :  double[ ][ ]
CNNRegressionModel.getFitResiduals ( )  :  double[ ][ ]
CNNRegressionModel.getFitValue ( )  :  double
CNNRegressionModel.getFitWeights ( )  :  double[ ]
CNNRegressionModel.getPredictPredicted ( )  :  double[ ][ ]
CNNRegressionModel.loadModel ( String fileName )  :  void
CNNRegressionModel.loadModel ( String serializedModel, String modelName )  :  void
CNNRegressionModel.predict ( )  :  void
CNNRegressionModel.setParameters ( String key, Object obj )  :  void
CNNRegressionModel.summary ( )  :  R.CNNRegressionModelSummary
package org.openscience.cdk.qsar.model.R2
CNNRegressionModel.build ( )  :  void
CNNRegressionModel.CNNRegressionModel ( )
CNNRegressionModel.CNNRegressionModel ( double[ ][ ] x, double[ ] y, int size )
CNNRegressionModel.CNNRegressionModel ( double[ ][ ] x, double[ ][ ] y, int size )
CNNRegressionModel.getCensored ( )  :  JRI.RBool
CNNRegressionModel.getConn ( )  :  double[ ]
CNNRegressionModel.getDecay ( )  :  double
CNNRegressionModel.getEntropy ( )  :  JRI.RBool
CNNRegressionModel.getFittedValues ( )  :  double[ ][ ]
CNNRegressionModel.getN ( )  :  double[ ]
CNNRegressionModel.getNconn ( )  :  double[ ]
CNNRegressionModel.getNsunits ( )  :  double
CNNRegressionModel.getNunits ( )  :  double
CNNRegressionModel.getPredictions ( )  :  double[ ][ ]
CNNRegressionModel.getResiduals ( )  :  double[ ][ ]
CNNRegressionModel.getSoftmax ( )  :  JRI.RBool
CNNRegressionModel.getValue ( )  :  double
CNNRegressionModel.getWts ( )  :  double[ ]
CNNRegressionModel.loadModel ( String fileName )  :  void
CNNRegressionModel.loadModel ( String serializedModel, String modelName )  :  void
CNNRegressionModel.predict ( )  :  void
CNNRegressionModel.setParameters ( String key, Object obj )  :  void
CNNRegressionModel.summary ( )  :  JRI.RList

cdk-1.0.1.jar, CNNRegressionModelFit.class
package org.openscience.cdk.qsar.model.R
CNNRegressionModelFit.CNNRegressionModelFit ( int noutput, int nobs, double[ ] weights, double[ ] fitted, double[ ] residual, double value )
CNNRegressionModelFit.CNNRegressionModelFit ( int noutput, int nobs, double[ ] weights, double[ ] fitted, double[ ] residual, double value, double[ ] hessian )
CNNRegressionModelFit.getFitted ( )  :  double[ ][ ]
CNNRegressionModelFit.getHessian ( )  :  double[ ][ ]
CNNRegressionModelFit.getResiduals ( )  :  double[ ][ ]
CNNRegressionModelFit.getValue ( )  :  double
CNNRegressionModelFit.getWeights ( )  :  double[ ]
CNNRegressionModelFit.setFitted ( double[ ][ ] fitted )  :  void
CNNRegressionModelFit.setHessian ( double[ ][ ] theHessian )  :  void
CNNRegressionModelFit.setResiduals ( double[ ][ ] residuals )  :  void
CNNRegressionModelFit.setValue ( double value )  :  void
CNNRegressionModelFit.setWeights ( double[ ] weights )  :  void

cdk-1.0.1.jar, CNNRegressionModelPredict.class
package org.openscience.cdk.qsar.model.R
CNNRegressionModelPredict.CNNRegressionModelPredict ( int noutput, double values )
CNNRegressionModelPredict.CNNRegressionModelPredict ( int noutput, double[ ] values )
CNNRegressionModelPredict.getPredicted ( )  :  double[ ][ ]
CNNRegressionModelPredict.setPredicted ( double[ ][ ] predicted )  :  void

cdk-1.0.1.jar, CNNRegressionModelSummary.class
package org.openscience.cdk.qsar.model.R
CNNRegressionModelSummary.CNNRegressionModelSummary ( double[ ] n, boolean entropy, boolean softmax, boolean censored, double value, double[ ] residuals )
CNNRegressionModelSummary.CNNRegressionModelSummary ( int[ ] n, boolean entropy, boolean softmax, boolean censored, double value, double[ ] residuals )
CNNRegressionModelSummary.getCensored ( )  :  boolean
CNNRegressionModelSummary.getEntropy ( )  :  boolean
CNNRegressionModelSummary.getNumNeurons ( )  :  int[ ]
CNNRegressionModelSummary.getResiduals ( )  :  double[ ]
CNNRegressionModelSummary.getSoftmax ( )  :  boolean
CNNRegressionModelSummary.getValue ( )  :  double

cdk-1.0.1.jar, Cobweb.class
package weka.clusterers
Cobweb.acuityTipText ( )  :  String
Cobweb.addInstance ( Instance p1 )  :  void
Cobweb.buildClusterer ( Instances p1 )  :  void
Cobweb.clusterInstance ( Instance p1 )  :  int
Cobweb.Cobweb ( )
Cobweb.cutoffTipText ( )  :  String
Cobweb.getAcuity ( )  :  double
Cobweb.getCutoff ( )  :  double
Cobweb.getOptions ( )  :  String[ ]
Cobweb.getSaveInstanceData ( )  :  boolean
Cobweb.graph ( )  :  String
Cobweb.graphType ( )  :  int
Cobweb.listOptions ( )  :  Enumeration
Cobweb.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Cobweb.numberOfClusters ( )  :  int
Cobweb.saveInstanceDataTipText ( )  :  String
Cobweb.setAcuity ( double p1 )  :  void
Cobweb.setCutoff ( double p1 )  :  void
Cobweb.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
Cobweb.setSaveInstanceData ( boolean p1 )  :  void
Cobweb.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, Colors.class
package weka.gui.treevisualizer
Colors.Colors ( )

cdk-1.0.1.jar, Committee.class
package weka.classifiers.meta
RacedIncrementalLogitBoost.Committee.boost ( Instances p1 )  :  Classifier[ ]
RacedIncrementalLogitBoost.Committee.chunkSize ( )  :  int
RacedIncrementalLogitBoost.Committee.classifyInstance ( double[ ] p1 )  :  double
RacedIncrementalLogitBoost.Committee.classifyInstance ( Instance p1 )  :  double
RacedIncrementalLogitBoost.Committee.committeeSize ( )  :  int
RacedIncrementalLogitBoost.Committee.distributionForInstance ( double[ ] p1 )  :  double[ ]
RacedIncrementalLogitBoost.Committee.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
RacedIncrementalLogitBoost.Committee.keepLastModel ( )  :  void
RacedIncrementalLogitBoost.Committee.logLikelihood ( )  :  double
RacedIncrementalLogitBoost.Committee.logLikelihoodAfter ( )  :  double
RacedIncrementalLogitBoost.Committee.pruneLastModel ( )  :  void
RacedIncrementalLogitBoost.Committee.RacedIncrementalLogitBoost.Committee ( RacedIncrementalLogitBoost p1, int p2 )
RacedIncrementalLogitBoost.Committee.resetConsumed ( )  :  void
RacedIncrementalLogitBoost.Committee.toString ( )  :  String
RacedIncrementalLogitBoost.Committee.update ( )  :  boolean
RacedIncrementalLogitBoost.Committee.updateFS ( Instance p1, Classifier[ ] p2, double[ ] p3 )  :  double[ ]
RacedIncrementalLogitBoost.Committee.validationError ( )  :  double

cdk-1.0.1.jar, ComplementNaiveBayes.class
package weka.classifiers.bayes
ComplementNaiveBayes.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
ComplementNaiveBayes.classifyInstance ( Instance p1 )  :  double
ComplementNaiveBayes.ComplementNaiveBayes ( )
ComplementNaiveBayes.getNormalizeWordWeights ( )  :  boolean
ComplementNaiveBayes.getOptions ( )  :  String[ ]
ComplementNaiveBayes.getSmoothingParameter ( )  :  double
ComplementNaiveBayes.globalInfo ( )  :  String
ComplementNaiveBayes.listOptions ( )  :  Enumeration
ComplementNaiveBayes.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
ComplementNaiveBayes.normalizeWordWeightsTipText ( )  :  String
ComplementNaiveBayes.setNormalizeWordWeights ( boolean p1 )  :  void
ComplementNaiveBayes.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
ComplementNaiveBayes.setSmoothingParameter ( double p1 )  :  void
ComplementNaiveBayes.smoothingParameterTipText ( )  :  String
ComplementNaiveBayes.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, ComponentHelper.class
package weka.gui
ComponentHelper.ComponentHelper ( )
ComponentHelper.getImage ( String p1 ) [static]  :  Image
ComponentHelper.getImage ( String p1, String p2 ) [static]  :  Image
ComponentHelper.getImageIcon ( String p1 ) [static]  :  ImageIcon
ComponentHelper.getImageIcon ( String p1, String p2 ) [static]  :  ImageIcon
ComponentHelper.showInputBox ( Component p1, String p2, String p3, Object p4 ) [static]  :  String
ComponentHelper.showMessageBox ( Component p1, String p2, String p3, int p4, int p5 ) [static]  :  int

cdk-1.0.1.jar, Compute.class
package weka.experiment
Compute.checkStatus ( Object p1 ) [abstract]  :  Object
Compute.executeTask ( Task p1 ) [abstract]  :  Object

cdk-1.0.1.jar, ConditionalEstimator.class
package weka.estimators
ConditionalEstimator.addValue ( double p1, double p2, double p3 ) [abstract]  :  void
ConditionalEstimator.getEstimator ( double p1 ) [abstract]  :  Estimator
ConditionalEstimator.getProbability ( double p1, double p2 ) [abstract]  :  double

cdk-1.0.1.jar, ConfusionMatrix.class
package weka.classifiers.evaluation
ConfusionMatrix.addPrediction ( NominalPrediction p1 )  :  void
ConfusionMatrix.addPredictions ( FastVector p1 )  :  void
ConfusionMatrix.className ( int p1 )  :  String
ConfusionMatrix.clone ( )  :  Object
ConfusionMatrix.ConfusionMatrix ( String[ ] p1 )
ConfusionMatrix.correct ( )  :  double
ConfusionMatrix.errorRate ( )  :  double
ConfusionMatrix.getTwoClassStats ( int p1 )  :  TwoClassStats
ConfusionMatrix.incorrect ( )  :  double
ConfusionMatrix.makeWeighted ( CostMatrix p1 )  :  ConfusionMatrix
ConfusionMatrix.size ( )  :  int
ConfusionMatrix.toString ( )  :  String
ConfusionMatrix.toString ( String p1 )  :  String
ConfusionMatrix.total ( )  :  double

cdk-1.0.1.jar, ConjunctiveRule.class
package weka.classifiers.rules
ConjunctiveRule.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
ConjunctiveRule.ConjunctiveRule ( )
ConjunctiveRule.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
ConjunctiveRule.exclusiveTipText ( )  :  String
ConjunctiveRule.foldsTipText ( )  :  String
ConjunctiveRule.getExclusive ( )  :  boolean
ConjunctiveRule.getFolds ( )  :  int
ConjunctiveRule.getMinNo ( )  :  double
ConjunctiveRule.getNumAntds ( )  :  int
ConjunctiveRule.getOptions ( )  :  String[ ]
ConjunctiveRule.getSeed ( )  :  long
ConjunctiveRule.globalInfo ( )  :  String
ConjunctiveRule.hasAntds ( )  :  boolean
ConjunctiveRule.isCover ( Instance p1 )  :  boolean
ConjunctiveRule.listOptions ( )  :  Enumeration
ConjunctiveRule.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
ConjunctiveRule.minNoTipText ( )  :  String
ConjunctiveRule.numAntdsTipText ( )  :  String
ConjunctiveRule.seedTipText ( )  :  String
ConjunctiveRule.setExclusive ( boolean p1 )  :  void
ConjunctiveRule.setFolds ( int p1 )  :  void
ConjunctiveRule.setMinNo ( double p1 )  :  void
ConjunctiveRule.setNumAntds ( int p1 )  :  void
ConjunctiveRule.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
ConjunctiveRule.setSeed ( long p1 )  :  void
ConjunctiveRule.toString ( )  :  String
ConjunctiveRule.toString ( String p1, String p2 )  :  String

cdk-1.0.1.jar, ConsistencySubsetEval.class
package weka.attributeSelection
ConsistencySubsetEval.buildEvaluator ( Instances p1 )  :  void
ConsistencySubsetEval.ConsistencySubsetEval ( )
ConsistencySubsetEval.evaluateSubset ( BitSet p1 )  :  double
ConsistencySubsetEval.globalInfo ( )  :  String
ConsistencySubsetEval.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
ConsistencySubsetEval.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, ContingencyTables.class
package weka.core
ContingencyTables.chiSquared ( double[ ][ ] p1, boolean p2 ) [static]  :  double
ContingencyTables.chiVal ( double[ ][ ] p1, boolean p2 ) [static]  :  double
ContingencyTables.cochransCriterion ( double[ ][ ] p1 ) [static]  :  boolean
ContingencyTables.ContingencyTables ( )
ContingencyTables.CramersV ( double[ ][ ] p1 ) [static]  :  double
ContingencyTables.entropy ( double[ ] p1 ) [static]  :  double
ContingencyTables.entropyConditionedOnColumns ( double[ ][ ] p1 ) [static]  :  double
ContingencyTables.entropyConditionedOnRows ( double[ ][ ] p1 ) [static]  :  double
ContingencyTables.entropyConditionedOnRows ( double[ ][ ] p1, double[ ][ ] p2, double p3 ) [static]  :  double
ContingencyTables.entropyOverColumns ( double[ ][ ] p1 ) [static]  :  double
ContingencyTables.entropyOverRows ( double[ ][ ] p1 ) [static]  :  double
ContingencyTables.gainRatio ( double[ ][ ] p1 ) [static]  :  double
ContingencyTables.log2MultipleHypergeometric ( double[ ][ ] p1 ) [static]  :  double
ContingencyTables.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
ContingencyTables.reduceMatrix ( double[ ][ ] p1 ) [static]  :  double[ ][ ]
ContingencyTables.symmetricalUncertainty ( double[ ][ ] p1 ) [static]  :  double
ContingencyTables.tauVal ( double[ ][ ] p1 ) [static]  :  double

cdk-1.0.1.jar, ConverterUtils.class
package weka.core.converters
ConverterUtils.ConverterUtils ( )
ConverterUtils.errms ( StreamTokenizer p1, String p2 ) [static]  :  void
ConverterUtils.getFirstToken ( StreamTokenizer p1 ) [static]  :  void
ConverterUtils.getToken ( StreamTokenizer p1 ) [static]  :  void

cdk-1.0.1.jar, Copy.class
package weka.filters.unsupervised.attribute
Copy.attributeIndicesTipText ( )  :  String
Copy.Copy ( )
Copy.getAttributeIndices ( )  :  String
Copy.getInvertSelection ( )  :  boolean
Copy.getOptions ( )  :  String[ ]
Copy.globalInfo ( )  :  String
Copy.input ( Instance p1 )  :  boolean
Copy.invertSelectionTipText ( )  :  String
Copy.listOptions ( )  :  Enumeration
Copy.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Copy.setAttributeIndices ( String p1 )  :  void
Copy.setAttributeIndicesArray ( int[ ] p1 )  :  void
Copy.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
Copy.setInvertSelection ( boolean p1 )  :  void
Copy.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, Copyable.class
package weka.core
Copyable.copy ( ) [abstract]  :  Object

cdk-1.0.1.jar, CorrelationSplitInfo.class
package weka.classifiers.trees.m5
CorrelationSplitInfo.attrSplit ( int p1, Instances p2 )  :  void
CorrelationSplitInfo.copy ( )  :  SplitEvaluate
CorrelationSplitInfo.CorrelationSplitInfo ( int p1, int p2, int p3 )
CorrelationSplitInfo.initialize ( int p1, int p2, int p3 )  :  void
CorrelationSplitInfo.maxImpurity ( )  :  double
CorrelationSplitInfo.position ( )  :  int
CorrelationSplitInfo.splitAttr ( )  :  int
CorrelationSplitInfo.splitValue ( )  :  double

cdk-1.0.1.jar, CostCurve.class
package weka.classifiers.evaluation
CostCurve.CostCurve ( )
CostCurve.getCurve ( FastVector p1 )  :  Instances
CostCurve.getCurve ( FastVector p1, int p2 )  :  Instances
CostCurve.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void

cdk-1.0.1.jar, CostMatrix.class
package weka.classifiers
CostMatrix.applyCostMatrix ( Instances p1, Random p2 )  :  Instances
CostMatrix.CostMatrix ( CostMatrix p1 )
CostMatrix.CostMatrix ( int p1 )
CostMatrix.CostMatrix ( Reader p1 )
CostMatrix.expectedCosts ( double[ ] p1 )  :  double[ ]
CostMatrix.getMaxCost ( int p1 )  :  double
CostMatrix.initialize ( )  :  void
CostMatrix.normalize ( )  :  void
CostMatrix.readOldFormat ( Reader p1 )  :  void
CostMatrix.size ( )  :  int

cdk-1.0.1.jar, CostMatrixEditor.class
package weka.gui
CostMatrixEditor.addPropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
CostMatrixEditor.CostMatrixEditor ( )
CostMatrixEditor.getAsText ( )  :  String
CostMatrixEditor.getCustomEditor ( )  :  Component
CostMatrixEditor.getJavaInitializationString ( )  :  String
CostMatrixEditor.getTags ( )  :  String[ ]
CostMatrixEditor.getValue ( )  :  Object
CostMatrixEditor.isPaintable ( )  :  boolean
CostMatrixEditor.paintValue ( Graphics p1, Rectangle p2 )  :  void
CostMatrixEditor.removePropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
CostMatrixEditor.setAsText ( String p1 )  :  void
CostMatrixEditor.setValue ( Object p1 )  :  void
CostMatrixEditor.supportsCustomEditor ( )  :  boolean

cdk-1.0.1.jar, CostSensitiveClassifier.class
package weka.classifiers.meta
CostSensitiveClassifier.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
CostSensitiveClassifier.costMatrixSourceTipText ( )  :  String
CostSensitiveClassifier.costMatrixTipText ( )  :  String
CostSensitiveClassifier.CostSensitiveClassifier ( )
CostSensitiveClassifier.defaultClassifierString ( )  :  String
CostSensitiveClassifier.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
CostSensitiveClassifier.getClassifierSpec ( )  :  String
CostSensitiveClassifier.getCostMatrix ( )  :  CostMatrix
CostSensitiveClassifier.getCostMatrixSource ( )  :  SelectedTag
CostSensitiveClassifier.getMinimizeExpectedCost ( )  :  boolean
CostSensitiveClassifier.getOnDemandDirectory ( )  :  File
CostSensitiveClassifier.getOptions ( )  :  String[ ]
CostSensitiveClassifier.globalInfo ( )  :  String
CostSensitiveClassifier.graph ( )  :  String
CostSensitiveClassifier.graphType ( )  :  int
CostSensitiveClassifier.listOptions ( )  :  Enumeration
CostSensitiveClassifier.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
CostSensitiveClassifier.minimizeExpectedCostTipText ( )  :  String
CostSensitiveClassifier.onDemandDirectoryTipText ( )  :  String
CostSensitiveClassifier.setCostMatrix ( CostMatrix p1 )  :  void
CostSensitiveClassifier.setCostMatrixSource ( SelectedTag p1 )  :  void
CostSensitiveClassifier.setMinimizeExpectedCost ( boolean p1 )  :  void
CostSensitiveClassifier.setOnDemandDirectory ( File p1 )  :  void
CostSensitiveClassifier.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
CostSensitiveClassifier.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, CostSensitiveClassifierSplitEvaluator.class
package weka.experiment
CostSensitiveClassifierSplitEvaluator.CostSensitiveClassifierSplitEvaluator ( )
CostSensitiveClassifierSplitEvaluator.getOnDemandDirectory ( )  :  File
CostSensitiveClassifierSplitEvaluator.getOptions ( )  :  String[ ]
CostSensitiveClassifierSplitEvaluator.getResult ( Instances p1, Instances p2 )  :  Object[ ]
CostSensitiveClassifierSplitEvaluator.getResultNames ( )  :  String[ ]
CostSensitiveClassifierSplitEvaluator.getResultTypes ( )  :  Object[ ]
CostSensitiveClassifierSplitEvaluator.globalInfo ( )  :  String
CostSensitiveClassifierSplitEvaluator.listOptions ( )  :  Enumeration
CostSensitiveClassifierSplitEvaluator.onDemandDirectoryTipText ( )  :  String
CostSensitiveClassifierSplitEvaluator.setOnDemandDirectory ( File p1 )  :  void
CostSensitiveClassifierSplitEvaluator.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
CostSensitiveClassifierSplitEvaluator.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, CrossValidationFoldMaker.class
package weka.gui.beans
CrossValidationFoldMaker.acceptDataSet ( DataSetEvent p1 )  :  void
CrossValidationFoldMaker.acceptTestSet ( TestSetEvent p1 )  :  void
CrossValidationFoldMaker.acceptTrainingSet ( TrainingSetEvent p1 )  :  void
CrossValidationFoldMaker.CrossValidationFoldMaker ( )
CrossValidationFoldMaker.enumerateRequests ( )  :  Enumeration
CrossValidationFoldMaker.eventGeneratable ( String p1 )  :  boolean
CrossValidationFoldMaker.foldsTipText ( )  :  String
CrossValidationFoldMaker.getFolds ( )  :  int
CrossValidationFoldMaker.getSeed ( )  :  int
CrossValidationFoldMaker.globalInfo ( )  :  String
CrossValidationFoldMaker.notifyTrainingSetProduced ( TrainingSetEvent p1 )  :  void
CrossValidationFoldMaker.performRequest ( String p1 )  :  void
CrossValidationFoldMaker.seedTipText ( )  :  String
CrossValidationFoldMaker.setFolds ( int p1 )  :  void
CrossValidationFoldMaker.setSeed ( int p1 )  :  void
CrossValidationFoldMaker.stop ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, CrossValidationFoldMakerBeanInfo.class
package weka.gui.beans
CrossValidationFoldMakerBeanInfo.CrossValidationFoldMakerBeanInfo ( )
CrossValidationFoldMakerBeanInfo.getBeanDescriptor ( )  :  BeanDescriptor
CrossValidationFoldMakerBeanInfo.getPropertyDescriptors ( )  :  PropertyDescriptor[ ]

cdk-1.0.1.jar, CrossValidationFoldMakerCustomizer.class
package weka.gui.beans
CrossValidationFoldMakerCustomizer.addPropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
CrossValidationFoldMakerCustomizer.CrossValidationFoldMakerCustomizer ( )
CrossValidationFoldMakerCustomizer.removePropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
CrossValidationFoldMakerCustomizer.setObject ( Object p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, CrossValidationResultProducer.class
package weka.experiment
CrossValidationResultProducer.CrossValidationResultProducer ( )
CrossValidationResultProducer.doRun ( int p1 )  :  void
CrossValidationResultProducer.doRunKeys ( int p1 )  :  void
CrossValidationResultProducer.enumerateMeasures ( )  :  Enumeration
CrossValidationResultProducer.getCompatibilityState ( )  :  String
CrossValidationResultProducer.getKeyNames ( )  :  String[ ]
CrossValidationResultProducer.getKeyTypes ( )  :  Object[ ]
CrossValidationResultProducer.getMeasure ( String p1 )  :  double
CrossValidationResultProducer.getNumFolds ( )  :  int
CrossValidationResultProducer.getOptions ( )  :  String[ ]
CrossValidationResultProducer.getOutputFile ( )  :  File
CrossValidationResultProducer.getRawOutput ( )  :  boolean
CrossValidationResultProducer.getResultNames ( )  :  String[ ]
CrossValidationResultProducer.getResultTypes ( )  :  Object[ ]
CrossValidationResultProducer.getSplitEvaluator ( )  :  SplitEvaluator
CrossValidationResultProducer.getTimestamp ( ) [static]  :  Double
CrossValidationResultProducer.globalInfo ( )  :  String
CrossValidationResultProducer.listOptions ( )  :  Enumeration
CrossValidationResultProducer.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
CrossValidationResultProducer.numFoldsTipText ( )  :  String
CrossValidationResultProducer.outputFileTipText ( )  :  String
CrossValidationResultProducer.postProcess ( )  :  void
CrossValidationResultProducer.preProcess ( )  :  void
CrossValidationResultProducer.rawOutputTipText ( )  :  String
CrossValidationResultProducer.setAdditionalMeasures ( String[ ] p1 )  :  void
CrossValidationResultProducer.setInstances ( Instances p1 )  :  void
CrossValidationResultProducer.setNumFolds ( int p1 )  :  void
CrossValidationResultProducer.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
CrossValidationResultProducer.setOutputFile ( File p1 )  :  void
CrossValidationResultProducer.setRawOutput ( boolean p1 )  :  void
CrossValidationResultProducer.setResultListener ( ResultListener p1 )  :  void
CrossValidationResultProducer.setSplitEvaluator ( SplitEvaluator p1 )  :  void
CrossValidationResultProducer.splitEvaluatorTipText ( )  :  String
CrossValidationResultProducer.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, CSVLoader.class
package weka.core.converters
CSVLoader.CSVLoader ( )
CSVLoader.getDataSet ( )  :  Instances
CSVLoader.getFileDescription ( )  :  String
CSVLoader.getFileExtension ( )  :  String
CSVLoader.getNextInstance ( )  :  Instance
CSVLoader.getStructure ( )  :  Instances
CSVLoader.globalInfo ( )  :  String
CSVLoader.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
CSVLoader.reset ( )  :  void
CSVLoader.retrieveFile ( )  :  File
CSVLoader.setFile ( File p1 )  :  void
CSVLoader.setSource ( File p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, CSVResultListener.class
package weka.experiment
CSVResultListener.acceptResult ( ResultProducer p1, Object[ ] p2, Object[ ] p3 )  :  void
CSVResultListener.CSVResultListener ( )
CSVResultListener.determineColumnConstraints ( ResultProducer p1 )  :  String[ ]
CSVResultListener.getOptions ( )  :  String[ ]
CSVResultListener.getOutputFile ( )  :  File
CSVResultListener.globalInfo ( )  :  String
CSVResultListener.isResultRequired ( ResultProducer p1, Object[ ] p2 )  :  boolean
CSVResultListener.listOptions ( )  :  Enumeration
CSVResultListener.outputFileName ( )  :  String
CSVResultListener.outputFileTipText ( )  :  String
CSVResultListener.postProcess ( ResultProducer p1 )  :  void
CSVResultListener.preProcess ( ResultProducer p1 )  :  void
CSVResultListener.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
CSVResultListener.setOutputFile ( File p1 )  :  void
CSVResultListener.setOutputFileName ( String p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, CSVSaver.class
package weka.core.converters
CSVSaver.CSVSaver ( )
CSVSaver.getFileDescription ( )  :  String
CSVSaver.globalInfo ( )  :  String
CSVSaver.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
CSVSaver.resetOptions ( )  :  void
CSVSaver.writeBatch ( )  :  void
CSVSaver.writeIncremental ( Instance p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, CustomizerCloseRequester.class
package weka.gui.beans
CustomizerCloseRequester.setParentFrame ( JFrame p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, CustomizerClosingListener.class
package weka.gui.beans
CustomizerClosingListener.customizerClosing ( ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, CustomPanelSupplier.class
package weka.gui
CustomPanelSupplier.getCustomPanel ( ) [abstract]  :  JPanel

cdk-1.0.1.jar, CVParameter.class
package weka.classifiers.meta
CVParameterSelection.CVParameter.CVParameterSelection.CVParameter ( CVParameterSelection p1, String p2 )
CVParameterSelection.CVParameter.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, CVParameterSelection.class
package weka.classifiers.meta
CVParameterSelection.addCVParameter ( String p1 )  :  void
CVParameterSelection.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
CVParameterSelection.createOptions ( )  :  String[ ]
CVParameterSelection.CVParameterSelection ( )
CVParameterSelection.CVParametersTipText ( )  :  String
CVParameterSelection.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
CVParameterSelection.findParamsByCrossValidation ( int p1, Instances p2, Random p3 )  :  void
CVParameterSelection.getCVParameter ( int p1 )  :  String
CVParameterSelection.getCVParameters ( )  :  Object[ ]
CVParameterSelection.getNumFolds ( )  :  int
CVParameterSelection.getOptions ( )  :  String[ ]
CVParameterSelection.globalInfo ( )  :  String
CVParameterSelection.graph ( )  :  String
CVParameterSelection.graphType ( )  :  int
CVParameterSelection.listOptions ( )  :  Enumeration
CVParameterSelection.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
CVParameterSelection.numFoldsTipText ( )  :  String
CVParameterSelection.setCVParameters ( Object[ ] p1 )  :  void
CVParameterSelection.setNumFolds ( int p1 )  :  void
CVParameterSelection.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
CVParameterSelection.toString ( )  :  String
CVParameterSelection.toSummaryString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, DatabaseConnection.class
package weka.core.converters
DatabaseConnection.arrayToString ( Object[ ] p1 ) [static]  :  String
DatabaseConnection.connectToDatabase ( )  :  void
DatabaseConnection.DatabaseConnection ( )
DatabaseConnection.databaseURLTipText ( )  :  String
DatabaseConnection.disconnectFromDatabase ( )  :  void
DatabaseConnection.execute ( String p1 )  :  boolean
DatabaseConnection.getDatabaseURL ( )  :  String
DatabaseConnection.getMetaData ( )  :  DatabaseMetaData
DatabaseConnection.getPassword ( )  :  String
DatabaseConnection.getResultSet ( )  :  ResultSet
DatabaseConnection.getUpdateCount ( )  :  int
DatabaseConnection.getUpperCase ( )  :  boolean
DatabaseConnection.getUsername ( )  :  String
DatabaseConnection.isConnected ( )  :  boolean
DatabaseConnection.setDatabaseURL ( String p1 )  :  void
DatabaseConnection.setPassword ( String p1 )  :  void
DatabaseConnection.setUsername ( String p1 )  :  void
DatabaseConnection.tableExists ( String p1 )  :  boolean
DatabaseConnection.typeName ( int p1 ) [static]  :  String

cdk-1.0.1.jar, DatabaseConnectionDialog.class
package weka.gui
DatabaseConnectionDialog.DatabaseConnectionDialog ( Frame p1 )
DatabaseConnectionDialog.DatabaseConnectionDialog ( Frame p1, String p2, String p3 )
DatabaseConnectionDialog.DbConnectionDialog ( String p1, String p2 )  :  void
DatabaseConnectionDialog.getPassword ( )  :  String
DatabaseConnectionDialog.getReturnValue ( )  :  int
DatabaseConnectionDialog.getURL ( )  :  String
DatabaseConnectionDialog.getUsername ( )  :  String
DatabaseConnectionDialog.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void

cdk-1.0.1.jar, DatabaseConverter.class
package weka.core.converters
DatabaseConverter.getUrl ( ) [abstract]  :  String
DatabaseConverter.getUser ( ) [abstract]  :  String
DatabaseConverter.setPassword ( String p1 ) [abstract]  :  void
DatabaseConverter.setUrl ( String p1 ) [abstract]  :  void
DatabaseConverter.setUser ( String p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, DatabaseLoader.class
package weka.core.converters
DatabaseLoader.connectToDatabase ( )  :  void
DatabaseLoader.DatabaseLoader ( )
DatabaseLoader.getDataSet ( )  :  Instances
DatabaseLoader.getKeys ( )  :  String
DatabaseLoader.getNextInstance ( )  :  Instance
DatabaseLoader.getOptions ( )  :  String[ ]
DatabaseLoader.getQuery ( )  :  String
DatabaseLoader.getStructure ( )  :  Instances
DatabaseLoader.getUrl ( )  :  String
DatabaseLoader.getUser ( )  :  String
DatabaseLoader.globalInfo ( )  :  String
DatabaseLoader.keysTipText ( )  :  String
DatabaseLoader.listOptions ( )  :  Enumeration
DatabaseLoader.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
DatabaseLoader.passwordTipText ( )  :  String
DatabaseLoader.queryTipText ( )  :  String
DatabaseLoader.reset ( )  :  void
DatabaseLoader.resetStructure ( )  :  void
DatabaseLoader.setKeys ( String p1 )  :  void
DatabaseLoader.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
DatabaseLoader.setPassword ( String p1 )  :  void
DatabaseLoader.setQuery ( String p1 )  :  void
DatabaseLoader.setSource ( )  :  void
DatabaseLoader.setSource ( String p1 )  :  void
DatabaseLoader.setSource ( String p1, String p2, String p3 )  :  void
DatabaseLoader.setUrl ( String p1 )  :  void
DatabaseLoader.setUser ( String p1 )  :  void
DatabaseLoader.urlTipText ( )  :  String
DatabaseLoader.userTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, DatabaseResultListener.class
package weka.experiment
DatabaseResultListener.acceptResult ( ResultProducer p1, Object[ ] p2, Object[ ] p3 )  :  void
DatabaseResultListener.cacheKeyNameTipText ( )  :  String
DatabaseResultListener.DatabaseResultListener ( )
DatabaseResultListener.determineColumnConstraints ( ResultProducer p1 )  :  String[ ]
DatabaseResultListener.getCacheKeyName ( )  :  String
DatabaseResultListener.globalInfo ( )  :  String
DatabaseResultListener.isCacheValid ( Object[ ] p1 )  :  boolean
DatabaseResultListener.isKeyInCache ( ResultProducer p1, Object[ ] p2 )  :  boolean
DatabaseResultListener.isResultRequired ( ResultProducer p1, Object[ ] p2 )  :  boolean
DatabaseResultListener.loadCache ( ResultProducer p1, Object[ ] p2 )  :  void
DatabaseResultListener.postProcess ( ResultProducer p1 )  :  void
DatabaseResultListener.preProcess ( ResultProducer p1 )  :  void
DatabaseResultListener.setCacheKeyName ( String p1 )  :  void
DatabaseResultListener.updateResultsTableName ( ResultProducer p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, DatabaseResultProducer.class
package weka.experiment
DatabaseResultProducer.acceptResult ( ResultProducer p1, Object[ ] p2, Object[ ] p3 )  :  void
DatabaseResultProducer.DatabaseResultProducer ( )
DatabaseResultProducer.doRun ( int p1 )  :  void
DatabaseResultProducer.doRunKeys ( int p1 )  :  void
DatabaseResultProducer.enumerateMeasures ( )  :  Enumeration
DatabaseResultProducer.getCompatibilityState ( )  :  String
DatabaseResultProducer.getKeyNames ( )  :  String[ ]
DatabaseResultProducer.getKeyTypes ( )  :  Object[ ]
DatabaseResultProducer.getMeasure ( String p1 )  :  double
DatabaseResultProducer.getOptions ( )  :  String[ ]
DatabaseResultProducer.getResultNames ( )  :  String[ ]
DatabaseResultProducer.getResultProducer ( )  :  ResultProducer
DatabaseResultProducer.getResultTypes ( )  :  Object[ ]
DatabaseResultProducer.globalInfo ( )  :  String
DatabaseResultProducer.isResultRequired ( ResultProducer p1, Object[ ] p2 )  :  boolean
DatabaseResultProducer.listOptions ( )  :  Enumeration
DatabaseResultProducer.postProcess ( )  :  void
DatabaseResultProducer.postProcess ( ResultProducer p1 )  :  void
DatabaseResultProducer.preProcess ( )  :  void
DatabaseResultProducer.preProcess ( ResultProducer p1 )  :  void
DatabaseResultProducer.resultProducerTipText ( )  :  String
DatabaseResultProducer.setAdditionalMeasures ( String[ ] p1 )  :  void
DatabaseResultProducer.setInstances ( Instances p1 )  :  void
DatabaseResultProducer.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
DatabaseResultProducer.setResultListener ( ResultListener p1 )  :  void
DatabaseResultProducer.setResultProducer ( ResultProducer p1 )  :  void
DatabaseResultProducer.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, DatabaseSaver.class
package weka.core.converters
DatabaseSaver.autoKeyGenerationTipText ( )  :  String
DatabaseSaver.cancel ( )  :  void
DatabaseSaver.connectToDatabase ( )  :  void
DatabaseSaver.DatabaseSaver ( )
DatabaseSaver.getAutoKeyGeneration ( )  :  boolean
DatabaseSaver.getOptions ( )  :  String[ ]
DatabaseSaver.getRelationForTableName ( )  :  boolean
DatabaseSaver.getTableName ( )  :  String
DatabaseSaver.getUrl ( )  :  String
DatabaseSaver.getUser ( )  :  String
DatabaseSaver.globalInfo ( )  :  String
DatabaseSaver.listOptions ( )  :  Enumeration
DatabaseSaver.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
DatabaseSaver.passwordTipText ( )  :  String
DatabaseSaver.relationForTableNameTipText ( )  :  String
DatabaseSaver.resetOptions ( )  :  void
DatabaseSaver.setAutoKeyGeneration ( boolean p1 )  :  void
DatabaseSaver.setDestination ( )  :  void
DatabaseSaver.setDestination ( String p1 )  :  void
DatabaseSaver.setDestination ( String p1, String p2, String p3 )  :  void
DatabaseSaver.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
DatabaseSaver.setPassword ( String p1 )  :  void
DatabaseSaver.setRelationForTableName ( boolean p1 )  :  void
DatabaseSaver.setTableName ( String p1 )  :  void
DatabaseSaver.setUrl ( String p1 )  :  void
DatabaseSaver.setUser ( String p1 )  :  void
DatabaseSaver.tableNameTipText ( )  :  String
DatabaseSaver.urlTipText ( )  :  String
DatabaseSaver.userTipText ( )  :  String
DatabaseSaver.writeBatch ( )  :  void
DatabaseSaver.writeIncremental ( Instance p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, DatabaseUtils.class
package weka.experiment
DatabaseUtils.arrayToString ( Object[ ] p1 ) [static]  :  String
DatabaseUtils.attributeCaseFix ( String p1 )  :  String
DatabaseUtils.connectToDatabase ( )  :  void
DatabaseUtils.createExperimentIndex ( )  :  void
DatabaseUtils.createExperimentIndexEntry ( ResultProducer p1 )  :  String
DatabaseUtils.createResultsTable ( ResultProducer p1, String p2 )  :  String
DatabaseUtils.databaseURLTipText ( )  :  String
DatabaseUtils.DatabaseUtils ( )
DatabaseUtils.disconnectFromDatabase ( )  :  void
DatabaseUtils.execute ( String p1 )  :  boolean
DatabaseUtils.experimentIndexExists ( )  :  boolean
DatabaseUtils.getDatabaseURL ( )  :  String
DatabaseUtils.getPassword ( )  :  String
DatabaseUtils.getResultFromTable ( String p1, ResultProducer p2, Object[ ] p3 )  :  Object[ ]
DatabaseUtils.getResultSet ( )  :  ResultSet
DatabaseUtils.getResultsTableName ( ResultProducer p1 )  :  String
DatabaseUtils.getUsername ( )  :  String
DatabaseUtils.isConnected ( )  :  boolean
DatabaseUtils.isKeyInTable ( String p1, ResultProducer p2, Object[ ] p3 )  :  boolean
DatabaseUtils.putResultInTable ( String p1, ResultProducer p2, Object[ ] p3, Object[ ] p4 )  :  void
DatabaseUtils.setDatabaseURL ( String p1 )  :  void
DatabaseUtils.setPassword ( String p1 )  :  void
DatabaseUtils.setUsername ( String p1 )  :  void
DatabaseUtils.tableExists ( String p1 )  :  boolean
DatabaseUtils.typeName ( int p1 ) [static]  :  String

cdk-1.0.1.jar, DataFormatListener.class
package weka.gui.beans
DataFormatListener.newDataFormat ( DataSetEvent p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, DataGenerator.class
package weka.gui.boundaryvisualizer
DataGenerator.buildGenerator ( Instances p1 ) [abstract]  :  void
DataGenerator.generateInstances ( int[ ] p1 ) [abstract]  :  double[ ][ ]
DataGenerator.getNumGeneratingModels ( ) [abstract]  :  int
DataGenerator.getWeights ( ) [abstract]  :  double[ ]
DataGenerator.setSeed ( int p1 ) [abstract]  :  void
DataGenerator.setWeightingDimensions ( boolean[ ] p1 ) [abstract]  :  void
DataGenerator.setWeightingValues ( double[ ] p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, Dataset.class
package weka.experiment
PairedTTester.Dataset.add ( Instance p1 )  :  void
PairedTTester.Dataset.contents ( )  :  FastVector
PairedTTester.Dataset.matchesTemplate ( Instance p1 )  :  boolean
PairedTTester.Dataset.PairedTTester.Dataset ( PairedTTester p1, Instance p2 )
PairedTTester.Dataset.sort ( int p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, DataSetEvent.class
package weka.gui.beans
DataSetEvent.DataSetEvent ( Object p1, Instances p2 )
DataSetEvent.getDataSet ( )  :  Instances
DataSetEvent.isStructureOnly ( )  :  boolean

cdk-1.0.1.jar, DatasetListPanel.class
package weka.gui.experiment
DatasetListPanel.actionPerformed ( ActionEvent p1 )  :  void
DatasetListPanel.convertToRelativePath ( File p1 )  :  File
DatasetListPanel.createRelativePath ( File p1 )  :  File
DatasetListPanel.DatasetListPanel ( )
DatasetListPanel.DatasetListPanel ( Experiment p1 )
DatasetListPanel.getFilesRecursively ( File p1, Vector p2 )  :  void
DatasetListPanel.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
DatasetListPanel.setExperiment ( Experiment p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, DatasetSpecifiers.class
package weka.experiment
PairedTTester.DatasetSpecifiers.add ( Instance p1 )  :  void
PairedTTester.DatasetSpecifiers.numSpecifiers ( )  :  int
PairedTTester.DatasetSpecifiers.PairedTTester.DatasetSpecifiers ( PairedTTester p1 )
PairedTTester.DatasetSpecifiers.removeAllSpecifiers ( )  :  void
PairedTTester.DatasetSpecifiers.specifier ( int p1 )  :  Instance

cdk-1.0.1.jar, DataSource.class
package weka.gui.beans
DataSource.addDataSourceListener ( DataSourceListener p1 ) [abstract]  :  void
DataSource.addInstanceListener ( InstanceListener p1 ) [abstract]  :  void
DataSource.removeDataSourceListener ( DataSourceListener p1 ) [abstract]  :  void
DataSource.removeInstanceListener ( InstanceListener p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, DataSourceListener.class
package weka.gui.beans
DataSourceListener.acceptDataSet ( DataSetEvent p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, DataVisualizer.class
package weka.gui.beans
DataVisualizer.acceptDataSet ( DataSetEvent p1 )  :  void
DataVisualizer.acceptTestSet ( TestSetEvent p1 )  :  void
DataVisualizer.acceptTrainingSet ( TrainingSetEvent p1 )  :  void
DataVisualizer.addPropertyChangeListener ( String p1, PropertyChangeListener p2 )  :  void
DataVisualizer.addVetoableChangeListener ( String p1, VetoableChangeListener p2 )  :  void
DataVisualizer.appearanceDesign ( )  :  void
DataVisualizer.appearanceFinal ( )  :  void
DataVisualizer.DataVisualizer ( )
DataVisualizer.enumerateRequests ( )  :  Enumeration
DataVisualizer.getBeanContext ( )  :  BeanContext
DataVisualizer.getVisual ( )  :  BeanVisual
DataVisualizer.globalInfo ( )  :  String
DataVisualizer.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
DataVisualizer.performRequest ( String p1 )  :  void
DataVisualizer.removePropertyChangeListener ( String p1, PropertyChangeListener p2 )  :  void
DataVisualizer.removeVetoableChangeListener ( String p1, VetoableChangeListener p2 )  :  void
DataVisualizer.setBeanContext ( BeanContext p1 )  :  void
DataVisualizer.setInstances ( Instances p1 )  :  void
DataVisualizer.setUpFinal ( )  :  void
DataVisualizer.setVisual ( BeanVisual p1 )  :  void
DataVisualizer.useDefaultVisual ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, DataVisualizerBeanInfo.class
package weka.gui.beans
DataVisualizerBeanInfo.DataVisualizerBeanInfo ( )
DataVisualizerBeanInfo.getEventSetDescriptors ( )  :  EventSetDescriptor[ ]

cdk-1.0.1.jar, DDConditionalEstimator.class
package weka.estimators
DDConditionalEstimator.addValue ( double p1, double p2, double p3 )  :  void
DDConditionalEstimator.DDConditionalEstimator ( int p1, int p2, boolean p3 )
DDConditionalEstimator.getEstimator ( double p1 )  :  Estimator
DDConditionalEstimator.getProbability ( double p1, double p2 )  :  double
DDConditionalEstimator.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
DDConditionalEstimator.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, DecisionStump.class
package weka.classifiers.trees
DecisionStump.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
DecisionStump.DecisionStump ( )
DecisionStump.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
DecisionStump.globalInfo ( )  :  String
DecisionStump.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
DecisionStump.toSource ( String p1 )  :  String
DecisionStump.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, DecisionTable.class
package weka.classifiers.rules
DecisionTable.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
DecisionTable.crossValTipText ( )  :  String
DecisionTable.DecisionTable ( )
DecisionTable.displayRulesTipText ( )  :  String
DecisionTable.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
DecisionTable.enumerateMeasures ( )  :  Enumeration
DecisionTable.getCrossVal ( )  :  int
DecisionTable.getDisplayRules ( )  :  boolean
DecisionTable.getMaxStale ( )  :  int
DecisionTable.getMeasure ( String p1 )  :  double
DecisionTable.getOptions ( )  :  String[ ]
DecisionTable.getUseIBk ( )  :  boolean
DecisionTable.globalInfo ( )  :  String
DecisionTable.listOptions ( )  :  Enumeration
DecisionTable.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
DecisionTable.maxStaleTipText ( )  :  String
DecisionTable.measureNumRules ( )  :  double
DecisionTable.printFeatures ( )  :  String
DecisionTable.resetOptions ( )  :  void
DecisionTable.setCrossVal ( int p1 )  :  void
DecisionTable.setDisplayRules ( boolean p1 )  :  void
DecisionTable.setMaxStale ( int p1 )  :  void
DecisionTable.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
DecisionTable.setUseIBk ( boolean p1 )  :  void
DecisionTable.toString ( )  :  String
DecisionTable.useIBkTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, Decorate.class
package weka.classifiers.meta
Decorate.addInstances ( Instances p1, Instances p2 )  :  void
Decorate.artificialSizeTipText ( )  :  String
Decorate.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
Decorate.computeError ( Instances p1 )  :  double
Decorate.computeStats ( Instances p1 )  :  void
Decorate.Decorate ( )
Decorate.defaultClassifierString ( )  :  String
Decorate.desiredSizeTipText ( )  :  String
Decorate.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
Decorate.generateArtificialData ( int p1, Instances p2 )  :  Instances
Decorate.getArtificialSize ( )  :  double
Decorate.getDesiredSize ( )  :  int
Decorate.getOptions ( )  :  String[ ]
Decorate.globalInfo ( )  :  String
Decorate.inverseLabel ( double[ ] p1 )  :  int
Decorate.labelData ( Instances p1 )  :  void
Decorate.listOptions ( )  :  Enumeration
Decorate.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Decorate.numIterationsTipText ( )  :  String
Decorate.removeInstances ( Instances p1, int p2 )  :  void
Decorate.selectIndexProbabilistically ( double[ ] p1 )  :  int
Decorate.setArtificialSize ( double p1 )  :  void
Decorate.setDesiredSize ( int p1 )  :  void
Decorate.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
Decorate.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, DensityBasedClusterer.class
package weka.clusterers
DensityBasedClusterer.clusterPriors ( ) [abstract]  :  double[ ]
DensityBasedClusterer.DensityBasedClusterer ( )
DensityBasedClusterer.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
DensityBasedClusterer.logDensityForInstance ( Instance p1 )  :  double
DensityBasedClusterer.logDensityPerClusterForInstance ( Instance p1 ) [abstract]  :  double[ ]
DensityBasedClusterer.logJointDensitiesForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
DensityBasedClusterer.makeCopies ( DensityBasedClusterer p1, int p2 ) [static]  :  DensityBasedClusterer[ ]

cdk-1.0.1.jar, DensityBasedClustererModel.class
package org.openscience.cdk.qsar.model.weka
DensityBasedClustererModel.build ( )  :  void
DensityBasedClustererModel.clusterPriors ( )  :  double[ ]
DensityBasedClustererModel.DensityBasedClustererModel ( )
DensityBasedClustererModel.distributionForInstance ( )  :  Object[ ][ ]
DensityBasedClustererModel.logDensityForInstance ( )  :  Object[ ]
DensityBasedClustererModel.logDensityPerClusterForInstance ( )  :  Object[ ][ ]
DensityBasedClustererModel.logJointDensitiesForInstance ( )  :  Object[ ][ ]
DensityBasedClustererModel.setData ( String filename )  :  void
DensityBasedClustererModel.setData ( String[ ] attrib, int[ ] typAttrib, String[ ] classAttrib, Object[ ] y, Object[ ][ ] x )  :  void
DensityBasedClustererModel.setParameters ( Object[ ][ ] newX )  :  void
DensityBasedClustererModel.setParameters ( String path )  :  void

cdk-1.0.1.jar, DiscreteEstimator.class
package weka.estimators
DiscreteEstimator.addValue ( double p1, double p2 )  :  void
DiscreteEstimator.DiscreteEstimator ( int p1, boolean p2 )
DiscreteEstimator.DiscreteEstimator ( int p1, double p2 )
DiscreteEstimator.getCount ( double p1 )  :  double
DiscreteEstimator.getNumSymbols ( )  :  int
DiscreteEstimator.getProbability ( double p1 )  :  double
DiscreteEstimator.getSumOfCounts ( )  :  double
DiscreteEstimator.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
DiscreteEstimator.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, DiscreteEstimatorBayes.class
package weka.classifiers.bayes.net.estimate
DiscreteEstimatorBayes.addValue ( double p1, double p2 )  :  void
DiscreteEstimatorBayes.DiscreteEstimatorBayes ( int p1, double p2 )
DiscreteEstimatorBayes.getCount ( double p1 )  :  double
DiscreteEstimatorBayes.getNumSymbols ( )  :  int
DiscreteEstimatorBayes.getProbability ( double p1 )  :  double
DiscreteEstimatorBayes.logScore ( int p1 )  :  double
DiscreteEstimatorBayes.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
DiscreteEstimatorBayes.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, DiscreteEstimatorFullBayes.class
package weka.classifiers.bayes.net.estimate
DiscreteEstimatorFullBayes.DiscreteEstimatorFullBayes ( int p1, double p2, double p3, DiscreteEstimatorBayes p4, DiscreteEstimatorBayes p5, double p6 )
DiscreteEstimatorFullBayes.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void

cdk-1.0.1.jar, DiscreteFunction.class
package weka.classifiers.functions.pace
DiscreteFunction.clone ( )  :  Object
DiscreteFunction.DiscreteFunction ( )
DiscreteFunction.DiscreteFunction ( DoubleVector p1 )
DiscreteFunction.DiscreteFunction ( DoubleVector p1, DoubleVector p2 )
DiscreteFunction.getFunctionValue ( int p1 )  :  double
DiscreteFunction.getFunctionValues ( )  :  DoubleVector
DiscreteFunction.getPointValue ( int p1 )  :  double
DiscreteFunction.getPointValues ( )  :  DoubleVector
DiscreteFunction.isEmpty ( )  :  boolean
DiscreteFunction.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
DiscreteFunction.normalize ( )  :  DiscreteFunction
DiscreteFunction.plus ( DiscreteFunction p1 )  :  DiscreteFunction
DiscreteFunction.plusEquals ( DiscreteFunction p1 )  :  DiscreteFunction
DiscreteFunction.setFunctionValue ( int p1, double p2 )  :  void
DiscreteFunction.setPointValue ( int p1, double p2 )  :  void
DiscreteFunction.size ( )  :  int
DiscreteFunction.sort ( )  :  void
DiscreteFunction.timesEquals ( double p1 )  :  DiscreteFunction
DiscreteFunction.toString ( )  :  String
DiscreteFunction.unique ( )  :  DiscreteFunction

cdk-1.0.1.jar, Discretize.class
package weka.filters.supervised.attribute
Discretize.attributeIndicesTipText ( )  :  String
Discretize.batchFinished ( )  :  boolean
Discretize.calculateCutPoints ( )  :  void
Discretize.calculateCutPointsByMDL ( int p1, Instances p2 )  :  void
Discretize.convertInstance ( Instance p1 )  :  void
Discretize.Discretize ( )
Discretize.getAttributeIndices ( )  :  String
Discretize.getCutPoints ( int p1 )  :  double[ ]
Discretize.getInvertSelection ( )  :  boolean
Discretize.getMakeBinary ( )  :  boolean
Discretize.getOptions ( )  :  String[ ]
Discretize.getUseBetterEncoding ( )  :  boolean
Discretize.getUseKononenko ( )  :  boolean
Discretize.globalInfo ( )  :  String
Discretize.input ( Instance p1 )  :  boolean
Discretize.invertSelectionTipText ( )  :  String
Discretize.listOptions ( )  :  Enumeration
Discretize.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Discretize.makeBinaryTipText ( )  :  String
Discretize.setAttributeIndices ( String p1 )  :  void
Discretize.setAttributeIndicesArray ( int[ ] p1 )  :  void
Discretize.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
Discretize.setInvertSelection ( boolean p1 )  :  void
Discretize.setMakeBinary ( boolean p1 )  :  void
Discretize.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
Discretize.setOutputFormat ( )  :  void
Discretize.setUseBetterEncoding ( boolean p1 )  :  void
Discretize.setUseKononenko ( boolean p1 )  :  void
Discretize.useBetterEncodingTipText ( )  :  String
Discretize.useKononenkoTipText ( )  :  String
package weka.filters.unsupervised.attribute
Discretize.attributeIndicesTipText ( )  :  String
Discretize.batchFinished ( )  :  boolean
Discretize.binsTipText ( )  :  String
Discretize.calculateCutPoints ( )  :  void
Discretize.calculateCutPointsByEqualFrequencyBinning ( int p1 )  :  void
Discretize.calculateCutPointsByEqualWidthBinning ( int p1 )  :  void
Discretize.convertInstance ( Instance p1 )  :  void
Discretize.desiredWeightOfInstancesPerIntervalTipText ( )  :  String
Discretize.Discretize ( )
Discretize.Discretize ( String p1 )
Discretize.findNumBins ( int p1 )  :  void
Discretize.findNumBinsTipText ( )  :  String
Discretize.getAttributeIndices ( )  :  String
Discretize.getBins ( )  :  int
Discretize.getCutPoints ( int p1 )  :  double[ ]
Discretize.getDesiredWeightOfInstancesPerInterval ( )  :  double
Discretize.getFindNumBins ( )  :  boolean
Discretize.getInvertSelection ( )  :  boolean
Discretize.getMakeBinary ( )  :  boolean
Discretize.getOptions ( )  :  String[ ]
Discretize.getUseEqualFrequency ( )  :  boolean
Discretize.globalInfo ( )  :  String
Discretize.input ( Instance p1 )  :  boolean
Discretize.invertSelectionTipText ( )  :  String
Discretize.listOptions ( )  :  Enumeration
Discretize.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Discretize.makeBinaryTipText ( )  :  String
Discretize.setAttributeIndices ( String p1 )  :  void
Discretize.setAttributeIndicesArray ( int[ ] p1 )  :  void
Discretize.setBins ( int p1 )  :  void
Discretize.setDesiredWeightOfInstancesPerInterval ( double p1 )  :  void
Discretize.setFindNumBins ( boolean p1 )  :  void
Discretize.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
Discretize.setInvertSelection ( boolean p1 )  :  void
Discretize.setMakeBinary ( boolean p1 )  :  void
Discretize.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
Discretize.setOutputFormat ( )  :  void
Discretize.setUseEqualFrequency ( boolean p1 )  :  void
Discretize.useEqualFrequencyTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, DistributeExperimentPanel.class
package weka.gui.experiment
DistributeExperimentPanel.addCheckBoxActionListener ( ActionListener p1 )  :  void
DistributeExperimentPanel.distributedExperimentSelected ( )  :  boolean
DistributeExperimentPanel.DistributeExperimentPanel ( )
DistributeExperimentPanel.DistributeExperimentPanel ( Experiment p1 )
DistributeExperimentPanel.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
DistributeExperimentPanel.setExperiment ( Experiment p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, Distribution.class
package weka.classifiers.trees.j48
Distribution.actualNumBags ( )  :  int
Distribution.actualNumClasses ( )  :  int
Distribution.actualNumClasses ( int p1 )  :  int
Distribution.add ( int p1, double[ ] p2 )  :  void
Distribution.add ( int p1, Instance p2 )  :  void
Distribution.addInstWithUnknown ( Instances p1, int p2 )  :  void
Distribution.addRange ( int p1, Instances p2, int p3, int p4 )  :  void
Distribution.addWeights ( Instance p1, double[ ] p2 )  :  void
Distribution.check ( double p1 )  :  boolean
Distribution.clone ( )  :  Object
Distribution.del ( int p1, Instance p2 )  :  void
Distribution.delRange ( int p1, Instances p2, int p3, int p4 )  :  void
Distribution.Distribution ( Distribution p1 )
Distribution.Distribution ( Distribution p1, int p2 )
Distribution.Distribution ( double[ ][ ] p1 )
Distribution.Distribution ( Instances p1 )
Distribution.Distribution ( Instances p1, ClassifierSplitModel p2 )
Distribution.Distribution ( int p1, int p2 )
Distribution.dumpDistribution ( )  :  String
Distribution.initialize ( )  :  void
Distribution.laplaceProb ( int p1 )  :  double
Distribution.laplaceProb ( int p1, int p2 )  :  double
Distribution.matrix ( )  :  double[ ][ ]
Distribution.maxBag ( )  :  int
Distribution.maxClass ( )  :  int
Distribution.maxClass ( int p1 )  :  int
Distribution.numBags ( )  :  int
Distribution.numClasses ( )  :  int
Distribution.numCorrect ( )  :  double
Distribution.numCorrect ( int p1 )  :  double
Distribution.numIncorrect ( )  :  double
Distribution.numIncorrect ( int p1 )  :  double
Distribution.perBag ( int p1 )  :  double
Distribution.perClass ( int p1 )  :  double
Distribution.perClassPerBag ( int p1, int p2 )  :  double
Distribution.prob ( int p1 )  :  double
Distribution.prob ( int p1, int p2 )  :  double
Distribution.shift ( int p1, int p2, Instance p3 )  :  void
Distribution.shiftRange ( int p1, int p2, Instances p3, int p4, int p5 )  :  void
Distribution.sub ( int p1, Instance p2 )  :  void
Distribution.subtract ( Distribution p1 )  :  Distribution
Distribution.total ( )  :  double

cdk-1.0.1.jar, DKConditionalEstimator.class
package weka.estimators
DKConditionalEstimator.addValue ( double p1, double p2, double p3 )  :  void
DKConditionalEstimator.DKConditionalEstimator ( int p1, double p2 )
DKConditionalEstimator.getEstimator ( double p1 )  :  Estimator
DKConditionalEstimator.getProbability ( double p1, double p2 )  :  double
DKConditionalEstimator.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
DKConditionalEstimator.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, DNConditionalEstimator.class
package weka.estimators
DNConditionalEstimator.addValue ( double p1, double p2, double p3 )  :  void
DNConditionalEstimator.DNConditionalEstimator ( int p1, double p2 )
DNConditionalEstimator.getEstimator ( double p1 )  :  Estimator
DNConditionalEstimator.getProbability ( double p1, double p2 )  :  double
DNConditionalEstimator.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
DNConditionalEstimator.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, DotParser.class
package weka.gui.graphvisualizer
DotParser.DotParser ( Reader p1, FastVector p2, FastVector p3 )
DotParser.edgeAttrib ( StreamTokenizer p1, GraphEdge p2 )  :  void
DotParser.edgeStmt ( StreamTokenizer p1, int p2 )  :  void
DotParser.graph ( StreamTokenizer p1 )  :  void
DotParser.nodeID ( StreamTokenizer p1 )  :  void
DotParser.nodeStmt ( StreamTokenizer p1, int p2 )  :  void
DotParser.parse ( )  :  String
DotParser.setSyntax ( StreamTokenizer p1 )  :  void
DotParser.stmt ( StreamTokenizer p1 )  :  void
DotParser.stmtList ( StreamTokenizer p1 )  :  void
DotParser.writeDOT ( String p1, String p2, FastVector p3, FastVector p4 ) [static]  :  void

cdk-1.0.1.jar, DoubleVector.class
package weka.classifiers.functions.pace
DoubleVector.addElement ( double p1 )  :  void
DoubleVector.capacity ( )  :  int
DoubleVector.cat ( DoubleVector p1 )  :  DoubleVector
DoubleVector.clone ( )  :  Object
DoubleVector.copy ( )  :  DoubleVector
DoubleVector.cumulate ( )  :  DoubleVector
DoubleVector.cumulateInPlace ( )  :  DoubleVector
DoubleVector.dividedBy ( DoubleVector p1 )  :  DoubleVector
DoubleVector.dividedByEquals ( DoubleVector p1 )  :  DoubleVector
DoubleVector.DoubleVector ( )
DoubleVector.DoubleVector ( double[ ] p1 )
DoubleVector.DoubleVector ( int p1 )
DoubleVector.DoubleVector ( int p1, double p2 )
DoubleVector.get ( int p1 )  :  double
DoubleVector.getArrayCopy ( )  :  double[ ]
DoubleVector.indexOfMax ( )  :  int
DoubleVector.innerProduct ( DoubleVector p1 )  :  double
DoubleVector.isEmpty ( )  :  boolean
DoubleVector.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
DoubleVector.map ( String p1, String p2 )  :  DoubleVector
DoubleVector.max ( )  :  double
DoubleVector.minus ( double p1 )  :  DoubleVector
DoubleVector.minus ( DoubleVector p1 )  :  DoubleVector
DoubleVector.minusEquals ( double p1 )  :  DoubleVector
DoubleVector.minusEquals ( DoubleVector p1 )  :  DoubleVector
DoubleVector.norm1 ( )  :  double
DoubleVector.norm2 ( )  :  double
DoubleVector.plus ( double p1 )  :  DoubleVector
DoubleVector.plus ( DoubleVector p1 )  :  DoubleVector
DoubleVector.plusEquals ( double p1 )  :  DoubleVector
DoubleVector.plusEquals ( DoubleVector p1 )  :  DoubleVector
DoubleVector.random ( int p1 ) [static]  :  DoubleVector
DoubleVector.rev ( )  :  DoubleVector
DoubleVector.set ( double p1 )  :  void
DoubleVector.set ( DoubleVector p1 )  :  void
DoubleVector.set ( int p1, double p2 )  :  void
DoubleVector.set ( int p1, int p2, double p3 )  :  void
DoubleVector.set ( int p1, int p2, double[ ] p3, int p4 )  :  void
DoubleVector.set ( int p1, int p2, DoubleVector p3, int p4 )  :  void
DoubleVector.setCapacity ( int p1 )  :  void
DoubleVector.setPlus ( int p1, double p2 )  :  void
DoubleVector.setSize ( int p1 )  :  void
DoubleVector.setTimes ( int p1, double p2 )  :  void
DoubleVector.sign ( )  :  DoubleVector
DoubleVector.size ( )  :  int
DoubleVector.sort ( )  :  void
DoubleVector.sortWithIndex ( )  :  IntVector
DoubleVector.sortWithIndex ( int p1, int p2, IntVector p3 )  :  void
DoubleVector.sqrt ( )  :  DoubleVector
DoubleVector.square ( )  :  DoubleVector
DoubleVector.subvector ( int p1, int p2 )  :  DoubleVector
DoubleVector.subvector ( IntVector p1 )  :  DoubleVector
DoubleVector.sum ( )  :  double
DoubleVector.sum2 ( )  :  double
DoubleVector.sum2 ( DoubleVector p1 )  :  double
DoubleVector.swap ( int p1, int p2 )  :  void
DoubleVector.times ( double p1 )  :  DoubleVector
DoubleVector.times ( DoubleVector p1 )  :  DoubleVector
DoubleVector.timesEquals ( double p1 )  :  DoubleVector
DoubleVector.timesEquals ( DoubleVector p1 )  :  DoubleVector
DoubleVector.toString ( )  :  String
DoubleVector.toString ( int p1, boolean p2 )  :  String
DoubleVector.unpivoting ( IntVector p1, int p2 )  :  DoubleVector
DoubleVector.unsorted ( )  :  boolean

cdk-1.0.1.jar, Drawable.class
package weka.core
Drawable.graph ( ) [abstract]  :  String
Drawable.graphType ( ) [abstract]  :  int

cdk-1.0.1.jar, Edge.class
package weka.gui.treevisualizer
Edge.Edge ( String p1, String p2, String p3 )
Edge.getLabel ( )  :  String
Edge.getLine ( int p1 )  :  String
Edge.getRsource ( )  :  String
Edge.getRtarget ( )  :  String
Edge.getSource ( )  :  Node
Edge.getTarget ( )  :  Node
Edge.setRsource ( String p1 )  :  void
Edge.setRtarget ( String p1 )  :  void
Edge.setSource ( Node p1 )  :  void
Edge.setTarget ( Node p1 )  :  void
Edge.stringSize ( FontMetrics p1 )  :  Dimension

cdk-1.0.1.jar, EigenvalueDecomposition.class
package weka.core.matrix
EigenvalueDecomposition.EigenvalueDecomposition ( Matrix p1 )
EigenvalueDecomposition.getD ( )  :  Matrix
EigenvalueDecomposition.getImagEigenvalues ( )  :  double[ ]
EigenvalueDecomposition.getRealEigenvalues ( )  :  double[ ]
EigenvalueDecomposition.getV ( )  :  Matrix

cdk-1.0.1.jar, EM.class
package weka.clusterers
EM.buildClusterer ( Instances p1 )  :  void
EM.clusterPriors ( )  :  double[ ]
EM.EM ( )
EM.getClusterModelsNumericAtts ( )  :  double[ ][ ][ ]
EM.getClusterPriors ( )  :  double[ ]
EM.getDebug ( )  :  boolean
EM.getMaxIterations ( )  :  int
EM.getMinStdDev ( )  :  double
EM.getNumClusters ( )  :  int
EM.getOptions ( )  :  String[ ]
EM.getSeed ( )  :  int
EM.globalInfo ( )  :  String
EM.listOptions ( )  :  Enumeration
EM.logDensityPerClusterForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
EM.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
EM.maxIterationsTipText ( )  :  String
EM.minStdDevTipText ( )  :  String
EM.numberOfClusters ( )  :  int
EM.numClustersTipText ( )  :  String
EM.resetOptions ( )  :  void
EM.seedTipText ( )  :  String
EM.setDebug ( boolean p1 )  :  void
EM.setMaxIterations ( int p1 )  :  void
EM.setMinStdDev ( double p1 )  :  void
EM.setMinStdDevPerAtt ( double[ ] p1 )  :  void
EM.setNumClusters ( int p1 )  :  void
EM.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
EM.setSeed ( int p1 )  :  void
EM.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, EMCluster.class
package org.openscience.cdk.qsar.model.weka
EMCluster.build ( )  :  void
EMCluster.clusterPriors ( )  :  double[ ]
EMCluster.EMCluster ( )
EMCluster.getClusterModelsNumericAtts ( )  :  double[ ][ ][ ]
EMCluster.getClusterPriors ( )  :  double[ ]
EMCluster.getDebug ( )  :  boolean
EMCluster.getLogDensityPerClusterForInstance ( )  :  Object[ ][ ]
EMCluster.getMaxIterations ( )  :  int
EMCluster.getMinStdDev ( )  :  double
EMCluster.getNumClusters ( )  :  int
EMCluster.getOptions ( )  :  String[ ]
EMCluster.getSeed ( )  :  int
EMCluster.logDensityPerClusterForInstance ( )  :  void
EMCluster.numberOfCluster ( )  :  int
EMCluster.setData ( String filename )  :  void
EMCluster.setData ( String[ ] attrib, int[ ] typAttrib, String[ ] classAttrib, Object[ ] y, Object[ ][ ] x )  :  void
EMCluster.setOptions ( String[ ] options )  :  void
EMCluster.setParameters ( Object[ ][ ] newX )  :  void
EMCluster.setParameters ( String path )  :  void

cdk-1.0.1.jar, EntropyBasedSplitCrit.class
package weka.classifiers.trees.j48
EntropyBasedSplitCrit.EntropyBasedSplitCrit ( )
EntropyBasedSplitCrit.logFunc ( double p1 )  :  double
EntropyBasedSplitCrit.newEnt ( Distribution p1 )  :  double
EntropyBasedSplitCrit.oldEnt ( Distribution p1 )  :  double
EntropyBasedSplitCrit.splitEnt ( Distribution p1 )  :  double

cdk-1.0.1.jar, EntropySplitCrit.class
package weka.classifiers.trees.j48
EntropySplitCrit.EntropySplitCrit ( )
EntropySplitCrit.splitCritValue ( Distribution p1 )  :  double
EntropySplitCrit.splitCritValue ( Distribution p1, Distribution p2 )  :  double

cdk-1.0.1.jar, Estimator.class
package weka.estimators
Estimator.addValue ( double p1, double p2 ) [abstract]  :  void
Estimator.getProbability ( double p1 ) [abstract]  :  double

cdk-1.0.1.jar, Evaluation.class
package weka.classifiers
Evaluation.addNumericTrainClass ( double p1, double p2 )  :  void
Evaluation.attributeValuesString ( Instance p1, Range p2 ) [static]  :  String
Evaluation.avgCost ( )  :  double
Evaluation.confusionMatrix ( )  :  double[ ][ ]
Evaluation.correct ( )  :  double
Evaluation.correlationCoefficient ( )  :  double
Evaluation.crossValidateModel ( Classifier p1, Instances p2, int p3, Random p4 )  :  void
Evaluation.crossValidateModel ( String p1, Instances p2, int p3, String[ ] p4, Random p5 )  :  void
Evaluation.equals ( Object p1 )  :  boolean
Evaluation.errorRate ( )  :  double
Evaluation.evaluateModel ( Classifier p1, Instances p2 )  :  double[ ]
Evaluation.evaluateModel ( Classifier p1, String[ ] p2 ) [static]  :  String
Evaluation.evaluateModel ( String p1, String[ ] p2 ) [static]  :  String
Evaluation.evaluateModelOnce ( Classifier p1, Instance p2 )  :  double
Evaluation.evaluateModelOnce ( double p1, Instance p2 )  :  void
Evaluation.evaluateModelOnce ( double[ ] p1, Instance p2 )  :  double
Evaluation.Evaluation ( Instances p1 )
Evaluation.Evaluation ( Instances p1, CostMatrix p2 )
Evaluation.falseNegativeRate ( int p1 )  :  double
Evaluation.falsePositiveRate ( int p1 )  :  double
Evaluation.fMeasure ( int p1 )  :  double
Evaluation.handleCostOption ( String p1, int p2 ) [static]  :  CostMatrix
Evaluation.incorrect ( )  :  double
Evaluation.kappa ( )  :  double
Evaluation.KBInformation ( )  :  double
Evaluation.KBMeanInformation ( )  :  double
Evaluation.KBRelativeInformation ( )  :  double
Evaluation.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Evaluation.makeDistribution ( double p1 )  :  double[ ]
Evaluation.makeOptionString ( Classifier p1 ) [static]  :  String
Evaluation.meanAbsoluteError ( )  :  double
Evaluation.meanPriorAbsoluteError ( )  :  double
Evaluation.num2ShortID ( int p1, char[ ] p2, int p3 )  :  String
Evaluation.numFalseNegatives ( int p1 )  :  double
Evaluation.numFalsePositives ( int p1 )  :  double
Evaluation.numInstances ( )  :  double
Evaluation.numTrueNegatives ( int p1 )  :  double
Evaluation.numTruePositives ( int p1 )  :  double
Evaluation.pctCorrect ( )  :  double
Evaluation.pctIncorrect ( )  :  double
Evaluation.pctUnclassified ( )  :  double
Evaluation.precision ( int p1 )  :  double
Evaluation.printClassifications ( Classifier p1, Instances p2, String p3, int p4, Range p5 ) [static]  :  String
Evaluation.priorEntropy ( )  :  double
Evaluation.recall ( int p1 )  :  double
Evaluation.relativeAbsoluteError ( )  :  double
Evaluation.rootMeanPriorSquaredError ( )  :  double
Evaluation.rootMeanSquaredError ( )  :  double
Evaluation.rootRelativeSquaredError ( )  :  double
Evaluation.setNumericPriorsFromBuffer ( )  :  void
Evaluation.setPriors ( Instances p1 )  :  void
Evaluation.SFEntropyGain ( )  :  double
Evaluation.SFMeanEntropyGain ( )  :  double
Evaluation.SFMeanPriorEntropy ( )  :  double
Evaluation.SFMeanSchemeEntropy ( )  :  double
Evaluation.SFPriorEntropy ( )  :  double
Evaluation.SFSchemeEntropy ( )  :  double
Evaluation.toClassDetailsString ( )  :  String
Evaluation.toClassDetailsString ( String p1 )  :  String
Evaluation.toCumulativeMarginDistributionString ( )  :  String
Evaluation.toMatrixString ( )  :  String
Evaluation.toMatrixString ( String p1 )  :  String
Evaluation.toSummaryString ( )  :  String
Evaluation.toSummaryString ( boolean p1 )  :  String
Evaluation.toSummaryString ( String p1, boolean p2 )  :  String
Evaluation.totalCost ( )  :  double
Evaluation.trueNegativeRate ( int p1 )  :  double
Evaluation.truePositiveRate ( int p1 )  :  double
Evaluation.unclassified ( )  :  double
Evaluation.updateMargins ( double[ ] p1, int p2, double p3 )  :  void
Evaluation.updateNumericScores ( double[ ] p1, double[ ] p2, double p3 )  :  void
Evaluation.updatePriors ( Instance p1 )  :  void
Evaluation.updateStatsForClassifier ( double[ ] p1, Instance p2 )  :  void
Evaluation.updateStatsForPredictor ( double p1, Instance p2 )  :  void
Evaluation.wekaStaticWrapper ( Sourcable p1, String p2 ) [static]  :  String

cdk-1.0.1.jar, EvaluationUtils.class
package weka.classifiers.evaluation
EvaluationUtils.EvaluationUtils ( )
EvaluationUtils.getCVPredictions ( Classifier p1, Instances p2, int p3 )  :  FastVector
EvaluationUtils.getPrediction ( Classifier p1, Instance p2 )  :  Prediction
EvaluationUtils.getSeed ( )  :  int
EvaluationUtils.getTestPredictions ( Classifier p1, Instances p2 )  :  FastVector
EvaluationUtils.getTrainTestPredictions ( Classifier p1, Instances p2, Instances p3 )  :  FastVector
EvaluationUtils.setSeed ( int p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, EventConstraints.class
package weka.gui.beans
EventConstraints.eventGeneratable ( String p1 ) [abstract]  :  boolean

cdk-1.0.1.jar, ExhaustiveSearch.class
package weka.attributeSelection
ExhaustiveSearch.ExhaustiveSearch ( )
ExhaustiveSearch.getOptions ( )  :  String[ ]
ExhaustiveSearch.getStartSet ( )  :  String
ExhaustiveSearch.getVerbose ( )  :  boolean
ExhaustiveSearch.globalInfo ( )  :  String
ExhaustiveSearch.listOptions ( )  :  Enumeration
ExhaustiveSearch.search ( attributeSelection.ASEvaluation p1, Instances p2 )  :  int[ ]
ExhaustiveSearch.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
ExhaustiveSearch.setStartSet ( String p1 )  :  void
ExhaustiveSearch.setVerbose ( boolean p1 )  :  void
ExhaustiveSearch.startSetTipText ( )  :  String
ExhaustiveSearch.toString ( )  :  String
ExhaustiveSearch.verboseTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, Experiment.class
package weka.experiment
Experiment.advanceCounters ( )  :  void
Experiment.classFirst ( boolean p1 )  :  void
Experiment.Experiment ( )
Experiment.getAdvanceDataSetFirst ( )  :  boolean
Experiment.getCurrentDatasetNumber ( )  :  int
Experiment.getCurrentPropertyNumber ( )  :  int
Experiment.getCurrentRunNumber ( )  :  int
Experiment.getDatasets ( )  :  DefaultListModel
Experiment.getNotes ( )  :  String
Experiment.getOptions ( )  :  String[ ]
Experiment.getPropertyArray ( )  :  Object
Experiment.getPropertyArrayLength ( )  :  int
Experiment.getPropertyArrayValue ( int p1 )  :  Object
Experiment.getPropertyPath ( )  :  PropertyNode[ ]
Experiment.getResultListener ( )  :  ResultListener
Experiment.getResultProducer ( )  :  ResultProducer
Experiment.getRunLower ( )  :  int
Experiment.getRunUpper ( )  :  int
Experiment.getUsePropertyIterator ( )  :  boolean
Experiment.hasMoreIterations ( )  :  boolean
Experiment.initialize ( )  :  void
Experiment.listOptions ( )  :  Enumeration
Experiment.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Experiment.nextIteration ( )  :  void
Experiment.postProcess ( )  :  void
Experiment.runExperiment ( )  :  void
Experiment.setAdvanceDataSetFirst ( boolean p1 )  :  void
Experiment.setDatasets ( DefaultListModel p1 )  :  void
Experiment.setNotes ( String p1 )  :  void
Experiment.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
Experiment.setProperty ( int p1, Object p2 )  :  void
Experiment.setPropertyArray ( Object p1 )  :  void
Experiment.setPropertyPath ( PropertyNode[ ] p1 )  :  void
Experiment.setResultListener ( ResultListener p1 )  :  void
Experiment.setResultProducer ( ResultProducer p1 )  :  void
Experiment.setRunLower ( int p1 )  :  void
Experiment.setRunUpper ( int p1 )  :  void
Experiment.setUsePropertyIterator ( boolean p1 )  :  void
Experiment.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, Experimenter.class
package weka.gui.experiment
Experimenter.Experimenter ( boolean p1 )
Experimenter.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void

cdk-1.0.1.jar, ExperimenterDefaults.class
package weka.gui.experiment
ExperimenterDefaults.ExperimenterDefaults ( )
ExperimenterDefaults.get ( String p1, String p2 ) [static]  :  String
ExperimenterDefaults.getColumn ( ) [static]  :  String
ExperimenterDefaults.getComparisonField ( ) [static]  :  String
ExperimenterDefaults.getDatasetsFirst ( ) [static]  :  boolean
ExperimenterDefaults.getDestination ( ) [static]  :  String
ExperimenterDefaults.getExperimentType ( ) [static]  :  String
ExperimenterDefaults.getExtension ( ) [static]  :  String
ExperimenterDefaults.getFolds ( ) [static]  :  int
ExperimenterDefaults.getInitialDatasetsDirectory ( ) [static]  :  File
ExperimenterDefaults.getMeanPrecision ( ) [static]  :  int
ExperimenterDefaults.getProperties ( ) [static]  :  Properties
ExperimenterDefaults.getRepetitions ( ) [static]  :  int
ExperimenterDefaults.getRow ( ) [static]  :  String
ExperimenterDefaults.getShowStdDevs ( ) [static]  :  boolean
ExperimenterDefaults.getSignificance ( ) [static]  :  double
ExperimenterDefaults.getStdDevPrecision ( ) [static]  :  int
ExperimenterDefaults.getTrainPercentage ( ) [static]  :  double
ExperimenterDefaults.getUseClassification ( ) [static]  :  boolean
ExperimenterDefaults.getUseRelativePaths ( ) [static]  :  boolean

cdk-1.0.1.jar, ExplicitConnectionAtom.class
package org.openscience.cdk.isomorphism.matchers.smarts
ExplicitConnectionAtom.ExplicitConnectionAtom ( )
ExplicitConnectionAtom.ExplicitConnectionAtom ( int connection )
ExplicitConnectionAtom.getNumOfConnection ( )  :  int
ExplicitConnectionAtom.matches ( IAtom atom )  :  boolean
ExplicitConnectionAtom.setNumOfConnection ( int numOfConnection )  :  void

cdk-1.0.1.jar, Explorer.class
package weka.gui.explorer
Explorer.Explorer ( )
Explorer.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void

cdk-1.0.1.jar, ExponentialFormat.class
package weka.classifiers.functions.pace
ExponentialFormat.ExponentialFormat ( )
ExponentialFormat.ExponentialFormat ( int p1 )
ExponentialFormat.ExponentialFormat ( int p1, boolean p2 )
ExponentialFormat.ExponentialFormat ( int p1, int p2, boolean p3, boolean p4 )
ExponentialFormat.format ( double p1, StringBuffer p2, FieldPosition p3 )  :  StringBuffer
ExponentialFormat.width ( )  :  int

cdk-1.0.1.jar, ExtensionFileFilter.class
package weka.gui
ExtensionFileFilter.accept ( File p1 )  :  boolean
ExtensionFileFilter.accept ( File p1, String p2 )  :  boolean
ExtensionFileFilter.ExtensionFileFilter ( String p1, String p2 )
ExtensionFileFilter.ExtensionFileFilter ( String[ ] p1, String p2 )
ExtensionFileFilter.getDescription ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, FarthestFirst.class
package weka.clusterers
FarthestFirst.buildClusterer ( Instances p1 )  :  void
FarthestFirst.clusterInstance ( Instance p1 )  :  int
FarthestFirst.clusterProcessedInstance ( Instance p1 )  :  int
FarthestFirst.difference ( int p1, double p2, double p3 )  :  double
FarthestFirst.distance ( Instance p1, Instance p2 )  :  double
FarthestFirst.farthestAway ( double[ ] p1, boolean[ ] p2 )  :  int
FarthestFirst.FarthestFirst ( )
FarthestFirst.getNumClusters ( )  :  int
FarthestFirst.getOptions ( )  :  String[ ]
FarthestFirst.getSeed ( )  :  int
FarthestFirst.globalInfo ( )  :  String
FarthestFirst.initMinMax ( Instances p1 )  :  void
FarthestFirst.listOptions ( )  :  Enumeration
FarthestFirst.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
FarthestFirst.norm ( double p1, int p2 )  :  double
FarthestFirst.numberOfClusters ( )  :  int
FarthestFirst.numClustersTipText ( )  :  String
FarthestFirst.seedTipText ( )  :  String
FarthestFirst.setNumClusters ( int p1 )  :  void
FarthestFirst.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
FarthestFirst.setSeed ( int p1 )  :  void
FarthestFirst.toString ( )  :  String
FarthestFirst.updateMinDistance ( double[ ] p1, boolean[ ] p2, Instances p3, Instance p4 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, FastVector.class
package weka.core
FastVector.addElement ( Object p1 )  :  void
FastVector.appendElements ( FastVector p1 )  :  void
FastVector.capacity ( )  :  int
FastVector.contains ( Object p1 )  :  boolean
FastVector.copy ( )  :  Object
FastVector.copyElements ( )  :  Object
FastVector.elementAt ( int p1 )  :  Object
FastVector.elements ( )  :  Enumeration
FastVector.elements ( int p1 )  :  Enumeration
FastVector.FastVector ( )
FastVector.FastVector ( int p1 )
FastVector.firstElement ( )  :  Object
FastVector.indexOf ( Object p1 )  :  int
FastVector.insertElementAt ( Object p1, int p2 )  :  void
FastVector.lastElement ( )  :  Object
FastVector.removeAllElements ( )  :  void
FastVector.removeElementAt ( int p1 )  :  void
FastVector.setCapacity ( int p1 )  :  void
FastVector.setElementAt ( Object p1, int p2 )  :  void
FastVector.size ( )  :  int
FastVector.swap ( int p1, int p2 )  :  void
FastVector.toArray ( )  :  Object[ ]
FastVector.trimToSize ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, FastVectorEnumeration.class
package weka.core
FastVector.FastVectorEnumeration.FastVector.FastVectorEnumeration ( FastVector p1, FastVector p2 )
FastVector.FastVectorEnumeration.FastVector.FastVectorEnumeration ( FastVector p1, FastVector p2, int p3 )
FastVector.FastVectorEnumeration.hasMoreElements ( )  :  boolean
FastVector.FastVectorEnumeration.nextElement ( )  :  Object

cdk-1.0.1.jar, FileChooser.class
package weka.gui.arffviewer
FileChooser.FileChooser ( )
FileChooser.FileChooser ( File p1 )
FileChooser.FileChooser ( String p1 )
FileChooser.showSaveDialog ( Component p1 )  :  int

cdk-1.0.1.jar, FileEditor.class
package weka.gui
FileEditor.FileEditor ( )
FileEditor.getCustomEditor ( )  :  Component
FileEditor.getJavaInitializationString ( )  :  String
FileEditor.isPaintable ( )  :  boolean
FileEditor.paintValue ( Graphics p1, Rectangle p2 )  :  void
FileEditor.supportsCustomEditor ( )  :  boolean

cdk-1.0.1.jar, FileSourcedConverter.class
package weka.core.converters
FileSourcedConverter.getFileDescription ( ) [abstract]  :  String
FileSourcedConverter.getFileExtension ( ) [abstract]  :  String
FileSourcedConverter.retrieveFile ( ) [abstract]  :  File
FileSourcedConverter.setFile ( File p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, Filter.class
package weka.filters
Filter.batchFilterFile ( Filter p1, String[ ] p2 ) [static]  :  void
Filter.batchFinished ( )  :  boolean
Filter.bufferInput ( Instance p1 )  :  void
Filter.copyStringValues ( Instance p1, boolean p2, Instances p3, Instances p4 )  :  void
Filter.copyStringValues ( Instance p1, boolean p2, Instances p3, int[ ] p4, Instances p5, int[ ] p6 )  :  void
Filter.Filter ( )
Filter.filterFile ( Filter p1, String[ ] p2 ) [static]  :  void
Filter.flushInput ( )  :  void
Filter.getInputFormat ( )  :  Instances
Filter.getInputStringIndex ( )  :  int[ ]
Filter.getOutputFormat ( )  :  Instances
Filter.getOutputStringIndex ( )  :  int[ ]
Filter.getStringIndices ( Instances p1 )  :  int[ ]
Filter.input ( Instance p1 )  :  boolean
Filter.inputFormat ( Instances p1 )  :  boolean *DEPRECATED*
Filter.inputFormatPeek ( )  :  Instances
Filter.isOutputFormatDefined ( )  :  boolean
Filter.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Filter.numPendingOutput ( )  :  int
Filter.output ( )  :  Instance
Filter.outputFormat ( )  :  Instances *DEPRECATED*
Filter.outputFormatPeek ( )  :  Instances
Filter.outputPeek ( )  :  Instance
Filter.push ( Instance p1 )  :  void
Filter.resetQueue ( )  :  void
Filter.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
Filter.setOutputFormat ( Instances p1 )  :  void
Filter.useFilter ( Instances p1, Filter p2 ) [static]  :  Instances
package weka.gui.beans
Filter.acceptDataSet ( DataSetEvent p1 )  :  void
Filter.acceptInstance ( InstanceEvent p1 )  :  void
Filter.acceptTestSet ( TestSetEvent p1 )  :  void
Filter.acceptTrainingSet ( TrainingSetEvent p1 )  :  void
Filter.addDataSourceListener ( DataSourceListener p1 )  :  void
Filter.addInstanceListener ( InstanceListener p1 )  :  void
Filter.addTestSetListener ( TestSetListener p1 )  :  void
Filter.addTrainingSetListener ( TrainingSetListener p1 )  :  void
Filter.connectionAllowed ( EventSetDescriptor p1 )  :  boolean
Filter.connectionAllowed ( String p1 )  :  boolean
Filter.connectionNotification ( String p1, Object p2 )  :  void
Filter.disconnectionNotification ( String p1, Object p2 )  :  void
Filter.enumerateRequests ( )  :  Enumeration
Filter.eventGeneratable ( String p1 )  :  boolean
Filter.Filter ( )
Filter.getFilter ( )  :  Filter
Filter.getVisual ( )  :  BeanVisual
Filter.getWrappedAlgorithm ( )  :  Object
Filter.globalInfo ( )  :  String
Filter.notifyInstanceListeners ( InstanceEvent p1 )  :  void
Filter.performRequest ( String p1 )  :  void
Filter.removeDataSourceListener ( DataSourceListener p1 )  :  void
Filter.removeInstanceListener ( InstanceListener p1 )  :  void
Filter.removeTestSetListener ( TestSetListener p1 )  :  void
Filter.removeTrainingSetListener ( TrainingSetListener p1 )  :  void
Filter.setFilter ( Filter p1 )  :  void
Filter.setLog ( Logger p1 )  :  void
Filter.setVisual ( BeanVisual p1 )  :  void
Filter.setWrappedAlgorithm ( Object p1 )  :  void
Filter.stop ( )  :  void
Filter.useDefaultVisual ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, FilterBeanInfo.class
package weka.gui.beans
FilterBeanInfo.FilterBeanInfo ( )
FilterBeanInfo.getBeanDescriptor ( )  :  BeanDescriptor
FilterBeanInfo.getEventSetDescriptors ( )  :  EventSetDescriptor[ ]

cdk-1.0.1.jar, FilterCustomizer.class
package weka.gui.beans
FilterCustomizer.addPropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
FilterCustomizer.FilterCustomizer ( )
FilterCustomizer.removePropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
FilterCustomizer.setObject ( Object p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, FilteredClassifier.class
package weka.classifiers.meta
FilteredClassifier.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
FilteredClassifier.defaultClassifierString ( )  :  String
FilteredClassifier.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
FilteredClassifier.FilteredClassifier ( )
FilteredClassifier.filterTipText ( )  :  String
FilteredClassifier.getFilter ( )  :  Filter
FilteredClassifier.getFilterSpec ( )  :  String
FilteredClassifier.getOptions ( )  :  String[ ]
FilteredClassifier.globalInfo ( )  :  String
FilteredClassifier.graph ( )  :  String
FilteredClassifier.graphType ( )  :  int
FilteredClassifier.listOptions ( )  :  Enumeration
FilteredClassifier.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
FilteredClassifier.setFilter ( Filter p1 )  :  void
FilteredClassifier.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
FilteredClassifier.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, FilterSupervisedResample.class
package org.openscience.cdk.qsar.model.weka
FilterSupervisedResample.build ( )  :  void
FilterSupervisedResample.FilterSupervisedResample ( )
FilterSupervisedResample.getBiasToUniformClass ( )  :  double
FilterSupervisedResample.getOptions ( )  :  String[ ]
FilterSupervisedResample.getRandomSeed ( )  :  int
FilterSupervisedResample.getSampleSizePercent ( )  :  double
FilterSupervisedResample.setData ( String filename )  :  void
FilterSupervisedResample.setData ( String[ ] attrib, int[ ] typAttrib, String[ ] classAttrib, Object[ ] y, Object[ ][ ] x )  :  void
FilterSupervisedResample.setOptions ( String[ ] options )  :  void

cdk-1.0.1.jar, FilterUnSupervisedRandomize.class
package org.openscience.cdk.qsar.model.weka
FilterUnSupervisedRandomize.build ( )  :  void
FilterUnSupervisedRandomize.FilterUnSupervisedRandomize ( )
FilterUnSupervisedRandomize.getOptions ( )  :  String[ ]
FilterUnSupervisedRandomize.getRandomSeed ( )  :  int
FilterUnSupervisedRandomize.setData ( String filename )  :  void
FilterUnSupervisedRandomize.setData ( String[ ] attrib, int[ ] typAttrib, String[ ] classAttrib, Object[ ] y, Object[ ][ ] x )  :  void
FilterUnSupervisedRandomize.setOptions ( String[ ] options )  :  void

cdk-1.0.1.jar, FilterUnSupervisedResample.class
package org.openscience.cdk.qsar.model.weka
FilterUnSupervisedResample.build ( )  :  void
FilterUnSupervisedResample.FilterUnSupervisedResample ( )
FilterUnSupervisedResample.getOptions ( )  :  String[ ]
FilterUnSupervisedResample.getRandomSeed ( )  :  int
FilterUnSupervisedResample.getSampleSizePercent ( )  :  double
FilterUnSupervisedResample.setData ( String filename )  :  void
FilterUnSupervisedResample.setData ( String[ ] attrib, int[ ] typAttrib, String[ ] classAttrib, Object[ ] y, Object[ ][ ] x )  :  void
FilterUnSupervisedResample.setOptions ( String[ ] options )  :  void

cdk-1.0.1.jar, FirstOrder.class
package weka.filters.unsupervised.attribute
FirstOrder.attributeIndicesTipText ( )  :  String
FirstOrder.FirstOrder ( )
FirstOrder.getAttributeIndices ( )  :  String
FirstOrder.getOptions ( )  :  String[ ]
FirstOrder.globalInfo ( )  :  String
FirstOrder.input ( Instance p1 )  :  boolean
FirstOrder.listOptions ( )  :  Enumeration
FirstOrder.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
FirstOrder.setAttributeIndices ( String p1 )  :  void
FirstOrder.setAttributeIndicesArray ( int[ ] p1 )  :  void
FirstOrder.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
FirstOrder.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, FlexibleDecimalFormat.class
package weka.classifiers.functions.pace
FlexibleDecimalFormat.FlexibleDecimalFormat ( )
FlexibleDecimalFormat.FlexibleDecimalFormat ( double p1 )
FlexibleDecimalFormat.FlexibleDecimalFormat ( int p1 )
FlexibleDecimalFormat.FlexibleDecimalFormat ( int p1, boolean p2 )
FlexibleDecimalFormat.FlexibleDecimalFormat ( int p1, boolean p2, boolean p3, boolean p4 )
FlexibleDecimalFormat.format ( double p1, StringBuffer p2, FieldPosition p3 )  :  StringBuffer
FlexibleDecimalFormat.formatString ( String p1 )  :  StringBuffer
FlexibleDecimalFormat.grouping ( boolean p1 )  :  void
FlexibleDecimalFormat.needExponentialFormat ( double p1 )  :  boolean
FlexibleDecimalFormat.update ( double p1 )  :  void
FlexibleDecimalFormat.width ( )  :  int

cdk-1.0.1.jar, FloatingPointFormat.class
package weka.classifiers.functions.pace
FloatingPointFormat.FloatingPointFormat ( )
FloatingPointFormat.FloatingPointFormat ( int p1 )
FloatingPointFormat.FloatingPointFormat ( int p1, int p2 )
FloatingPointFormat.FloatingPointFormat ( int p1, int p2, boolean p3 )
FloatingPointFormat.format ( double p1, StringBuffer p2, FieldPosition p3 )  :  StringBuffer
FloatingPointFormat.pattern ( int p1, int p2 ) [static]  :  String
FloatingPointFormat.width ( )  :  int

cdk-1.0.1.jar, FromFile.class
package weka.classifiers.bayes.net.search.fixed
FromFile.buildStructure ( BayesNet p1, Instances p2 )  :  void
FromFile.FromFile ( )
FromFile.getBIFFile ( )  :  String
FromFile.getOptions ( )  :  String[ ]
FromFile.listOptions ( )  :  Enumeration
FromFile.setBIFFile ( String p1 )  :  void
FromFile.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, GABitSet.class
package weka.attributeSelection
GeneticSearch.GABitSet.clear ( int p1 )  :  void
GeneticSearch.GABitSet.clone ( )  :  Object
GeneticSearch.GABitSet.GeneticSearch.GABitSet ( attributeSelection.GeneticSearch p1 )
GeneticSearch.GABitSet.get ( int p1 )  :  boolean
GeneticSearch.GABitSet.getChromosome ( )  :  BitSet
GeneticSearch.GABitSet.getFitness ( )  :  double
GeneticSearch.GABitSet.getObjective ( )  :  double
GeneticSearch.GABitSet.set ( int p1 )  :  void
GeneticSearch.GABitSet.setChromosome ( BitSet p1 )  :  void
GeneticSearch.GABitSet.setFitness ( double p1 )  :  void
GeneticSearch.GABitSet.setObjective ( double p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, GainRatioAttributeEval.class
package weka.attributeSelection
GainRatioAttributeEval.buildEvaluator ( Instances p1 )  :  void
GainRatioAttributeEval.evaluateAttribute ( int p1 )  :  double
GainRatioAttributeEval.GainRatioAttributeEval ( )
GainRatioAttributeEval.getMissingMerge ( )  :  boolean
GainRatioAttributeEval.getOptions ( )  :  String[ ]
GainRatioAttributeEval.globalInfo ( )  :  String
GainRatioAttributeEval.listOptions ( )  :  Enumeration
GainRatioAttributeEval.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
GainRatioAttributeEval.missingMergeTipText ( )  :  String
GainRatioAttributeEval.resetOptions ( )  :  void
GainRatioAttributeEval.setMissingMerge ( boolean p1 )  :  void
GainRatioAttributeEval.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
GainRatioAttributeEval.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, GainRatioSplitCrit.class
package weka.classifiers.trees.j48
GainRatioSplitCrit.GainRatioSplitCrit ( )
GainRatioSplitCrit.splitCritValue ( Distribution p1 )  :  double
GainRatioSplitCrit.splitCritValue ( Distribution p1, double p2, double p3 )  :  double

cdk-1.0.1.jar, Generator.class
package weka.datagenerators
Generator.Generator ( )
Generator.getDebug ( )  :  boolean
Generator.getFormat ( )  :  Instances
Generator.getNumAttributes ( )  :  int
Generator.getNumClasses ( )  :  int
Generator.getNumExamples ( )  :  int
Generator.getNumExamplesAct ( )  :  int
Generator.getOutput ( )  :  PrintWriter
Generator.getRelationName ( )  :  String
Generator.makeData ( Generator p1, String[ ] p2 ) [static]  :  void
Generator.setDebug ( boolean p1 )  :  void
Generator.setFormat ( Instances p1 )  :  void
Generator.setNumAttributes ( int p1 )  :  void
Generator.setNumClasses ( int p1 )  :  void
Generator.setNumExamples ( int p1 )  :  void
Generator.setNumExamplesAct ( int p1 )  :  void
Generator.setOutput ( PrintWriter p1 )  :  void
Generator.setRelationName ( String p1 )  :  void
Generator.toStringFormat ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, GeneratorPropertyIteratorPanel.class
package weka.gui.experiment
GeneratorPropertyIteratorPanel.actionPerformed ( ActionEvent p1 )  :  void
GeneratorPropertyIteratorPanel.addActionListener ( ActionListener p1 )  :  void
GeneratorPropertyIteratorPanel.GeneratorPropertyIteratorPanel ( )
GeneratorPropertyIteratorPanel.GeneratorPropertyIteratorPanel ( Experiment p1 )
GeneratorPropertyIteratorPanel.getEditorActive ( )  :  boolean
GeneratorPropertyIteratorPanel.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
GeneratorPropertyIteratorPanel.selectProperty ( )  :  int
GeneratorPropertyIteratorPanel.setExperiment ( Experiment p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, GenericArrayEditor.class
package weka.gui
GenericArrayEditor.addPropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
GenericArrayEditor.GenericArrayEditor ( )
GenericArrayEditor.getAsText ( )  :  String
GenericArrayEditor.getCustomEditor ( )  :  Component
GenericArrayEditor.getJavaInitializationString ( )  :  String
GenericArrayEditor.getTags ( )  :  String[ ]
GenericArrayEditor.getValue ( )  :  Object
GenericArrayEditor.isPaintable ( )  :  boolean
GenericArrayEditor.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
GenericArrayEditor.paintValue ( Graphics p1, Rectangle p2 )  :  void
GenericArrayEditor.removePropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
GenericArrayEditor.setAsText ( String p1 )  :  void
GenericArrayEditor.setValue ( Object p1 )  :  void
GenericArrayEditor.supportsCustomEditor ( )  :  boolean

cdk-1.0.1.jar, GenericObjectEditor.class
package weka.gui
GenericObjectEditor.addChildrenToTree ( DefaultMutableTreeNode p1, HierarchyPropertyParser p2 )  :  void
GenericObjectEditor.addPropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
GenericObjectEditor.classSelected ( String p1 )  :  void
GenericObjectEditor.createChooseClassButton ( )  :  JButton
GenericObjectEditor.createTree ( Hashtable p1 )  :  JTree
GenericObjectEditor.GenericObjectEditor ( )
GenericObjectEditor.GenericObjectEditor ( boolean p1 )
GenericObjectEditor.getAsText ( )  :  String
GenericObjectEditor.getBackup ( )  :  Object
GenericObjectEditor.getChooseClassPopupMenu ( )  :  JPopupMenu
GenericObjectEditor.getClassesFromProperties ( )  :  Hashtable
GenericObjectEditor.getCustomEditor ( )  :  Component
GenericObjectEditor.getCustomPanel ( )  :  JPanel
GenericObjectEditor.getJavaInitializationString ( )  :  String
GenericObjectEditor.getRootFromClass ( String p1, String p2 ) [static]  :  String
GenericObjectEditor.getTags ( )  :  String[ ]
GenericObjectEditor.getValue ( )  :  Object
GenericObjectEditor.isPaintable ( )  :  boolean
GenericObjectEditor.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
GenericObjectEditor.paintValue ( Graphics p1, Rectangle p2 )  :  void
GenericObjectEditor.removePropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
GenericObjectEditor.setAsText ( String p1 )  :  void
GenericObjectEditor.setClassType ( Class p1 )  :  void
GenericObjectEditor.setDefaultValue ( )  :  void
GenericObjectEditor.setEnabled ( boolean p1 )  :  void
GenericObjectEditor.setObject ( Object p1 )  :  void
GenericObjectEditor.setValue ( Object p1 )  :  void
GenericObjectEditor.sortClassesByRoot ( String p1 ) [static]  :  Hashtable
GenericObjectEditor.supportsCustomEditor ( )  :  boolean
GenericObjectEditor.updateObjectNames ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, GenericPropertiesCreator.class
package weka.gui
GenericPropertiesCreator.execute ( )  :  void
GenericPropertiesCreator.execute ( boolean p1 )  :  void
GenericPropertiesCreator.generateOutputProperties ( )  :  void
GenericPropertiesCreator.GenericPropertiesCreator ( )
GenericPropertiesCreator.GenericPropertiesCreator ( String p1 )
GenericPropertiesCreator.getExplicitPropsFile ( )  :  boolean
GenericPropertiesCreator.getInputFilename ( )  :  String
GenericPropertiesCreator.getInputProperties ( )  :  Properties
GenericPropertiesCreator.getOutputFilename ( )  :  String
GenericPropertiesCreator.getOutputProperties ( )  :  Properties
GenericPropertiesCreator.isValidClassname ( String p1 )  :  boolean
GenericPropertiesCreator.isValidClassname ( String p1, String p2 )  :  boolean
GenericPropertiesCreator.loadInputProperties ( )  :  void
GenericPropertiesCreator.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
GenericPropertiesCreator.setExplicitPropsFile ( boolean p1 )  :  void
GenericPropertiesCreator.setInputFilename ( String p1 )  :  void
GenericPropertiesCreator.setOutputFilename ( String p1 )  :  void
GenericPropertiesCreator.storeOutputProperties ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, GeneticSearch.class
package weka.attributeSelection
GeneticSearch.crossoverProbTipText ( )  :  String
GeneticSearch.GeneticSearch ( )
GeneticSearch.getCrossoverProb ( )  :  double
GeneticSearch.getMaxGenerations ( )  :  int
GeneticSearch.getMutationProb ( )  :  double
GeneticSearch.getOptions ( )  :  String[ ]
GeneticSearch.getPopulationSize ( )  :  int
GeneticSearch.getReportFrequency ( )  :  int
GeneticSearch.getSeed ( )  :  int
GeneticSearch.getStartSet ( )  :  String
GeneticSearch.globalInfo ( )  :  String
GeneticSearch.listOptions ( )  :  Enumeration
GeneticSearch.maxGenerationsTipText ( )  :  String
GeneticSearch.mutationProbTipText ( )  :  String
GeneticSearch.populationSizeTipText ( )  :  String
GeneticSearch.reportFrequencyTipText ( )  :  String
GeneticSearch.search ( attributeSelection.ASEvaluation p1, Instances p2 )  :  int[ ]
GeneticSearch.seedTipText ( )  :  String
GeneticSearch.setCrossoverProb ( double p1 )  :  void
GeneticSearch.setMaxGenerations ( int p1 )  :  void
GeneticSearch.setMutationProb ( double p1 )  :  void
GeneticSearch.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
GeneticSearch.setPopulationSize ( int p1 )  :  void
GeneticSearch.setReportFrequency ( int p1 )  :  void
GeneticSearch.setSeed ( int p1 )  :  void
GeneticSearch.setStartSet ( String p1 )  :  void
GeneticSearch.startSetTipText ( )  :  String
GeneticSearch.toString ( )  :  String
package weka.classifiers.bayes.net.search.global
GeneticSearch.descendantPopulationSizeTipText ( )  :  String
GeneticSearch.GeneticSearch ( )
GeneticSearch.getDescendantPopulationSize ( )  :  int
GeneticSearch.getOptions ( )  :  String[ ]
GeneticSearch.getPopulationSize ( )  :  int
GeneticSearch.getRuns ( )  :  int
GeneticSearch.getSeed ( )  :  int
GeneticSearch.getUseCrossOver ( )  :  boolean
GeneticSearch.getUseMutation ( )  :  boolean
GeneticSearch.getUseTournamentSelection ( )  :  boolean
GeneticSearch.globalInfo ( )  :  String
GeneticSearch.listOptions ( )  :  Enumeration
GeneticSearch.populationSizeTipText ( )  :  String
GeneticSearch.runsTipText ( )  :  String
GeneticSearch.search ( BayesNet p1, Instances p2 )  :  void
GeneticSearch.seedTipText ( )  :  String
GeneticSearch.setDescendantPopulationSize ( int p1 )  :  void
GeneticSearch.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
GeneticSearch.setPopulationSize ( int p1 )  :  void
GeneticSearch.setRuns ( int p1 )  :  void
GeneticSearch.setSeed ( int p1 )  :  void
GeneticSearch.setUseCrossOver ( boolean p1 )  :  void
GeneticSearch.setUseMutation ( boolean p1 )  :  void
GeneticSearch.setUseTournamentSelection ( boolean p1 )  :  void
GeneticSearch.useCrossOverTipText ( )  :  String
GeneticSearch.useMutationTipText ( )  :  String
GeneticSearch.useTournamentSelectionTipText ( )  :  String
package weka.classifiers.bayes.net.search.local
GeneticSearch.descendantPopulationSizeTipText ( )  :  String
GeneticSearch.GeneticSearch ( )
GeneticSearch.getDescendantPopulationSize ( )  :  int
GeneticSearch.getOptions ( )  :  String[ ]
GeneticSearch.getPopulationSize ( )  :  int
GeneticSearch.getRuns ( )  :  int
GeneticSearch.getSeed ( )  :  int
GeneticSearch.getUseCrossOver ( )  :  boolean
GeneticSearch.getUseMutation ( )  :  boolean
GeneticSearch.getUseTournamentSelection ( )  :  boolean
GeneticSearch.globalInfo ( )  :  String
GeneticSearch.listOptions ( )  :  Enumeration
GeneticSearch.populationSizeTipText ( )  :  String
GeneticSearch.runsTipText ( )  :  String
GeneticSearch.search ( BayesNet p1, Instances p2 )  :  void
GeneticSearch.seedTipText ( )  :  String
GeneticSearch.setDescendantPopulationSize ( int p1 )  :  void
GeneticSearch.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
GeneticSearch.setPopulationSize ( int p1 )  :  void
GeneticSearch.setRuns ( int p1 )  :  void
GeneticSearch.setSeed ( int p1 )  :  void
GeneticSearch.setUseCrossOver ( boolean p1 )  :  void
GeneticSearch.setUseMutation ( boolean p1 )  :  void
GeneticSearch.setUseTournamentSelection ( boolean p1 )  :  void
GeneticSearch.useCrossOverTipText ( )  :  String
GeneticSearch.useMutationTipText ( )  :  String
GeneticSearch.useTournamentSelectionTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, GlobalScoreSearchAlgorithm.class
package weka.classifiers.bayes.net.search.global
GlobalScoreSearchAlgorithm.calcScore ( BayesNet p1 )  :  double
GlobalScoreSearchAlgorithm.calcScoreWithExtraParent ( int p1, int p2 )  :  double
GlobalScoreSearchAlgorithm.calcScoreWithMissingParent ( int p1, int p2 )  :  double
GlobalScoreSearchAlgorithm.calcScoreWithReversedParent ( int p1, int p2 )  :  double
GlobalScoreSearchAlgorithm.cumulativeCV ( BayesNet p1 )  :  double
GlobalScoreSearchAlgorithm.CVTypeTipText ( )  :  String
GlobalScoreSearchAlgorithm.getCVType ( )  :  SelectedTag
GlobalScoreSearchAlgorithm.getOptions ( )  :  String[ ]
GlobalScoreSearchAlgorithm.getUseProb ( )  :  boolean
GlobalScoreSearchAlgorithm.globalInfo ( )  :  String
GlobalScoreSearchAlgorithm.GlobalScoreSearchAlgorithm ( )
GlobalScoreSearchAlgorithm.kFoldCV ( BayesNet p1, int p2 )  :  double
GlobalScoreSearchAlgorithm.leaveOneOutCV ( BayesNet p1 )  :  double
GlobalScoreSearchAlgorithm.listOptions ( )  :  Enumeration
GlobalScoreSearchAlgorithm.setCVType ( SelectedTag p1 )  :  void
GlobalScoreSearchAlgorithm.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
GlobalScoreSearchAlgorithm.setUseProb ( boolean p1 )  :  void
GlobalScoreSearchAlgorithm.useProbTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, GOEPanel.class
package weka.gui
GenericObjectEditor.GOEPanel.addCancelListener ( ActionListener p1 )  :  void
GenericObjectEditor.GOEPanel.addOkListener ( ActionListener p1 )  :  void
GenericObjectEditor.GOEPanel.copyObject ( Object p1 )  :  Object
GenericObjectEditor.GOEPanel.createFileChooser ( )  :  void
GenericObjectEditor.GOEPanel.GenericObjectEditor.GOEPanel ( GenericObjectEditor p1 )
GenericObjectEditor.GOEPanel.openObject ( )  :  Object
GenericObjectEditor.GOEPanel.removeCancelListener ( ActionListener p1 )  :  void
GenericObjectEditor.GOEPanel.removeOkListener ( ActionListener p1 )  :  void
GenericObjectEditor.GOEPanel.saveObject ( Object p1 )  :  void
GenericObjectEditor.GOEPanel.setCancelButton ( boolean p1 )  :  void
GenericObjectEditor.GOEPanel.setOkButtonText ( String p1 )  :  void
GenericObjectEditor.GOEPanel.updateChildPropertySheet ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, Grading.class
package weka.classifiers.meta
Grading.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
Grading.generateMetaLevel ( Instances p1, Random p2 )  :  void
Grading.globalInfo ( )  :  String
Grading.Grading ( )
Grading.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Grading.metaFormat ( Instances p1 )  :  Instances
Grading.metaInstance ( Instance p1, int p2 )  :  Instance
Grading.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, GraphEdge.class
package weka.gui.graphvisualizer
GraphEdge.equals ( Object p1 )  :  boolean
GraphEdge.GraphEdge ( int p1, int p2, int p3 )
GraphEdge.GraphEdge ( int p1, int p2, int p3, String p4, String p5 )
GraphEdge.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, GraphEvent.class
package weka.gui.beans
GraphEvent.getGraphString ( )  :  String
GraphEvent.getGraphTitle ( )  :  String
GraphEvent.getGraphType ( )  :  int
GraphEvent.GraphEvent ( Object p1, String p2, String p3, int p4 )

cdk-1.0.1.jar, GraphListener.class
package weka.gui.beans
GraphListener.acceptGraph ( GraphEvent p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, GraphNode.class
package weka.gui.graphvisualizer
GraphNode.equals ( Object p1 )  :  boolean
GraphNode.GraphNode ( String p1, String p2 )
GraphNode.GraphNode ( String p1, String p2, int p3 )

cdk-1.0.1.jar, GraphViewer.class
package weka.gui.beans
GraphViewer.acceptGraph ( GraphEvent p1 )  :  void
GraphViewer.enumerateRequests ( )  :  Enumeration
GraphViewer.getVisual ( )  :  BeanVisual
GraphViewer.globalInfo ( )  :  String
GraphViewer.GraphViewer ( )
GraphViewer.performRequest ( String p1 )  :  void
GraphViewer.setVisual ( BeanVisual p1 )  :  void
GraphViewer.showResults ( )  :  void
GraphViewer.useDefaultVisual ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, GraphViewerBeanInfo.class
package weka.gui.beans
GraphViewerBeanInfo.getEventSetDescriptors ( )  :  EventSetDescriptor[ ]
GraphViewerBeanInfo.GraphViewerBeanInfo ( )

cdk-1.0.1.jar, GraphVisualizer.class
package weka.gui.graphvisualizer
GraphVisualizer.GraphVisualizer ( )
GraphVisualizer.layoutCompleted ( LayoutCompleteEvent p1 )  :  void
GraphVisualizer.layoutGraph ( )  :  void
GraphVisualizer.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
GraphVisualizer.readBIF ( InputStream p1 )  :  void
GraphVisualizer.readBIF ( String p1 )  :  void
GraphVisualizer.readDOT ( Reader p1 )  :  void
GraphVisualizer.setAppropriateNodeSize ( )  :  void
GraphVisualizer.setAppropriateSize ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, GreedyStepwise.class
package weka.attributeSelection
GreedyStepwise.attributeList ( BitSet p1 )  :  int[ ]
GreedyStepwise.generateRankingTipText ( )  :  String
GreedyStepwise.getCalculatedNumToSelect ( )  :  int
GreedyStepwise.getGenerateRanking ( )  :  boolean
GreedyStepwise.getNumToSelect ( )  :  int
GreedyStepwise.getOptions ( )  :  String[ ]
GreedyStepwise.getSearchBackwards ( )  :  boolean
GreedyStepwise.getStartSet ( )  :  String
GreedyStepwise.getThreshold ( )  :  double
GreedyStepwise.globalInfo ( )  :  String
GreedyStepwise.GreedyStepwise ( )
GreedyStepwise.listOptions ( )  :  Enumeration
GreedyStepwise.numToSelectTipText ( )  :  String
GreedyStepwise.rankedAttributes ( )  :  double[ ][ ]
GreedyStepwise.resetOptions ( )  :  void
GreedyStepwise.search ( attributeSelection.ASEvaluation p1, Instances p2 )  :  int[ ]
GreedyStepwise.searchBackwardsTipText ( )  :  String
GreedyStepwise.setGenerateRanking ( boolean p1 )  :  void
GreedyStepwise.setNumToSelect ( int p1 )  :  void
GreedyStepwise.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
GreedyStepwise.setSearchBackwards ( boolean p1 )  :  void
GreedyStepwise.setStartSet ( String p1 )  :  void
GreedyStepwise.setThreshold ( double p1 )  :  void
GreedyStepwise.startSetTipText ( )  :  String
GreedyStepwise.startSetToString ( )  :  String
GreedyStepwise.thresholdTipText ( )  :  String
GreedyStepwise.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, GUIChooser.class
package weka.gui
GUIChooser.GUIChooser ( )
GUIChooser.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void

cdk-1.0.1.jar, hashKey.class
package weka.attributeSelection
ConsistencySubsetEval.hashKey.ConsistencySubsetEval.hashKey ( attributeSelection.ConsistencySubsetEval p1, double[ ] p2 )
ConsistencySubsetEval.hashKey.ConsistencySubsetEval.hashKey ( attributeSelection.ConsistencySubsetEval p1, Instance p2, int p3 )
ConsistencySubsetEval.hashKey.equals ( Object p1 )  :  boolean
ConsistencySubsetEval.hashKey.hashCode ( )  :  int
ConsistencySubsetEval.hashKey.print_hash_code ( )  :  void
ConsistencySubsetEval.hashKey.toString ( Instances p1, int p2 )  :  String
package weka.classifiers.rules
DecisionTable.hashKey.DecisionTable.hashKey ( double[ ] p1 )
DecisionTable.hashKey.DecisionTable.hashKey ( Instance p1, int p2, boolean p3 )
DecisionTable.hashKey.equals ( Object p1 )  :  boolean
DecisionTable.hashKey.hashCode ( )  :  int
DecisionTable.hashKey.print_hash_code ( )  :  void
DecisionTable.hashKey.toString ( Instances p1, int p2 )  :  String

cdk-1.0.1.jar, Head.class
package weka.associations.tertius
Head.canKeep ( Instance p1, Literal p2 )  :  boolean
Head.Head ( )
Head.Head ( Instances p1 )
Head.isIncludedIn ( Rule p1 )  :  boolean
Head.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, HierarchicalBCEngine.class
package weka.gui.graphvisualizer
HierarchicalBCEngine.addLayoutCompleteEventListener ( LayoutCompleteEventListener p1 )  :  void
HierarchicalBCEngine.assignLevels ( int[ ] p1, int p2, int p3, int p4 )  :  void
HierarchicalBCEngine.calcColBC ( int p1, int[ ][ ] p2 )  :  float[ ]
HierarchicalBCEngine.calcRowBC ( int p1, int[ ][ ] p2 )  :  float[ ]
HierarchicalBCEngine.clearTemps_and_EdgesFromNodes ( )  :  void
HierarchicalBCEngine.copy2DArray ( int[ ][ ] p1, int[ ][ ] p2 )  :  void
HierarchicalBCEngine.copyMatrix ( int[ ][ ] p1, int[ ][ ] p2 )  :  void
HierarchicalBCEngine.crossings ( int[ ][ ] p1 )  :  int
HierarchicalBCEngine.fireLayoutCompleteEvent ( LayoutCompleteEvent p1 )  :  void
HierarchicalBCEngine.getControlPanel ( )  :  JPanel
HierarchicalBCEngine.getProgressBar ( )  :  JProgressBar
HierarchicalBCEngine.HierarchicalBCEngine ( )
HierarchicalBCEngine.HierarchicalBCEngine ( FastVector p1, FastVector p2, int p3, int p4 )
HierarchicalBCEngine.HierarchicalBCEngine ( FastVector p1, FastVector p2, int p3, int p4, boolean p5 )
HierarchicalBCEngine.isort ( int[ ] p1, float[ ] p2 ) [static]  :  void
HierarchicalBCEngine.layoutGraph ( )  :  void
HierarchicalBCEngine.lBCenter ( int p1, int p2, int[ ] p3 )  :  int
HierarchicalBCEngine.lConnectivity ( int p1, int p2 )  :  int
HierarchicalBCEngine.makeGUIPanel ( boolean p1 )  :  void
HierarchicalBCEngine.makeProperHierarchy ( )  :  void
HierarchicalBCEngine.naiveLayout ( )  :  void
HierarchicalBCEngine.phaseID ( int p1, int[ ][ ] p2 )  :  void
HierarchicalBCEngine.phaseIID ( int p1, int[ ][ ] p2 )  :  void
HierarchicalBCEngine.phaseIIU ( int p1, int[ ][ ] p2 )  :  void
HierarchicalBCEngine.phaseIU ( int p1, int[ ][ ] p2 )  :  void
HierarchicalBCEngine.printMatrices ( int[ ][ ] p1 )  :  void
HierarchicalBCEngine.priorityLayout1 ( )  :  void
HierarchicalBCEngine.processGraph ( )  :  void
HierarchicalBCEngine.removeCycles ( )  :  void
HierarchicalBCEngine.removeLayoutCompleteEventListener ( LayoutCompleteEventListener p1 )  :  void
HierarchicalBCEngine.setNodesEdges ( FastVector p1, FastVector p2 )  :  void
HierarchicalBCEngine.setNodeSize ( int p1, int p2 )  :  void
HierarchicalBCEngine.uBCenter ( int p1, int p2, int[ ] p3 )  :  int
HierarchicalBCEngine.uConnectivity ( int p1, int p2 )  :  int

cdk-1.0.1.jar, HierarchyPropertyParser.class
package weka.gui
HierarchyPropertyParser.add ( String p1 )  :  void
HierarchyPropertyParser.build ( String p1, String p2 )  :  void
HierarchyPropertyParser.childrenValues ( )  :  String[ ]
HierarchyPropertyParser.contains ( String p1 )  :  boolean
HierarchyPropertyParser.context ( )  :  String
HierarchyPropertyParser.depth ( )  :  int
HierarchyPropertyParser.fullValue ( )  :  String
HierarchyPropertyParser.getLevel ( )  :  int
HierarchyPropertyParser.getSeperator ( )  :  String
HierarchyPropertyParser.getValue ( )  :  String
HierarchyPropertyParser.goDown ( String p1 )  :  boolean
HierarchyPropertyParser.goTo ( String p1 )  :  boolean
HierarchyPropertyParser.goToChild ( int p1 )  :  void
HierarchyPropertyParser.goToChild ( String p1 )  :  boolean
HierarchyPropertyParser.goToParent ( )  :  void
HierarchyPropertyParser.goToRoot ( )  :  void
HierarchyPropertyParser.HierarchyPropertyParser ( )
HierarchyPropertyParser.HierarchyPropertyParser ( String p1, String p2 )
HierarchyPropertyParser.isHierachic ( String p1 )  :  boolean
HierarchyPropertyParser.isLeafReached ( )  :  boolean
HierarchyPropertyParser.isRootReached ( )  :  boolean
HierarchyPropertyParser.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
HierarchyPropertyParser.numChildren ( )  :  int
HierarchyPropertyParser.parentValue ( )  :  String
HierarchyPropertyParser.search ( Vector p1, String p2 )  :  int
HierarchyPropertyParser.setSeperator ( String p1 )  :  void
HierarchyPropertyParser.showTree ( )  :  String
HierarchyPropertyParser.tokenize ( String p1 )  :  String[ ]

cdk-1.0.1.jar, HillClimber.class
package weka.classifiers.bayes.net.search.global
HillClimber.getInitAsNaiveBayes ( )  :  boolean
HillClimber.getMaxNrOfParents ( )  :  int
HillClimber.getOptions ( )  :  String[ ]
HillClimber.getUseArcReversal ( )  :  boolean
HillClimber.globalInfo ( )  :  String
HillClimber.HillClimber ( )
HillClimber.listOptions ( )  :  Enumeration
HillClimber.search ( BayesNet p1, Instances p2 )  :  void
HillClimber.setInitAsNaiveBayes ( boolean p1 )  :  void
HillClimber.setMaxNrOfParents ( int p1 )  :  void
HillClimber.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
HillClimber.setUseArcReversal ( boolean p1 )  :  void
HillClimber.useArcReversalTipText ( )  :  String
package weka.classifiers.bayes.net.search.local
HillClimber.getInitAsNaiveBayes ( )  :  boolean
HillClimber.getMaxNrOfParents ( )  :  int
HillClimber.getOptions ( )  :  String[ ]
HillClimber.getUseArcReversal ( )  :  boolean
HillClimber.globalInfo ( )  :  String
HillClimber.HillClimber ( )
HillClimber.listOptions ( )  :  Enumeration
HillClimber.search ( BayesNet p1, Instances p2 )  :  void
HillClimber.setInitAsNaiveBayes ( boolean p1 )  :  void
HillClimber.setMaxNrOfParents ( int p1 )  :  void
HillClimber.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
HillClimber.setUseArcReversal ( boolean p1 )  :  void
HillClimber.useArcReversalTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, HoldOutSubsetEvaluator.class
package weka.attributeSelection
HoldOutSubsetEvaluator.evaluateSubset ( BitSet p1, Instance p2, boolean p3 ) [abstract]  :  double
HoldOutSubsetEvaluator.evaluateSubset ( BitSet p1, Instances p2 ) [abstract]  :  double
HoldOutSubsetEvaluator.HoldOutSubsetEvaluator ( )

cdk-1.0.1.jar, HostListPanel.class
package weka.gui.experiment
HostListPanel.actionPerformed ( ActionEvent p1 )  :  void
HostListPanel.HostListPanel ( )
HostListPanel.HostListPanel ( RemoteExperiment p1 )
HostListPanel.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
HostListPanel.setExperiment ( RemoteExperiment p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, HyperPipes.class
package weka.classifiers.misc
HyperPipes.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
HyperPipes.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
HyperPipes.globalInfo ( )  :  String
HyperPipes.HyperPipes ( )
HyperPipes.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
HyperPipes.toString ( )  :  String
HyperPipes.updateClassifier ( Instance p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, IB1.class
package weka.classifiers.lazy
IB1.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
IB1.classifyInstance ( Instance p1 )  :  double
IB1.globalInfo ( )  :  String
IB1.IB1 ( )
IB1.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
IB1.toString ( )  :  String
IB1.updateClassifier ( Instance p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, IBk.class
package weka.classifiers.lazy
IBk.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
IBk.crossValidate ( )  :  void
IBk.crossValidateTipText ( )  :  String
IBk.difference ( int p1, double p2, double p3 )  :  double
IBk.distance ( Instance p1, Instance p2 )  :  double
IBk.distanceWeightingTipText ( )  :  String
IBk.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
IBk.findNeighbors ( Instance p1 )  :  IBk.NeighborList
IBk.getAttributeMax ( int p1 )  :  double
IBk.getAttributeMin ( int p1 )  :  double
IBk.getCrossValidate ( )  :  boolean
IBk.getDistanceWeighting ( )  :  SelectedTag
IBk.getKNN ( )  :  int
IBk.getMeanSquared ( )  :  boolean
IBk.getNoNormalization ( )  :  boolean
IBk.getNumTraining ( )  :  int
IBk.getOptions ( )  :  String[ ]
IBk.getWindowSize ( )  :  int
IBk.globalInfo ( )  :  String
IBk.IBk ( )
IBk.IBk ( int p1 )
IBk.init ( )  :  void
IBk.KNNTipText ( )  :  String
IBk.listOptions ( )  :  Enumeration
IBk.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
IBk.makeDistribution ( IBk.NeighborList p1 )  :  double[ ]
IBk.meanSquaredTipText ( )  :  String
IBk.noNormalizationTipText ( )  :  String
IBk.norm ( double p1, int p2 )  :  double
IBk.setCrossValidate ( boolean p1 )  :  void
IBk.setDistanceWeighting ( SelectedTag p1 )  :  void
IBk.setKNN ( int p1 )  :  void
IBk.setMeanSquared ( boolean p1 )  :  void
IBk.setNoNormalization ( boolean p1 )  :  void
IBk.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
IBk.setWindowSize ( int p1 )  :  void
IBk.toString ( )  :  String
IBk.updateClassifier ( Instance p1 )  :  void
IBk.updateMinMax ( Instance p1 )  :  void
IBk.windowSizeTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, ICSSearchAlgorithm.class
package weka.classifiers.bayes.net.search.ci
ICSSearchAlgorithm.getMaxCardinality ( )  :  int
ICSSearchAlgorithm.globalInfo ( )  :  String
ICSSearchAlgorithm.ICSSearchAlgorithm ( )
ICSSearchAlgorithm.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
ICSSearchAlgorithm.maxCardinalityTipText ( )  :  String
ICSSearchAlgorithm.search ( BayesNet p1, Instances p2 )  :  void
ICSSearchAlgorithm.setMaxCardinality ( int p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, Id3.class
package weka.classifiers.trees
Id3.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
Id3.classifyInstance ( Instance p1 )  :  double
Id3.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
Id3.globalInfo ( )  :  String
Id3.Id3 ( )
Id3.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Id3.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, Impurity.class
package weka.classifiers.trees.m5
Impurity.Impurity ( int p1, int p2, Instances p3, int p4 )
Impurity.incremental ( double p1, int p2 )  :  void
Impurity.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, IncrementalClassifierEvaluator.class
package weka.gui.beans
IncrementalClassifierEvaluator.acceptClassifier ( IncrementalClassifierEvent p1 )  :  void
IncrementalClassifierEvaluator.addChartListener ( ChartListener p1 )  :  void
IncrementalClassifierEvaluator.addTextListener ( TextListener p1 )  :  void
IncrementalClassifierEvaluator.eventGeneratable ( String p1 )  :  boolean
IncrementalClassifierEvaluator.globalInfo ( )  :  String
IncrementalClassifierEvaluator.IncrementalClassifierEvaluator ( )
IncrementalClassifierEvaluator.removeChartListener ( ChartListener p1 )  :  void
IncrementalClassifierEvaluator.removeTextListener ( TextListener p1 )  :  void
IncrementalClassifierEvaluator.stop ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, IncrementalClassifierEvaluatorBeanInfo.class
package weka.gui.beans
IncrementalClassifierEvaluatorBeanInfo.getEventSetDescriptors ( )  :  EventSetDescriptor[ ]
IncrementalClassifierEvaluatorBeanInfo.IncrementalClassifierEvaluatorBeanInfo ( )

cdk-1.0.1.jar, IncrementalClassifierEvent.class
package weka.gui.beans
IncrementalClassifierEvent.getClassifier ( )  :  Classifier
IncrementalClassifierEvent.getCurrentInstance ( )  :  Instance
IncrementalClassifierEvent.getStatus ( )  :  int
IncrementalClassifierEvent.getStructure ( )  :  Instances
IncrementalClassifierEvent.IncrementalClassifierEvent ( Object p1 )
IncrementalClassifierEvent.IncrementalClassifierEvent ( Object p1, Classifier p2, Instance p3, int p4 )
IncrementalClassifierEvent.IncrementalClassifierEvent ( Object p1, Classifier p2, Instances p3 )
IncrementalClassifierEvent.setClassifier ( Classifier p1 )  :  void
IncrementalClassifierEvent.setCurrentInstance ( Instance p1 )  :  void
IncrementalClassifierEvent.setStatus ( int p1 )  :  void
IncrementalClassifierEvent.setStructure ( Instances p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, IncrementalClassifierListener.class
package weka.gui.beans
IncrementalClassifierListener.acceptClassifier ( IncrementalClassifierEvent p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, Indexes.class
package weka.classifiers.lazy
LBR.Indexes.getAttIndex ( int p1 )  :  boolean
LBR.Indexes.getInstanceIndex ( int p1 )  :  boolean
LBR.Indexes.getNumAttributes ( )  :  int
LBR.Indexes.getNumAttributesSet ( )  :  int
LBR.Indexes.getNumInstances ( )  :  int
LBR.Indexes.getNumInstancesSet ( )  :  int
LBR.Indexes.getSequentialAttIndex ( int p1 )  :  int
LBR.Indexes.getSequentialInstanceIndex ( int p1 )  :  int
LBR.Indexes.getSequentialNumAttributes ( )  :  int
LBR.Indexes.getSequentialNumInstances ( )  :  int
LBR.Indexes.isSequentialAttIndexValid ( )  :  boolean
LBR.Indexes.isSequentialInstanceIndexValid ( )  :  boolean
LBR.Indexes.LBR.Indexes ( LBR p1, int p2, int p3, boolean p4, int p5 )
LBR.Indexes.LBR.Indexes ( LBR p1, LBR.Indexes p2 )
LBR.Indexes.resetAttIndex ( boolean p1 )  :  void
LBR.Indexes.resetAttIndexTo ( LBR.Indexes p1 )  :  void
LBR.Indexes.resetDatasetBasedOn ( LBR.Indexes p1 )  :  void
LBR.Indexes.resetInstanceIndex ( boolean p1 )  :  void
LBR.Indexes.setAttIndex ( int p1, boolean p2 )  :  void
LBR.Indexes.setAtts ( int[ ] p1, boolean p2 )  :  void
LBR.Indexes.setInstanceIndex ( int p1, boolean p2 )  :  void
LBR.Indexes.setInsts ( int[ ] p1, boolean p2 )  :  void
LBR.Indexes.setSequentialAttIndex ( boolean p1 )  :  void
LBR.Indexes.setSequentialDataset ( boolean p1 )  :  void
LBR.Indexes.setSequentialInstanceIndex ( boolean p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, IndividualInstance.class
package weka.associations.tertius
IndividualInstance.copy ( )  :  Object
IndividualInstance.getParts ( )  :  Instances
IndividualInstance.IndividualInstance ( IndividualInstance p1 )
IndividualInstance.IndividualInstance ( Instance p1, Instances p2 )

cdk-1.0.1.jar, IndividualInstances.class
package weka.associations.tertius
IndividualInstances.IndividualInstances ( Instances p1, Instances p2 )

cdk-1.0.1.jar, IndividualLiteral.class
package weka.associations.tertius
IndividualLiteral.getType ( )  :  int
IndividualLiteral.IndividualLiteral ( Predicate p1, String p2, int p3, int p4, int p5, int p6 )

cdk-1.0.1.jar, InfoGainAttributeEval.class
package weka.attributeSelection
InfoGainAttributeEval.binarizeNumericAttributesTipText ( )  :  String
InfoGainAttributeEval.buildEvaluator ( Instances p1 )  :  void
InfoGainAttributeEval.evaluateAttribute ( int p1 )  :  double
InfoGainAttributeEval.getBinarizeNumericAttributes ( )  :  boolean
InfoGainAttributeEval.getMissingMerge ( )  :  boolean
InfoGainAttributeEval.getOptions ( )  :  String[ ]
InfoGainAttributeEval.globalInfo ( )  :  String
InfoGainAttributeEval.InfoGainAttributeEval ( )
InfoGainAttributeEval.listOptions ( )  :  Enumeration
InfoGainAttributeEval.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
InfoGainAttributeEval.missingMergeTipText ( )  :  String
InfoGainAttributeEval.resetOptions ( )  :  void
InfoGainAttributeEval.setBinarizeNumericAttributes ( boolean p1 )  :  void
InfoGainAttributeEval.setMissingMerge ( boolean p1 )  :  void
InfoGainAttributeEval.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
InfoGainAttributeEval.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, InfoGainSplitCrit.class
package weka.classifiers.trees.j48
InfoGainSplitCrit.InfoGainSplitCrit ( )
InfoGainSplitCrit.splitCritValue ( Distribution p1 )  :  double
InfoGainSplitCrit.splitCritValue ( Distribution p1, double p2 )  :  double
InfoGainSplitCrit.splitCritValue ( Distribution p1, double p2, double p3 )  :  double

cdk-1.0.1.jar, Instance.class
package weka.core
Instance.attribute ( int p1 )  :  Attribute
Instance.attributeSparse ( int p1 )  :  Attribute
Instance.classAttribute ( )  :  Attribute
Instance.classIndex ( )  :  int
Instance.classIsMissing ( )  :  boolean
Instance.classValue ( )  :  double
Instance.copy ( )  :  Object
Instance.dataset ( )  :  Instances
Instance.deleteAttributeAt ( int p1 )  :  void
Instance.enumerateAttributes ( )  :  Enumeration
Instance.equalHeaders ( Instance p1 )  :  boolean
Instance.hasMissingValue ( )  :  boolean
Instance.index ( int p1 )  :  int
Instance.insertAttributeAt ( int p1 )  :  void
Instance.Instance ( )
Instance.Instance ( double p1, double[ ] p2 )
Instance.Instance ( Instance p1 )
Instance.Instance ( int p1 )
Instance.isMissing ( Attribute p1 )  :  boolean
Instance.isMissing ( int p1 )  :  boolean
Instance.isMissingSparse ( int p1 )  :  boolean
Instance.isMissingValue ( double p1 ) [static]  :  boolean
Instance.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Instance.mergeInstance ( Instance p1 )  :  Instance
Instance.missingValue ( ) [static]  :  double
Instance.numAttributes ( )  :  int
Instance.numClasses ( )  :  int
Instance.numValues ( )  :  int
Instance.replaceMissingValues ( double[ ] p1 )  :  void
Instance.setClassMissing ( )  :  void
Instance.setClassValue ( double p1 )  :  void
Instance.setClassValue ( String p1 )  :  void
Instance.setDataset ( Instances p1 )  :  void
Instance.setMissing ( Attribute p1 )  :  void
Instance.setMissing ( int p1 )  :  void
Instance.setValue ( Attribute p1, double p2 )  :  void
Instance.setValue ( Attribute p1, String p2 )  :  void
Instance.setValue ( int p1, double p2 )  :  void
Instance.setValue ( int p1, String p2 )  :  void
Instance.setValueSparse ( int p1, double p2 )  :  void
Instance.setWeight ( double p1 )  :  void
Instance.stringValue ( Attribute p1 )  :  String
Instance.stringValue ( int p1 )  :  String
Instance.toDoubleArray ( )  :  double[ ]
Instance.toString ( )  :  String
Instance.toString ( Attribute p1 )  :  String
Instance.toString ( int p1 )  :  String
Instance.value ( Attribute p1 )  :  double
Instance.value ( int p1 )  :  double
Instance.valueSparse ( int p1 )  :  double
Instance.weight ( )  :  double

cdk-1.0.1.jar, InstanceComparator.class
package weka.core
InstanceComparator.compare ( Object p1, Object p2 )  :  int
InstanceComparator.getIncludeClass ( )  :  boolean
InstanceComparator.InstanceComparator ( )
InstanceComparator.InstanceComparator ( boolean p1 )
InstanceComparator.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
InstanceComparator.setIncludeClass ( boolean p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, InstanceCounter.class
package weka.gui.streams
InstanceCounter.getDebug ( )  :  boolean
InstanceCounter.input ( Instance p1 )  :  void
InstanceCounter.inputFormat ( Instances p1 )  :  void
InstanceCounter.InstanceCounter ( )
InstanceCounter.instanceProduced ( InstanceEvent p1 )  :  void
InstanceCounter.setDebug ( boolean p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, InstanceEvent.class
package weka.gui.beans
InstanceEvent.getInstance ( )  :  Instance
InstanceEvent.getStatus ( )  :  int
InstanceEvent.getStructure ( )  :  Instances
InstanceEvent.InstanceEvent ( Object p1 )
InstanceEvent.InstanceEvent ( Object p1, Instance p2, int p3 )
InstanceEvent.InstanceEvent ( Object p1, Instances p2 )
InstanceEvent.setInstance ( Instance p1 )  :  void
InstanceEvent.setStatus ( int p1 )  :  void
InstanceEvent.setStructure ( Instances p1 )  :  void
package weka.gui.streams
InstanceEvent.getID ( )  :  int
InstanceEvent.InstanceEvent ( Object p1, int p2 )

cdk-1.0.1.jar, InstanceJoiner.class
package weka.gui.streams
InstanceJoiner.addInstanceListener ( InstanceListener p1 )  :  void
InstanceJoiner.batchFinished ( )  :  void
InstanceJoiner.getDebug ( )  :  boolean
InstanceJoiner.input ( Instance p1 )  :  boolean
InstanceJoiner.inputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
InstanceJoiner.InstanceJoiner ( )
InstanceJoiner.instanceProduced ( InstanceEvent p1 )  :  void
InstanceJoiner.notifyInstanceProduced ( InstanceEvent p1 )  :  void
InstanceJoiner.outputFormat ( )  :  Instances
InstanceJoiner.outputPeek ( )  :  Instance
InstanceJoiner.removeInstanceListener ( InstanceListener p1 )  :  void
InstanceJoiner.secondInstanceProduced ( InstanceEvent p1 )  :  void
InstanceJoiner.setDebug ( boolean p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, InstanceListener.class
package weka.gui.beans
InstanceListener.acceptInstance ( InstanceEvent p1 ) [abstract]  :  void
package weka.gui.streams
InstanceListener.instanceProduced ( InstanceEvent p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, InstanceLoader.class
package weka.gui.streams
InstanceLoader.actionPerformed ( ActionEvent p1 )  :  void
InstanceLoader.addInstanceListener ( InstanceListener p1 )  :  void
InstanceLoader.getArffFile ( )  :  String
InstanceLoader.getDebug ( )  :  boolean
InstanceLoader.InstanceLoader ( )
InstanceLoader.notifyInstanceProduced ( InstanceEvent p1 )  :  void
InstanceLoader.outputFormat ( )  :  Instances
InstanceLoader.outputPeek ( )  :  Instance
InstanceLoader.removeInstanceListener ( InstanceListener p1 )  :  void
InstanceLoader.setArffFile ( String p1 )  :  void
InstanceLoader.setDebug ( boolean p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, InstanceProducer.class
package weka.gui.streams
InstanceProducer.addInstanceListener ( InstanceListener p1 ) [abstract]  :  void
InstanceProducer.outputFormat ( ) [abstract]  :  Instances
InstanceProducer.outputPeek ( ) [abstract]  :  Instance
InstanceProducer.removeInstanceListener ( InstanceListener p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, InstanceQuery.class
package weka.experiment
InstanceQuery.getOptions ( )  :  String[ ]
InstanceQuery.getQuery ( )  :  String
InstanceQuery.getSparseData ( )  :  boolean
InstanceQuery.InstanceQuery ( )
InstanceQuery.listOptions ( )  :  Enumeration
InstanceQuery.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
InstanceQuery.queryTipText ( )  :  String
InstanceQuery.retrieveInstances ( )  :  Instances
InstanceQuery.retrieveInstances ( String p1 )  :  Instances
InstanceQuery.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
InstanceQuery.setQuery ( String p1 )  :  void
InstanceQuery.setSparseData ( boolean p1 )  :  void
InstanceQuery.sparseDataTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, Instances.class
package weka.core
Instances.add ( Instance p1 )  :  void
Instances.attribute ( int p1 )  :  Attribute
Instances.attribute ( String p1 )  :  Attribute
Instances.attributeStats ( int p1 )  :  AttributeStats
Instances.attributeToDoubleArray ( int p1 )  :  double[ ]
Instances.checkForStringAttributes ( )  :  boolean
Instances.checkInstance ( Instance p1 )  :  boolean
Instances.classAttribute ( )  :  Attribute
Instances.classIndex ( )  :  int
Instances.compactify ( )  :  void
Instances.copyInstances ( int p1, Instances p2, int p3 )  :  void
Instances.delete ( )  :  void
Instances.delete ( int p1 )  :  void
Instances.deleteAttributeAt ( int p1 )  :  void
Instances.deleteStringAttributes ( )  :  void
Instances.deleteWithMissing ( Attribute p1 )  :  void
Instances.deleteWithMissing ( int p1 )  :  void
Instances.deleteWithMissingClass ( )  :  void
Instances.enumerateAttributes ( )  :  Enumeration
Instances.enumerateInstances ( )  :  Enumeration
Instances.equalHeaders ( Instances p1 )  :  boolean
Instances.errms ( StreamTokenizer p1, String p2 )  :  void
Instances.firstInstance ( )  :  Instance
Instances.freshAttributeInfo ( )  :  void
Instances.getFirstToken ( StreamTokenizer p1 )  :  void
Instances.getIndex ( StreamTokenizer p1 )  :  void
Instances.getInstance ( StreamTokenizer p1, boolean p2 )  :  boolean
Instances.getInstanceFull ( StreamTokenizer p1, boolean p2 )  :  boolean
Instances.getInstanceSparse ( StreamTokenizer p1, boolean p2 )  :  boolean
Instances.getLastToken ( StreamTokenizer p1, boolean p2 )  :  void
Instances.getNextToken ( StreamTokenizer p1 )  :  void
Instances.getRandomNumberGenerator ( long p1 )  :  Random
Instances.initTokenizer ( StreamTokenizer p1 )  :  void
Instances.insertAttributeAt ( Attribute p1, int p2 )  :  void
Instances.instance ( int p1 )  :  Instance
Instances.Instances ( Instances p1 )
Instances.Instances ( Instances p1, int p2 )
Instances.Instances ( Instances p1, int p2, int p3 )
Instances.Instances ( Reader p1 )
Instances.Instances ( Reader p1, int p2 )
Instances.Instances ( String p1, FastVector p2, int p3 )
Instances.instancesAndWeights ( )  :  String
Instances.kthSmallestValue ( Attribute p1, int p2 )  :  double
Instances.kthSmallestValue ( int p1, int p2 )  :  double
Instances.lastInstance ( )  :  Instance
Instances.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Instances.meanOrMode ( Attribute p1 )  :  double
Instances.meanOrMode ( int p1 )  :  double
Instances.mergeInstances ( Instances p1, Instances p2 ) [static]  :  Instances
Instances.numAttributes ( )  :  int
Instances.numClasses ( )  :  int
Instances.numDistinctValues ( Attribute p1 )  :  int
Instances.numDistinctValues ( int p1 )  :  int
Instances.numInstances ( )  :  int
Instances.partition ( int p1, int p2, int p3 )  :  int
Instances.quickSort ( int p1, int p2, int p3 )  :  void
Instances.randomize ( Random p1 )  :  void
Instances.readHeader ( StreamTokenizer p1 )  :  void
Instances.readInstance ( Reader p1 )  :  boolean
Instances.readTillEOL ( StreamTokenizer p1 )  :  void
Instances.relationName ( )  :  String
Instances.renameAttribute ( Attribute p1, String p2 )  :  void
Instances.renameAttribute ( int p1, String p2 )  :  void
Instances.renameAttributeValue ( Attribute p1, String p2, String p3 )  :  void
Instances.renameAttributeValue ( int p1, int p2, String p3 )  :  void
Instances.resample ( Random p1 )  :  Instances
Instances.resampleWithWeights ( Random p1 )  :  Instances
Instances.resampleWithWeights ( Random p1, double[ ] p2 )  :  Instances
Instances.select ( int p1, int p2, int p3, int p4 )  :  int
Instances.setClass ( Attribute p1 )  :  void
Instances.setClassIndex ( int p1 )  :  void
Instances.setRelationName ( String p1 )  :  void
Instances.sort ( Attribute p1 )  :  void
Instances.sort ( int p1 )  :  void
Instances.stratify ( int p1 )  :  void
Instances.stratStep ( int p1 )  :  void
Instances.stringFreeStructure ( )  :  Instances
Instances.sumOfWeights ( )  :  double
Instances.swap ( int p1, int p2 )  :  void
Instances.test ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Instances.testCV ( int p1, int p2 )  :  Instances
Instances.toString ( )  :  String
Instances.toSummaryString ( )  :  String
Instances.trainCV ( int p1, int p2 )  :  Instances
Instances.trainCV ( int p1, int p2, Random p3 )  :  Instances
Instances.variance ( Attribute p1 )  :  double
Instances.variance ( int p1 )  :  double

cdk-1.0.1.jar, InstanceSavePanel.class
package weka.gui.streams
InstanceSavePanel.batchFinished ( )  :  void
InstanceSavePanel.getArffFile ( )  :  String
InstanceSavePanel.getDebug ( )  :  boolean
InstanceSavePanel.input ( Instance p1 )  :  void
InstanceSavePanel.inputFormat ( Instances p1 )  :  void
InstanceSavePanel.instanceProduced ( InstanceEvent p1 )  :  void
InstanceSavePanel.InstanceSavePanel ( )
InstanceSavePanel.setArffFile ( String p1 )  :  void
InstanceSavePanel.setDebug ( boolean p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, InstancesResultListener.class
package weka.experiment
InstancesResultListener.acceptResult ( ResultProducer p1, Object[ ] p2, Object[ ] p3 )  :  void
InstancesResultListener.globalInfo ( )  :  String
InstancesResultListener.InstancesResultListener ( )
InstancesResultListener.postProcess ( ResultProducer p1 )  :  void
InstancesResultListener.preProcess ( ResultProducer p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, InstancesSummaryPanel.class
package weka.gui
InstancesSummaryPanel.InstancesSummaryPanel ( )
InstancesSummaryPanel.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
InstancesSummaryPanel.setInstances ( Instances p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, InstanceTable.class
package weka.gui.streams
InstanceTable.batchFinished ( )  :  void
InstanceTable.getDebug ( )  :  boolean
InstanceTable.input ( Instance p1 )  :  void
InstanceTable.inputFormat ( Instances p1 )  :  void
InstanceTable.instanceProduced ( InstanceEvent p1 )  :  void
InstanceTable.InstanceTable ( )
InstanceTable.setDebug ( boolean p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, InstanceViewer.class
package weka.gui.streams
InstanceViewer.batchFinished ( )  :  void
InstanceViewer.getClearEachDataset ( )  :  boolean
InstanceViewer.getDebug ( )  :  boolean
InstanceViewer.input ( Instance p1 )  :  void
InstanceViewer.inputFormat ( Instances p1 )  :  void
InstanceViewer.instanceProduced ( InstanceEvent p1 )  :  void
InstanceViewer.InstanceViewer ( )
InstanceViewer.setClearEachDataset ( boolean p1 )  :  void
InstanceViewer.setDebug ( boolean p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, IntVector.class
package weka.classifiers.functions.pace
IntVector.capacity ( )  :  int
IntVector.clone ( )  :  Object
IntVector.copy ( )  :  IntVector
IntVector.get ( int p1 )  :  int
IntVector.getArray ( )  :  int[ ]
IntVector.getArrayCopy ( )  :  int[ ]
IntVector.IntVector ( )
IntVector.IntVector ( int p1 )
IntVector.IntVector ( int p1, int p2 )
IntVector.IntVector ( int[ ] p1 )
IntVector.isEmpty ( )  :  boolean
IntVector.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
IntVector.seq ( int p1, int p2 ) [static]  :  IntVector
IntVector.set ( int p1 )  :  void
IntVector.set ( int p1, int p2 )  :  void
IntVector.set ( int p1, int p2, int[ ] p3, int p4 )  :  void
IntVector.set ( int p1, int p2, IntVector p3, int p4 )  :  void
IntVector.set ( IntVector p1 )  :  void
IntVector.setArray ( int[ ] p1 )  :  void
IntVector.setCapacity ( int p1 )  :  void
IntVector.setSize ( int p1 )  :  void
IntVector.shift ( int p1, int p2 )  :  void
IntVector.shiftToEnd ( int p1 )  :  void
IntVector.size ( )  :  int
IntVector.sort ( )  :  void
IntVector.subvector ( int p1, int p2 )  :  IntVector
IntVector.subvector ( IntVector p1 )  :  IntVector
IntVector.swap ( int p1, int p2 )  :  void
IntVector.toString ( )  :  String
IntVector.toString ( int p1, boolean p2 )  :  String

cdk-1.0.1.jar, ItemSet.class
package weka.associations
ItemSet.containedBy ( Instance p1 )  :  boolean
ItemSet.counter ( )  :  int
ItemSet.deleteItemSets ( FastVector p1, int p2, int p3 ) [static]  :  FastVector
ItemSet.equals ( Object p1 )  :  boolean
ItemSet.getHashtable ( FastVector p1, int p2 ) [static]  :  Hashtable
ItemSet.hashCode ( )  :  int
ItemSet.itemAt ( int p1 )  :  int
ItemSet.items ( )  :  int[ ]
ItemSet.ItemSet ( int p1 )
ItemSet.ItemSet ( int p1, int[ ] p2 )
ItemSet.ItemSet ( int[ ] p1 )
ItemSet.mergeAllItemSets ( FastVector p1, int p2, int p3 ) [static]  :  FastVector
ItemSet.pruneItemSets ( FastVector p1, Hashtable p2 ) [static]  :  FastVector
ItemSet.pruneRules ( FastVector[ ] p1, double p2 ) [static]  :  void
ItemSet.setCounter ( int p1 )  :  void
ItemSet.setItem ( int[ ] p1 )  :  void
ItemSet.setItemAt ( int p1, int p2 )  :  void
ItemSet.singletons ( Instances p1 ) [static]  :  FastVector
ItemSet.support ( )  :  int
ItemSet.toString ( Instances p1 )  :  String
ItemSet.upDateCounter ( Instance p1 )  :  void
ItemSet.upDateCounters ( FastVector p1, Instances p2 ) [static]  :  void

cdk-1.0.1.jar, IteratedSingleClassifierEnhancer.class
package weka.classifiers
IteratedSingleClassifierEnhancer.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
IteratedSingleClassifierEnhancer.getNumIterations ( )  :  int
IteratedSingleClassifierEnhancer.getOptions ( )  :  String[ ]
IteratedSingleClassifierEnhancer.IteratedSingleClassifierEnhancer ( )
IteratedSingleClassifierEnhancer.listOptions ( )  :  Enumeration
IteratedSingleClassifierEnhancer.numIterationsTipText ( )  :  String
IteratedSingleClassifierEnhancer.setNumIterations ( int p1 )  :  void
IteratedSingleClassifierEnhancer.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, IterativeClassifier.class
package weka.classifiers
IterativeClassifier.clone ( ) [abstract]  :  Object
IterativeClassifier.done ( ) [abstract]  :  void
IterativeClassifier.initClassifier ( Instances p1 ) [abstract]  :  void
IterativeClassifier.next ( int p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, J48.class
package weka.classifiers.trees
J48.binarySplitsTipText ( )  :  String
J48.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
J48.classifyInstance ( Instance p1 )  :  double
J48.confidenceFactorTipText ( )  :  String
J48.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
J48.enumerateMeasures ( )  :  Enumeration
J48.getBinarySplits ( )  :  boolean
J48.getConfidenceFactor ( )  :  float
J48.getMeasure ( String p1 )  :  double
J48.getMinNumObj ( )  :  int
J48.getNumFolds ( )  :  int
J48.getOptions ( )  :  String[ ]
J48.getReducedErrorPruning ( )  :  boolean
J48.getSaveInstanceData ( )  :  boolean
J48.getSeed ( )  :  int
J48.getSubtreeRaising ( )  :  boolean
J48.getUnpruned ( )  :  boolean
J48.getUseLaplace ( )  :  boolean
J48.globalInfo ( )  :  String
J48.graph ( )  :  String
J48.graphType ( )  :  int
J48.J48 ( )
J48.listOptions ( )  :  Enumeration
J48.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
J48.measureNumLeaves ( )  :  double
J48.measureNumRules ( )  :  double
J48.measureTreeSize ( )  :  double
J48.minNumObjTipText ( )  :  String
J48.numFoldsTipText ( )  :  String
J48.prefix ( )  :  String
J48.reducedErrorPruningTipText ( )  :  String
J48.saveInstanceDataTipText ( )  :  String
J48.seedTipText ( )  :  String
J48.setBinarySplits ( boolean p1 )  :  void
J48.setConfidenceFactor ( float p1 )  :  void
J48.setMinNumObj ( int p1 )  :  void
J48.setNumFolds ( int p1 )  :  void
J48.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
J48.setReducedErrorPruning ( boolean p1 )  :  void
J48.setSaveInstanceData ( boolean p1 )  :  void
J48.setSeed ( int p1 )  :  void
J48.setSubtreeRaising ( boolean p1 )  :  void
J48.setUnpruned ( boolean p1 )  :  void
J48.setUseLaplace ( boolean p1 )  :  void
J48.subtreeRaisingTipText ( )  :  String
J48.toSource ( String p1 )  :  String
J48.toString ( )  :  String
J48.toSummaryString ( )  :  String
J48.unprunedTipText ( )  :  String
J48.useLaplaceTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, J48WModel.class
package org.openscience.cdk.qsar.model.weka
J48WModel.build ( )  :  void
J48WModel.getOptions ( )  :  String[ ]
J48WModel.getPredictPredicted ( )  :  Object[ ]
J48WModel.J48WModel ( boolean cdkResource, String pathTest )
J48WModel.J48WModel ( int[ ] typAttrib, String[ ] classAttrib, Object[ ] y, Object[ ][ ] x )
J48WModel.J48WModel ( int[ ] typAttrib, String[ ] classAttrib, Object[ ] y, Object[ ][ ] x, String[ ] attrib )
J48WModel.predict ( )  :  void
J48WModel.setOptions ( String[ ] options )  :  void
J48WModel.setParameters ( Object[ ][ ] newX )  :  void
J48WModel.setParametersCDK ( String path )  :  void

cdk-1.0.1.jar, Java2DRenderer.class
package org.openscience.cdk.renderer
Java2DRenderer.getRenderer2DModel ( )  :  Renderer2DModel
Java2DRenderer.Java2DRenderer ( Renderer2DModel model )
Java2DRenderer.paintChemModel ( IChemModel model, Graphics2D graphics )  :  void
Java2DRenderer.paintMolecule ( IAtomContainer atomCon, Graphics2D graphics )  :  void
Java2DRenderer.paintMolecule ( IAtomContainer atomCon, Graphics2D graphics, Rectangle2D bounds )  :  void
Java2DRenderer.paintMoleculeSet ( IMoleculeSet moleculeSet, Graphics2D graphics )  :  void
Java2DRenderer.paintReaction ( IReaction reaction, Graphics2D graphics )  :  void
Java2DRenderer.paintReactionSet ( IReactionSet reactionSet, Graphics2D graphics )  :  void
Java2DRenderer.setRenderer2DModel ( Renderer2DModel model )  :  void

cdk-1.0.1.jar, JComponentWriter.class
package weka.gui.visualize
JComponentWriter.getComponent ( )  :  JComponent
JComponentWriter.getDescription ( )  :  String
JComponentWriter.getExtension ( )  :  String
JComponentWriter.getFile ( )  :  File
JComponentWriter.getScalingEnabled ( )  :  boolean
JComponentWriter.getXScale ( )  :  double
JComponentWriter.getYScale ( )  :  double
JComponentWriter.initialize ( )  :  void
JComponentWriter.JComponentWriter ( )
JComponentWriter.JComponentWriter ( JComponent p1 )
JComponentWriter.JComponentWriter ( JComponent p1, File p2 )
JComponentWriter.setComponent ( JComponent p1 )  :  void
JComponentWriter.setFile ( File p1 )  :  void
JComponentWriter.setScale ( double p1, double p2 )  :  void
JComponentWriter.setScalingEnabled ( boolean p1 )  :  void
JComponentWriter.toOutput ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, JComponentWriterFileFilter.class
package weka.gui.visualize
PrintableComponent.JComponentWriterFileFilter.getWriter ( )  :  JComponentWriter
PrintableComponent.JComponentWriterFileFilter.PrintableComponent.JComponentWriterFileFilter ( PrintableComponent p1, String p2, String p3, JComponentWriter p4 )

cdk-1.0.1.jar, JPEGWriter.class
package weka.gui.visualize
JPEGWriter.getBackground ( )  :  Color
JPEGWriter.getDescription ( )  :  String
JPEGWriter.getExtension ( )  :  String
JPEGWriter.getQuality ( )  :  float
JPEGWriter.initialize ( )  :  void
JPEGWriter.JPEGWriter ( )
JPEGWriter.JPEGWriter ( JComponent p1 )
JPEGWriter.JPEGWriter ( JComponent p1, File p2 )
JPEGWriter.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
JPEGWriter.setBackground ( Color p1 )  :  void
JPEGWriter.setQuality ( float p1 )  :  void
JPEGWriter.toOutput ( )  :  void
JPEGWriter.toOutput ( JComponent p1, File p2 ) [static]  :  void

cdk-1.0.1.jar, JRip.class
package weka.classifiers.rules
JRip.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
JRip.checkErrorRateTipText ( )  :  String
JRip.debugTipText ( )  :  String
JRip.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
JRip.enumerateMeasures ( )  :  Enumeration
JRip.foldsTipText ( )  :  String
JRip.getCheckErrorRate ( )  :  boolean
JRip.getDebug ( )  :  boolean
JRip.getFolds ( )  :  int
JRip.getMeasure ( String p1 )  :  double
JRip.getMinNo ( )  :  double
JRip.getOptimizations ( )  :  int
JRip.getOptions ( )  :  String[ ]
JRip.getRuleset ( )  :  FastVector
JRip.getRuleStats ( int p1 )  :  RuleStats
JRip.getSeed ( )  :  long
JRip.getUsePruning ( )  :  boolean
JRip.globalInfo ( )  :  String
JRip.JRip ( )
JRip.listOptions ( )  :  Enumeration
JRip.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
JRip.minNoTipText ( )  :  String
JRip.optimizationsTipText ( )  :  String
JRip.rulesetForOneClass ( double p1, Instances p2, double p3, double p4 )  :  Instances
JRip.seedTipText ( )  :  String
JRip.setCheckErrorRate ( boolean p1 )  :  void
JRip.setDebug ( boolean p1 )  :  void
JRip.setFolds ( int p1 )  :  void
JRip.setMinNo ( double p1 )  :  void
JRip.setOptimizations ( int p1 )  :  void
JRip.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
JRip.setSeed ( long p1 )  :  void
JRip.setUsePruning ( boolean p1 )  :  void
JRip.toString ( )  :  String
JRip.usePruningTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, JTableHelper.class
package weka.gui
JTableHelper.calcColumnWidth ( int p1 )  :  int
JTableHelper.calcColumnWidth ( JTable p1, int p2 ) [static]  :  int
JTableHelper.calcHeaderWidth ( int p1 )  :  int
JTableHelper.calcHeaderWidth ( JTable p1, int p2 ) [static]  :  int
JTableHelper.getJTable ( )  :  JTable
JTableHelper.JTableHelper ( JTable p1 )
JTableHelper.scrollToVisible ( int p1, int p2 )  :  void
JTableHelper.scrollToVisible ( JTable p1, int p2, int p3 ) [static]  :  void
JTableHelper.setOptimalColumnWidth ( )  :  void
JTableHelper.setOptimalColumnWidth ( int p1 )  :  void
JTableHelper.setOptimalColumnWidth ( JTable p1 ) [static]  :  void
JTableHelper.setOptimalColumnWidth ( JTable p1, int p2 ) [static]  :  void
JTableHelper.setOptimalHeaderWidth ( )  :  void
JTableHelper.setOptimalHeaderWidth ( int p1 )  :  void
JTableHelper.setOptimalHeaderWidth ( JTable p1 ) [static]  :  void
JTableHelper.setOptimalHeaderWidth ( JTable p1, int p2 ) [static]  :  void

cdk-1.0.1.jar, JTreePopupMenu.class
package weka.gui
GenericObjectEditor.JTreePopupMenu.GenericObjectEditor.JTreePopupMenu ( GenericObjectEditor p1, JTree p2 )
GenericObjectEditor.JTreePopupMenu.show ( Component p1, int p2, int p3 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, K2.class
package weka.classifiers.bayes.net.search.global
K2.buildStructure ( BayesNet p1, Instances p2 )  :  void
K2.getInitAsNaiveBayes ( )  :  boolean
K2.getMaxNrOfParents ( )  :  int
K2.getOptions ( )  :  String[ ]
K2.getRandomOrder ( )  :  boolean
K2.globalInfo ( )  :  String
K2.K2 ( )
K2.listOptions ( )  :  Enumeration
K2.randomOrderTipText ( )  :  String
K2.setInitAsNaiveBayes ( boolean p1 )  :  void
K2.setMaxNrOfParents ( int p1 )  :  void
K2.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
K2.setRandomOrder ( boolean p1 )  :  void
package weka.classifiers.bayes.net.search.local
K2.buildStructure ( BayesNet p1, Instances p2 )  :  void
K2.getInitAsNaiveBayes ( )  :  boolean
K2.getMaxNrOfParents ( )  :  int
K2.getOptions ( )  :  String[ ]
K2.getRandomOrder ( )  :  boolean
K2.globalInfo ( )  :  String
K2.K2 ( )
K2.listOptions ( )  :  Enumeration
K2.randomOrderTipText ( )  :  String
K2.setInitAsNaiveBayes ( boolean p1 )  :  void
K2.setMaxNrOfParents ( int p1 )  :  void
K2.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
K2.setRandomOrder ( boolean p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, KDConditionalEstimator.class
package weka.estimators
KDConditionalEstimator.addValue ( double p1, double p2, double p3 )  :  void
KDConditionalEstimator.getEstimator ( double p1 )  :  Estimator
KDConditionalEstimator.getProbability ( double p1, double p2 )  :  double
KDConditionalEstimator.KDConditionalEstimator ( int p1, double p2 )
KDConditionalEstimator.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
KDConditionalEstimator.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, KDDataGenerator.class
package weka.gui.boundaryvisualizer
KDDataGenerator.buildGenerator ( Instances p1 )  :  void
KDDataGenerator.generateInstances ( int[ ] p1 )  :  double[ ][ ]
KDDataGenerator.getKernelBandwidth ( )  :  int
KDDataGenerator.getNumGeneratingModels ( )  :  int
KDDataGenerator.getWeights ( )  :  double[ ]
KDDataGenerator.KDDataGenerator ( )
KDDataGenerator.setKernelBandwidth ( int p1 )  :  void
KDDataGenerator.setSeed ( int p1 )  :  void
KDDataGenerator.setWeightingDimensions ( boolean[ ] p1 )  :  void
KDDataGenerator.setWeightingValues ( double[ ] p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, Kernel.class
package weka.classifiers.functions.supportVector
Kernel.clean ( ) [abstract]  :  void
Kernel.eval ( int p1, int p2, Instance p3 ) [abstract]  :  double
Kernel.Kernel ( )
Kernel.numCacheHits ( ) [abstract]  :  int
Kernel.numEvals ( ) [abstract]  :  int

cdk-1.0.1.jar, KernelEstimator.class
package weka.estimators
KernelEstimator.addValue ( double p1, double p2 )  :  void
KernelEstimator.getProbability ( double p1 )  :  double
KernelEstimator.KernelEstimator ( double p1 )
KernelEstimator.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
KernelEstimator.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, KKConditionalEstimator.class
package weka.estimators
KKConditionalEstimator.addValue ( double p1, double p2, double p3 )  :  void
KKConditionalEstimator.getEstimator ( double p1 )  :  Estimator
KKConditionalEstimator.getProbability ( double p1, double p2 )  :  double
KKConditionalEstimator.KKConditionalEstimator ( double p1 )
KKConditionalEstimator.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
KKConditionalEstimator.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, KmeansCluster.class
package org.openscience.cdk.qsar.model.weka
KmeansCluster.build ( )  :  void
KmeansCluster.clusterInstance ( )  :  void
KmeansCluster.getClusterCentroids ( )  :  double[ ][ ]
KmeansCluster.getClusterer ( )  :  Clusterer
KmeansCluster.getClusterInstance ( )  :  Object[ ]
KmeansCluster.getClusterSizes ( )  :  int[ ]
KmeansCluster.getClusterStandardDevs ( )  :  double[ ][ ]
KmeansCluster.getOptions ( )  :  String[ ]
KmeansCluster.getSquaredError ( )  :  double
KmeansCluster.KmeansCluster ( )
KmeansCluster.numberOfCluster ( )  :  int
KmeansCluster.setData ( String filename )  :  void
KmeansCluster.setData ( String[ ] attrib, int[ ] typAttrib, String[ ] classAttrib, Object[ ] y, Object[ ][ ] x )  :  void
KmeansCluster.setOptions ( String[ ] options )  :  void
KmeansCluster.setParameters ( Object[ ][ ] newX )  :  void
KmeansCluster.setParameters ( String path )  :  void

cdk-1.0.1.jar, KnowledgeFlow.class
package weka.gui.beans
KnowledgeFlow.KnowledgeFlow ( )
KnowledgeFlow.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
KnowledgeFlow.startApp ( ) [static]  :  void

cdk-1.0.1.jar, KnowledgeFlowApp.class
package weka.gui.beans
KnowledgeFlowApp.addStartupListener ( StartUpListener p1 ) [static]  :  void
KnowledgeFlowApp.createSingleton ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
KnowledgeFlowApp.getGlobalInfo ( Object p1 ) [static]  :  String
KnowledgeFlowApp.getSingleton ( ) [static]  :  KnowledgeFlowApp
KnowledgeFlowApp.KnowledgeFlowApp ( )
KnowledgeFlowApp.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
KnowledgeFlowApp.propertyChange ( PropertyChangeEvent p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, KOML.class
package weka.core.xml
KOML.isPresent ( ) [static]  :  boolean
KOML.KOML ( )
KOML.read ( File p1 ) [static]  :  Object
KOML.read ( InputStream p1 ) [static]  :  Object
KOML.read ( String p1 ) [static]  :  Object
KOML.write ( File p1, Object p2 ) [static]  :  boolean
KOML.write ( OutputStream p1, Object p2 ) [static]  :  boolean
KOML.write ( String p1, Object p2 ) [static]  :  boolean

cdk-1.0.1.jar, KStar.class
package weka.classifiers.lazy
KStar.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
KStar.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
KStar.entropicAutoBlendTipText ( )  :  String
KStar.getEntropicAutoBlend ( )  :  boolean
KStar.getGlobalBlend ( )  :  int
KStar.getMissingMode ( )  :  SelectedTag
KStar.getOptions ( )  :  String[ ]
KStar.globalBlendTipText ( )  :  String
KStar.globalInfo ( )  :  String
KStar.KStar ( )
KStar.listOptions ( )  :  Enumeration
KStar.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
KStar.missingModeTipText ( )  :  String
KStar.setEntropicAutoBlend ( boolean p1 )  :  void
KStar.setGlobalBlend ( int p1 )  :  void
KStar.setMissingMode ( SelectedTag p1 )  :  void
KStar.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
KStar.toString ( )  :  String
KStar.updateClassifier ( Instance p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, KStarCache.class
package weka.classifiers.lazy.kstar
KStarCache.containsKey ( double p1 )  :  boolean
KStarCache.getCacheValues ( double p1 )  :  KStarCache.TableEntry
KStarCache.KStarCache ( )
KStarCache.store ( double p1, double p2, double p3 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, KStarNominalAttribute.class
package weka.classifiers.lazy.kstar
KStarNominalAttribute.KStarNominalAttribute ( Instance p1, Instance p2, int p3, Instances p4, int[ ][ ] p5, KStarCache p6 )
KStarNominalAttribute.setOptions ( int p1, int p2, int p3 )  :  void
KStarNominalAttribute.transProb ( )  :  double

cdk-1.0.1.jar, KStarNumericAttribute.class
package weka.classifiers.lazy.kstar
KStarNumericAttribute.KStarNumericAttribute ( Instance p1, Instance p2, int p3, Instances p4, int[ ][ ] p5, KStarCache p6 )
KStarNumericAttribute.setBlendFactor ( int p1 )  :  void
KStarNumericAttribute.setBlendMethod ( int p1 )  :  void
KStarNumericAttribute.setMissingMode ( int p1 )  :  void
KStarNumericAttribute.setOptions ( int p1, int p2, int p3 )  :  void
KStarNumericAttribute.transProb ( )  :  double

cdk-1.0.1.jar, KStarWrapper.class
package weka.classifiers.lazy.kstar
KStarWrapper.KStarWrapper ( )

cdk-1.0.1.jar, LabeledItemSet.class
package weka.associations
LabeledItemSet.deleteItemSets ( FastVector p1, int p2, int p3 ) [static]  :  FastVector
LabeledItemSet.divide ( Instances p1, boolean p2 ) [static]  :  Instances
LabeledItemSet.equalCondset ( Object p1 )  :  boolean
LabeledItemSet.equals ( Object p1 )  :  boolean
LabeledItemSet.generateRules ( double p1, boolean p2 )  :  FastVector[ ]
LabeledItemSet.getHashtable ( FastVector p1, int p2 ) [static]  :  Hashtable
LabeledItemSet.LabeledItemSet ( int p1, int p2 )
LabeledItemSet.mergeAllItemSets ( FastVector p1, int p2, int p3 ) [static]  :  FastVector
LabeledItemSet.pruneItemSets ( FastVector p1, Hashtable p2 ) [static]  :  FastVector
LabeledItemSet.singletons ( Instances p1, Instances p2 ) [static]  :  FastVector
LabeledItemSet.support ( )  :  int
LabeledItemSet.upDateCounter ( Instance p1, Instance p2 )  :  void
LabeledItemSet.upDateCounters ( FastVector p1, Instances p2, Instances p3 ) [static]  :  void

cdk-1.0.1.jar, LayoutCompleteEvent.class
package weka.gui.graphvisualizer
LayoutCompleteEvent.LayoutCompleteEvent ( Object p1 )

cdk-1.0.1.jar, LayoutCompleteEventListener.class
package weka.gui.graphvisualizer
LayoutCompleteEventListener.layoutCompleted ( LayoutCompleteEvent p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, LayoutEngine.class
package weka.gui.graphvisualizer
LayoutEngine.addLayoutCompleteEventListener ( LayoutCompleteEventListener p1 ) [abstract]  :  void
LayoutEngine.fireLayoutCompleteEvent ( LayoutCompleteEvent p1 ) [abstract]  :  void
LayoutEngine.getControlPanel ( ) [abstract]  :  JPanel
LayoutEngine.getProgressBar ( ) [abstract]  :  JProgressBar
LayoutEngine.layoutGraph ( ) [abstract]  :  void
LayoutEngine.removeLayoutCompleteEventListener ( LayoutCompleteEventListener p1 ) [abstract]  :  void
LayoutEngine.setNodesEdges ( FastVector p1, FastVector p2 ) [abstract]  :  void
LayoutEngine.setNodeSize ( int p1, int p2 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, LBR.class
package weka.classifiers.lazy
LBR.binomP ( double p1, double p2, double p3 )  :  double
LBR.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
LBR.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
LBR.globalInfo ( )  :  String
LBR.LBR ( )
LBR.leaveOneOut ( LBR.Indexes p1, int[ ][ ][ ] p2, int[ ] p3, boolean[ ] p4 )  :  int
LBR.localDistributionForInstance ( Instance p1, LBR.Indexes p2 )  :  double[ ]
LBR.localNaiveBayes ( LBR.Indexes p1 )  :  void
LBR.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
LBR.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, LearningRateResultProducer.class
package weka.experiment
LearningRateResultProducer.acceptResult ( ResultProducer p1, Object[ ] p2, Object[ ] p3 )  :  void
LearningRateResultProducer.determineColumnConstraints ( ResultProducer p1 )  :  String[ ]
LearningRateResultProducer.doRun ( int p1 )  :  void
LearningRateResultProducer.doRunKeys ( int p1 )  :  void
LearningRateResultProducer.enumerateMeasures ( )  :  Enumeration
LearningRateResultProducer.getCompatibilityState ( )  :  String
LearningRateResultProducer.getKeyNames ( )  :  String[ ]
LearningRateResultProducer.getKeyTypes ( )  :  Object[ ]
LearningRateResultProducer.getLowerSize ( )  :  int
LearningRateResultProducer.getMeasure ( String p1 )  :  double
LearningRateResultProducer.getOptions ( )  :  String[ ]
LearningRateResultProducer.getResultNames ( )  :  String[ ]
LearningRateResultProducer.getResultProducer ( )  :  ResultProducer
LearningRateResultProducer.getResultTypes ( )  :  Object[ ]
LearningRateResultProducer.getStepSize ( )  :  int
LearningRateResultProducer.getUpperSize ( )  :  int
LearningRateResultProducer.globalInfo ( )  :  String
LearningRateResultProducer.isResultRequired ( ResultProducer p1, Object[ ] p2 )  :  boolean
LearningRateResultProducer.LearningRateResultProducer ( )
LearningRateResultProducer.listOptions ( )  :  Enumeration
LearningRateResultProducer.lowerSizeTipText ( )  :  String
LearningRateResultProducer.postProcess ( )  :  void
LearningRateResultProducer.postProcess ( ResultProducer p1 )  :  void
LearningRateResultProducer.preProcess ( )  :  void
LearningRateResultProducer.preProcess ( ResultProducer p1 )  :  void
LearningRateResultProducer.resultProducerTipText ( )  :  String
LearningRateResultProducer.setAdditionalMeasures ( String[ ] p1 )  :  void
LearningRateResultProducer.setInstances ( Instances p1 )  :  void
LearningRateResultProducer.setLowerSize ( int p1 )  :  void
LearningRateResultProducer.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
LearningRateResultProducer.setResultListener ( ResultListener p1 )  :  void
LearningRateResultProducer.setResultProducer ( ResultProducer p1 )  :  void
LearningRateResultProducer.setStepSize ( int p1 )  :  void
LearningRateResultProducer.setUpperSize ( int p1 )  :  void
LearningRateResultProducer.stepSizeTipText ( )  :  String
LearningRateResultProducer.toString ( )  :  String
LearningRateResultProducer.upperSizeTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, LeastMedSq.class
package weka.classifiers.functions
LeastMedSq.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
LeastMedSq.classifyInstance ( Instance p1 )  :  double
LeastMedSq.combinations ( int p1, int p2 ) [static]  :  int
LeastMedSq.getDebug ( )  :  boolean
LeastMedSq.getOptions ( )  :  String[ ]
LeastMedSq.getRandomSeed ( )  :  long
LeastMedSq.getSampleSize ( )  :  int
LeastMedSq.globalInfo ( )  :  String
LeastMedSq.LeastMedSq ( )
LeastMedSq.listOptions ( )  :  Enumeration
LeastMedSq.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
LeastMedSq.randomSeedTipText ( )  :  String
LeastMedSq.sampleSizeTipText ( )  :  String
LeastMedSq.setDebug ( boolean p1 )  :  void
LeastMedSq.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
LeastMedSq.setRandomSeed ( long p1 )  :  void
LeastMedSq.setSampleSize ( int p1 )  :  void
LeastMedSq.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, LegendEntry.class
package weka.gui.visualize
LegendPanel.LegendEntry.LegendPanel.LegendEntry ( LegendPanel p1, PlotData2D p2, int p3 )

cdk-1.0.1.jar, LegendPanel.class
package weka.gui.visualize
LegendPanel.addRepaintNotify ( Component p1 )  :  void
LegendPanel.LegendPanel ( )
LegendPanel.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
LegendPanel.setPlotList ( FastVector p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, LinearRegression.class
package weka.classifiers.functions
LinearRegression.attributeSelectionMethodTipText ( )  :  String
LinearRegression.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
LinearRegression.classifyInstance ( Instance p1 )  :  double
LinearRegression.coefficients ( )  :  double[ ]
LinearRegression.debugTipText ( )  :  String
LinearRegression.eliminateColinearAttributesTipText ( )  :  String
LinearRegression.getAttributeSelectionMethod ( )  :  SelectedTag
LinearRegression.getDebug ( )  :  boolean
LinearRegression.getEliminateColinearAttributes ( )  :  boolean
LinearRegression.getOptions ( )  :  String[ ]
LinearRegression.getRidge ( )  :  double
LinearRegression.globalInfo ( )  :  String
LinearRegression.LinearRegression ( )
LinearRegression.listOptions ( )  :  Enumeration
LinearRegression.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
LinearRegression.numParameters ( )  :  int
LinearRegression.ridgeTipText ( )  :  String
LinearRegression.setAttributeSelectionMethod ( SelectedTag p1 )  :  void
LinearRegression.setDebug ( boolean p1 )  :  void
LinearRegression.setEliminateColinearAttributes ( boolean p1 )  :  void
LinearRegression.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
LinearRegression.setRidge ( double p1 )  :  void
LinearRegression.toString ( )  :  String
LinearRegression.turnChecksOff ( )  :  void
LinearRegression.turnChecksOn ( )  :  void
package weka.core.matrix
LinearRegression.calculate ( Matrix p1, Matrix p2, double p3 )  :  void
LinearRegression.getCoefficients ( )  :  double[ ]
LinearRegression.LinearRegression ( Matrix p1, Matrix p2, double p3 )
LinearRegression.LinearRegression ( Matrix p1, Matrix p2, double[ ] p3, double p4 )
LinearRegression.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, LinearRegressionModel.class
package org.openscience.cdk.qsar.model.R
LinearRegressionModel.build ( )  :  void
LinearRegressionModel.finalize ( )  :  void
LinearRegressionModel.getFitCoefficients ( )  :  double[ ]
LinearRegressionModel.getFitDFResidual ( )  :  int
LinearRegressionModel.getFitFitted ( )  :  double[ ]
LinearRegressionModel.getFitRank ( )  :  int
LinearRegressionModel.getFitResiduals ( )  :  double[ ]
LinearRegressionModel.getPredictDF ( )  :  int
LinearRegressionModel.getPredictLowerBound ( )  :  double[ ]
LinearRegressionModel.getPredictPredicted ( )  :  double[ ]
LinearRegressionModel.getPredictResidualScale ( )  :  double
LinearRegressionModel.getPredictSEPredictions ( )  :  double[ ]
LinearRegressionModel.getPredictUpperBound ( )  :  double[ ]
LinearRegressionModel.LinearRegressionModel ( )
LinearRegressionModel.LinearRegressionModel ( double[ ][ ] xx, double[ ] yy )
LinearRegressionModel.LinearRegressionModel ( double[ ][ ] xx, double[ ] yy, double[ ] weights )
LinearRegressionModel.loadModel ( String fileName )  :  void
LinearRegressionModel.loadModel ( String serializedModel, String modelName )  :  void
LinearRegressionModel.predict ( )  :  void
LinearRegressionModel.setParameters ( String key, Object obj )  :  void
LinearRegressionModel.summary ( )  :  R.LinearRegressionModelSummary
package org.openscience.cdk.qsar.model.R2
LinearRegressionModel.build ( )  :  void
LinearRegressionModel.getAssign ( )  :  int[ ]
LinearRegressionModel.getCoefficients ( )  :  double[ ]
LinearRegressionModel.getDfResidual ( )  :  int
LinearRegressionModel.getEffects ( )  :  double[ ]
LinearRegressionModel.getFittedValues ( )  :  double[ ]
LinearRegressionModel.getModel ( )  :  JRI.RList
LinearRegressionModel.getModelPredict ( )  :  JRI.RList
LinearRegressionModel.getQr ( )  :  JRI.RList
LinearRegressionModel.getRank ( )  :  int
LinearRegressionModel.getResiduals ( )  :  double[ ]
LinearRegressionModel.getXlevels ( )  :  JRI.RList
LinearRegressionModel.LinearRegressionModel ( )
LinearRegressionModel.LinearRegressionModel ( double[ ][ ] xx, double[ ] yy )
LinearRegressionModel.LinearRegressionModel ( double[ ][ ] xx, double[ ] yy, double[ ] weights )
LinearRegressionModel.loadModel ( String fileName )  :  void
LinearRegressionModel.loadModel ( String serializedModel, String modelName )  :  void
LinearRegressionModel.predict ( )  :  void
LinearRegressionModel.setParameters ( String key, Object obj )  :  void
LinearRegressionModel.summary ( )  :  JRI.RList

cdk-1.0.1.jar, LinearRegressionModelFit.class
package org.openscience.cdk.qsar.model.R
LinearRegressionModelFit.getCoefficients ( )  :  double[ ]
LinearRegressionModelFit.getdfResidual ( )  :  int
LinearRegressionModelFit.getFitted ( )  :  double[ ]
LinearRegressionModelFit.getRank ( )  :  int
LinearRegressionModelFit.getResiduals ( )  :  double[ ]
LinearRegressionModelFit.LinearRegressionModelFit ( double[ ] coeff, double[ ] res, double[ ] fitted, int rank, int degreesOfFreedom )
LinearRegressionModelFit.setCoefficients ( double[ ] coeff )  :  void
LinearRegressionModelFit.setdfResidual ( int degreesOfFreedom )  :  void
LinearRegressionModelFit.setFitted ( double[ ] fitted )  :  void
LinearRegressionModelFit.setRank ( int rank )  :  void
LinearRegressionModelFit.setResiduals ( double[ ] residuals )  :  void

cdk-1.0.1.jar, LinearRegressionModelPredict.class
package org.openscience.cdk.qsar.model.R
LinearRegressionModelPredict.getDF ( )  :  int
LinearRegressionModelPredict.getLower ( )  :  double[ ]
LinearRegressionModelPredict.getPredicted ( )  :  double[ ]
LinearRegressionModelPredict.getResidualScale ( )  :  double
LinearRegressionModelPredict.getSEFit ( )  :  double[ ]
LinearRegressionModelPredict.getUpper ( )  :  double[ ]
LinearRegressionModelPredict.LinearRegressionModelPredict ( double predicted, double standardErrors, double lowerBounds, double upperBounds, int degreesOfFreedom, double residualScale )
LinearRegressionModelPredict.LinearRegressionModelPredict ( double[ ] predicted, double[ ] standardErrors, double[ ] lowerBounds, double[ ] upperBounds, int degreesOfFreedom, double residualScale )
LinearRegressionModelPredict.setDF ( int degreesOfFreedom )  :  void
LinearRegressionModelPredict.setLower ( double[ ] lowerBounds )  :  void
LinearRegressionModelPredict.setPredicted ( double[ ] predicted )  :  void
LinearRegressionModelPredict.setResidualScale ( double scale )  :  void
LinearRegressionModelPredict.setSEFit ( double[ ] standardErrors )  :  void
LinearRegressionModelPredict.setUpper ( double[ ] upperBounds )  :  void

cdk-1.0.1.jar, LinearRegressionModelSummary.class
package org.openscience.cdk.qsar.model.R
LinearRegressionModelSummary.getAdjRSQ ( )  :  double
LinearRegressionModelSummary.getCoeff ( )  :  double[ ][ ]
LinearRegressionModelSummary.getFStatistic ( )  :  double
LinearRegressionModelSummary.getFStatisticDF ( )  :  int[ ]
LinearRegressionModelSummary.getResiduals ( )  :  double[ ]
LinearRegressionModelSummary.getRSQ ( )  :  double
LinearRegressionModelSummary.getSigma ( )  :  double[ ]
LinearRegressionModelSummary.LinearRegressionModelSummary ( double[ ] residuals, double[ ] coeff, double sigma, double rsq, double adjrsq, int df, double[ ] fstat, String[ ] coeffRowNames, String[ ] coeffColNames )

cdk-1.0.1.jar, LinearRegressionWModel.class
package org.openscience.cdk.qsar.model.weka
LinearRegressionWModel.build ( )  :  void
LinearRegressionWModel.getOptions ( )  :  String[ ]
LinearRegressionWModel.getPredictPredicted ( )  :  Object[ ]
LinearRegressionWModel.LinearRegressionWModel ( int[ ] typAttrib, Object[ ] y, Object[ ][ ] x, String[ ] attrib )
LinearRegressionWModel.LinearRegressionWModel ( Object[ ] y, Object[ ][ ] x )
LinearRegressionWModel.LinearRegressionWModel ( String pathTest )
LinearRegressionWModel.predict ( )  :  void
LinearRegressionWModel.setOptions ( String[ ] options )  :  void
LinearRegressionWModel.setParameters ( Object[ ][ ] newX )  :  void
LinearRegressionWModel.setParametersCDK ( String path )  :  void

cdk-1.0.1.jar, LinearUnit.class
package weka.classifiers.functions.neural
LinearUnit.errorValue ( NeuralNode p1 )  :  double
LinearUnit.LinearUnit ( )
LinearUnit.outputValue ( NeuralNode p1 )  :  double
LinearUnit.updateWeights ( NeuralNode p1, double p2, double p3 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, Link.class
package weka.classifiers.rules
DecisionTable.Link.DecisionTable.Link ( DecisionTable p1, BitSet p2, double p3 )
DecisionTable.Link.getGroup ( )  :  BitSet
DecisionTable.Link.getMerit ( )  :  double
DecisionTable.Link.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, Link2.class
package weka.attributeSelection
BestFirst.Link2.BestFirst.Link2 ( attributeSelection.BestFirst p1, Object[ ] p2, double p3 )
BestFirst.Link2.getData ( )  :  Object[ ]
BestFirst.Link2.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, LinkedList.class
package weka.classifiers.rules
DecisionTable.LinkedList.addToList ( BitSet p1, double p2 )  :  void
DecisionTable.LinkedList.DecisionTable.LinkedList ( DecisionTable p1 )
DecisionTable.LinkedList.getLinkAt ( int p1 )  :  DecisionTable.Link
DecisionTable.LinkedList.removeLinkAt ( int p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, LinkedList2.class
package weka.attributeSelection
BestFirst.LinkedList2.addToList ( Object[ ] p1, double p2 )  :  void
BestFirst.LinkedList2.BestFirst.LinkedList2 ( attributeSelection.BestFirst p1, int p2 )
BestFirst.LinkedList2.getLinkAt ( int p1 )  :  attributeSelection.BestFirst.Link2
BestFirst.LinkedList2.removeLinkAt ( int p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, LinkedListInverseIterator.class
package weka.associations.tertius
SimpleLinkedList.LinkedListInverseIterator.hasPrevious ( )  :  boolean
SimpleLinkedList.LinkedListInverseIterator.previous ( )  :  Object
SimpleLinkedList.LinkedListInverseIterator.remove ( )  :  void
SimpleLinkedList.LinkedListInverseIterator.SimpleLinkedList.LinkedListInverseIterator ( SimpleLinkedList p1 )

cdk-1.0.1.jar, LinkedListIterator.class
package weka.associations.tertius
SimpleLinkedList.LinkedListIterator.addBefore ( Object p1 )  :  void
SimpleLinkedList.LinkedListIterator.hasNext ( )  :  boolean
SimpleLinkedList.LinkedListIterator.next ( )  :  Object
SimpleLinkedList.LinkedListIterator.remove ( )  :  void
SimpleLinkedList.LinkedListIterator.SimpleLinkedList.LinkedListIterator ( SimpleLinkedList p1 )

cdk-1.0.1.jar, ListSelectorDialog.class
package weka.gui
ListSelectorDialog.ListSelectorDialog ( Frame p1, JList p2 )
ListSelectorDialog.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
ListSelectorDialog.showDialog ( )  :  int

cdk-1.0.1.jar, Literal.class
package weka.associations.tertius
Literal.getNegation ( )  :  Literal
Literal.getPredicate ( )  :  Predicate
Literal.Literal ( Predicate p1, int p2, int p3 )
Literal.negationSatisfies ( Instance p1 ) [abstract]  :  boolean
Literal.negative ( )  :  boolean
Literal.positive ( )  :  boolean
Literal.satisfies ( Instance p1 ) [abstract]  :  boolean
Literal.setNegation ( Literal p1 )  :  void
Literal.toString ( ) [abstract]  :  String

cdk-1.0.1.jar, LiteralSet.class
package weka.associations.tertius
LiteralSet.addElement ( Literal p1 )  :  void
LiteralSet.canKeep ( Instance p1, Literal p2 ) [abstract]  :  boolean
LiteralSet.clone ( )  :  Object
LiteralSet.contains ( Literal p1 )  :  boolean
LiteralSet.counterInstance ( Instance p1 )  :  boolean
LiteralSet.counterInstance ( Instance p1, Instance p2 )  :  boolean
LiteralSet.enumerateLiterals ( )  :  Iterator
LiteralSet.getCounterInstancesFrequency ( )  :  double
LiteralSet.getCounterInstancesNumber ( )  :  int
LiteralSet.getLastLiteral ( )  :  Literal
LiteralSet.getType ( )  :  int
LiteralSet.hasMaxCounterInstances ( )  :  boolean
LiteralSet.isEmpty ( )  :  boolean
LiteralSet.isIncludedIn ( Rule p1 ) [abstract]  :  boolean
LiteralSet.LiteralSet ( )
LiteralSet.LiteralSet ( Instances p1 )
LiteralSet.negationIncludedIn ( LiteralSet p1 )  :  boolean
LiteralSet.numLiterals ( )  :  int
LiteralSet.overFrequencyThreshold ( double p1 )  :  boolean
LiteralSet.toString ( ) [abstract]  :  String
LiteralSet.upDate ( Instances p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, LMT.class
package weka.classifiers.trees
LMT.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
LMT.classifyInstance ( Instance p1 )  :  double
LMT.convertNominalTipText ( )  :  String
LMT.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
LMT.enumerateMeasures ( )  :  Enumeration
LMT.errorOnProbabilitiesTipText ( )  :  String
LMT.fastRegressionTipText ( )  :  String
LMT.getConvertNominal ( )  :  boolean
LMT.getErrorOnProbabilities ( )  :  boolean
LMT.getFastRegression ( )  :  boolean
LMT.getMeasure ( String p1 )  :  double
LMT.getMinNumInstances ( )  :  int
LMT.getNumBoostingIterations ( )  :  int
LMT.getOptions ( )  :  String[ ]
LMT.getSplitOnResiduals ( )  :  boolean
LMT.globalInfo ( )  :  String
LMT.graph ( )  :  String
LMT.graphType ( )  :  int
LMT.listOptions ( )  :  Enumeration
LMT.LMT ( )
LMT.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
LMT.measureNumLeaves ( )  :  int
LMT.measureTreeSize ( )  :  int
LMT.minNumInstancesTipText ( )  :  String
LMT.numBoostingIterationsTipText ( )  :  String
LMT.setConvertNominal ( boolean p1 )  :  void
LMT.setErrorOnProbabilities ( boolean p1 )  :  void
LMT.setFastRegression ( boolean p1 )  :  void
LMT.setMinNumInstances ( int p1 )  :  void
LMT.setNumBoostingIterations ( int p1 )  :  void
LMT.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
LMT.setSplitOnResiduals ( boolean p1 )  :  void
LMT.splitOnResidualsTipText ( )  :  String
LMT.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, LMTNode.class
package weka.classifiers.trees.lmt
LMTNode.assignIDs ( int p1 )  :  int
LMTNode.assignLeafModelNumbers ( int p1 )  :  int
LMTNode.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
LMTNode.buildTree ( Instances p1, SimpleLinearRegression[ ][ ] p2, double p3 )  :  void
LMTNode.calculateAlphas ( )  :  void
LMTNode.cleanup ( )  :  void
LMTNode.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
LMTNode.dumpTree ( int p1, StringBuffer p2 )  :  void
LMTNode.getCoefficients ( )  :  double[ ][ ]
LMTNode.getFs ( Instance p1 )  :  double[ ]
LMTNode.getModelParameters ( )  :  String
LMTNode.getNodes ( )  :  Vector
LMTNode.getNodes ( Vector p1 )  :  void
LMTNode.getNumericData ( Instances p1 )  :  Instances
LMTNode.getNumInnerNodes ( )  :  int
LMTNode.getNumLeaves ( )  :  int
LMTNode.graph ( )  :  String
LMTNode.hasModels ( )  :  boolean
LMTNode.LMTNode ( ModelSelection p1, int p2, boolean p3, boolean p4, int p5 )
LMTNode.mergeArrays ( SimpleLinearRegression[ ][ ] p1, SimpleLinearRegression[ ][ ] p2 )  :  SimpleLinearRegression[ ][ ]
LMTNode.modelDistributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
LMTNode.modelErrors ( )  :  void
LMTNode.modelsToString ( )  :  String
LMTNode.numLeaves ( )  :  int
LMTNode.numNodes ( )  :  int
LMTNode.prune ( double p1 )  :  void
LMTNode.prune ( double[ ] p1, double[ ] p2, Instances p3 )  :  int
LMTNode.toString ( )  :  String
LMTNode.treeErrors ( )  :  void
LMTNode.tryLogistic ( Instances p1 )  :  int
LMTNode.unprune ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, Loader.class
package weka.core.converters
Loader.getDataSet ( ) [abstract]  :  Instances
Loader.getNextInstance ( ) [abstract]  :  Instance
Loader.getStructure ( ) [abstract]  :  Instances
Loader.reset ( ) [abstract]  :  void
Loader.setSource ( File p1 ) [abstract]  :  void
Loader.setSource ( InputStream p1 ) [abstract]  :  void
package weka.gui
Loader.getDir ( )  :  String
Loader.getInputStream ( String p1 )  :  InputStream
Loader.getInputStream ( String p1, String p2 ) [static]  :  InputStream
Loader.getReader ( String p1 )  :  Reader
Loader.getReader ( String p1, String p2 ) [static]  :  Reader
Loader.getURL ( String p1 )  :  URL
Loader.getURL ( String p1, String p2 ) [static]  :  URL
Loader.Loader ( String p1 )
Loader.processFilename ( String p1 )  :  String
package weka.gui.beans
Loader.addDataSourceListener ( DataSourceListener p1 )  :  void
Loader.addInstanceListener ( InstanceListener p1 )  :  void
Loader.appearanceDesign ( )  :  void
Loader.appearanceFinal ( )  :  void
Loader.enumerateRequests ( )  :  Enumeration
Loader.eventGeneratable ( String p1 )  :  boolean
Loader.getLoader ( )  :  Loader
Loader.getWrappedAlgorithm ( )  :  Object
Loader.globalInfo ( )  :  String
Loader.Loader ( )
Loader.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Loader.notifyDataSetLoaded ( DataSetEvent p1 )  :  void
Loader.notifyInstanceLoaded ( InstanceEvent p1 )  :  void
Loader.notifyStructureAvailable ( Instances p1 )  :  void
Loader.performRequest ( String p1 )  :  void
Loader.removeDataSourceListener ( DataSourceListener p1 )  :  void
Loader.removeInstanceListener ( InstanceListener p1 )  :  void
Loader.setBeanContext ( BeanContext p1 )  :  void
Loader.setDB ( boolean p1 )  :  void
Loader.setLoader ( Loader p1 )  :  void
Loader.setWrappedAlgorithm ( Object p1 )  :  void
Loader.startLoading ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, LoaderBeanInfo.class
package weka.gui.beans
LoaderBeanInfo.getBeanDescriptor ( )  :  BeanDescriptor
LoaderBeanInfo.LoaderBeanInfo ( )

cdk-1.0.1.jar, LoaderCustomizer.class
package weka.gui.beans
LoaderCustomizer.addPropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
LoaderCustomizer.LoaderCustomizer ( )
LoaderCustomizer.removePropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
LoaderCustomizer.setObject ( Object p1 )  :  void
LoaderCustomizer.setParentFrame ( JFrame p1 )  :  void
LoaderCustomizer.setUpFile ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, LocalScoreSearchAlgorithm.class
package weka.classifiers.bayes.net.search.local
LocalScoreSearchAlgorithm.buildStructure ( BayesNet p1, Instances p2 )  :  void
LocalScoreSearchAlgorithm.calcNodeScore ( int p1 )  :  double
LocalScoreSearchAlgorithm.calcScoreOfCounts ( int[ ] p1, int p2, int p3, Instances p4 )  :  double
LocalScoreSearchAlgorithm.calcScoreOfCounts2 ( int[ ][ ] p1, int p2, int p3, Instances p4 )  :  double
LocalScoreSearchAlgorithm.calcScoreWithExtraParent ( int p1, int p2 )  :  double
LocalScoreSearchAlgorithm.calcScoreWithMissingParent ( int p1, int p2 )  :  double
LocalScoreSearchAlgorithm.getOptions ( )  :  String[ ]
LocalScoreSearchAlgorithm.getScoreType ( )  :  SelectedTag
LocalScoreSearchAlgorithm.listOptions ( )  :  Enumeration
LocalScoreSearchAlgorithm.LocalScoreSearchAlgorithm ( )
LocalScoreSearchAlgorithm.LocalScoreSearchAlgorithm ( BayesNet p1, Instances p2 )
LocalScoreSearchAlgorithm.logScore ( int p1 )  :  double
LocalScoreSearchAlgorithm.scoreTypeTipText ( )  :  String
LocalScoreSearchAlgorithm.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
LocalScoreSearchAlgorithm.setScoreType ( SelectedTag p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, Logger.class
package weka.gui
Logger.logMessage ( String p1 ) [abstract]  :  void
Logger.statusMessage ( String p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, LogicalOperatorAtom.class
package org.openscience.cdk.isomorphism.matchers.smarts
LogicalOperatorAtom.getFlag ( int flagType )  :  boolean
LogicalOperatorAtom.getLeft ( )  :  IQueryAtom
LogicalOperatorAtom.getOperator ( )  :  String
LogicalOperatorAtom.getRight ( )  :  IQueryAtom
LogicalOperatorAtom.LogicalOperatorAtom ( )
LogicalOperatorAtom.matches ( IAtom atom )  :  boolean
LogicalOperatorAtom.setLeft ( IQueryAtom left )  :  void
LogicalOperatorAtom.setOperator ( String name )  :  void
LogicalOperatorAtom.setRight ( IQueryAtom right )  :  void

cdk-1.0.1.jar, LogicalOperatorBond.class
package org.openscience.cdk.isomorphism.matchers.smarts
LogicalOperatorBond.getLeft ( )  :  IQueryBond
LogicalOperatorBond.getOperator ( )  :  String
LogicalOperatorBond.getRight ( )  :  IQueryBond
LogicalOperatorBond.LogicalOperatorBond ( )
LogicalOperatorBond.matches ( IBond bond )  :  boolean
LogicalOperatorBond.setAtoms ( IAtom[ ] atoms )  :  void
LogicalOperatorBond.setLeft ( IQueryBond left )  :  void
LogicalOperatorBond.setOperator ( String name )  :  void
LogicalOperatorBond.setRight ( IQueryBond right )  :  void

cdk-1.0.1.jar, Logistic.class
package weka.classifiers.functions
Logistic.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
Logistic.debugTipText ( )  :  String
Logistic.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
Logistic.getDebug ( )  :  boolean
Logistic.getMaxIts ( )  :  int
Logistic.getOptions ( )  :  String[ ]
Logistic.getRidge ( )  :  double
Logistic.globalInfo ( )  :  String
Logistic.listOptions ( )  :  Enumeration
Logistic.Logistic ( )
Logistic.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Logistic.maxItsTipText ( )  :  String
Logistic.ridgeTipText ( )  :  String
Logistic.setDebug ( boolean p1 )  :  void
Logistic.setMaxIts ( int p1 )  :  void
Logistic.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
Logistic.setRidge ( double p1 )  :  void
Logistic.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, LogisticBase.class
package weka.classifiers.trees.lmt
LogisticBase.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
LogisticBase.cleanup ( )  :  void
LogisticBase.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
LogisticBase.getBestIteration ( double[ ] p1, int p2 )  :  int
LogisticBase.getCoefficients ( )  :  double[ ][ ]
LogisticBase.getErrorRate ( Instances p1 )  :  double
LogisticBase.getFs ( Instance p1 )  :  double[ ]
LogisticBase.getFs ( Instances p1 )  :  double[ ][ ]
LogisticBase.getMaxIterations ( )  :  int
LogisticBase.getMeanAbsoluteError ( Instances p1 )  :  double
LogisticBase.getNumericData ( Instances p1 )  :  Instances
LogisticBase.getNumRegressions ( )  :  int
LogisticBase.getProbs ( double[ ][ ] p1 )  :  double[ ][ ]
LogisticBase.getUsedAttributes ( )  :  int[ ][ ]
LogisticBase.getWs ( double[ ][ ] p1, double[ ][ ] p2 )  :  double[ ][ ]
LogisticBase.getYs ( Instances p1 )  :  double[ ][ ]
LogisticBase.getZ ( double p1, double p2 )  :  double
LogisticBase.getZs ( double[ ][ ] p1, double[ ][ ] p2 )  :  double[ ][ ]
LogisticBase.initRegressions ( )  :  SimpleLinearRegression[ ][ ]
LogisticBase.LogisticBase ( )
LogisticBase.LogisticBase ( int p1, boolean p2, boolean p3 )
LogisticBase.logLikelihood ( double[ ][ ] p1, double[ ][ ] p2 )  :  double
LogisticBase.percentAttributesUsed ( )  :  double
LogisticBase.performBoosting ( )  :  void
LogisticBase.performBoosting ( Instances p1, Instances p2, double[ ] p3, int p4 )  :  int
LogisticBase.performBoosting ( int p1 )  :  void
LogisticBase.performBoostingCV ( )  :  void
LogisticBase.performIteration ( int p1, double[ ][ ] p2, double[ ][ ] p3, double[ ][ ] p4, Instances p5 )  :  boolean
LogisticBase.probs ( double[ ] p1 )  :  double[ ]
LogisticBase.selectRegressions ( SimpleLinearRegression[ ][ ] p1 )  :  SimpleLinearRegression[ ][ ]
LogisticBase.setHeuristicStop ( int p1 )  :  void
LogisticBase.setMaxIterations ( int p1 )  :  void
LogisticBase.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, LogitBoost.class
package weka.classifiers.meta
LogitBoost.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
LogitBoost.classifiers ( )  :  Classifier[ ][ ]
LogitBoost.defaultClassifierString ( )  :  String
LogitBoost.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
LogitBoost.getLikelihoodThreshold ( )  :  double
LogitBoost.getNumFolds ( )  :  int
LogitBoost.getNumRuns ( )  :  int
LogitBoost.getOptions ( )  :  String[ ]
LogitBoost.getShrinkage ( )  :  double
LogitBoost.getUseResampling ( )  :  boolean
LogitBoost.getWeightThreshold ( )  :  int
LogitBoost.globalInfo ( )  :  String
LogitBoost.likelihoodThresholdTipText ( )  :  String
LogitBoost.listOptions ( )  :  Enumeration
LogitBoost.LogitBoost ( )
LogitBoost.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
LogitBoost.numFoldsTipText ( )  :  String
LogitBoost.numRunsTipText ( )  :  String
LogitBoost.selectWeightQuantile ( Instances p1, double p2 )  :  Instances
LogitBoost.setLikelihoodThreshold ( double p1 )  :  void
LogitBoost.setNumFolds ( int p1 )  :  void
LogitBoost.setNumRuns ( int p1 )  :  void
LogitBoost.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
LogitBoost.setShrinkage ( double p1 )  :  void
LogitBoost.setUseResampling ( boolean p1 )  :  void
LogitBoost.setWeightThreshold ( int p1 )  :  void
LogitBoost.shrinkageTipText ( )  :  String
LogitBoost.toSource ( String p1 )  :  String
LogitBoost.toString ( )  :  String
LogitBoost.useResamplingTipText ( )  :  String
LogitBoost.weightThresholdTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, LogPanel.class
package weka.gui
LogPanel.getTimestamp ( ) [static]  :  String
LogPanel.logMessage ( String p1 )  :  void
LogPanel.LogPanel ( )
LogPanel.LogPanel ( WekaTaskMonitor p1 )
LogPanel.LogPanel ( WekaTaskMonitor p1, boolean p2 )
LogPanel.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
LogPanel.statusMessage ( String p1 )  :  void
LogPanel.taskFinished ( )  :  void
LogPanel.taskStarted ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, LookAndFeel.class
package weka.gui
LookAndFeel.getInstalledLookAndFeels ( ) [static]  :  String[ ]
LookAndFeel.getSystemLookAndFeel ( ) [static]  :  String
LookAndFeel.LookAndFeel ( )
LookAndFeel.setLookAndFeel ( ) [static]  :  boolean
LookAndFeel.setLookAndFeel ( String p1 ) [static]  :  boolean

cdk-1.0.1.jar, LUDecomposition.class
package weka.core.matrix
LUDecomposition.det ( )  :  double
LUDecomposition.getDoublePivot ( )  :  double[ ]
LUDecomposition.getL ( )  :  Matrix
LUDecomposition.getPivot ( )  :  int[ ]
LUDecomposition.getU ( )  :  Matrix
LUDecomposition.isNonsingular ( )  :  boolean
LUDecomposition.LUDecomposition ( Matrix p1 )
LUDecomposition.solve ( Matrix p1 )  :  Matrix

cdk-1.0.1.jar, LWL.class
package weka.classifiers.lazy
LWL.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
LWL.defaultClassifierString ( )  :  String
LWL.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
LWL.dontNormalizeTipText ( )  :  String
LWL.getAttributeMax ( int p1 )  :  double
LWL.getAttributeMin ( int p1 )  :  double
LWL.getDontNormalize ( )  :  boolean
LWL.getKNN ( )  :  int
LWL.getOptions ( )  :  String[ ]
LWL.getWeightingKernel ( )  :  int
LWL.globalInfo ( )  :  String
LWL.KNNTipText ( )  :  String
LWL.listOptions ( )  :  Enumeration
LWL.LWL ( )
LWL.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
LWL.setDontNormalize ( boolean p1 )  :  void
LWL.setKNN ( int p1 )  :  void
LWL.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
LWL.setWeightingKernel ( int p1 )  :  void
LWL.toString ( )  :  String
LWL.updateClassifier ( Instance p1 )  :  void
LWL.weightingKernelTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, M5Base.class
package weka.classifiers.trees.m5
M5Base.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
M5Base.classifyInstance ( Instance p1 )  :  double
M5Base.enumerateMeasures ( )  :  Enumeration
M5Base.getBuildRegressionTree ( )  :  boolean
M5Base.getGenerateRules ( )  :  boolean
M5Base.getM5RootNode ( )  :  RuleNode
M5Base.getMeasure ( String p1 )  :  double
M5Base.getMinNumInstances ( )  :  double
M5Base.getOptions ( )  :  String[ ]
M5Base.getUnpruned ( )  :  boolean
M5Base.getUseUnsmoothed ( )  :  boolean
M5Base.globalInfo ( )  :  String
M5Base.listOptions ( )  :  Enumeration
M5Base.M5Base ( )
M5Base.measureNumRules ( )  :  double
M5Base.setBuildRegressionTree ( boolean p1 )  :  void
M5Base.setGenerateRules ( boolean p1 )  :  void
M5Base.setMinNumInstances ( double p1 )  :  void
M5Base.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
M5Base.setUnpruned ( boolean p1 )  :  void
M5Base.setUseUnsmoothed ( boolean p1 )  :  void
M5Base.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, M5P.class
package weka.classifiers.trees
M5P.getOptions ( )  :  String[ ]
M5P.getSaveInstances ( )  :  boolean
M5P.graph ( )  :  String
M5P.graphType ( )  :  int
M5P.listOptions ( )  :  Enumeration
M5P.M5P ( )
M5P.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
M5P.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
M5P.setSaveInstances ( boolean p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, M5Rules.class
package weka.classifiers.rules
M5Rules.globalInfo ( )  :  String
M5Rules.M5Rules ( )
M5Rules.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void

cdk-1.0.1.jar, MahalanobisEstimator.class
package weka.estimators
MahalanobisEstimator.addValue ( double p1, double p2 )  :  void
MahalanobisEstimator.getProbability ( double p1 )  :  double
MahalanobisEstimator.MahalanobisEstimator ( Matrix p1, double p2, double p3 )
MahalanobisEstimator.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
MahalanobisEstimator.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, MakeDecList.class
package weka.classifiers.rules.part
MakeDecList.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
MakeDecList.classifyInstance ( Instance p1 )  :  double
MakeDecList.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
MakeDecList.MakeDecList ( ModelSelection p1, double p2, int p3 )
MakeDecList.MakeDecList ( ModelSelection p1, int p2 )
MakeDecList.MakeDecList ( ModelSelection p1, int p2, int p3, int p4 )
MakeDecList.numRules ( )  :  int
MakeDecList.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, MakeDensityBasedClusterer.class
package weka.clusterers
MakeDensityBasedClusterer.buildClusterer ( Instances p1 )  :  void
MakeDensityBasedClusterer.clusterPriors ( )  :  double[ ]
MakeDensityBasedClusterer.getClusterer ( )  :  Clusterer
MakeDensityBasedClusterer.getMinStdDev ( )  :  double
MakeDensityBasedClusterer.getOptions ( )  :  String[ ]
MakeDensityBasedClusterer.listOptions ( )  :  Enumeration
MakeDensityBasedClusterer.logDensityPerClusterForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
MakeDensityBasedClusterer.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
MakeDensityBasedClusterer.MakeDensityBasedClusterer ( )
MakeDensityBasedClusterer.MakeDensityBasedClusterer ( Clusterer p1 )
MakeDensityBasedClusterer.minStdDevTipText ( )  :  String
MakeDensityBasedClusterer.numberOfClusters ( )  :  int
MakeDensityBasedClusterer.setClusterer ( Clusterer p1 )  :  void
MakeDensityBasedClusterer.setMinStdDev ( double p1 )  :  void
MakeDensityBasedClusterer.setNumClusters ( int p1 )  :  void
MakeDensityBasedClusterer.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
MakeDensityBasedClusterer.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, MakeIndicator.class
package weka.filters.unsupervised.attribute
MakeIndicator.attributeIndexTipText ( )  :  String
MakeIndicator.getAttributeIndex ( )  :  String
MakeIndicator.getNumeric ( )  :  boolean
MakeIndicator.getOptions ( )  :  String[ ]
MakeIndicator.getValueIndices ( )  :  String
MakeIndicator.getValueRange ( )  :  Range
MakeIndicator.globalInfo ( )  :  String
MakeIndicator.input ( Instance p1 )  :  boolean
MakeIndicator.listOptions ( )  :  Enumeration
MakeIndicator.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
MakeIndicator.MakeIndicator ( )
MakeIndicator.numericTipText ( )  :  String
MakeIndicator.setAttributeIndex ( String p1 )  :  void
MakeIndicator.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
MakeIndicator.setNumeric ( boolean p1 )  :  void
MakeIndicator.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
MakeIndicator.setValueIndex ( int p1 )  :  void
MakeIndicator.setValueIndices ( String p1 )  :  void
MakeIndicator.setValueIndicesArray ( int[ ] p1 )  :  void
MakeIndicator.valueIndicesTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, MarginCurve.class
package weka.classifiers.evaluation
MarginCurve.getCurve ( FastVector p1 )  :  Instances
MarginCurve.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
MarginCurve.MarginCurve ( )

cdk-1.0.1.jar, Matchable.class
package weka.core
Matchable.prefix ( ) [abstract]  :  String

cdk-1.0.1.jar, Maths.class
package weka.classifiers.functions.pace
Maths.dchisq ( double p1 ) [static]  :  double
Maths.dchisq ( double p1, double p2 ) [static]  :  double
Maths.dchisq ( double p1, DoubleVector p2 ) [static]  :  DoubleVector
Maths.dchisqLog ( double p1 ) [static]  :  double
Maths.dchisqLog ( double p1, double p2 ) [static]  :  double
Maths.dchisqLog ( double p1, DoubleVector p2 ) [static]  :  DoubleVector
Maths.dnorm ( double p1 ) [static]  :  double
Maths.dnorm ( double p1, double p2, double p3 ) [static]  :  double
Maths.dnorm ( double p1, DoubleVector p2, double p3 ) [static]  :  DoubleVector
Maths.dnormLog ( double p1 ) [static]  :  double
Maths.dnormLog ( double p1, double p2, double p3 ) [static]  :  double
Maths.dnormLog ( double p1, DoubleVector p2, double p3 ) [static]  :  DoubleVector
Maths.hypot ( double p1, double p2 ) [static]  :  double
Maths.Maths ( )
Maths.pchisq ( double p1 ) [static]  :  double
Maths.pchisq ( double p1, double p2 ) [static]  :  double
Maths.pchisq ( double p1, DoubleVector p2 ) [static]  :  DoubleVector
Maths.pnorm ( double p1 ) [static]  :  double
Maths.pnorm ( double p1, double p2, double p3 ) [static]  :  double
Maths.pnorm ( double p1, DoubleVector p2, double p3 ) [static]  :  DoubleVector
Maths.rchisq ( int p1, double p2, Random p3 ) [static]  :  DoubleVector
Maths.rnorm ( int p1, double p2, double p3, Random p4 ) [static]  :  DoubleVector
Maths.square ( double p1 ) [static]  :  double
package weka.core.matrix
Maths.hypot ( double p1, double p2 ) [static]  :  double
Maths.Maths ( )

cdk-1.0.1.jar, Matrix.class
package weka.classifiers.functions.pace
Matrix.arrayLeftDivide ( Matrix p1 )  :  Matrix
Matrix.arrayLeftDivideEquals ( Matrix p1 )  :  Matrix
Matrix.arrayRightDivide ( Matrix p1 )  :  Matrix
Matrix.arrayRightDivideEquals ( Matrix p1 )  :  Matrix
Matrix.arrayTimes ( Matrix p1 )  :  Matrix
Matrix.arrayTimesEquals ( Matrix p1 )  :  Matrix
Matrix.clone ( )  :  Object
Matrix.constructWithCopy ( double[ ][ ] p1 ) [static]  :  Matrix
Matrix.copy ( )  :  Matrix
Matrix.get ( int p1, int p2 )  :  double
Matrix.getArray ( )  :  double[ ][ ]
Matrix.getArrayCopy ( )  :  double[ ][ ]
Matrix.getColumnDimension ( )  :  int
Matrix.getColumnPackedCopy ( )  :  double[ ]
Matrix.getMatrix ( int p1, int p2, int p3, int p4 )  :  Matrix
Matrix.getMatrix ( int p1, int p2, int[ ] p3 )  :  Matrix
Matrix.getMatrix ( int[ ] p1, int p2, int p3 )  :  Matrix
Matrix.getMatrix ( int[ ] p1, int[ ] p2 )  :  Matrix
Matrix.getRowDimension ( )  :  int
Matrix.getRowPackedCopy ( )  :  double[ ]
Matrix.identity ( int p1, int p2 ) [static]  :  Matrix
Matrix.Matrix ( double[ ] p1, int p2 )
Matrix.Matrix ( double[ ][ ] p1 )
Matrix.Matrix ( double[ ][ ] p1, int p2, int p3 )
Matrix.Matrix ( int p1, int p2 )
Matrix.Matrix ( int p1, int p2, double p3 )
Matrix.minus ( Matrix p1 )  :  Matrix
Matrix.minusEquals ( Matrix p1 )  :  Matrix
Matrix.norm1 ( )  :  double
Matrix.normF ( )  :  double
Matrix.normInf ( )  :  double
Matrix.plus ( Matrix p1 )  :  Matrix
Matrix.plusEquals ( Matrix p1 )  :  Matrix
Matrix.print ( int p1, int p2 )  :  void
Matrix.print ( NumberFormat p1, int p2 )  :  void
Matrix.print ( PrintWriter p1, int p2, int p3 )  :  void
Matrix.print ( PrintWriter p1, NumberFormat p2, int p3 )  :  void
Matrix.random ( int p1, int p2 ) [static]  :  Matrix
Matrix.read ( BufferedReader p1 ) [static]  :  Matrix
Matrix.set ( int p1, int p2, double p3 )  :  void
Matrix.setMatrix ( int p1, int p2, int p3, int p4, Matrix p5 )  :  void
Matrix.setMatrix ( int p1, int p2, int[ ] p3, Matrix p4 )  :  void
Matrix.setMatrix ( int[ ] p1, int p2, int p3, Matrix p4 )  :  void
Matrix.setMatrix ( int[ ] p1, int[ ] p2, Matrix p3 )  :  void
Matrix.times ( double p1 )  :  Matrix
Matrix.times ( Matrix p1 )  :  Matrix
Matrix.timesEquals ( double p1 )  :  Matrix
Matrix.trace ( )  :  double
Matrix.transpose ( )  :  Matrix
Matrix.uminus ( )  :  Matrix
package weka.core
Matrix.add ( Matrix p1 )  :  Matrix
Matrix.addElement ( int p1, int p2, double p3 )  :  void
Matrix.clone ( )  :  Object
Matrix.eigenvalueDecomposition ( double[ ][ ] p1, double[ ] p2 )  :  void
Matrix.getColumn ( int p1 )  :  double[ ]
Matrix.getElement ( int p1, int p2 )  :  double
Matrix.getL ( )  :  Matrix
Matrix.getMatrix ( )  :  Matrix
Matrix.getRow ( int p1 )  :  double[ ]
Matrix.getU ( )  :  Matrix
Matrix.hypot ( double p1, double p2 ) [static]  :  double
Matrix.isSymmetric ( )  :  boolean
Matrix.LUDecomposition ( )  :  int[ ]
Matrix.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Matrix.Matrix ( double[ ][ ] p1 )
Matrix.Matrix ( int p1, int p2 )
Matrix.Matrix ( Reader p1 )
Matrix.multiply ( Matrix p1 )  :  Matrix
Matrix.numColumns ( )  :  int
Matrix.numRows ( )  :  int
Matrix.parseMatlab ( String p1 ) [static]  :  Matrix
Matrix.regression ( Matrix p1, double p2 )  :  double[ ]
Matrix.regression ( Matrix p1, double[ ] p2, double p3 )  :  double[ ]
Matrix.setColumn ( int p1, double[ ] p2 )  :  void
Matrix.setElement ( int p1, int p2, double p3 )  :  void
Matrix.setRow ( int p1, double[ ] p2 )  :  void
Matrix.solve ( double[ ] p1 )  :  void
Matrix.toMatlab ( )  :  String
Matrix.toString ( )  :  String
Matrix.transpose ( )  :  Matrix
Matrix.write ( Writer p1 )  :  void
package weka.core.matrix
Matrix.arrayLeftDivide ( Matrix p1 )  :  Matrix
Matrix.arrayLeftDivideEquals ( Matrix p1 )  :  Matrix
Matrix.arrayRightDivide ( Matrix p1 )  :  Matrix
Matrix.arrayRightDivideEquals ( Matrix p1 )  :  Matrix
Matrix.arrayTimes ( Matrix p1 )  :  Matrix
Matrix.arrayTimesEquals ( Matrix p1 )  :  Matrix
Matrix.chol ( )  :  CholeskyDecomposition
Matrix.clone ( )  :  Object
Matrix.cond ( )  :  double
Matrix.constructWithCopy ( double[ ][ ] p1 ) [static]  :  Matrix
Matrix.copy ( )  :  Matrix
Matrix.det ( )  :  double
Matrix.eig ( )  :  EigenvalueDecomposition
Matrix.get ( int p1, int p2 )  :  double
Matrix.getArray ( )  :  double[ ][ ]
Matrix.getArrayCopy ( )  :  double[ ][ ]
Matrix.getColumnDimension ( )  :  int
Matrix.getColumnPackedCopy ( )  :  double[ ]
Matrix.getMatrix ( int p1, int p2, int p3, int p4 )  :  Matrix
Matrix.getMatrix ( int p1, int p2, int[ ] p3 )  :  Matrix
Matrix.getMatrix ( int[ ] p1, int p2, int p3 )  :  Matrix
Matrix.getMatrix ( int[ ] p1, int[ ] p2 )  :  Matrix
Matrix.getRowDimension ( )  :  int
Matrix.getRowPackedCopy ( )  :  double[ ]
Matrix.identity ( int p1, int p2 ) [static]  :  Matrix
Matrix.inverse ( )  :  Matrix
Matrix.isSquare ( )  :  boolean
Matrix.isSymmetric ( )  :  boolean
Matrix.lu ( )  :  LUDecomposition
Matrix.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Matrix.Matrix ( double[ ] p1, int p2 )
Matrix.Matrix ( double[ ][ ] p1 )
Matrix.Matrix ( double[ ][ ] p1, int p2, int p3 )
Matrix.Matrix ( int p1, int p2 )
Matrix.Matrix ( int p1, int p2, double p3 )
Matrix.Matrix ( Reader p1 )
Matrix.minus ( Matrix p1 )  :  Matrix
Matrix.minusEquals ( Matrix p1 )  :  Matrix
Matrix.norm1 ( )  :  double
Matrix.norm2 ( )  :  double
Matrix.normF ( )  :  double
Matrix.normInf ( )  :  double
Matrix.parseMatlab ( String p1 ) [static]  :  Matrix
Matrix.plus ( Matrix p1 )  :  Matrix
Matrix.plusEquals ( Matrix p1 )  :  Matrix
Matrix.print ( int p1, int p2 )  :  void
Matrix.print ( NumberFormat p1, int p2 )  :  void
Matrix.print ( PrintWriter p1, int p2, int p3 )  :  void
Matrix.print ( PrintWriter p1, NumberFormat p2, int p3 )  :  void
Matrix.qr ( )  :  QRDecomposition
Matrix.random ( int p1, int p2 ) [static]  :  Matrix
Matrix.rank ( )  :  int
Matrix.read ( BufferedReader p1 ) [static]  :  Matrix
Matrix.regression ( Matrix p1, double p2 )  :  LinearRegression
Matrix.regression ( Matrix p1, double[ ] p2, double p3 )  :  LinearRegression
Matrix.set ( int p1, int p2, double p3 )  :  void
Matrix.setMatrix ( int p1, int p2, int p3, int p4, Matrix p5 )  :  void
Matrix.setMatrix ( int p1, int p2, int[ ] p3, Matrix p4 )  :  void
Matrix.setMatrix ( int[ ] p1, int p2, int p3, Matrix p4 )  :  void
Matrix.setMatrix ( int[ ] p1, int[ ] p2, Matrix p3 )  :  void
Matrix.solve ( Matrix p1 )  :  Matrix
Matrix.solveTranspose ( Matrix p1 )  :  Matrix
Matrix.sqrt ( )  :  Matrix
Matrix.svd ( )  :  SingularValueDecomposition
Matrix.times ( double p1 )  :  Matrix
Matrix.times ( Matrix p1 )  :  Matrix
Matrix.timesEquals ( double p1 )  :  Matrix
Matrix.toMatlab ( )  :  String
Matrix.toString ( )  :  String
Matrix.trace ( )  :  double
Matrix.transpose ( )  :  Matrix
Matrix.uminus ( )  :  Matrix
Matrix.write ( Writer p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, MatrixPanel.class
package weka.gui.visualize
MatrixPanel.initInternalFields ( )  :  void
MatrixPanel.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
MatrixPanel.MatrixPanel ( )
MatrixPanel.setInstances ( Instances p1 )  :  void
MatrixPanel.setPercent ( )  :  void
MatrixPanel.setupAttribLists ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, Memory.class
package weka.core
Memory.getCurrent ( )  :  long
Memory.getInitial ( )  :  long
Memory.getMax ( )  :  long
Memory.getUseGUI ( )  :  boolean
Memory.isEnabled ( )  :  boolean
Memory.isOutOfMemory ( )  :  boolean
Memory.Memory ( )
Memory.Memory ( boolean p1 )
Memory.setEnabled ( boolean p1 )  :  void
Memory.showOutOfMemory ( )  :  void
Memory.stopThreads ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, MergeTwoValues.class
package weka.filters.unsupervised.attribute
MergeTwoValues.attributeIndexTipText ( )  :  String
MergeTwoValues.firstValueTipText ( )  :  String
MergeTwoValues.getAttributeIndex ( )  :  String
MergeTwoValues.getFirstValueIndex ( )  :  String
MergeTwoValues.getOptions ( )  :  String[ ]
MergeTwoValues.getSecondValueIndex ( )  :  String
MergeTwoValues.globalInfo ( )  :  String
MergeTwoValues.input ( Instance p1 )  :  boolean
MergeTwoValues.listOptions ( )  :  Enumeration
MergeTwoValues.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
MergeTwoValues.MergeTwoValues ( )
MergeTwoValues.secondValueTipText ( )  :  String
MergeTwoValues.setAttributeIndex ( String p1 )  :  void
MergeTwoValues.setFirstValueIndex ( String p1 )  :  void
MergeTwoValues.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
MergeTwoValues.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
MergeTwoValues.setSecondValueIndex ( String p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, MetaBean.class
package weka.gui.beans
MetaBean.addPropertyChangeListenersSubFlow ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
MetaBean.canAcceptConnection ( Class p1 )  :  boolean
MetaBean.connectionAllowed ( EventSetDescriptor p1 )  :  boolean
MetaBean.connectionAllowed ( String p1 )  :  boolean
MetaBean.connectionNotification ( String p1, Object p2 )  :  void
MetaBean.disconnectionNotification ( String p1, Object p2 )  :  void
MetaBean.enumerateRequests ( )  :  Enumeration
MetaBean.eventGeneratable ( EventSetDescriptor p1 )  :  boolean
MetaBean.eventGeneratable ( String p1 )  :  boolean
MetaBean.getAssociatedConnections ( )  :  Vector
MetaBean.getBeanInfoInputs ( )  :  Vector
MetaBean.getBeanInfoOutputs ( )  :  Vector
MetaBean.getBeanInfoSubFlow ( )  :  Vector
MetaBean.getBeansInInputs ( )  :  Vector
MetaBean.getBeansInOutputs ( )  :  Vector
MetaBean.getBeansInSubFlow ( )  :  Vector
MetaBean.getInputs ( )  :  Vector
MetaBean.getOriginalCoords ( )  :  Vector
MetaBean.getOutputs ( )  :  Vector
MetaBean.getSubFlow ( )  :  Vector
MetaBean.getSuitableTargets ( EventSetDescriptor p1 )  :  Vector
MetaBean.getVisual ( )  :  BeanVisual
MetaBean.MetaBean ( )
MetaBean.performRequest ( String p1 )  :  void
MetaBean.removePropertyChangeListenersSubFlow ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
MetaBean.restoreBeans ( )  :  void
MetaBean.setAssociatedConnections ( Vector p1 )  :  void
MetaBean.setInputs ( Vector p1 )  :  void
MetaBean.setLog ( Logger p1 )  :  void
MetaBean.setOriginalCoords ( Vector p1 )  :  void
MetaBean.setOutputs ( Vector p1 )  :  void
MetaBean.setSubFlow ( Vector p1 )  :  void
MetaBean.setVisual ( BeanVisual p1 )  :  void
MetaBean.shiftBeans ( BeanInstance p1, boolean p2 )  :  void
MetaBean.stop ( )  :  void
MetaBean.useDefaultVisual ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, MetaCost.class
package weka.classifiers.meta
MetaCost.bagSizePercentTipText ( )  :  String
MetaCost.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
MetaCost.classifyInstance ( Instance p1 )  :  double
MetaCost.costMatrixSourceTipText ( )  :  String
MetaCost.costMatrixTipText ( )  :  String
MetaCost.getBagSizePercent ( )  :  int
MetaCost.getClassifierSpec ( )  :  String
MetaCost.getCostMatrix ( )  :  CostMatrix
MetaCost.getCostMatrixSource ( )  :  SelectedTag
MetaCost.getNumIterations ( )  :  int
MetaCost.getOnDemandDirectory ( )  :  File
MetaCost.getOptions ( )  :  String[ ]
MetaCost.globalInfo ( )  :  String
MetaCost.listOptions ( )  :  Enumeration
MetaCost.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
MetaCost.MetaCost ( )
MetaCost.numIterationsTipText ( )  :  String
MetaCost.onDemandDirectoryTipText ( )  :  String
MetaCost.setBagSizePercent ( int p1 )  :  void
MetaCost.setCostMatrix ( CostMatrix p1 )  :  void
MetaCost.setCostMatrixSource ( SelectedTag p1 )  :  void
MetaCost.setNumIterations ( int p1 )  :  void
MetaCost.setOnDemandDirectory ( File p1 )  :  void
MetaCost.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
MetaCost.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, MethodHandler.class
package weka.core.xml
MethodHandler.add ( Class p1, Method p2 )  :  void
MethodHandler.add ( String p1, Method p2 )  :  void
MethodHandler.clear ( )  :  void
MethodHandler.contains ( Class p1 )  :  boolean
MethodHandler.contains ( String p1 )  :  boolean
MethodHandler.get ( Class p1 )  :  Method
MethodHandler.get ( String p1 )  :  Method
MethodHandler.keys ( )  :  Enumeration
MethodHandler.MethodHandler ( )
MethodHandler.remove ( Class p1 )  :  boolean
MethodHandler.remove ( String p1 )  :  boolean
MethodHandler.size ( )  :  int
MethodHandler.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, MixtureDistribution.class
package weka.classifiers.functions.pace
MixtureDistribution.empiricalProbability ( DoubleVector p1, PaceMatrix p2 )  :  PaceMatrix
MixtureDistribution.fit ( DoubleVector p1 )  :  void
MixtureDistribution.fit ( DoubleVector p1, int p2 )  :  void
MixtureDistribution.fitForSingleCluster ( DoubleVector p1, int p2 )  :  DiscreteFunction
MixtureDistribution.fittingIntervals ( DoubleVector p1 ) [abstract]  :  PaceMatrix
MixtureDistribution.getMixingDistribution ( )  :  DiscreteFunction
MixtureDistribution.MixtureDistribution ( )
MixtureDistribution.probabilityMatrix ( DoubleVector p1, PaceMatrix p2 ) [abstract]  :  PaceMatrix
MixtureDistribution.separable ( DoubleVector p1, int p2, int p3, double p4 ) [abstract]  :  boolean
MixtureDistribution.setMixingDistribution ( DiscreteFunction p1 )  :  void
MixtureDistribution.supportPoints ( DoubleVector p1, int p2 ) [abstract]  :  DoubleVector
MixtureDistribution.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, ModelPerformanceChart.class
package weka.gui.beans
ModelPerformanceChart.acceptDataSet ( ThresholdDataEvent p1 )  :  void
ModelPerformanceChart.acceptDataSet ( VisualizableErrorEvent p1 )  :  void
ModelPerformanceChart.addPropertyChangeListener ( String p1, PropertyChangeListener p2 )  :  void
ModelPerformanceChart.addVetoableChangeListener ( String p1, VetoableChangeListener p2 )  :  void
ModelPerformanceChart.appearanceDesign ( )  :  void
ModelPerformanceChart.appearanceFinal ( )  :  void
ModelPerformanceChart.enumerateRequests ( )  :  Enumeration
ModelPerformanceChart.getBeanContext ( )  :  BeanContext
ModelPerformanceChart.getVisual ( )  :  BeanVisual
ModelPerformanceChart.globalInfo ( )  :  String
ModelPerformanceChart.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
ModelPerformanceChart.ModelPerformanceChart ( )
ModelPerformanceChart.performRequest ( String p1 )  :  void
ModelPerformanceChart.removePropertyChangeListener ( String p1, PropertyChangeListener p2 )  :  void
ModelPerformanceChart.removeVetoableChangeListener ( String p1, VetoableChangeListener p2 )  :  void
ModelPerformanceChart.setBeanContext ( BeanContext p1 )  :  void
ModelPerformanceChart.setUpFinal ( )  :  void
ModelPerformanceChart.setVisual ( BeanVisual p1 )  :  void
ModelPerformanceChart.useDefaultVisual ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ModelPerformanceChartBeanInfo.class
package weka.gui.beans
ModelPerformanceChartBeanInfo.getEventSetDescriptors ( )  :  EventSetDescriptor[ ]
ModelPerformanceChartBeanInfo.ModelPerformanceChartBeanInfo ( )

cdk-1.0.1.jar, ModelSelection.class
package weka.classifiers.trees.j48
ModelSelection.ModelSelection ( )
ModelSelection.selectModel ( Instances p1 ) [abstract]  :  ClassifierSplitModel
ModelSelection.selectModel ( Instances p1, Instances p2 )  :  ClassifierSplitModel

cdk-1.0.1.jar, MultiBoostAB.class
package weka.classifiers.meta
MultiBoostAB.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
MultiBoostAB.getNumSubCmtys ( )  :  int
MultiBoostAB.getOptions ( )  :  String[ ]
MultiBoostAB.globalInfo ( )  :  String
MultiBoostAB.listOptions ( )  :  Enumeration
MultiBoostAB.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
MultiBoostAB.MultiBoostAB ( )
MultiBoostAB.numSubCmtysTipText ( )  :  String
MultiBoostAB.setNumSubCmtys ( int p1 )  :  void
MultiBoostAB.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
MultiBoostAB.setWeights ( Instances p1, double p2 )  :  void
MultiBoostAB.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, MultiClassClassifier.class
package weka.classifiers.meta
MultiClassClassifier.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
MultiClassClassifier.defaultClassifierString ( )  :  String
MultiClassClassifier.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
MultiClassClassifier.getMethod ( )  :  SelectedTag
MultiClassClassifier.getOptions ( )  :  String[ ]
MultiClassClassifier.getRandomWidthFactor ( )  :  double
MultiClassClassifier.globalInfo ( )  :  String
MultiClassClassifier.individualPredictions ( Instance p1 )  :  double[ ]
MultiClassClassifier.listOptions ( )  :  Enumeration
MultiClassClassifier.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
MultiClassClassifier.methodTipText ( )  :  String
MultiClassClassifier.MultiClassClassifier ( )
MultiClassClassifier.randomWidthFactorTipText ( )  :  String
MultiClassClassifier.setMethod ( SelectedTag p1 )  :  void
MultiClassClassifier.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
MultiClassClassifier.setRandomWidthFactor ( double p1 )  :  void
MultiClassClassifier.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, MultilayerPerceptron.class
package weka.classifiers.functions
MultilayerPerceptron.autoBuildTipText ( )  :  String
MultilayerPerceptron.blocker ( boolean p1 )  :  void
MultilayerPerceptron.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
MultilayerPerceptron.decayTipText ( )  :  String
MultilayerPerceptron.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
MultilayerPerceptron.getAutoBuild ( )  :  boolean
MultilayerPerceptron.getDecay ( )  :  boolean
MultilayerPerceptron.getGUI ( )  :  boolean
MultilayerPerceptron.getHiddenLayers ( )  :  String
MultilayerPerceptron.getLearningRate ( )  :  double
MultilayerPerceptron.getMomentum ( )  :  double
MultilayerPerceptron.getNominalToBinaryFilter ( )  :  boolean
MultilayerPerceptron.getNormalizeAttributes ( )  :  boolean
MultilayerPerceptron.getNormalizeNumericClass ( )  :  boolean
MultilayerPerceptron.getOptions ( )  :  String[ ]
MultilayerPerceptron.getRandomSeed ( )  :  long
MultilayerPerceptron.getReset ( )  :  boolean
MultilayerPerceptron.getTrainingTime ( )  :  int
MultilayerPerceptron.getValidationSetSize ( )  :  int
MultilayerPerceptron.getValidationThreshold ( )  :  int
MultilayerPerceptron.globalInfo ( )  :  String
MultilayerPerceptron.GUITipText ( )  :  String
MultilayerPerceptron.hiddenLayersTipText ( )  :  String
MultilayerPerceptron.learningRateTipText ( )  :  String
MultilayerPerceptron.listOptions ( )  :  Enumeration
MultilayerPerceptron.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
MultilayerPerceptron.momentumTipText ( )  :  String
MultilayerPerceptron.MultilayerPerceptron ( )
MultilayerPerceptron.nominalToBinaryFilterTipText ( )  :  String
MultilayerPerceptron.normalizeAttributesTipText ( )  :  String
MultilayerPerceptron.normalizeNumericClassTipText ( )  :  String
MultilayerPerceptron.randomSeedTipText ( )  :  String
MultilayerPerceptron.resetTipText ( )  :  String
MultilayerPerceptron.setAutoBuild ( boolean p1 )  :  void
MultilayerPerceptron.setDecay ( boolean p1 )  :  void
MultilayerPerceptron.setGUI ( boolean p1 )  :  void
MultilayerPerceptron.setHiddenLayers ( String p1 )  :  void
MultilayerPerceptron.setLearningRate ( double p1 )  :  void
MultilayerPerceptron.setMomentum ( double p1 )  :  void
MultilayerPerceptron.setNominalToBinaryFilter ( boolean p1 )  :  void
MultilayerPerceptron.setNormalizeAttributes ( boolean p1 )  :  void
MultilayerPerceptron.setNormalizeNumericClass ( boolean p1 )  :  void
MultilayerPerceptron.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
MultilayerPerceptron.setRandomSeed ( long p1 )  :  void
MultilayerPerceptron.setReset ( boolean p1 )  :  void
MultilayerPerceptron.setTrainingTime ( int p1 )  :  void
MultilayerPerceptron.setValidationSetSize ( int p1 )  :  void
MultilayerPerceptron.setValidationThreshold ( int p1 )  :  void
MultilayerPerceptron.toString ( )  :  String
MultilayerPerceptron.trainingTimeTipText ( )  :  String
MultilayerPerceptron.validationSetSizeTipText ( )  :  String
MultilayerPerceptron.validationThresholdTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, MultilayerPerceptronModel.class
package org.openscience.cdk.qsar.model.weka
MultilayerPerceptronModel.build ( )  :  void
MultilayerPerceptronModel.getAutoBuild ( )  :  boolean
MultilayerPerceptronModel.getDecay ( )  :  boolean
MultilayerPerceptronModel.getGUI ( )  :  boolean
MultilayerPerceptronModel.getHiddenLayers ( )  :  String
MultilayerPerceptronModel.getLearningRate ( )  :  double
MultilayerPerceptronModel.getMomentum ( )  :  double
MultilayerPerceptronModel.getNominalToBinaryFilter ( )  :  boolean
MultilayerPerceptronModel.getNormalizeAttributes ( )  :  boolean
MultilayerPerceptronModel.getNormalizeNumericClass ( )  :  boolean
MultilayerPerceptronModel.getOptions ( )  :  String[ ]
MultilayerPerceptronModel.getPredictPredicted ( )  :  Object[ ][ ]
MultilayerPerceptronModel.getRandomSeed ( )  :  long
MultilayerPerceptronModel.getReset ( )  :  boolean
MultilayerPerceptronModel.getTrainingTime ( )  :  double
MultilayerPerceptronModel.getValidationSetSize ( )  :  double
MultilayerPerceptronModel.getValidationThreshold ( )  :  double
MultilayerPerceptronModel.MultilayerPerceptronModel ( )
MultilayerPerceptronModel.predict ( )  :  void
MultilayerPerceptronModel.setData ( String filename )  :  void
MultilayerPerceptronModel.setData ( String[ ] attrib, int[ ] typAttrib, String[ ] classAttrib, Object[ ] y, Object[ ][ ] x )  :  void
MultilayerPerceptronModel.setOptions ( String[ ] options )  :  void
MultilayerPerceptronModel.setParameters ( Object[ ][ ] newX )  :  void
MultilayerPerceptronModel.setParameters ( String path )  :  void

cdk-1.0.1.jar, MultiNomialBMAEstimator.class
package weka.classifiers.bayes.net.estimate
MultiNomialBMAEstimator.distributionForInstance ( BayesNet p1, Instance p2 )  :  double[ ]
MultiNomialBMAEstimator.estimateCPTs ( BayesNet p1 )  :  void
MultiNomialBMAEstimator.initCPTs ( BayesNet p1 )  :  void
MultiNomialBMAEstimator.isUseK2Prior ( )  :  boolean
MultiNomialBMAEstimator.MultiNomialBMAEstimator ( )
MultiNomialBMAEstimator.setUseK2Prior ( boolean p1 )  :  void
MultiNomialBMAEstimator.updateClassifier ( BayesNet p1, Instance p2 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, MultipleClassifiersCombiner.class
package weka.classifiers
MultipleClassifiersCombiner.classifiersTipText ( )  :  String
MultipleClassifiersCombiner.getClassifier ( int p1 )  :  Classifier
MultipleClassifiersCombiner.getClassifiers ( )  :  Classifier[ ]
MultipleClassifiersCombiner.getClassifierSpec ( int p1 )  :  String
MultipleClassifiersCombiner.getOptions ( )  :  String[ ]
MultipleClassifiersCombiner.listOptions ( )  :  Enumeration
MultipleClassifiersCombiner.MultipleClassifiersCombiner ( )
MultipleClassifiersCombiner.setClassifiers ( Classifier[ ] p1 )  :  void
MultipleClassifiersCombiner.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, MultiScheme.class
package weka.classifiers.meta
MultiScheme.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
MultiScheme.classifiersTipText ( )  :  String
MultiScheme.debugTipText ( )  :  String
MultiScheme.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
MultiScheme.getClassifier ( int p1 )  :  Classifier
MultiScheme.getClassifiers ( )  :  Classifier[ ]
MultiScheme.getClassifierSpec ( int p1 )  :  String
MultiScheme.getDebug ( )  :  boolean
MultiScheme.getNumFolds ( )  :  int
MultiScheme.getOptions ( )  :  String[ ]
MultiScheme.getSeed ( )  :  int
MultiScheme.globalInfo ( )  :  String
MultiScheme.listOptions ( )  :  Enumeration
MultiScheme.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
MultiScheme.MultiScheme ( )
MultiScheme.numFoldsTipText ( )  :  String
MultiScheme.seedTipText ( )  :  String
MultiScheme.setClassifiers ( Classifier[ ] p1 )  :  void
MultiScheme.setDebug ( boolean p1 )  :  void
MultiScheme.setNumFolds ( int p1 )  :  void
MultiScheme.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
MultiScheme.setSeed ( int p1 )  :  void
MultiScheme.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, NaiveBayes.class
package weka.classifiers.bayes
NaiveBayes.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
NaiveBayes.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
NaiveBayes.getOptions ( )  :  String[ ]
NaiveBayes.getUseKernelEstimator ( )  :  boolean
NaiveBayes.getUseSupervisedDiscretization ( )  :  boolean
NaiveBayes.globalInfo ( )  :  String
NaiveBayes.listOptions ( )  :  Enumeration
NaiveBayes.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
NaiveBayes.NaiveBayes ( )
NaiveBayes.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
NaiveBayes.setUseKernelEstimator ( boolean p1 )  :  void
NaiveBayes.setUseSupervisedDiscretization ( boolean p1 )  :  void
NaiveBayes.toString ( )  :  String
NaiveBayes.updateClassifier ( Instance p1 )  :  void
NaiveBayes.useKernelEstimatorTipText ( )  :  String
NaiveBayes.useSupervisedDiscretizationTipText ( )  :  String
package weka.classifiers.bayes.net.search.fixed
NaiveBayes.buildStructure ( BayesNet p1, Instances p2 )  :  void
NaiveBayes.NaiveBayes ( )

cdk-1.0.1.jar, NaiveBayesModel.class
package org.openscience.cdk.qsar.model.weka
NaiveBayesModel.build ( )  :  void
NaiveBayesModel.getOptions ( )  :  String[ ]
NaiveBayesModel.getProbabilities ( )  :  Object[ ][ ]
NaiveBayesModel.getUseKernelEstimator ( )  :  boolean
NaiveBayesModel.getUseSupervisedDiscretization ( )  :  boolean
NaiveBayesModel.NaiveBayesModel ( )
NaiveBayesModel.probabilities ( )  :  void
NaiveBayesModel.setData ( String filename )  :  void
NaiveBayesModel.setData ( String[ ] attrib, int[ ] typAttrib, String[ ] classAttrib, Object[ ] y, Object[ ][ ] x )  :  void
NaiveBayesModel.setOptions ( String[ ] options )  :  void
NaiveBayesModel.setParameters ( Object[ ][ ] newX )  :  void
NaiveBayesModel.setParameters ( String path )  :  void
NaiveBayesModel.updateClassifier ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, NaiveBayesMultinomial.class
package weka.classifiers.bayes
NaiveBayesMultinomial.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
NaiveBayesMultinomial.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
NaiveBayesMultinomial.globalInfo ( )  :  String
NaiveBayesMultinomial.lnFactorial ( int p1 )  :  double
NaiveBayesMultinomial.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
NaiveBayesMultinomial.NaiveBayesMultinomial ( )
NaiveBayesMultinomial.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, NaiveBayesSimple.class
package weka.classifiers.bayes
NaiveBayesSimple.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
NaiveBayesSimple.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
NaiveBayesSimple.globalInfo ( )  :  String
NaiveBayesSimple.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
NaiveBayesSimple.NaiveBayesSimple ( )
NaiveBayesSimple.normalDens ( double p1, double p2, double p3 )  :  double
NaiveBayesSimple.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, NaiveBayesUpdateable.class
package weka.classifiers.bayes
NaiveBayesUpdateable.globalInfo ( )  :  String
NaiveBayesUpdateable.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
NaiveBayesUpdateable.NaiveBayesUpdateable ( )
NaiveBayesUpdateable.setUseSupervisedDiscretization ( boolean p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, NamedColor.class
package weka.gui.treevisualizer
NamedColor.NamedColor ( String p1, int p2, int p3, int p4 )

cdk-1.0.1.jar, NBTree.class
package weka.classifiers.trees
NBTree.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
NBTree.classifyInstance ( Instance p1 )  :  double
NBTree.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
NBTree.enumerateMeasures ( )  :  Enumeration
NBTree.getMeasure ( String p1 )  :  double
NBTree.globalInfo ( )  :  String
NBTree.graph ( )  :  String
NBTree.graphType ( )  :  int
NBTree.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
NBTree.measureNumLeaves ( )  :  double
NBTree.measureNumRules ( )  :  double
NBTree.measureTreeSize ( )  :  double
NBTree.NBTree ( )
NBTree.toString ( )  :  String
NBTree.toSummaryString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, NBTreeClassifierTree.class
package weka.classifiers.trees.j48
NBTreeClassifierTree.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
NBTreeClassifierTree.getNewTree ( Instances p1 )  :  ClassifierTree
NBTreeClassifierTree.getNewTree ( Instances p1, Instances p2 )  :  ClassifierTree
NBTreeClassifierTree.graph ( )  :  String
NBTreeClassifierTree.NBTreeClassifierTree ( ModelSelection p1 )
NBTreeClassifierTree.printLeafModels ( )  :  String
NBTreeClassifierTree.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, NBTreeModelSelection.class
package weka.classifiers.trees.j48
NBTreeModelSelection.cleanup ( )  :  void
NBTreeModelSelection.NBTreeModelSelection ( int p1, Instances p2 )
NBTreeModelSelection.selectModel ( Instances p1 )  :  ClassifierSplitModel
NBTreeModelSelection.selectModel ( Instances p1, Instances p2 )  :  ClassifierSplitModel

cdk-1.0.1.jar, NBTreeNoSplit.class
package weka.classifiers.trees.j48
NBTreeNoSplit.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
NBTreeNoSplit.classProb ( int p1, Instance p2, int p3 )  :  double
NBTreeNoSplit.crossValidate ( NaiveBayesUpdateable p1, Instances p2, Random p3 ) [static]  :  double
NBTreeNoSplit.getDiscretizer ( )  :  Discretize
NBTreeNoSplit.getErrors ( )  :  double
NBTreeNoSplit.getNaiveBayesModel ( )  :  NaiveBayesUpdateable
NBTreeNoSplit.leftSide ( Instances p1 )  :  String
NBTreeNoSplit.NBTreeNoSplit ( )
NBTreeNoSplit.rightSide ( int p1, Instances p2 )  :  String
NBTreeNoSplit.sourceExpression ( int p1, Instances p2 )  :  String
NBTreeNoSplit.toString ( )  :  String
NBTreeNoSplit.weights ( Instance p1 )  :  double[ ]
NBTreeNoSplit.whichSubset ( Instance p1 )  :  int

cdk-1.0.1.jar, NBTreeSplit.class
package weka.classifiers.trees.j48
NBTreeSplit.attIndex ( )  :  int
NBTreeSplit.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
NBTreeSplit.classProb ( int p1, Instance p2, int p3 )  :  double
NBTreeSplit.getErrors ( )  :  double
NBTreeSplit.getGlobalModel ( )  :  NBTreeNoSplit
NBTreeSplit.leftSide ( Instances p1 )  :  String
NBTreeSplit.NBTreeSplit ( int p1, int p2, double p3 )
NBTreeSplit.rightSide ( int p1, Instances p2 )  :  String
NBTreeSplit.setGlobalModel ( NBTreeNoSplit p1 )  :  void
NBTreeSplit.sourceExpression ( int p1, Instances p2 )  :  String
NBTreeSplit.weights ( Instance p1 )  :  double[ ]
NBTreeSplit.whichSubset ( Instance p1 )  :  int

cdk-1.0.1.jar, NDConditionalEstimator.class
package weka.estimators
NDConditionalEstimator.addValue ( double p1, double p2, double p3 )  :  void
NDConditionalEstimator.getEstimator ( double p1 )  :  Estimator
NDConditionalEstimator.getProbability ( double p1, double p2 )  :  double
NDConditionalEstimator.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
NDConditionalEstimator.NDConditionalEstimator ( int p1, double p2 )
NDConditionalEstimator.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, NeighborList.class
package weka.classifiers.lazy
IBk.NeighborList.currentLength ( )  :  int
IBk.NeighborList.IBk.NeighborList ( IBk p1, int p2 )
IBk.NeighborList.insertSorted ( double p1, Instance p2 )  :  void
IBk.NeighborList.isEmpty ( )  :  boolean
IBk.NeighborList.printList ( )  :  void
IBk.NeighborList.pruneToK ( int p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, NeighborNode.class
package weka.classifiers.lazy
IBk.NeighborNode.IBk.NeighborNode ( IBk p1, double p2, Instance p3 )
IBk.NeighborNode.IBk.NeighborNode ( IBk p1, double p2, Instance p3, IBk.NeighborNode p4 )

cdk-1.0.1.jar, NeuralConnection.class
package weka.classifiers.functions.neural
NeuralConnection.allocateInputs ( )  :  void
NeuralConnection.allocateOutputs ( )  :  void
NeuralConnection.changeInputNum ( int p1, int p2 )  :  void
NeuralConnection.changeOutputNum ( int p1, int p2 )  :  void
NeuralConnection.connect ( NeuralConnection p1, NeuralConnection p2 ) [static]  :  boolean
NeuralConnection.connectInput ( NeuralConnection p1, int p2 )  :  boolean
NeuralConnection.connectOutput ( NeuralConnection p1, int p2 )  :  boolean
NeuralConnection.disconnect ( NeuralConnection p1, NeuralConnection p2 ) [static]  :  boolean
NeuralConnection.disconnectInput ( NeuralConnection p1, int p2 )  :  boolean
NeuralConnection.disconnectOutput ( NeuralConnection p1, int p2 )  :  boolean
NeuralConnection.drawHighlight ( Graphics p1, int p2, int p3 )  :  void
NeuralConnection.drawInputLines ( Graphics p1, int p2, int p3 )  :  void
NeuralConnection.drawNode ( Graphics p1, int p2, int p3 )  :  void
NeuralConnection.drawOutputLines ( Graphics p1, int p2, int p3 )  :  void
NeuralConnection.errorValue ( boolean p1 ) [abstract]  :  double
NeuralConnection.getId ( )  :  String
NeuralConnection.getInputNums ( )  :  int[ ]
NeuralConnection.getInputs ( )  :  NeuralConnection[ ]
NeuralConnection.getNumInputs ( )  :  int
NeuralConnection.getNumOutputs ( )  :  int
NeuralConnection.getOutputNums ( )  :  int[ ]
NeuralConnection.getOutputs ( )  :  NeuralConnection[ ]
NeuralConnection.getType ( )  :  int
NeuralConnection.getX ( )  :  double
NeuralConnection.getY ( )  :  double
NeuralConnection.NeuralConnection ( String p1 )
NeuralConnection.onUnit ( Graphics p1, int p2, int p3, int p4, int p5 )  :  boolean
NeuralConnection.outputValue ( boolean p1 ) [abstract]  :  double
NeuralConnection.removeAllInputs ( )  :  void
NeuralConnection.removeAllOutputs ( )  :  void
NeuralConnection.reset ( ) [abstract]  :  void
NeuralConnection.setType ( int p1 )  :  void
NeuralConnection.setX ( double p1 )  :  void
NeuralConnection.setY ( double p1 )  :  void
NeuralConnection.updateWeights ( double p1, double p2 )  :  void
NeuralConnection.weightValue ( int p1 )  :  double

cdk-1.0.1.jar, NeuralEnd.class
package weka.classifiers.functions
MultilayerPerceptron.NeuralEnd.drawHighlight ( Graphics p1, int p2, int p3 )  :  void
MultilayerPerceptron.NeuralEnd.drawNode ( Graphics p1, int p2, int p3 )  :  void
MultilayerPerceptron.NeuralEnd.errorValue ( boolean p1 )  :  double
MultilayerPerceptron.NeuralEnd.getLink ( )  :  int
MultilayerPerceptron.NeuralEnd.MultilayerPerceptron.NeuralEnd ( MultilayerPerceptron p1, String p2 )
MultilayerPerceptron.NeuralEnd.onUnit ( Graphics p1, int p2, int p3, int p4, int p5 )  :  boolean
MultilayerPerceptron.NeuralEnd.outputValue ( boolean p1 )  :  double
MultilayerPerceptron.NeuralEnd.reset ( )  :  void
MultilayerPerceptron.NeuralEnd.setLink ( boolean p1, int p2 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, NeuralMethod.class
package weka.classifiers.functions.neural
NeuralMethod.errorValue ( NeuralNode p1 ) [abstract]  :  double
NeuralMethod.outputValue ( NeuralNode p1 ) [abstract]  :  double
NeuralMethod.updateWeights ( NeuralNode p1, double p2, double p3 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, NeuralNode.class
package weka.classifiers.functions.neural
NeuralNode.allocateInputs ( )  :  void
NeuralNode.connectInput ( NeuralConnection p1, int p2 )  :  boolean
NeuralNode.disconnectInput ( NeuralConnection p1, int p2 )  :  boolean
NeuralNode.errorValue ( boolean p1 )  :  double
NeuralNode.getChangeInWeights ( )  :  double[ ]
NeuralNode.getMethod ( )  :  NeuralMethod
NeuralNode.getWeights ( )  :  double[ ]
NeuralNode.NeuralNode ( String p1, Random p2, NeuralMethod p3 )
NeuralNode.outputValue ( boolean p1 )  :  double
NeuralNode.removeAllInputs ( )  :  void
NeuralNode.reset ( )  :  void
NeuralNode.setMethod ( NeuralMethod p1 )  :  void
NeuralNode.updateWeights ( double p1, double p2 )  :  void
NeuralNode.weightValue ( int p1 )  :  double

cdk-1.0.1.jar, NNConditionalEstimator.class
package weka.estimators
NNConditionalEstimator.addValue ( double p1, double p2, double p3 )  :  void
NNConditionalEstimator.getEstimator ( double p1 )  :  Estimator
NNConditionalEstimator.getProbability ( double p1, double p2 )  :  double
NNConditionalEstimator.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
NNConditionalEstimator.NNConditionalEstimator ( )
NNConditionalEstimator.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, NNge.class
package weka.classifiers.rules
NNge.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
NNge.classifyInstance ( Instance p1 )  :  double
NNge.getNumAttemptsOfGeneOption ( )  :  int
NNge.getNumFoldersMIOption ( )  :  int
NNge.getOptions ( )  :  String[ ]
NNge.globalInfo ( )  :  String
NNge.listOptions ( )  :  Enumeration
NNge.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
NNge.NNge ( )
NNge.numAttemptsOfGeneOptionTipText ( )  :  String
NNge.numFoldersMIOptionTipText ( )  :  String
NNge.setNumAttemptsOfGeneOption ( int p1 )  :  void
NNge.setNumFoldersMIOption ( int p1 )  :  void
NNge.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
NNge.toString ( )  :  String
NNge.updateClassifier ( Instance p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, Node.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
Node.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
Node.jjtAddChild ( Node p1, int p2 ) [abstract]  :  void
Node.jjtClose ( ) [abstract]  :  void
Node.jjtGetChild ( int p1 ) [abstract]  :  Node
Node.jjtGetNumChildren ( ) [abstract]  :  int
Node.jjtGetParent ( ) [abstract]  :  Node
Node.jjtOpen ( ) [abstract]  :  void
Node.jjtRemoveChild ( int p1 ) [abstract]  :  void
Node.jjtSetParent ( Node p1 ) [abstract]  :  void
package weka.gui.treevisualizer
Node.addChild ( Edge p1 )  :  void
Node.adjustCenter ( double p1 )  :  void
Node.getCenter ( )  :  double
Node.getChild ( int p1 )  :  Edge
Node.getColor ( )  :  Color
Node.getCount ( Node p1, int p2 ) [static]  :  int
Node.getCVisible ( )  :  boolean
Node.getGCount ( Node p1, int p2 ) [static]  :  int
Node.getHeight ( Node p1, int p2 ) [static]  :  int
Node.getInstances ( )  :  Instances
Node.getLabel ( )  :  String
Node.getLine ( int p1 )  :  String
Node.getParent ( int p1 )  :  Edge
Node.getRefer ( )  :  String
Node.getRoot ( )  :  boolean
Node.getShape ( )  :  int
Node.getTop ( )  :  double
Node.getTotalCount ( Node p1, int p2 ) [static]  :  int
Node.getTotalGCount ( Node p1, int p2 ) [static]  :  int
Node.getTotalHeight ( Node p1, int p2 ) [static]  :  int
Node.getVisible ( )  :  boolean
Node.Node ( String p1, String p2, int p3, int p4, Color p5, String p6 )
Node.setCenter ( double p1 )  :  void
Node.setColor ( Color p1 )  :  void
Node.setCVisible ( boolean p1 )  :  void
Node.setParent ( Edge p1 )  :  void
Node.setRefer ( String p1 )  :  void
Node.setRoot ( boolean p1 )  :  void
Node.setShape ( int p1 )  :  void
Node.setTop ( double p1 )  :  void
Node.stringSize ( FontMetrics p1 )  :  Dimension

cdk-1.0.1.jar, NodePlace.class
package weka.gui.treevisualizer
NodePlace.place ( Node p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, NominalPrediction.class
package weka.classifiers.evaluation
NominalPrediction.actual ( )  :  double
NominalPrediction.distribution ( )  :  double[ ]
NominalPrediction.makeDistribution ( double p1, int p2 ) [static]  :  double[ ]
NominalPrediction.makeUniformDistribution ( int p1 ) [static]  :  double[ ]
NominalPrediction.margin ( )  :  double
NominalPrediction.NominalPrediction ( double p1, double[ ] p2 )
NominalPrediction.NominalPrediction ( double p1, double[ ] p2, double p3 )
NominalPrediction.predicted ( )  :  double
NominalPrediction.toString ( )  :  String
NominalPrediction.weight ( )  :  double

cdk-1.0.1.jar, NominalToBinary.class
package weka.filters.supervised.attribute
NominalToBinary.batchFinished ( )  :  boolean
NominalToBinary.binaryAttributesNominalTipText ( )  :  String
NominalToBinary.getBinaryAttributesNominal ( )  :  boolean
NominalToBinary.getOptions ( )  :  String[ ]
NominalToBinary.getTransformAllValues ( )  :  boolean
NominalToBinary.globalInfo ( )  :  String
NominalToBinary.input ( Instance p1 )  :  boolean
NominalToBinary.listOptions ( )  :  Enumeration
NominalToBinary.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
NominalToBinary.NominalToBinary ( )
NominalToBinary.setBinaryAttributesNominal ( boolean p1 )  :  void
NominalToBinary.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
NominalToBinary.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
NominalToBinary.setTransformAllValues ( boolean p1 )  :  void
NominalToBinary.transformAllValuesTipText ( )  :  String
package weka.filters.unsupervised.attribute
NominalToBinary.attributeIndicesTipText ( )  :  String
NominalToBinary.binaryAttributesNominalTipText ( )  :  String
NominalToBinary.getAttributeIndices ( )  :  String
NominalToBinary.getBinaryAttributesNominal ( )  :  boolean
NominalToBinary.getInvertSelection ( )  :  boolean
NominalToBinary.getOptions ( )  :  String[ ]
NominalToBinary.globalInfo ( )  :  String
NominalToBinary.input ( Instance p1 )  :  boolean
NominalToBinary.invertSelectionTipText ( )  :  String
NominalToBinary.listOptions ( )  :  Enumeration
NominalToBinary.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
NominalToBinary.NominalToBinary ( )
NominalToBinary.setAttributeIndices ( String p1 )  :  void
NominalToBinary.setBinaryAttributesNominal ( boolean p1 )  :  void
NominalToBinary.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
NominalToBinary.setInvertSelection ( boolean p1 )  :  void
NominalToBinary.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, NonSparseToSparse.class
package weka.filters.unsupervised.instance
NonSparseToSparse.globalInfo ( )  :  String
NonSparseToSparse.input ( Instance p1 )  :  boolean
NonSparseToSparse.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
NonSparseToSparse.NonSparseToSparse ( )
NonSparseToSparse.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean

cdk-1.0.1.jar, NormalEstimator.class
package weka.estimators
NormalEstimator.addValue ( double p1, double p2 )  :  void
NormalEstimator.getProbability ( double p1 )  :  double
NormalEstimator.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
NormalEstimator.NormalEstimator ( double p1 )
NormalEstimator.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, Normalize.class
package weka.filters.unsupervised.attribute
Normalize.batchFinished ( )  :  boolean
Normalize.globalInfo ( )  :  String
Normalize.input ( Instance p1 )  :  boolean
Normalize.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Normalize.Normalize ( )
Normalize.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
package weka.filters.unsupervised.instance
Normalize.getLNorm ( )  :  double
Normalize.getNorm ( )  :  double
Normalize.getOptions ( )  :  String[ ]
Normalize.globalInfo ( )  :  String
Normalize.input ( Instance p1 )  :  boolean
Normalize.listOptions ( )  :  Enumeration
Normalize.LNormTipText ( )  :  String
Normalize.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Normalize.Normalize ( )
Normalize.normTipText ( )  :  String
Normalize.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
Normalize.setLNorm ( double p1 )  :  void
Normalize.setNorm ( double p1 )  :  void
Normalize.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, NormalizedPolyKernel.class
package weka.classifiers.functions.supportVector
NormalizedPolyKernel.eval ( int p1, int p2, Instance p3 )  :  double
NormalizedPolyKernel.NormalizedPolyKernel ( Instances p1, int p2, double p3, boolean p4 )

cdk-1.0.1.jar, NormalMixture.class
package weka.classifiers.functions.pace
NormalMixture.empiricalBayesEstimate ( double p1 )  :  double
NormalMixture.empiricalBayesEstimate ( DoubleVector p1 )  :  DoubleVector
NormalMixture.f ( double p1 )  :  double
NormalMixture.f ( DoubleVector p1 )  :  DoubleVector
NormalMixture.fittingIntervals ( DoubleVector p1 )  :  PaceMatrix
NormalMixture.getSeparatingThreshold ( )  :  double
NormalMixture.getTrimingThreshold ( )  :  double
NormalMixture.h ( double p1 )  :  double
NormalMixture.h ( DoubleVector p1 )  :  DoubleVector
NormalMixture.hf ( double p1 )  :  double
NormalMixture.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
NormalMixture.nestedEstimate ( DoubleVector p1 )  :  DoubleVector
NormalMixture.NormalMixture ( )
NormalMixture.probabilityMatrix ( DoubleVector p1, PaceMatrix p2 )  :  PaceMatrix
NormalMixture.separable ( DoubleVector p1, int p2, int p3, double p4 )  :  boolean
NormalMixture.setSeparatingThreshold ( double p1 )  :  void
NormalMixture.setTrimingThreshold ( double p1 )  :  void
NormalMixture.subsetEstimate ( DoubleVector p1 )  :  DoubleVector
NormalMixture.supportPoints ( DoubleVector p1, int p2 )  :  DoubleVector
NormalMixture.toString ( )  :  String
NormalMixture.trim ( DoubleVector p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, NoSplit.class
package weka.classifiers.trees.j48
NoSplit.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
NoSplit.leftSide ( Instances p1 )  :  String
NoSplit.NoSplit ( Distribution p1 )
NoSplit.rightSide ( int p1, Instances p2 )  :  String
NoSplit.sourceExpression ( int p1, Instances p2 )  :  String
NoSplit.weights ( Instance p1 )  :  double[ ]
NoSplit.whichSubset ( Instance p1 )  :  int

cdk-1.0.1.jar, NoSupportForMissingValuesException.class
package weka.core
NoSupportForMissingValuesException.NoSupportForMissingValuesException ( )
NoSupportForMissingValuesException.NoSupportForMissingValuesException ( String p1 )

cdk-1.0.1.jar, NullFilter.class
package weka.filters
NullFilter.input ( Instance p1 )  :  boolean
NullFilter.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
NullFilter.NullFilter ( )
NullFilter.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean

cdk-1.0.1.jar, NumberOfClustersRequestable.class
package weka.clusterers
NumberOfClustersRequestable.setNumClusters ( int p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, NumericPrediction.class
package weka.classifiers.evaluation
NumericPrediction.actual ( )  :  double
NumericPrediction.error ( )  :  double
NumericPrediction.NumericPrediction ( double p1, double p2 )
NumericPrediction.NumericPrediction ( double p1, double p2, double p3 )
NumericPrediction.predicted ( )  :  double
NumericPrediction.toString ( )  :  String
NumericPrediction.weight ( )  :  double

cdk-1.0.1.jar, NumericToBinary.class
package weka.filters.unsupervised.attribute
NumericToBinary.globalInfo ( )  :  String
NumericToBinary.input ( Instance p1 )  :  boolean
NumericToBinary.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
NumericToBinary.NumericToBinary ( )
NumericToBinary.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean

cdk-1.0.1.jar, NumericTransform.class
package weka.filters.unsupervised.attribute
NumericTransform.attributeIndicesTipText ( )  :  String
NumericTransform.classNameTipText ( )  :  String
NumericTransform.getAttributeIndices ( )  :  String
NumericTransform.getClassName ( )  :  String
NumericTransform.getInvertSelection ( )  :  boolean
NumericTransform.getMethodName ( )  :  String
NumericTransform.getOptions ( )  :  String[ ]
NumericTransform.globalInfo ( )  :  String
NumericTransform.input ( Instance p1 )  :  boolean
NumericTransform.invertSelectionTipText ( )  :  String
NumericTransform.listOptions ( )  :  Enumeration
NumericTransform.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
NumericTransform.methodNameTipText ( )  :  String
NumericTransform.NumericTransform ( )
NumericTransform.setAttributeIndices ( String p1 )  :  void
NumericTransform.setAttributeIndicesArray ( int[ ] p1 )  :  void
NumericTransform.setClassName ( String p1 )  :  void
NumericTransform.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
NumericTransform.setInvertSelection ( boolean p1 )  :  void
NumericTransform.setMethodName ( String p1 )  :  void
NumericTransform.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, Obfuscate.class
package weka.filters.unsupervised.attribute
Obfuscate.globalInfo ( )  :  String
Obfuscate.input ( Instance p1 )  :  boolean
Obfuscate.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Obfuscate.Obfuscate ( )
Obfuscate.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean

cdk-1.0.1.jar, ObjectCellRenderer.class
package weka.gui.experiment
AlgorithmListPanel.ObjectCellRenderer.AlgorithmListPanel.ObjectCellRenderer ( AlgorithmListPanel p1 )
AlgorithmListPanel.ObjectCellRenderer.getListCellRendererComponent ( JList p1, Object p2, int p3, boolean p4, boolean p5 )  :  Component

cdk-1.0.1.jar, OneR.class
package weka.classifiers.rules
OneR.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
OneR.classifyInstance ( Instance p1 )  :  double
OneR.getMinBucketSize ( )  :  int
OneR.getOptions ( )  :  String[ ]
OneR.globalInfo ( )  :  String
OneR.listOptions ( )  :  Enumeration
OneR.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
OneR.minBucketSizeTipText ( )  :  String
OneR.newNominalRule ( Attribute p1, Instances p2, int[ ] p3 )  :  OneR.OneRRule
OneR.newNumericRule ( Attribute p1, Instances p2, int[ ] p3 )  :  OneR.OneRRule
OneR.newRule ( Attribute p1, Instances p2 )  :  OneR.OneRRule
OneR.OneR ( )
OneR.setMinBucketSize ( int p1 )  :  void
OneR.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
OneR.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, OneRAttributeEval.class
package weka.attributeSelection
OneRAttributeEval.buildEvaluator ( Instances p1 )  :  void
OneRAttributeEval.evaluateAttribute ( int p1 )  :  double
OneRAttributeEval.evalUsingTrainingDataTipText ( )  :  String
OneRAttributeEval.foldsTipText ( )  :  String
OneRAttributeEval.getEvalUsingTrainingData ( )  :  boolean
OneRAttributeEval.getFolds ( )  :  int
OneRAttributeEval.getMinimumBucketSize ( )  :  int
OneRAttributeEval.getOptions ( )  :  String[ ]
OneRAttributeEval.getSeed ( )  :  int
OneRAttributeEval.globalInfo ( )  :  String
OneRAttributeEval.listOptions ( )  :  Enumeration
OneRAttributeEval.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
OneRAttributeEval.minimumBucketSizeTipText ( )  :  String
OneRAttributeEval.OneRAttributeEval ( )
OneRAttributeEval.resetOptions ( )  :  void
OneRAttributeEval.seedTipText ( )  :  String
OneRAttributeEval.setEvalUsingTrainingData ( boolean p1 )  :  void
OneRAttributeEval.setFolds ( int p1 )  :  void
OneRAttributeEval.setMinimumBucketSize ( int p1 )  :  void
OneRAttributeEval.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
OneRAttributeEval.setSeed ( int p1 )  :  void
OneRAttributeEval.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, Optimization.class
package weka.core
Optimization.evaluateGradient ( double[ ] p1 ) [abstract]  :  double[ ]
Optimization.evaluateHessian ( double[ ] p1, int p2 )  :  double[ ]
Optimization.findArgmin ( double[ ] p1, double[ ][ ] p2 )  :  double[ ]
Optimization.getMinFunction ( )  :  double
Optimization.getVarbValues ( )  :  double[ ]
Optimization.lnsrch ( double[ ] p1, double[ ] p2, double[ ] p3, double p4, boolean[ ] p5, double[ ][ ] p6, Optimization.DynamicIntArray p7 )  :  double[ ]
Optimization.objectiveFunction ( double[ ] p1 ) [abstract]  :  double
Optimization.Optimization ( )
Optimization.setDebug ( boolean p1 )  :  void
Optimization.setMaxIteration ( int p1 )  :  void
Optimization.solveTriangle ( Matrix p1, double[ ] p2, boolean p3, boolean[ ] p4 ) [static]  :  double[ ]
Optimization.updateCholeskyFactor ( Matrix p1, double[ ] p2, double[ ] p3, double p4, boolean[ ] p5 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, Option.class
package weka.core
Option.description ( )  :  String
Option.name ( )  :  String
Option.numArguments ( )  :  int
Option.Option ( String p1, String p2, int p3, String p4 )
Option.synopsis ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, OptionHandler.class
package weka.core
OptionHandler.getOptions ( ) [abstract]  :  String[ ]
OptionHandler.listOptions ( ) [abstract]  :  Enumeration
OptionHandler.setOptions ( String[ ] p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, OrdinalClassClassifier.class
package weka.classifiers.meta
OrdinalClassClassifier.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
OrdinalClassClassifier.defaultClassifierString ( )  :  String
OrdinalClassClassifier.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
OrdinalClassClassifier.getOptions ( )  :  String[ ]
OrdinalClassClassifier.globalInfo ( )  :  String
OrdinalClassClassifier.listOptions ( )  :  Enumeration
OrdinalClassClassifier.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
OrdinalClassClassifier.OrdinalClassClassifier ( )
OrdinalClassClassifier.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
OrdinalClassClassifier.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, OutputFormatDialog.class
package weka.gui.experiment
OutputFormatDialog.createDialog ( )  :  void
OutputFormatDialog.getMeanPrec ( )  :  int
OutputFormatDialog.getProduceCSV ( )  :  boolean
OutputFormatDialog.getProduceLatex ( )  :  boolean
OutputFormatDialog.getResult ( )  :  int
OutputFormatDialog.getStdDevPrec ( )  :  int
OutputFormatDialog.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
OutputFormatDialog.OutputFormatDialog ( Frame p1 )
OutputFormatDialog.setMeanPrec ( int p1 )  :  void
OutputFormatDialog.setProduceCSV ( boolean p1 )  :  void
OutputFormatDialog.setProduceLatex ( boolean p1 )  :  void
OutputFormatDialog.setStdDevPrec ( int p1 )  :  void
OutputFormatDialog.showDialog ( )  :  int

cdk-1.0.1.jar, OutputZipper.class
package weka.experiment
OutputZipper.finished ( )  :  void
OutputZipper.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
OutputZipper.OutputZipper ( File p1 )
OutputZipper.zipit ( String p1, String p2 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, PaceMatrix.class
package weka.classifiers.functions.pace
PaceMatrix.backward ( PaceMatrix p1, IntVector p2, int p3, int p4 )  :  void
PaceMatrix.cbind ( PaceMatrix p1 )  :  PaceMatrix
PaceMatrix.clone ( )  :  Object
PaceMatrix.columnResponseExplanation ( PaceMatrix p1, IntVector p2, int p3, int p4 )  :  double
PaceMatrix.format ( )  :  DecimalFormat[ ]
PaceMatrix.format ( int p1 )  :  DecimalFormat[ ]
PaceMatrix.format ( int p1, boolean p2 )  :  DecimalFormat[ ]
PaceMatrix.format ( int p1, int p2, int p3, int p4, boolean p5 )  :  DecimalFormat
PaceMatrix.format ( int p1, int p2, int p3, int p4, int p5, boolean p6 )  :  DecimalFormat[ ]
PaceMatrix.forward ( PaceMatrix p1, IntVector p2, int p3 )  :  void
PaceMatrix.g1 ( double p1, double p2 )  :  double[ ]
PaceMatrix.g2 ( double[ ] p1, int p2, int p3, int p4 )  :  void
PaceMatrix.getColumn ( int p1 )  :  DoubleVector
PaceMatrix.getColumn ( int p1, int p2, int p3 )  :  DoubleVector
PaceMatrix.h1 ( int p1, int p2 )  :  double[ ]
PaceMatrix.h2 ( int p1, int p2, double p3, PaceMatrix p4, int p5 )  :  void
PaceMatrix.isEmpty ( )  :  boolean
PaceMatrix.leastExplainingColumn ( PaceMatrix p1, IntVector p2, int p3, int p4 )  :  int
PaceMatrix.lsqr ( PaceMatrix p1, IntVector p2, int p3 )  :  void
PaceMatrix.lsqrSelection ( PaceMatrix p1, IntVector p2, int p3 )  :  void
PaceMatrix.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
PaceMatrix.maxAbs ( )  :  double
PaceMatrix.maxAbs ( int p1, int p2, int p3 )  :  double
PaceMatrix.minAbs ( int p1, int p2, int p3 )  :  double
PaceMatrix.mostExplainingColumn ( PaceMatrix p1, IntVector p2, int p3 )  :  int
PaceMatrix.nnls ( PaceMatrix p1, IntVector p2 )  :  DoubleVector
PaceMatrix.nnlse ( PaceMatrix p1, PaceMatrix p2, PaceMatrix p3, IntVector p4 )  :  DoubleVector
PaceMatrix.nnlse1 ( PaceMatrix p1, IntVector p2 )  :  DoubleVector
PaceMatrix.PaceMatrix ( double[ ] p1, int p2 )
PaceMatrix.PaceMatrix ( double[ ][ ] p1 )
PaceMatrix.PaceMatrix ( double[ ][ ] p1, int p2, int p3 )
PaceMatrix.PaceMatrix ( DoubleVector p1 )
PaceMatrix.PaceMatrix ( int p1, int p2 )
PaceMatrix.PaceMatrix ( int p1, int p2, double p3 )
PaceMatrix.PaceMatrix ( Matrix p1 )
PaceMatrix.positiveDiagonal ( PaceMatrix p1, IntVector p2 )  :  void
PaceMatrix.randomNormal ( int p1, int p2 ) [static]  :  Matrix
PaceMatrix.rbind ( PaceMatrix p1 )  :  PaceMatrix
PaceMatrix.rsolve ( PaceMatrix p1, IntVector p2, int p3 )  :  void
PaceMatrix.setColumnDimension ( int p1 )  :  void
PaceMatrix.setMatrix ( double[ ] p1, boolean p2 )  :  void
PaceMatrix.setMatrix ( int p1, int p2, int p3, DoubleVector p4 )  :  void
PaceMatrix.setMatrix ( int p1, int p2, int p3, int p4, double p5 )  :  void
PaceMatrix.setPlus ( int p1, int p2, double p3 )  :  void
PaceMatrix.setRowDimension ( int p1 )  :  void
PaceMatrix.setTimes ( int p1, int p2, double p3 )  :  void
PaceMatrix.steplsqr ( PaceMatrix p1, IntVector p2, int p3, int p4, boolean p5 )  :  void
PaceMatrix.sum2 ( boolean p1 )  :  double[ ]
PaceMatrix.sum2 ( int p1, int p2, int p3, boolean p4 )  :  double
PaceMatrix.times ( int p1, int p2, int p3, PaceMatrix p4, int p5 )  :  double
PaceMatrix.toString ( )  :  String
PaceMatrix.toString ( int p1, boolean p2 )  :  String

cdk-1.0.1.jar, PaceRegression.class
package weka.classifiers.functions
PaceRegression.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
PaceRegression.checkForMissing ( Instance p1, Instances p2 )  :  boolean
PaceRegression.checkForMissing ( Instances p1 )  :  boolean
PaceRegression.checkForNonBinary ( Instances p1 )  :  boolean
PaceRegression.classifyInstance ( Instance p1 )  :  double
PaceRegression.coefficients ( )  :  double[ ]
PaceRegression.debugTipText ( )  :  String
PaceRegression.estimatorTipText ( )  :  String
PaceRegression.getDebug ( )  :  boolean
PaceRegression.getEstimator ( )  :  SelectedTag
PaceRegression.getOptions ( )  :  String[ ]
PaceRegression.getThreshold ( )  :  double
PaceRegression.globalInfo ( )  :  String
PaceRegression.listOptions ( )  :  Enumeration
PaceRegression.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
PaceRegression.numParameters ( )  :  int
PaceRegression.PaceRegression ( )
PaceRegression.setDebug ( boolean p1 )  :  void
PaceRegression.setEstimator ( SelectedTag p1 )  :  void
PaceRegression.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
PaceRegression.setThreshold ( double p1 )  :  void
PaceRegression.thresholdTipText ( )  :  String
PaceRegression.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, PairedCorrectedTTester.class
package weka.experiment
PairedCorrectedTTester.calculateStatistics ( Instance p1, int p2, int p3, int p4 )  :  PairedStats
PairedCorrectedTTester.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
PairedCorrectedTTester.PairedCorrectedTTester ( )

cdk-1.0.1.jar, PairedStats.class
package weka.experiment
PairedStats.add ( double p1, double p2 )  :  void
PairedStats.calculateDerived ( )  :  void
PairedStats.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
PairedStats.PairedStats ( double p1 )
PairedStats.subtract ( double p1, double p2 )  :  void
PairedStats.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, PairedStatsCorrected.class
package weka.experiment
PairedStatsCorrected.calculateDerived ( )  :  void
PairedStatsCorrected.PairedStatsCorrected ( double p1, double p2 )

cdk-1.0.1.jar, PairedTTester.class
package weka.experiment
PairedTTester.calculateStatistics ( Instance p1, int p2, int p3, int p4 )  :  PairedStats
PairedTTester.displayResultset ( int p1 )  :  boolean
PairedTTester.getDatasetKeyColumns ( )  :  Range
PairedTTester.getDisplayedResultsets ( )  :  int[ ]
PairedTTester.getFoldColumn ( )  :  int
PairedTTester.getInstances ( )  :  Instances
PairedTTester.getMeanPrec ( )  :  int
PairedTTester.getNumDatasets ( )  :  int
PairedTTester.getNumDisplayedResultsets ( )  :  int
PairedTTester.getNumResultsets ( )  :  int
PairedTTester.getOptions ( )  :  String[ ]
PairedTTester.getProduceCSV ( )  :  boolean
PairedTTester.getProduceLatex ( )  :  boolean
PairedTTester.getResultsetKeyColumns ( )  :  Range
PairedTTester.getResultsetName ( int p1 )  :  String
PairedTTester.getRunColumn ( )  :  int
PairedTTester.getShowStdDevs ( )  :  boolean
PairedTTester.getSignificanceLevel ( )  :  double
PairedTTester.getStdDevPrec ( )  :  int
PairedTTester.header ( int p1 )  :  String
PairedTTester.listOptions ( )  :  Enumeration
PairedTTester.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
PairedTTester.multiResultsetFull ( int p1, int p2 )  :  String
PairedTTester.multiResultsetRanking ( int p1 )  :  String
PairedTTester.multiResultsetSummary ( int p1 )  :  String
PairedTTester.multiResultsetWins ( int p1, int[ ][ ] p2 )  :  int[ ][ ]
PairedTTester.PairedTTester ( )
PairedTTester.prepareData ( )  :  void
PairedTTester.resultsetKey ( )  :  String
PairedTTester.setDatasetKeyColumns ( Range p1 )  :  void
PairedTTester.setDisplayedResultsets ( int[ ] p1 )  :  void
PairedTTester.setFoldColumn ( int p1 )  :  void
PairedTTester.setInstances ( Instances p1 )  :  void
PairedTTester.setMeanPrec ( int p1 )  :  void
PairedTTester.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
PairedTTester.setProduceCSV ( boolean p1 )  :  void
PairedTTester.setProduceLatex ( boolean p1 )  :  void
PairedTTester.setResultsetKeyColumns ( Range p1 )  :  void
PairedTTester.setRunColumn ( int p1 )  :  void
PairedTTester.setShowStdDevs ( boolean p1 )  :  void
PairedTTester.setSignificanceLevel ( double p1 )  :  void
PairedTTester.setStdDevPrec ( int p1 )  :  void
PairedTTester.templateString ( Instance p1 )  :  String

cdk-1.0.1.jar, ParentSet.class
package weka.classifiers.bayes.net
ParentSet.addParent ( int p1, Instances p2 )  :  void
ParentSet.addParent ( int p1, int p2, Instances p3 )  :  void
ParentSet.contains ( int p1 )  :  boolean
ParentSet.copy ( ParentSet p1 )  :  void
ParentSet.deleteLastParent ( Instances p1 )  :  void
ParentSet.deleteParent ( int p1, Instances p2 )  :  int
ParentSet.getCardinalityOfParents ( )  :  int
ParentSet.getNrOfParents ( )  :  int
ParentSet.getParent ( int p1 )  :  int
ParentSet.maxParentSetSize ( int p1 )  :  void
ParentSet.ParentSet ( )
ParentSet.ParentSet ( int p1 )
ParentSet.ParentSet ( ParentSet p1 )
ParentSet.SetParent ( int p1, int p2 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ParseException.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts
ParseException.add_escapes ( String str )  :  String
ParseException.getMessage ( )  :  String
ParseException.ParseException ( )
ParseException.ParseException ( String message )
ParseException.ParseException ( Token currentTokenVal, int[ ][ ] expectedTokenSequencesVal, String[ ] tokenImageVal )
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
ParseException.add_escapes ( String str )  :  String
ParseException.getMessage ( )  :  String
ParseException.ParseException ( )
ParseException.ParseException ( String message )
ParseException.ParseException ( Token currentTokenVal, int[ ][ ] expectedTokenSequencesVal, String[ ] tokenImageVal )

cdk-1.0.1.jar, PART.class
package weka.classifiers.rules
PART.binarySplitsTipText ( )  :  String
PART.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
PART.classifyInstance ( Instance p1 )  :  double
PART.confidenceFactorTipText ( )  :  String
PART.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
PART.enumerateMeasures ( )  :  Enumeration
PART.getBinarySplits ( )  :  boolean
PART.getConfidenceFactor ( )  :  float
PART.getMeasure ( String p1 )  :  double
PART.getMinNumObj ( )  :  int
PART.getNumFolds ( )  :  int
PART.getOptions ( )  :  String[ ]
PART.getReducedErrorPruning ( )  :  boolean
PART.getSeed ( )  :  int
PART.getUnpruned ( )  :  boolean
PART.globalInfo ( )  :  String
PART.listOptions ( )  :  Enumeration
PART.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
PART.measureNumRules ( )  :  double
PART.minNumObjTipText ( )  :  String
PART.numFoldsTipText ( )  :  String
PART.PART ( )
PART.reducedErrorPruningTipText ( )  :  String
PART.seedTipText ( )  :  String
PART.setBinarySplits ( boolean p1 )  :  void
PART.setConfidenceFactor ( float p1 )  :  void
PART.setMinNumObj ( int p1 )  :  void
PART.setNumFolds ( int p1 )  :  void
PART.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
PART.setReducedErrorPruning ( boolean p1 )  :  void
PART.setSeed ( int p1 )  :  void
PART.setUnpruned ( boolean p1 )  :  void
PART.toString ( )  :  String
PART.toSummaryString ( )  :  String
PART.unprunedTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, PermutationGenerator.class
package org.openscience.cdk.math
PermutationGenerator.getNext ( )  :  int[ ]
PermutationGenerator.getNumLeft ( )  :  BigInteger
PermutationGenerator.getTotal ( )  :  BigInteger
PermutationGenerator.hasMore ( )  :  boolean
PermutationGenerator.PermutationGenerator ( int n )
PermutationGenerator.reset ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, PKIDiscretize.class
package weka.filters.unsupervised.attribute
PKIDiscretize.binsTipText ( )  :  String
PKIDiscretize.findNumBins ( int p1 )  :  void
PKIDiscretize.findNumBinsTipText ( )  :  String
PKIDiscretize.getBins ( )  :  int
PKIDiscretize.getFindNumBins ( )  :  boolean
PKIDiscretize.getOptions ( )  :  String[ ]
PKIDiscretize.getUseEqualFrequency ( )  :  boolean
PKIDiscretize.globalInfo ( )  :  String
PKIDiscretize.listOptions ( )  :  Enumeration
PKIDiscretize.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
PKIDiscretize.PKIDiscretize ( )
PKIDiscretize.setBins ( int p1 )  :  void
PKIDiscretize.setFindNumBins ( boolean p1 )  :  void
PKIDiscretize.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
PKIDiscretize.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
PKIDiscretize.setUseEqualFrequency ( boolean p1 )  :  void
PKIDiscretize.useEqualFrequencyTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, PlaceNode1.class
package weka.gui.treevisualizer
PlaceNode1.place ( Node p1 )  :  void
PlaceNode1.PlaceNode1 ( )

cdk-1.0.1.jar, PlaceNode2.class
package weka.gui.treevisualizer
PlaceNode2.place ( Node p1 )  :  void
PlaceNode2.PlaceNode2 ( )

cdk-1.0.1.jar, Plot2D.class
package weka.gui.visualize
Plot2D.addPlot ( PlotData2D p1 )  :  void
Plot2D.convertToAttribX ( double p1 )  :  double
Plot2D.convertToAttribY ( double p1 )  :  double
Plot2D.convertToPanelX ( double p1 )  :  double
Plot2D.convertToPanelY ( double p1 )  :  double
Plot2D.determineBounds ( )  :  void
Plot2D.drawDataPoint ( double p1, double p2, double p3, double p4, int p5, int p6, Graphics p7 ) [static]  :  void
Plot2D.drawDataPoint ( double p1, double p2, int p3, int p4, Graphics p5 ) [static]  :  void
Plot2D.getMasterPlot ( )  :  PlotData2D
Plot2D.getMaxC ( )  :  double
Plot2D.getMaxX ( )  :  double
Plot2D.getMaxY ( )  :  double
Plot2D.getMinC ( )  :  double
Plot2D.getMinX ( )  :  double
Plot2D.getMinY ( )  :  double
Plot2D.getPlots ( )  :  FastVector
Plot2D.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Plot2D.paintComponent ( Graphics p1 )  :  void
Plot2D.Plot2D ( )
Plot2D.removeAllPlots ( )  :  void
Plot2D.searchPoints ( int p1, int p2, boolean p3 )  :  void
Plot2D.setCindex ( int p1 )  :  void
Plot2D.setColours ( FastVector p1 )  :  void
Plot2D.setInstances ( Instances p1 )  :  void
Plot2D.setJitter ( int p1 )  :  void
Plot2D.setMasterPlot ( PlotData2D p1 )  :  void
Plot2D.setPlotCompanion ( Plot2DCompanion p1 )  :  void
Plot2D.setXindex ( int p1 )  :  void
Plot2D.setYindex ( int p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, Plot2DCompanion.class
package weka.gui.visualize
Plot2DCompanion.prePlot ( Graphics p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, PlotData2D.class
package weka.gui.visualize
PlotData2D.addInstanceNumberAttribute ( )  :  void
PlotData2D.getCindex ( )  :  int
PlotData2D.getPlotInstances ( )  :  Instances
PlotData2D.getPlotName ( )  :  String
PlotData2D.getXindex ( )  :  int
PlotData2D.getYindex ( )  :  int
PlotData2D.PlotData2D ( Instances p1 )
PlotData2D.setCindex ( int p1 )  :  void
PlotData2D.setConnectPoints ( boolean[ ] p1 )  :  void
PlotData2D.setConnectPoints ( FastVector p1 )  :  void
PlotData2D.setCustomColour ( Color p1 )  :  void
PlotData2D.setPlotName ( String p1 )  :  void
PlotData2D.setShapeSize ( FastVector p1 )  :  void
PlotData2D.setShapeSize ( int[ ] p1 )  :  void
PlotData2D.setShapeType ( FastVector p1 )  :  void
PlotData2D.setShapeType ( int[ ] p1 )  :  void
PlotData2D.setXindex ( int p1 )  :  void
PlotData2D.setYindex ( int p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, PlotPanel.class
package weka.gui.visualize
VisualizePanel.PlotPanel.addPlot ( PlotData2D p1 )  :  void
VisualizePanel.PlotPanel.cancelShapes ( )  :  void
VisualizePanel.PlotPanel.getShapes ( )  :  FastVector
VisualizePanel.PlotPanel.inSplit ( Instance p1 )  :  boolean
VisualizePanel.PlotPanel.prePlot ( Graphics p1 )  :  void
VisualizePanel.PlotPanel.setCindex ( int p1 )  :  void
VisualizePanel.PlotPanel.setColours ( FastVector p1 )  :  void
VisualizePanel.PlotPanel.setJitter ( int p1 )  :  void
VisualizePanel.PlotPanel.setMasterPlot ( PlotData2D p1 )  :  void
VisualizePanel.PlotPanel.setShapes ( FastVector p1 )  :  void
VisualizePanel.PlotPanel.setSindex ( int p1 )  :  void
VisualizePanel.PlotPanel.setXindex ( int p1 )  :  void
VisualizePanel.PlotPanel.setYindex ( int p1 )  :  void
VisualizePanel.PlotPanel.switchToLegend ( )  :  void
VisualizePanel.PlotPanel.VisualizePanel.PlotPanel ( VisualizePanel p1 )

cdk-1.0.1.jar, PlotThread.class
package weka.gui.boundaryvisualizer
BoundaryPanel.PlotThread.BoundaryPanel.PlotThread ( BoundaryPanel p1 )
BoundaryPanel.PlotThread.run ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, PLSRegressionModel.class
package org.openscience.cdk.qsar.model.R
PLSRegressionModel.build ( )  :  void
PLSRegressionModel.finalize ( )  :  void
PLSRegressionModel.getFitB ( )  :  double[ ][ ][ ]
PLSRegressionModel.getFitMethod ( )  :  String
PLSRegressionModel.getFitNComp ( )  :  int[ ]
PLSRegressionModel.getFitRMS ( )  :  double[ ][ ]
PLSRegressionModel.getFitWasValidated ( )  :  boolean
PLSRegressionModel.getFitXLoading ( )  :  double[ ][ ]
PLSRegressionModel.getFitXScores ( )  :  double[ ][ ]
PLSRegressionModel.getFitYLoading ( )  :  double[ ][ ]
PLSRegressionModel.getFitYPred ( )  :  double[ ][ ][ ]
PLSRegressionModel.getFitYScores ( )  :  double[ ][ ]
PLSRegressionModel.getPredictPredicted ( )  :  double[ ][ ]
PLSRegressionModel.getValidationIter ( )  :  int
PLSRegressionModel.getValidationLV ( )  :  int
PLSRegressionModel.getValidationR2 ( )  :  double[ ][ ]
PLSRegressionModel.getValidationRMS ( )  :  double[ ][ ]
PLSRegressionModel.getValidationRMSsd ( )  :  double[ ][ ]
PLSRegressionModel.getValidationYPred ( )  :  double[ ][ ][ ]
PLSRegressionModel.loadModel ( String fileName )  :  void
PLSRegressionModel.loadModel ( String serializedModel, String modelName )  :  void
PLSRegressionModel.PLSRegressionModel ( )
PLSRegressionModel.PLSRegressionModel ( double[ ][ ] xx, double[ ] yy )
PLSRegressionModel.PLSRegressionModel ( double[ ][ ] xx, double[ ][ ] yy )
PLSRegressionModel.predict ( )  :  void
PLSRegressionModel.setParameters ( String key, Object obj )  :  void

cdk-1.0.1.jar, PLSRegressionModelFit.class
package org.openscience.cdk.qsar.model.R
PLSRegressionModelFit.getB ( )  :  double[ ][ ][ ]
PLSRegressionModelFit.getMethod ( )  :  String
PLSRegressionModelFit.getNComp ( )  :  int[ ]
PLSRegressionModelFit.getTrainingRMS ( )  :  double[ ][ ]
PLSRegressionModelFit.getTrainingYPred ( )  :  double[ ][ ][ ]
PLSRegressionModelFit.getValidationIter ( )  :  int
PLSRegressionModelFit.getValidationLV ( )  :  int
PLSRegressionModelFit.getValidationR2 ( )  :  double[ ][ ]
PLSRegressionModelFit.getValidationRMS ( )  :  double[ ][ ]
PLSRegressionModelFit.getValidationRMSSD ( )  :  double[ ][ ]
PLSRegressionModelFit.getValidationYPred ( )  :  double[ ][ ][ ]
PLSRegressionModelFit.getXLoading ( )  :  double[ ][ ]
PLSRegressionModelFit.getXScores ( )  :  double[ ][ ]
PLSRegressionModelFit.getYLoading ( )  :  double[ ][ ]
PLSRegressionModelFit.getYScores ( )  :  double[ ][ ]
PLSRegressionModelFit.PLSRegressionModelFit ( int nobs, int nvar, int npred, int[ ] ncomp, String method )
PLSRegressionModelFit.setTrainingData ( double[ ] B, double[ ] ypred, double[ ] rms, double[ ] xscores, double[ ] yscores, double[ ] xload, double[ ] yload )  :  void
PLSRegressionModelFit.setValidationData ( int niter, int nlv, double[ ] ypred, double[ ] rms, double[ ] rmssd, double[ ] r2 )  :  void
PLSRegressionModelFit.wasValidated ( )  :  boolean

cdk-1.0.1.jar, PLSRegressionModelPredict.class
package org.openscience.cdk.qsar.model.R
PLSRegressionModelPredict.getPredictions ( )  :  double[ ][ ]
PLSRegressionModelPredict.PLSRegressionModelPredict ( int ncol, double[ ] preds )

cdk-1.0.1.jar, PoissonEstimator.class
package weka.estimators
PoissonEstimator.addValue ( double p1, double p2 )  :  void
PoissonEstimator.getProbability ( double p1 )  :  double
PoissonEstimator.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
PoissonEstimator.PoissonEstimator ( )
PoissonEstimator.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, PolyKernel.class
package weka.classifiers.functions.supportVector
PolyKernel.evaluate ( int p1, int p2, Instance p3 )  :  double
PolyKernel.PolyKernel ( Instances p1, int p2, double p3, boolean p4 )

cdk-1.0.1.jar, PostscriptGraphics.class
package weka.gui.visualize
PostscriptGraphics.addPSFontReplacement ( String p1, String p2 ) [static]  :  void
PostscriptGraphics.addRenderingHints ( Map p1 )  :  void
PostscriptGraphics.clearRect ( int p1, int p2, int p3, int p4 )  :  void
PostscriptGraphics.clip ( Shape p1 )  :  void
PostscriptGraphics.clipRect ( int p1, int p2, int p3, int p4 )  :  void
PostscriptGraphics.copyArea ( int p1, int p2, int p3, int p4, int p5, int p6 )  :  void
PostscriptGraphics.create ( )  :  Graphics
PostscriptGraphics.dispose ( )  :  void
PostscriptGraphics.draw ( Shape p1 )  :  void
PostscriptGraphics.draw3DRect ( int p1, int p2, int p3, int p4, boolean p5 )  :  void
PostscriptGraphics.drawArc ( int p1, int p2, int p3, int p4, int p5, int p6 )  :  void
PostscriptGraphics.drawBytes ( byte[ ] p1, int p2, int p3, int p4, int p5 )  :  void
PostscriptGraphics.drawChars ( char[ ] p1, int p2, int p3, int p4, int p5 )  :  void
PostscriptGraphics.drawGlyphVector ( GlyphVector p1, float p2, float p3 )  :  void
PostscriptGraphics.drawImage ( BufferedImage p1, BufferedImageOp p2, int p3, int p4 )  :  void
PostscriptGraphics.drawImage ( Image p1, AffineTransform p2, ImageObserver p3 )  :  boolean
PostscriptGraphics.drawImage ( Image p1, int p2, int p3, Color p4, ImageObserver p5 )  :  boolean
PostscriptGraphics.drawImage ( Image p1, int p2, int p3, ImageObserver p4 )  :  boolean
PostscriptGraphics.drawImage ( Image p1, int p2, int p3, int p4, int p5, Color p6, ImageObserver p7 )  :  boolean
PostscriptGraphics.drawImage ( Image p1, int p2, int p3, int p4, int p5, ImageObserver p6 )  :  boolean
PostscriptGraphics.drawImage ( Image p1, int p2, int p3, int p4, int p5, int p6, int p7, int p8, int p9, Color p10, ImageObserver p11 )  :  boolean
PostscriptGraphics.drawImage ( Image p1, int p2, int p3, int p4, int p5, int p6, int p7, int p8, int p9, ImageObserver p10 )  :  boolean
PostscriptGraphics.drawLine ( int p1, int p2, int p3, int p4 )  :  void
PostscriptGraphics.drawOval ( int p1, int p2, int p3, int p4 )  :  void
PostscriptGraphics.drawPolygon ( int[ ] p1, int[ ] p2, int p3 )  :  void
PostscriptGraphics.drawPolyline ( int[ ] p1, int[ ] p2, int p3 )  :  void
PostscriptGraphics.drawRect ( int p1, int p2, int p3, int p4 )  :  void
PostscriptGraphics.drawRenderableImage ( RenderableImage p1, AffineTransform p2 )  :  void
PostscriptGraphics.drawRenderedImage ( RenderedImage p1, AffineTransform p2 )  :  void
PostscriptGraphics.drawRoundRect ( int p1, int p2, int p3, int p4, int p5, int p6 )  :  void
PostscriptGraphics.drawString ( AttributedCharacterIterator p1, float p2, float p3 )  :  void
PostscriptGraphics.drawString ( AttributedCharacterIterator p1, int p2, int p3 )  :  void
PostscriptGraphics.drawString ( String p1, float p2, float p3 )  :  void
PostscriptGraphics.drawString ( String p1, int p2, int p3 )  :  void
PostscriptGraphics.fill ( Shape p1 )  :  void
PostscriptGraphics.fill3DRect ( int p1, int p2, int p3, int p4, boolean p5 )  :  void
PostscriptGraphics.fillArc ( int p1, int p2, int p3, int p4, int p5, int p6 )  :  void
PostscriptGraphics.fillOval ( int p1, int p2, int p3, int p4 )  :  void
PostscriptGraphics.fillPolygon ( int[ ] p1, int[ ] p2, int p3 )  :  void
PostscriptGraphics.fillPolygon ( Polygon p1 )  :  void
PostscriptGraphics.fillRect ( int p1, int p2, int p3, int p4 )  :  void
PostscriptGraphics.fillRoundRect ( int p1, int p2, int p3, int p4, int p5, int p6 )  :  void
PostscriptGraphics.finalize ( )  :  void
PostscriptGraphics.finished ( )  :  void
PostscriptGraphics.getBackground ( )  :  Color
PostscriptGraphics.getClip ( )  :  Shape
PostscriptGraphics.getClipBounds ( )  :  Rectangle
PostscriptGraphics.getClipBounds ( Rectangle p1 )  :  Rectangle
PostscriptGraphics.getClipRect ( )  :  Rectangle
PostscriptGraphics.getColor ( )  :  Color
PostscriptGraphics.getComposite ( )  :  Composite
PostscriptGraphics.getDeviceConfiguration ( )  :  GraphicsConfiguration
PostscriptGraphics.getFont ( )  :  Font
PostscriptGraphics.getFontMetrics ( Font p1 )  :  FontMetrics
PostscriptGraphics.getFontRenderContext ( )  :  FontRenderContext
PostscriptGraphics.getPaint ( )  :  Paint
PostscriptGraphics.getRenderingHint ( RenderingHints.Key p1 )  :  Object
PostscriptGraphics.getRenderingHints ( )  :  RenderingHints
PostscriptGraphics.getStroke ( )  :  Stroke
PostscriptGraphics.getTransform ( )  :  AffineTransform
PostscriptGraphics.hit ( Rectangle p1, Shape p2, boolean p3 )  :  boolean
PostscriptGraphics.PostscriptGraphics ( int p1, int p2, OutputStream p3 )
PostscriptGraphics.rotate ( double p1 )  :  void
PostscriptGraphics.rotate ( double p1, double p2, double p3 )  :  void
PostscriptGraphics.scale ( double p1, double p2 )  :  void
PostscriptGraphics.setBackground ( Color p1 )  :  void
PostscriptGraphics.setClip ( int p1, int p2, int p3, int p4 )  :  void
PostscriptGraphics.setClip ( Shape p1 )  :  void
PostscriptGraphics.setColor ( Color p1 )  :  void
PostscriptGraphics.setComposite ( Composite p1 )  :  void
PostscriptGraphics.setFont ( Font p1 )  :  void
PostscriptGraphics.setPaint ( Paint p1 )  :  void
PostscriptGraphics.setPaintMode ( )  :  void
PostscriptGraphics.setRenderingHint ( RenderingHints.Key p1, Object p2 )  :  void
PostscriptGraphics.setRenderingHints ( Map p1 )  :  void
PostscriptGraphics.setStroke ( Stroke p1 )  :  void
PostscriptGraphics.setTransform ( AffineTransform p1 )  :  void
PostscriptGraphics.setXORMode ( Color p1 )  :  void
PostscriptGraphics.shear ( double p1, double p2 )  :  void
PostscriptGraphics.transform ( AffineTransform p1 )  :  void
PostscriptGraphics.translate ( double p1, double p2 )  :  void
PostscriptGraphics.translate ( int p1, int p2 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, PostscriptWriter.class
package weka.gui.visualize
PostscriptWriter.getDescription ( )  :  String
PostscriptWriter.getExtension ( )  :  String
PostscriptWriter.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
PostscriptWriter.PostscriptWriter ( )
PostscriptWriter.PostscriptWriter ( JComponent p1 )
PostscriptWriter.PostscriptWriter ( JComponent p1, File p2 )
PostscriptWriter.toOutput ( )  :  void
PostscriptWriter.toOutput ( JComponent p1, File p2 ) [static]  :  void

cdk-1.0.1.jar, PotentialClassIgnorer.class
package weka.filters.unsupervised.attribute
PotentialClassIgnorer.getOutputFormat ( )  :  Instances
PotentialClassIgnorer.PotentialClassIgnorer ( )
PotentialClassIgnorer.setIgnoreClass ( boolean p1 )  :  void
PotentialClassIgnorer.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean

cdk-1.0.1.jar, PreConstructedLinearModel.class
package weka.classifiers.trees.m5
PreConstructedLinearModel.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
PreConstructedLinearModel.classifyInstance ( Instance p1 )  :  double
PreConstructedLinearModel.coefficients ( )  :  double[ ]
PreConstructedLinearModel.intercept ( )  :  double
PreConstructedLinearModel.numParameters ( )  :  int
PreConstructedLinearModel.PreConstructedLinearModel ( double[ ] p1, double p2 )
PreConstructedLinearModel.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, Predicate.class
package weka.associations.tertius
Predicate.addLiteral ( Literal p1 )  :  void
Predicate.description ( )  :  String
Predicate.getIndex ( )  :  int
Predicate.getLiteral ( int p1 )  :  Literal
Predicate.indexOf ( Literal p1 )  :  int
Predicate.isClass ( )  :  boolean
Predicate.numLiterals ( )  :  int
Predicate.Predicate ( String p1, int p2, boolean p3 )
Predicate.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, Prediction.class
package weka.classifiers.evaluation
Prediction.actual ( ) [abstract]  :  double
Prediction.predicted ( ) [abstract]  :  double
Prediction.weight ( ) [abstract]  :  double

cdk-1.0.1.jar, PredictionAppender.class
package weka.gui.beans
PredictionAppender.acceptClassifier ( BatchClassifierEvent p1 )  :  void
PredictionAppender.acceptClassifier ( IncrementalClassifierEvent p1 )  :  void
PredictionAppender.acceptClusterer ( BatchClustererEvent p1 )  :  void
PredictionAppender.addDataSourceListener ( DataSourceListener p1 )  :  void
PredictionAppender.addInstanceListener ( InstanceListener p1 )  :  void
PredictionAppender.appendPredictedProbabilitiesTipText ( )  :  String
PredictionAppender.connectionAllowed ( EventSetDescriptor p1 )  :  boolean
PredictionAppender.connectionAllowed ( String p1 )  :  boolean
PredictionAppender.connectionNotification ( String p1, Object p2 )  :  void
PredictionAppender.disconnectionNotification ( String p1, Object p2 )  :  void
PredictionAppender.eventGeneratable ( String p1 )  :  boolean
PredictionAppender.getAppendPredictedProbabilities ( )  :  boolean
PredictionAppender.getVisual ( )  :  BeanVisual
PredictionAppender.globalInfo ( )  :  String
PredictionAppender.notifyDataSetAvailable ( DataSetEvent p1 )  :  void
PredictionAppender.notifyInstanceAvailable ( InstanceEvent p1 )  :  void
PredictionAppender.PredictionAppender ( )
PredictionAppender.removeDataSourceListener ( DataSourceListener p1 )  :  void
PredictionAppender.removeInstanceListener ( InstanceListener p1 )  :  void
PredictionAppender.setAppendPredictedProbabilities ( boolean p1 )  :  void
PredictionAppender.setLog ( Logger p1 )  :  void
PredictionAppender.setVisual ( BeanVisual p1 )  :  void
PredictionAppender.stop ( )  :  void
PredictionAppender.useDefaultVisual ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, PredictionAppenderBeanInfo.class
package weka.gui.beans
PredictionAppenderBeanInfo.getBeanDescriptor ( )  :  BeanDescriptor
PredictionAppenderBeanInfo.getEventSetDescriptors ( )  :  EventSetDescriptor[ ]
PredictionAppenderBeanInfo.getPropertyDescriptors ( )  :  PropertyDescriptor[ ]
PredictionAppenderBeanInfo.PredictionAppenderBeanInfo ( )

cdk-1.0.1.jar, PredictionAppenderCustomizer.class
package weka.gui.beans
PredictionAppenderCustomizer.addPropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
PredictionAppenderCustomizer.PredictionAppenderCustomizer ( )
PredictionAppenderCustomizer.removePropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
PredictionAppenderCustomizer.setObject ( Object p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, PredictionNode.class
package weka.classifiers.trees.adtree
PredictionNode.addChild ( Splitter p1, ADTree p2 )  :  void
PredictionNode.children ( )  :  Enumeration
PredictionNode.clone ( )  :  Object
PredictionNode.getChildren ( )  :  FastVector
PredictionNode.getValue ( )  :  double
PredictionNode.merge ( PredictionNode p1, ADTree p2 )  :  void
PredictionNode.PredictionNode ( double p1 )
PredictionNode.setValue ( double p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, PredictiveApriori.class
package weka.associations
PredictiveApriori.buildAssociations ( Instances p1 )  :  void
PredictiveApriori.getNumRules ( )  :  int
PredictiveApriori.getOptions ( )  :  String[ ]
PredictiveApriori.globalInfo ( )  :  String
PredictiveApriori.listOptions ( )  :  Enumeration
PredictiveApriori.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
PredictiveApriori.numRulesTipText ( )  :  String
PredictiveApriori.PredictiveApriori ( )
PredictiveApriori.resetOptions ( )  :  void
PredictiveApriori.setNumRules ( int p1 )  :  void
PredictiveApriori.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
PredictiveApriori.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, PreprocessPanel.class
package weka.gui.explorer
PreprocessPanel.addPropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
PreprocessPanel.addUndoPoint ( )  :  void
PreprocessPanel.applyFilter ( Filter p1 )  :  void
PreprocessPanel.edit ( )  :  void
PreprocessPanel.getInstances ( )  :  Instances
PreprocessPanel.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
PreprocessPanel.PreprocessPanel ( )
PreprocessPanel.removePropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
PreprocessPanel.saveInstancesToC45File ( File p1, Instances p2 )  :  void
PreprocessPanel.saveInstancesToFile ( File p1, Instances p2, boolean p3 )  :  void
PreprocessPanel.saveSerializedInstancesToFile ( File p1, Instances p2 )  :  void
PreprocessPanel.saveWorkingInstancesToFileQ ( )  :  void
PreprocessPanel.setInstances ( Instances p1 )  :  void
PreprocessPanel.setInstancesFromDB ( InstanceQuery p1 )  :  void
PreprocessPanel.setInstancesFromDBQ ( )  :  void
PreprocessPanel.setInstancesFromFile ( File p1 )  :  void
PreprocessPanel.setInstancesFromFileQ ( )  :  void
PreprocessPanel.setInstancesFromURL ( URL p1 )  :  void
PreprocessPanel.setInstancesFromURLQ ( )  :  void
PreprocessPanel.setLog ( Logger p1 )  :  void
PreprocessPanel.undo ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, PrincipalComponents.class
package weka.attributeSelection
PrincipalComponents.buildEvaluator ( Instances p1 )  :  void
PrincipalComponents.convertInstance ( Instance p1 )  :  Instance
PrincipalComponents.evaluateAttribute ( int p1 )  :  double
PrincipalComponents.getMaximumAttributeNames ( )  :  int
PrincipalComponents.getNormalize ( )  :  boolean
PrincipalComponents.getOptions ( )  :  String[ ]
PrincipalComponents.getTransformBackToOriginal ( )  :  boolean
PrincipalComponents.getVarianceCovered ( )  :  double
PrincipalComponents.globalInfo ( )  :  String
PrincipalComponents.listOptions ( )  :  Enumeration
PrincipalComponents.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
PrincipalComponents.normalizeTipText ( )  :  String
PrincipalComponents.PrincipalComponents ( )
PrincipalComponents.setMaximumAttributeNames ( int p1 )  :  void
PrincipalComponents.setNormalize ( boolean p1 )  :  void
PrincipalComponents.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
PrincipalComponents.setTransformBackToOriginal ( boolean p1 )  :  void
PrincipalComponents.setVarianceCovered ( double p1 )  :  void
PrincipalComponents.toString ( )  :  String
PrincipalComponents.transformBackToOriginalTipText ( )  :  String
PrincipalComponents.transformedData ( )  :  Instances
PrincipalComponents.transformedHeader ( )  :  Instances
PrincipalComponents.varianceCoveredTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, PrintableComponent.class
package weka.gui.visualize
PrintableComponent.getComponent ( )  :  JComponent
PrintableComponent.getSaveDialogTitle ( )  :  String
PrintableComponent.getToolTipText ( PrintableComponent p1 ) [static]  :  String
PrintableComponent.getWriter ( String p1 )  :  JComponentWriter
PrintableComponent.getWriters ( )  :  Hashtable
PrintableComponent.getXScale ( )  :  double
PrintableComponent.getYScale ( )  :  double
PrintableComponent.initFileChooser ( )  :  void
PrintableComponent.PrintableComponent ( JComponent p1 )
PrintableComponent.saveComponent ( )  :  void
PrintableComponent.setSaveDialogTitle ( String p1 )  :  void
PrintableComponent.setScale ( double p1, double p2 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, PrintableHandler.class
package weka.gui.visualize
PrintableHandler.getSaveDialogTitle ( ) [abstract]  :  String
PrintableHandler.getWriter ( String p1 ) [abstract]  :  JComponentWriter
PrintableHandler.getWriters ( ) [abstract]  :  Hashtable
PrintableHandler.getXScale ( ) [abstract]  :  double
PrintableHandler.getYScale ( ) [abstract]  :  double
PrintableHandler.saveComponent ( ) [abstract]  :  void
PrintableHandler.setSaveDialogTitle ( String p1 ) [abstract]  :  void
PrintableHandler.setScale ( double p1, double p2 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, PrintablePanel.class
package weka.gui.visualize
PrintablePanel.getSaveDialogTitle ( )  :  String
PrintablePanel.getWriter ( String p1 )  :  JComponentWriter
PrintablePanel.getWriters ( )  :  Hashtable
PrintablePanel.getXScale ( )  :  double
PrintablePanel.getYScale ( )  :  double
PrintablePanel.PrintablePanel ( )
PrintablePanel.saveComponent ( )  :  void
PrintablePanel.setSaveDialogTitle ( String p1 )  :  void
PrintablePanel.setScale ( double p1, double p2 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, PriorEstimation.class
package weka.associations
PriorEstimation.addCons ( int[ ] p1 )  :  RuleItem
PriorEstimation.buildDistribution ( double p1, double p2 )  :  void
PriorEstimation.calculatePriorSum ( boolean p1, double p2 )  :  double
PriorEstimation.estimatePrior ( )  :  Hashtable
PriorEstimation.findIntervall ( double p1 )  :  double
PriorEstimation.generateDistribution ( )  :  void
PriorEstimation.getMidPoints ( )  :  double[ ]
PriorEstimation.logbinomialCoefficient ( int p1, int p2 ) [static]  :  double
PriorEstimation.midPoint ( double p1, int p2 )  :  double
PriorEstimation.midPoints ( )  :  void
PriorEstimation.PriorEstimation ( Instances p1, int p2, int p3, boolean p4 )
PriorEstimation.randomCARule ( int p1, int p2, Random p3 )  :  int[ ]
PriorEstimation.randomRule ( int p1, int p2, Random p3 )  :  int[ ]
PriorEstimation.splitItemSet ( int p1, int[ ] p2 )  :  RuleItem
PriorEstimation.updateCounters ( ItemSet p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, Prism.class
package weka.classifiers.rules
Prism.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
Prism.classifyInstance ( Instance p1 )  :  double
Prism.globalInfo ( )  :  String
Prism.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Prism.Prism ( )
Prism.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, PropertyDialog.class
package weka.gui
PropertyDialog.getEditor ( )  :  PropertyEditor
PropertyDialog.PropertyDialog ( PropertyEditor p1, int p2, int p3 )

cdk-1.0.1.jar, PropertyHandler.class
package weka.core.xml
PropertyHandler.addAllowed ( Class p1, String p2 )  :  void
PropertyHandler.addIgnored ( Class p1, String p2 )  :  void
PropertyHandler.addIgnored ( String p1 )  :  void
PropertyHandler.allowed ( )  :  Enumeration
PropertyHandler.ignored ( )  :  Enumeration
PropertyHandler.isAllowed ( Class p1, String p2 )  :  boolean
PropertyHandler.isAllowed ( Object p1, String p2 )  :  boolean
PropertyHandler.isIgnored ( Class p1, String p2 )  :  boolean
PropertyHandler.isIgnored ( Object p1, String p2 )  :  boolean
PropertyHandler.isIgnored ( String p1 )  :  boolean
PropertyHandler.PropertyHandler ( )
PropertyHandler.removeAllowed ( Class p1, String p2 )  :  boolean
PropertyHandler.removeIgnored ( Class p1, String p2 )  :  boolean
PropertyHandler.removeIgnored ( String p1 )  :  boolean

cdk-1.0.1.jar, PropertyNode.class
package weka.experiment
PropertyNode.PropertyNode ( Object p1 )
PropertyNode.PropertyNode ( Object p1, PropertyDescriptor p2, Class p3 )
PropertyNode.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, PropertyPanel.class
package weka.gui
PropertyPanel.createDefaultPanel ( )  :  void
PropertyPanel.paintComponent ( Graphics p1 )  :  void
PropertyPanel.PropertyPanel ( PropertyEditor p1 )
PropertyPanel.PropertyPanel ( PropertyEditor p1, boolean p2 )
PropertyPanel.removeNotify ( )  :  void
PropertyPanel.showPropertyDialog ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, PropertySelectorDialog.class
package weka.gui
PropertySelectorDialog.createNodes ( DefaultMutableTreeNode p1 )  :  void
PropertySelectorDialog.getPath ( )  :  PropertyNode[ ]
PropertySelectorDialog.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
PropertySelectorDialog.PropertySelectorDialog ( Frame p1, Object p2 )
PropertySelectorDialog.showDialog ( )  :  int

cdk-1.0.1.jar, PropertySheetPanel.class
package weka.gui
PropertySheetPanel.addPropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
PropertySheetPanel.editableProperties ( )  :  int
PropertySheetPanel.getAboutPanel ( )  :  JPanel
PropertySheetPanel.openHelpFrame ( )  :  void
PropertySheetPanel.propertyChange ( PropertyChangeEvent p1 )  :  void
PropertySheetPanel.PropertySheetPanel ( )
PropertySheetPanel.removePropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
PropertySheetPanel.setTarget ( Object p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ProtectedProperties.class
package weka.core
ProtectedProperties.clear ( )  :  void
ProtectedProperties.load ( InputStream p1 )  :  void
ProtectedProperties.ProtectedProperties ( Properties p1 )
ProtectedProperties.put ( Object p1, Object p2 )  :  Object
ProtectedProperties.putAll ( Map p1 )  :  void
ProtectedProperties.remove ( Object p1 )  :  Object
ProtectedProperties.setProperty ( String p1, String p2 )  :  Object

cdk-1.0.1.jar, PruneableClassifierTree.class
package weka.classifiers.trees.j48
PruneableClassifierTree.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
PruneableClassifierTree.getNewTree ( Instances p1, Instances p2 )  :  ClassifierTree
PruneableClassifierTree.prune ( )  :  void
PruneableClassifierTree.PruneableClassifierTree ( ModelSelection p1, boolean p2, int p3, boolean p4, int p5 )

cdk-1.0.1.jar, PruneableDecList.class
package weka.classifiers.rules.part
PruneableDecList.buildDecList ( Instances p1, Instances p2, boolean p3 )  :  void
PruneableDecList.buildRule ( Instances p1, Instances p2 )  :  void
PruneableDecList.getNewDecList ( Instances p1, Instances p2, boolean p3 )  :  ClassifierDecList
PruneableDecList.PruneableDecList ( ModelSelection p1, int p2 )
PruneableDecList.pruneEnd ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, QRDecomposition.class
package weka.core.matrix
QRDecomposition.getH ( )  :  Matrix
QRDecomposition.getQ ( )  :  Matrix
QRDecomposition.getR ( )  :  Matrix
QRDecomposition.isFullRank ( )  :  boolean
QRDecomposition.QRDecomposition ( Matrix p1 )
QRDecomposition.solve ( Matrix p1 )  :  Matrix

cdk-1.0.1.jar, Queue.class
package weka.core
Queue.empty ( )  :  boolean
Queue.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Queue.peek ( )  :  Object
Queue.pop ( )  :  Object
Queue.push ( Object p1 )  :  Object
Queue.Queue ( )
Queue.removeAllElements ( )  :  void
Queue.size ( )  :  int
Queue.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, QueueNode.class
package weka.core
Queue.QueueNode.contents ( )  :  Object
Queue.QueueNode.contents ( Object p1 )  :  Object
Queue.QueueNode.next ( )  :  Queue.QueueNode
Queue.QueueNode.next ( Queue.QueueNode p1 )  :  Queue.QueueNode
Queue.QueueNode.Queue.QueueNode ( Queue p1, Object p2 )

cdk-1.0.1.jar, RacedIncrementalLogitBoost.class
package weka.classifiers.meta
RacedIncrementalLogitBoost.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
RacedIncrementalLogitBoost.defaultClassifierString ( )  :  String
RacedIncrementalLogitBoost.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
RacedIncrementalLogitBoost.getBestCommitteeChunkSize ( )  :  int
RacedIncrementalLogitBoost.getBestCommitteeErrorEstimate ( )  :  double
RacedIncrementalLogitBoost.getBestCommitteeLLEstimate ( )  :  double
RacedIncrementalLogitBoost.getBestCommitteeSize ( )  :  int
RacedIncrementalLogitBoost.getMaxChunkSize ( )  :  int
RacedIncrementalLogitBoost.getMinChunkSize ( )  :  int
RacedIncrementalLogitBoost.getOptions ( )  :  String[ ]
RacedIncrementalLogitBoost.getPruningType ( )  :  SelectedTag
RacedIncrementalLogitBoost.getUseResampling ( )  :  boolean
RacedIncrementalLogitBoost.getValidationChunkSize ( )  :  int
RacedIncrementalLogitBoost.globalInfo ( )  :  String
RacedIncrementalLogitBoost.listOptions ( )  :  Enumeration
RacedIncrementalLogitBoost.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
RacedIncrementalLogitBoost.maxChunkSizeTipText ( )  :  String
RacedIncrementalLogitBoost.minChunkSizeTipText ( )  :  String
RacedIncrementalLogitBoost.pruningTypeTipText ( )  :  String
RacedIncrementalLogitBoost.RacedIncrementalLogitBoost ( )
RacedIncrementalLogitBoost.RtoP ( double[ ] p1, int p2 ) [static]  :  double
RacedIncrementalLogitBoost.setMaxChunkSize ( int p1 )  :  void
RacedIncrementalLogitBoost.setMinChunkSize ( int p1 )  :  void
RacedIncrementalLogitBoost.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
RacedIncrementalLogitBoost.setPruningType ( SelectedTag p1 )  :  void
RacedIncrementalLogitBoost.setUseResampling ( boolean p1 )  :  void
RacedIncrementalLogitBoost.setValidationChunkSize ( int p1 )  :  void
RacedIncrementalLogitBoost.toString ( )  :  String
RacedIncrementalLogitBoost.updateClassifier ( Instance p1 )  :  void
RacedIncrementalLogitBoost.useResamplingTipText ( )  :  String
RacedIncrementalLogitBoost.validationChunkSizeTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, RaceSearch.class
package weka.attributeSelection
RaceSearch.attributeEvaluatorTipText ( )  :  String
RaceSearch.debugTipText ( )  :  String
RaceSearch.foldsTipText ( )  :  String
RaceSearch.generateRankingTipText ( )  :  String
RaceSearch.getAttributeEvaluator ( )  :  attributeSelection.ASEvaluation
RaceSearch.getCalculatedNumToSelect ( )  :  int
RaceSearch.getDebug ( )  :  boolean
RaceSearch.getFoldsType ( )  :  SelectedTag
RaceSearch.getGenerateRanking ( )  :  boolean
RaceSearch.getNumToSelect ( )  :  int
RaceSearch.getOptions ( )  :  String[ ]
RaceSearch.getRaceType ( )  :  SelectedTag
RaceSearch.getSelectionThreshold ( )  :  double
RaceSearch.getSignificanceLevel ( )  :  double
RaceSearch.getThreshold ( )  :  double
RaceSearch.globalInfo ( )  :  String
RaceSearch.listOptions ( )  :  Enumeration
RaceSearch.numToSelectTipText ( )  :  String
RaceSearch.RaceSearch ( )
RaceSearch.raceTypeTipText ( )  :  String
RaceSearch.rankedAttributes ( )  :  double[ ][ ]
RaceSearch.resetOptions ( )  :  void
RaceSearch.search ( attributeSelection.ASEvaluation p1, Instances p2 )  :  int[ ]
RaceSearch.selectionThresholdTipText ( )  :  String
RaceSearch.setAttributeEvaluator ( attributeSelection.ASEvaluation p1 )  :  void
RaceSearch.setDebug ( boolean p1 )  :  void
RaceSearch.setFoldsType ( SelectedTag p1 )  :  void
RaceSearch.setGenerateRanking ( boolean p1 )  :  void
RaceSearch.setNumToSelect ( int p1 )  :  void
RaceSearch.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
RaceSearch.setRaceType ( SelectedTag p1 )  :  void
RaceSearch.setSelectionThreshold ( double p1 )  :  void
RaceSearch.setSignificanceLevel ( double p1 )  :  void
RaceSearch.setThreshold ( double p1 )  :  void
RaceSearch.significanceLevelTipText ( )  :  String
RaceSearch.thresholdTipText ( )  :  String
RaceSearch.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, RandomCommittee.class
package weka.classifiers.meta
RandomCommittee.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
RandomCommittee.defaultClassifierString ( )  :  String
RandomCommittee.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
RandomCommittee.globalInfo ( )  :  String
RandomCommittee.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
RandomCommittee.RandomCommittee ( )
RandomCommittee.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, RandomForest.class
package weka.classifiers.trees
RandomForest.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
RandomForest.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
RandomForest.enumerateMeasures ( )  :  Enumeration
RandomForest.getMeasure ( String p1 )  :  double
RandomForest.getNumFeatures ( )  :  int
RandomForest.getNumTrees ( )  :  int
RandomForest.getOptions ( )  :  String[ ]
RandomForest.getSeed ( )  :  int
RandomForest.globalInfo ( )  :  String
RandomForest.listOptions ( )  :  Enumeration
RandomForest.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
RandomForest.measureOutOfBagError ( )  :  double
RandomForest.numFeaturesTipText ( )  :  String
RandomForest.numTreesTipText ( )  :  String
RandomForest.RandomForest ( )
RandomForest.seedTipText ( )  :  String
RandomForest.setNumFeatures ( int p1 )  :  void
RandomForest.setNumTrees ( int p1 )  :  void
RandomForest.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
RandomForest.setSeed ( int p1 )  :  void
RandomForest.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, Randomizable.class
package weka.core
Randomizable.getSeed ( ) [abstract]  :  int
Randomizable.setSeed ( int p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, RandomizableClassifier.class
package weka.classifiers
RandomizableClassifier.getOptions ( )  :  String[ ]
RandomizableClassifier.getSeed ( )  :  int
RandomizableClassifier.listOptions ( )  :  Enumeration
RandomizableClassifier.RandomizableClassifier ( )
RandomizableClassifier.seedTipText ( )  :  String
RandomizableClassifier.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
RandomizableClassifier.setSeed ( int p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, RandomizableIteratedSingleClassifierEnhancer.class
package weka.classifiers
RandomizableIteratedSingleClassifierEnhancer.getOptions ( )  :  String[ ]
RandomizableIteratedSingleClassifierEnhancer.getSeed ( )  :  int
RandomizableIteratedSingleClassifierEnhancer.listOptions ( )  :  Enumeration
RandomizableIteratedSingleClassifierEnhancer.RandomizableIteratedSingleClassifierEnhancer ( )
RandomizableIteratedSingleClassifierEnhancer.seedTipText ( )  :  String
RandomizableIteratedSingleClassifierEnhancer.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
RandomizableIteratedSingleClassifierEnhancer.setSeed ( int p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, RandomizableMultipleClassifiersCombiner.class
package weka.classifiers
RandomizableMultipleClassifiersCombiner.getOptions ( )  :  String[ ]
RandomizableMultipleClassifiersCombiner.getSeed ( )  :  int
RandomizableMultipleClassifiersCombiner.listOptions ( )  :  Enumeration
RandomizableMultipleClassifiersCombiner.RandomizableMultipleClassifiersCombiner ( )
RandomizableMultipleClassifiersCombiner.seedTipText ( )  :  String
RandomizableMultipleClassifiersCombiner.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
RandomizableMultipleClassifiersCombiner.setSeed ( int p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, RandomizableSingleClassifierEnhancer.class
package weka.classifiers
RandomizableSingleClassifierEnhancer.getOptions ( )  :  String[ ]
RandomizableSingleClassifierEnhancer.getSeed ( )  :  int
RandomizableSingleClassifierEnhancer.listOptions ( )  :  Enumeration
RandomizableSingleClassifierEnhancer.RandomizableSingleClassifierEnhancer ( )
RandomizableSingleClassifierEnhancer.seedTipText ( )  :  String
RandomizableSingleClassifierEnhancer.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
RandomizableSingleClassifierEnhancer.setSeed ( int p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, Randomize.class
package weka.filters.unsupervised.instance
Randomize.batchFinished ( )  :  boolean
Randomize.getOptions ( )  :  String[ ]
Randomize.getRandomSeed ( )  :  int
Randomize.globalInfo ( )  :  String
Randomize.listOptions ( )  :  Enumeration
Randomize.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Randomize.Randomize ( )
Randomize.randomSeedTipText ( )  :  String
Randomize.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
Randomize.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
Randomize.setRandomSeed ( int p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, RandomProjection.class
package weka.filters.unsupervised.attribute
RandomProjection.batchFinished ( )  :  boolean
RandomProjection.distributionTipText ( )  :  String
RandomProjection.getDistribution ( )  :  SelectedTag
RandomProjection.getNumberOfAttributes ( )  :  int
RandomProjection.getOptions ( )  :  String[ ]
RandomProjection.getPercent ( )  :  double
RandomProjection.getRandomSeed ( )  :  long
RandomProjection.getReplaceMissingValues ( )  :  boolean
RandomProjection.globalInfo ( )  :  String
RandomProjection.input ( Instance p1 )  :  boolean
RandomProjection.listOptions ( )  :  Enumeration
RandomProjection.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
RandomProjection.numberOfAttributesTipText ( )  :  String
RandomProjection.percentTipText ( )  :  String
RandomProjection.RandomProjection ( )
RandomProjection.randomSeedTipText ( )  :  String
RandomProjection.replaceMissingValuesTipText ( )  :  String
RandomProjection.setDistribution ( SelectedTag p1 )  :  void
RandomProjection.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
RandomProjection.setNumberOfAttributes ( int p1 )  :  void
RandomProjection.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
RandomProjection.setPercent ( double p1 )  :  void
RandomProjection.setRandomSeed ( long p1 )  :  void
RandomProjection.setReplaceMissingValues ( boolean p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, RandomSearch.class
package weka.attributeSelection
RandomSearch.getOptions ( )  :  String[ ]
RandomSearch.getSearchPercent ( )  :  double
RandomSearch.getStartSet ( )  :  String
RandomSearch.getVerbose ( )  :  boolean
RandomSearch.globalInfo ( )  :  String
RandomSearch.listOptions ( )  :  Enumeration
RandomSearch.RandomSearch ( )
RandomSearch.search ( attributeSelection.ASEvaluation p1, Instances p2 )  :  int[ ]
RandomSearch.searchPercentTipText ( )  :  String
RandomSearch.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
RandomSearch.setSearchPercent ( double p1 )  :  void
RandomSearch.setStartSet ( String p1 )  :  void
RandomSearch.setVerbose ( boolean p1 )  :  void
RandomSearch.startSetTipText ( )  :  String
RandomSearch.toString ( )  :  String
RandomSearch.verboseTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, RandomSplitResultProducer.class
package weka.experiment
RandomSplitResultProducer.doRun ( int p1 )  :  void
RandomSplitResultProducer.doRunKeys ( int p1 )  :  void
RandomSplitResultProducer.enumerateMeasures ( )  :  Enumeration
RandomSplitResultProducer.getCompatibilityState ( )  :  String
RandomSplitResultProducer.getKeyNames ( )  :  String[ ]
RandomSplitResultProducer.getKeyTypes ( )  :  Object[ ]
RandomSplitResultProducer.getMeasure ( String p1 )  :  double
RandomSplitResultProducer.getOptions ( )  :  String[ ]
RandomSplitResultProducer.getOutputFile ( )  :  File
RandomSplitResultProducer.getRandomizeData ( )  :  boolean
RandomSplitResultProducer.getRawOutput ( )  :  boolean
RandomSplitResultProducer.getResultNames ( )  :  String[ ]
RandomSplitResultProducer.getResultTypes ( )  :  Object[ ]
RandomSplitResultProducer.getSplitEvaluator ( )  :  SplitEvaluator
RandomSplitResultProducer.getTimestamp ( ) [static]  :  Double
RandomSplitResultProducer.getTrainPercent ( )  :  double
RandomSplitResultProducer.globalInfo ( )  :  String
RandomSplitResultProducer.listOptions ( )  :  Enumeration
RandomSplitResultProducer.outputFileTipText ( )  :  String
RandomSplitResultProducer.postProcess ( )  :  void
RandomSplitResultProducer.preProcess ( )  :  void
RandomSplitResultProducer.randomizeDataTipText ( )  :  String
RandomSplitResultProducer.RandomSplitResultProducer ( )
RandomSplitResultProducer.rawOutputTipText ( )  :  String
RandomSplitResultProducer.setAdditionalMeasures ( String[ ] p1 )  :  void
RandomSplitResultProducer.setInstances ( Instances p1 )  :  void
RandomSplitResultProducer.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
RandomSplitResultProducer.setOutputFile ( File p1 )  :  void
RandomSplitResultProducer.setRandomizeData ( boolean p1 )  :  void
RandomSplitResultProducer.setRawOutput ( boolean p1 )  :  void
RandomSplitResultProducer.setResultListener ( ResultListener p1 )  :  void
RandomSplitResultProducer.setSplitEvaluator ( SplitEvaluator p1 )  :  void
RandomSplitResultProducer.setTrainPercent ( double p1 )  :  void
RandomSplitResultProducer.splitEvaluatorTipText ( )  :  String
RandomSplitResultProducer.toString ( )  :  String
RandomSplitResultProducer.trainPercentTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, RandomTree.class
package weka.classifiers.trees
RandomTree.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
RandomTree.buildTree ( int[ ][ ] p1, double[ ][ ] p2, Instances p3, double[ ] p4, Instances p5, double p6, boolean p7, int[ ] p8, Random p9 )  :  void
RandomTree.debugTipText ( )  :  String
RandomTree.distribution ( double[ ][ ] p1, double[ ][ ][ ] p2, int p3, int[ ] p4, double[ ] p5, Instances p6 )  :  double
RandomTree.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
RandomTree.gain ( double[ ][ ] p1, double p2 )  :  double
RandomTree.getDebug ( )  :  boolean
RandomTree.getKValue ( )  :  int
RandomTree.getMinNum ( )  :  double
RandomTree.getOptions ( )  :  String[ ]
RandomTree.getSeed ( )  :  int
RandomTree.globalInfo ( )  :  String
RandomTree.KValueTipText ( )  :  String
RandomTree.leafString ( )  :  String
RandomTree.listOptions ( )  :  Enumeration
RandomTree.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
RandomTree.minNumTipText ( )  :  String
RandomTree.numNodes ( )  :  int
RandomTree.priorVal ( double[ ][ ] p1 )  :  double
RandomTree.RandomTree ( )
RandomTree.seedTipText ( )  :  String
RandomTree.setDebug ( boolean p1 )  :  void
RandomTree.setKValue ( int p1 )  :  void
RandomTree.setMinNum ( double p1 )  :  void
RandomTree.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
RandomTree.setSeed ( int p1 )  :  void
RandomTree.splitData ( int[ ][ ][ ] p1, double[ ][ ][ ] p2, int p3, double p4, int[ ][ ] p5, double[ ][ ] p6, double[ ][ ] p7, Instances p8 )  :  void
RandomTree.toGraph ( )  :  String
RandomTree.toGraph ( StringBuffer p1, int p2 )  :  int
RandomTree.toString ( )  :  String
RandomTree.toString ( int p1 )  :  String

cdk-1.0.1.jar, RandomVariates.class
package weka.core
RandomVariates.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
RandomVariates.next ( int p1 )  :  int
RandomVariates.nextErlang ( int p1 )  :  double
RandomVariates.nextExponential ( )  :  double
RandomVariates.nextGamma ( double p1 )  :  double
RandomVariates.RandomVariates ( )
RandomVariates.RandomVariates ( long p1 )

cdk-1.0.1.jar, Range.class
package weka.core
Range.getInvert ( )  :  boolean
Range.getRanges ( )  :  String
Range.getSelection ( )  :  int[ ]
Range.indicesToRangeList ( int[ ] p1 ) [static]  :  String
Range.isInRange ( int p1 )  :  boolean
Range.isValidRange ( String p1 )  :  boolean
Range.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Range.Range ( )
Range.Range ( String p1 )
Range.rangeLower ( String p1 )  :  int
Range.rangeSingle ( String p1 )  :  int
Range.rangeUpper ( String p1 )  :  int
Range.setFlags ( )  :  void
Range.setInvert ( boolean p1 )  :  void
Range.setRanges ( String p1 )  :  void
Range.setUpper ( int p1 )  :  void
Range.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, RankedOutputSearch.class
package weka.attributeSelection
RankedOutputSearch.getCalculatedNumToSelect ( ) [abstract]  :  int
RankedOutputSearch.getGenerateRanking ( ) [abstract]  :  boolean
RankedOutputSearch.getNumToSelect ( ) [abstract]  :  int
RankedOutputSearch.getThreshold ( ) [abstract]  :  double
RankedOutputSearch.rankedAttributes ( ) [abstract]  :  double[ ][ ]
RankedOutputSearch.setGenerateRanking ( boolean p1 ) [abstract]  :  void
RankedOutputSearch.setNumToSelect ( int p1 ) [abstract]  :  void
RankedOutputSearch.setThreshold ( double p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, Ranker.class
package weka.attributeSelection
Ranker.generateRankingTipText ( )  :  String
Ranker.getCalculatedNumToSelect ( )  :  int
Ranker.getGenerateRanking ( )  :  boolean
Ranker.getNumToSelect ( )  :  int
Ranker.getOptions ( )  :  String[ ]
Ranker.getStartSet ( )  :  String
Ranker.getThreshold ( )  :  double
Ranker.globalInfo ( )  :  String
Ranker.listOptions ( )  :  Enumeration
Ranker.numToSelectTipText ( )  :  String
Ranker.rankedAttributes ( )  :  double[ ][ ]
Ranker.Ranker ( )
Ranker.resetOptions ( )  :  void
Ranker.search ( attributeSelection.ASEvaluation p1, Instances p2 )  :  int[ ]
Ranker.setGenerateRanking ( boolean p1 )  :  void
Ranker.setNumToSelect ( int p1 )  :  void
Ranker.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
Ranker.setStartSet ( String p1 )  :  void
Ranker.setThreshold ( double p1 )  :  void
Ranker.startSetTipText ( )  :  String
Ranker.thresholdTipText ( )  :  String
Ranker.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, RankSearch.class
package weka.attributeSelection
RankSearch.attributeEvaluatorTipText ( )  :  String
RankSearch.getAttributeEvaluator ( )  :  attributeSelection.ASEvaluation
RankSearch.getOptions ( )  :  String[ ]
RankSearch.globalInfo ( )  :  String
RankSearch.listOptions ( )  :  Enumeration
RankSearch.RankSearch ( )
RankSearch.resetOptions ( )  :  void
RankSearch.search ( attributeSelection.ASEvaluation p1, Instances p2 )  :  int[ ]
RankSearch.setAttributeEvaluator ( attributeSelection.ASEvaluation p1 )  :  void
RankSearch.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
RankSearch.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, RBFKernel.class
package weka.classifiers.functions.supportVector
RBFKernel.evaluate ( int p1, int p2, Instance p3 )  :  double
RBFKernel.RBFKernel ( Instances p1, int p2, double p3 )

cdk-1.0.1.jar, RBFNetwork.class
package weka.classifiers.functions
RBFNetwork.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
RBFNetwork.clusteringSeedTipText ( )  :  String
RBFNetwork.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
RBFNetwork.getClusteringSeed ( )  :  int
RBFNetwork.getMaxIts ( )  :  int
RBFNetwork.getMinStdDev ( )  :  double
RBFNetwork.getNumClusters ( )  :  int
RBFNetwork.getOptions ( )  :  String[ ]
RBFNetwork.getRidge ( )  :  double
RBFNetwork.globalInfo ( )  :  String
RBFNetwork.listOptions ( )  :  Enumeration
RBFNetwork.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
RBFNetwork.maxItsTipText ( )  :  String
RBFNetwork.minStdDevTipText ( )  :  String
RBFNetwork.numClustersTipText ( )  :  String
RBFNetwork.RBFNetwork ( )
RBFNetwork.ridgeTipText ( )  :  String
RBFNetwork.setClusteringSeed ( int p1 )  :  void
RBFNetwork.setMaxIts ( int p1 )  :  void
RBFNetwork.setMinStdDev ( double p1 )  :  void
RBFNetwork.setNumClusters ( int p1 )  :  void
RBFNetwork.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
RBFNetwork.setRidge ( double p1 )  :  void
RBFNetwork.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, RDG1.class
package weka.datagenerators
RDG1.defineDataFormat ( )  :  Instances
RDG1.generateExample ( )  :  Instance
RDG1.generateExamples ( )  :  Instances
RDG1.generateExamples ( int p1, Random p2, Instances p3 )  :  Instances
RDG1.generateFinished ( )  :  String
RDG1.getAttList_Irr ( )  :  boolean[ ]
RDG1.getDatasetFormat ( )  :  Instances
RDG1.getMaxRuleSize ( )  :  int
RDG1.getMinRuleSize ( )  :  int
RDG1.getNumIrrelevant ( )  :  int
RDG1.getNumNumeric ( )  :  int
RDG1.getOptions ( )  :  String[ ]
RDG1.getRandom ( )  :  Random
RDG1.getSeed ( )  :  int
RDG1.getSingleModeFlag ( )  :  boolean
RDG1.getVoteFlag ( )  :  boolean
RDG1.globalInfo ( )  :  String
RDG1.listOptions ( )  :  Enumeration
RDG1.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
RDG1.RDG1 ( )
RDG1.setAttList_Irr ( boolean[ ] p1 )  :  void
RDG1.setDatasetFormat ( Instances p1 )  :  void
RDG1.setMaxRuleSize ( int p1 )  :  void
RDG1.setMinRuleSize ( int p1 )  :  void
RDG1.setNumIrrelevant ( int p1 )  :  void
RDG1.setNumNumeric ( int p1 )  :  void
RDG1.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
RDG1.setRandom ( Random p1 )  :  void
RDG1.setSeed ( int p1 )  :  void
RDG1.setVoteFlag ( boolean p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ReactionBalancer.class
package org.openscience.cdk.reaction.type
ReactionBalancer.addMoleculeHashs ( IMoleculeSet som, int side, Hashtable hash )  :  void
ReactionBalancer.addMoleculeToBalanceElement ( Molecule mol, String element )  :  void
ReactionBalancer.balance ( Reaction reaction )  :  boolean
ReactionBalancer.balanceCharge ( Molecule mol )  :  void
ReactionBalancer.balanceMoleculeSet ( IMoleculeSet som, double elementCount, Molecule mol )  :  void
ReactionBalancer.balanceMoleculeSet ( IMoleculeSet som, double elementCount, Molecule mol, int molPosition )  :  void
ReactionBalancer.containsOnlyOH ( Hashtable hash )  :  boolean
ReactionBalancer.getDiffHashtable ( )  :  Hashtable
ReactionBalancer.getMoleculePosition ( IMoleculeSet som, Molecule mol )  :  int
ReactionBalancer.getReaction ( )  :  Reaction
ReactionBalancer.isBalanced ( Reaction reaction )  :  boolean
ReactionBalancer.makeDiffHashtable ( )  :  void
ReactionBalancer.permutateStoichiometries ( double max )  :  boolean
ReactionBalancer.ReactionBalancer ( )
ReactionBalancer.removeZeroEntries ( Hashtable hash )  :  void
ReactionBalancer.updateDiffHashtable ( double elementCount, Map hash )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ReferenceInstances.class
package weka.classifiers.trees.adtree
ReferenceInstances.addReference ( Instance p1 )  :  void
ReferenceInstances.ReferenceInstances ( Instances p1, int p2 )

cdk-1.0.1.jar, RegressionByDiscretization.class
package weka.classifiers.meta
RegressionByDiscretization.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
RegressionByDiscretization.classifyInstance ( Instance p1 )  :  double
RegressionByDiscretization.defaultClassifierString ( )  :  String
RegressionByDiscretization.getNumBins ( )  :  int
RegressionByDiscretization.getOptions ( )  :  String[ ]
RegressionByDiscretization.globalInfo ( )  :  String
RegressionByDiscretization.listOptions ( )  :  Enumeration
RegressionByDiscretization.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
RegressionByDiscretization.numBinsTipText ( )  :  String
RegressionByDiscretization.RegressionByDiscretization ( )
RegressionByDiscretization.setNumBins ( int p1 )  :  void
RegressionByDiscretization.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
RegressionByDiscretization.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, RegressionSplitEvaluator.class
package weka.experiment
RegressionSplitEvaluator.classifierTipText ( )  :  String
RegressionSplitEvaluator.enumerateMeasures ( )  :  Enumeration
RegressionSplitEvaluator.getClassifier ( )  :  Classifier
RegressionSplitEvaluator.getKey ( )  :  Object[ ]
RegressionSplitEvaluator.getKeyNames ( )  :  String[ ]
RegressionSplitEvaluator.getKeyTypes ( )  :  Object[ ]
RegressionSplitEvaluator.getMeasure ( String p1 )  :  double
RegressionSplitEvaluator.getOptions ( )  :  String[ ]
RegressionSplitEvaluator.getRawResultOutput ( )  :  String
RegressionSplitEvaluator.getResult ( Instances p1, Instances p2 )  :  Object[ ]
RegressionSplitEvaluator.getResultNames ( )  :  String[ ]
RegressionSplitEvaluator.getResultTypes ( )  :  Object[ ]
RegressionSplitEvaluator.globalInfo ( )  :  String
RegressionSplitEvaluator.listOptions ( )  :  Enumeration
RegressionSplitEvaluator.RegressionSplitEvaluator ( )
RegressionSplitEvaluator.setAdditionalMeasures ( String[ ] p1 )  :  void
RegressionSplitEvaluator.setClassifier ( Classifier p1 )  :  void
RegressionSplitEvaluator.setClassifierName ( String p1 )  :  void
RegressionSplitEvaluator.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
RegressionSplitEvaluator.toString ( )  :  String
RegressionSplitEvaluator.updateOptions ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ReliefFAttributeEval.class
package weka.attributeSelection
ReliefFAttributeEval.buildEvaluator ( Instances p1 )  :  void
ReliefFAttributeEval.evaluateAttribute ( int p1 )  :  double
ReliefFAttributeEval.getNumNeighbours ( )  :  int
ReliefFAttributeEval.getOptions ( )  :  String[ ]
ReliefFAttributeEval.getSampleSize ( )  :  int
ReliefFAttributeEval.getSeed ( )  :  int
ReliefFAttributeEval.getSigma ( )  :  int
ReliefFAttributeEval.getWeightByDistance ( )  :  boolean
ReliefFAttributeEval.globalInfo ( )  :  String
ReliefFAttributeEval.listOptions ( )  :  Enumeration
ReliefFAttributeEval.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
ReliefFAttributeEval.numNeighboursTipText ( )  :  String
ReliefFAttributeEval.ReliefFAttributeEval ( )
ReliefFAttributeEval.resetOptions ( )  :  void
ReliefFAttributeEval.sampleSizeTipText ( )  :  String
ReliefFAttributeEval.seedTipText ( )  :  String
ReliefFAttributeEval.setNumNeighbours ( int p1 )  :  void
ReliefFAttributeEval.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
ReliefFAttributeEval.setSampleSize ( int p1 )  :  void
ReliefFAttributeEval.setSeed ( int p1 )  :  void
ReliefFAttributeEval.setSigma ( int p1 )  :  void
ReliefFAttributeEval.setWeightByDistance ( boolean p1 )  :  void
ReliefFAttributeEval.sigmaTipText ( )  :  String
ReliefFAttributeEval.toString ( )  :  String
ReliefFAttributeEval.weightByDistanceTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, RemoteBoundaryVisualizerSubTask.class
package weka.gui.boundaryvisualizer
RemoteBoundaryVisualizerSubTask.execute ( )  :  void
RemoteBoundaryVisualizerSubTask.getTaskStatus ( )  :  TaskStatusInfo
RemoteBoundaryVisualizerSubTask.RemoteBoundaryVisualizerSubTask ( )
RemoteBoundaryVisualizerSubTask.setClassifier ( Classifier p1 )  :  void
RemoteBoundaryVisualizerSubTask.setDataGenerator ( DataGenerator p1 )  :  void
RemoteBoundaryVisualizerSubTask.setGeneratorSamplesBase ( double p1 )  :  void
RemoteBoundaryVisualizerSubTask.setInstances ( Instances p1 )  :  void
RemoteBoundaryVisualizerSubTask.setMinMaxX ( double p1, double p2 )  :  void
RemoteBoundaryVisualizerSubTask.setMinMaxY ( double p1, double p2 )  :  void
RemoteBoundaryVisualizerSubTask.setNumSamplesPerRegion ( int p1 )  :  void
RemoteBoundaryVisualizerSubTask.setPanelHeight ( int p1 )  :  void
RemoteBoundaryVisualizerSubTask.setPanelWidth ( int p1 )  :  void
RemoteBoundaryVisualizerSubTask.setPixHeight ( double p1 )  :  void
RemoteBoundaryVisualizerSubTask.setPixWidth ( double p1 )  :  void
RemoteBoundaryVisualizerSubTask.setRowNumber ( int p1 )  :  void
RemoteBoundaryVisualizerSubTask.setXAttribute ( int p1 )  :  void
RemoteBoundaryVisualizerSubTask.setYAttribute ( int p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, RemoteEngine.class
package weka.experiment
RemoteEngine.checkStatus ( Object p1 )  :  Object
RemoteEngine.executeTask ( Task p1 )  :  Object
RemoteEngine.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
RemoteEngine.RemoteEngine ( String p1 )

cdk-1.0.1.jar, RemoteEngine_Skel.class
package weka.experiment
RemoteEngine_Skel.dispatch ( Remote p1, RemoteCall p2, int p3, long p4 )  :  void
RemoteEngine_Skel.getOperations ( )  :  Operation[ ]
RemoteEngine_Skel.RemoteEngine_Skel ( )

cdk-1.0.1.jar, RemoteEngine_Stub.class
package weka.experiment
RemoteEngine_Stub.checkStatus ( Object p1 )  :  Object
RemoteEngine_Stub.executeTask ( Task p1 )  :  Object
RemoteEngine_Stub.RemoteEngine_Stub ( )
RemoteEngine_Stub.RemoteEngine_Stub ( RemoteRef p1 )

cdk-1.0.1.jar, RemoteExperiment.class
package weka.experiment
RemoteExperiment.abortExperiment ( )  :  void
RemoteExperiment.addRemoteExperimentListener ( RemoteExperimentListener p1 )  :  void
RemoteExperiment.addRemoteHost ( String p1 )  :  void
RemoteExperiment.advanceCounters ( )  :  void
RemoteExperiment.availableHost ( int p1 )  :  void
RemoteExperiment.getBaseExperiment ( )  :  Experiment
RemoteExperiment.getRemoteHosts ( )  :  DefaultListModel
RemoteExperiment.getSplitByDataSet ( )  :  boolean
RemoteExperiment.incrementFailed ( int p1 )  :  void
RemoteExperiment.incrementFinished ( )  :  void
RemoteExperiment.initialize ( )  :  void
RemoteExperiment.launchNext ( int p1, int p2 )  :  void
RemoteExperiment.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
RemoteExperiment.nextIteration ( )  :  void
RemoteExperiment.postProcess ( )  :  void
RemoteExperiment.RemoteExperiment ( )
RemoteExperiment.RemoteExperiment ( Experiment p1 )
RemoteExperiment.runExperiment ( )  :  void
RemoteExperiment.setBaseExperiment ( Experiment p1 )  :  void
RemoteExperiment.setDatasets ( DefaultListModel p1 )  :  void
RemoteExperiment.setNotes ( String p1 )  :  void
RemoteExperiment.setPropertyArray ( Object p1 )  :  void
RemoteExperiment.setPropertyPath ( PropertyNode[ ] p1 )  :  void
RemoteExperiment.setRemoteHosts ( DefaultListModel p1 )  :  void
RemoteExperiment.setResultListener ( ResultListener p1 )  :  void
RemoteExperiment.setResultProducer ( ResultProducer p1 )  :  void
RemoteExperiment.setRunLower ( int p1 )  :  void
RemoteExperiment.setRunUpper ( int p1 )  :  void
RemoteExperiment.setSplitByDataSet ( boolean p1 )  :  void
RemoteExperiment.setUsePropertyIterator ( boolean p1 )  :  void
RemoteExperiment.toString ( )  :  String
RemoteExperiment.waitingExperiment ( int p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, RemoteExperimentEvent.class
package weka.experiment
RemoteExperimentEvent.RemoteExperimentEvent ( boolean p1, boolean p2, boolean p3, String p4 )

cdk-1.0.1.jar, RemoteExperimentListener.class
package weka.experiment
RemoteExperimentListener.remoteExperimentStatus ( RemoteExperimentEvent p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, RemoteExperimentSubTask.class
package weka.experiment
RemoteExperimentSubTask.execute ( )  :  void
RemoteExperimentSubTask.getExperiment ( )  :  Experiment
RemoteExperimentSubTask.getTaskStatus ( )  :  TaskStatusInfo
RemoteExperimentSubTask.RemoteExperimentSubTask ( )
RemoteExperimentSubTask.setExperiment ( Experiment p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, RemoteResult.class
package weka.gui.boundaryvisualizer
RemoteResult.getPercentCompleted ( )  :  int
RemoteResult.getProbabilities ( )  :  double[ ][ ]
RemoteResult.RemoteResult ( int p1, int p2 )
RemoteResult.setLocationProbs ( int p1, double[ ] p2 )  :  void
RemoteResult.setPercentCompleted ( int p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, Remove.class
package weka.filters.unsupervised.attribute
Remove.attributeIndicesTipText ( )  :  String
Remove.getAttributeIndices ( )  :  String
Remove.getInvertSelection ( )  :  boolean
Remove.getOptions ( )  :  String[ ]
Remove.globalInfo ( )  :  String
Remove.input ( Instance p1 )  :  boolean
Remove.invertSelectionTipText ( )  :  String
Remove.listOptions ( )  :  Enumeration
Remove.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Remove.Remove ( )
Remove.setAttributeIndices ( String p1 )  :  void
Remove.setAttributeIndicesArray ( int[ ] p1 )  :  void
Remove.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
Remove.setInvertSelection ( boolean p1 )  :  void
Remove.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, RemoveFolds.class
package weka.filters.unsupervised.instance
RemoveFolds.batchFinished ( )  :  boolean
RemoveFolds.foldTipText ( )  :  String
RemoveFolds.getFold ( )  :  int
RemoveFolds.getInvertSelection ( )  :  boolean
RemoveFolds.getNumFolds ( )  :  int
RemoveFolds.getOptions ( )  :  String[ ]
RemoveFolds.getSeed ( )  :  long
RemoveFolds.globalInfo ( )  :  String
RemoveFolds.invertSelectionTipText ( )  :  String
RemoveFolds.listOptions ( )  :  Enumeration
RemoveFolds.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
RemoveFolds.numFoldsTipText ( )  :  String
RemoveFolds.RemoveFolds ( )
RemoveFolds.seedTipText ( )  :  String
RemoveFolds.setFold ( int p1 )  :  void
RemoveFolds.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
RemoveFolds.setInvertSelection ( boolean p1 )  :  void
RemoveFolds.setNumFolds ( int p1 )  :  void
RemoveFolds.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
RemoveFolds.setSeed ( long p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, RemoveMisclassified.class
package weka.filters.unsupervised.instance
RemoveMisclassified.batchFinished ( )  :  boolean
RemoveMisclassified.classifierTipText ( )  :  String
RemoveMisclassified.classIndexTipText ( )  :  String
RemoveMisclassified.getClassifier ( )  :  Classifier
RemoveMisclassified.getClassifierSpec ( )  :  String
RemoveMisclassified.getClassIndex ( )  :  int
RemoveMisclassified.getInvert ( )  :  boolean
RemoveMisclassified.getMaxIterations ( )  :  int
RemoveMisclassified.getNumFolds ( )  :  int
RemoveMisclassified.getOptions ( )  :  String[ ]
RemoveMisclassified.getThreshold ( )  :  double
RemoveMisclassified.globalInfo ( )  :  String
RemoveMisclassified.input ( Instance p1 )  :  boolean
RemoveMisclassified.invertTipText ( )  :  String
RemoveMisclassified.listOptions ( )  :  Enumeration
RemoveMisclassified.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
RemoveMisclassified.maxIterationsTipText ( )  :  String
RemoveMisclassified.numFoldsTipText ( )  :  String
RemoveMisclassified.RemoveMisclassified ( )
RemoveMisclassified.setClassifier ( Classifier p1 )  :  void
RemoveMisclassified.setClassIndex ( int p1 )  :  void
RemoveMisclassified.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
RemoveMisclassified.setInvert ( boolean p1 )  :  void
RemoveMisclassified.setMaxIterations ( int p1 )  :  void
RemoveMisclassified.setNumFolds ( int p1 )  :  void
RemoveMisclassified.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
RemoveMisclassified.setThreshold ( double p1 )  :  void
RemoveMisclassified.thresholdTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, RemovePercentage.class
package weka.filters.unsupervised.instance
RemovePercentage.batchFinished ( )  :  boolean
RemovePercentage.getInvertSelection ( )  :  boolean
RemovePercentage.getOptions ( )  :  String[ ]
RemovePercentage.getPercentage ( )  :  int
RemovePercentage.globalInfo ( )  :  String
RemovePercentage.invertSelectionTipText ( )  :  String
RemovePercentage.listOptions ( )  :  Enumeration
RemovePercentage.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
RemovePercentage.percentageTipText ( )  :  String
RemovePercentage.RemovePercentage ( )
RemovePercentage.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
RemovePercentage.setInvertSelection ( boolean p1 )  :  void
RemovePercentage.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
RemovePercentage.setPercentage ( int p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, RemoveRange.class
package weka.filters.unsupervised.instance
RemoveRange.batchFinished ( )  :  boolean
RemoveRange.getInstancesIndices ( )  :  String
RemoveRange.getInvertSelection ( )  :  boolean
RemoveRange.getOptions ( )  :  String[ ]
RemoveRange.globalInfo ( )  :  String
RemoveRange.instancesIndicesTipText ( )  :  String
RemoveRange.invertSelectionTipText ( )  :  String
RemoveRange.listOptions ( )  :  Enumeration
RemoveRange.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
RemoveRange.RemoveRange ( )
RemoveRange.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
RemoveRange.setInstancesIndices ( String p1 )  :  void
RemoveRange.setInvertSelection ( boolean p1 )  :  void
RemoveRange.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, RemoveType.class
package weka.filters.unsupervised.attribute
RemoveType.attributeTypeTipText ( )  :  String
RemoveType.batchFinished ( )  :  boolean
RemoveType.getAttributeType ( )  :  SelectedTag
RemoveType.getAttributeTypeString ( )  :  String
RemoveType.getInvertSelection ( )  :  boolean
RemoveType.getOptions ( )  :  String[ ]
RemoveType.globalInfo ( )  :  String
RemoveType.input ( Instance p1 )  :  boolean
RemoveType.invertSelectionTipText ( )  :  String
RemoveType.isOutputFormatDefined ( )  :  boolean
RemoveType.listOptions ( )  :  Enumeration
RemoveType.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
RemoveType.numPendingOutput ( )  :  int
RemoveType.output ( )  :  Instance
RemoveType.outputPeek ( )  :  Instance
RemoveType.RemoveType ( )
RemoveType.setAttributeType ( SelectedTag p1 )  :  void
RemoveType.setAttributeTypeString ( String p1 )  :  void
RemoveType.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
RemoveType.setInvertSelection ( boolean p1 )  :  void
RemoveType.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, RemoveUseless.class
package weka.filters.unsupervised.attribute
RemoveUseless.batchFinished ( )  :  boolean
RemoveUseless.getMaximumVariancePercentageAllowed ( )  :  double
RemoveUseless.getOptions ( )  :  String[ ]
RemoveUseless.globalInfo ( )  :  String
RemoveUseless.input ( Instance p1 )  :  boolean
RemoveUseless.listOptions ( )  :  Enumeration
RemoveUseless.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
RemoveUseless.maximumVariancePercentageAllowedTipText ( )  :  String
RemoveUseless.RemoveUseless ( )
RemoveUseless.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
RemoveUseless.setMaximumVariancePercentageAllowed ( double p1 )  :  void
RemoveUseless.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, RemoveWithValues.class
package weka.filters.unsupervised.instance
RemoveWithValues.attributeIndexTipText ( )  :  String
RemoveWithValues.getAttributeIndex ( )  :  String
RemoveWithValues.getInvertSelection ( )  :  boolean
RemoveWithValues.getMatchMissingValues ( )  :  boolean
RemoveWithValues.getModifyHeader ( )  :  boolean
RemoveWithValues.getNominalIndices ( )  :  String
RemoveWithValues.getOptions ( )  :  String[ ]
RemoveWithValues.getSplitPoint ( )  :  double
RemoveWithValues.globalInfo ( )  :  String
RemoveWithValues.input ( Instance p1 )  :  boolean
RemoveWithValues.invertSelectionTipText ( )  :  String
RemoveWithValues.isNominal ( )  :  boolean
RemoveWithValues.isNumeric ( )  :  boolean
RemoveWithValues.listOptions ( )  :  Enumeration
RemoveWithValues.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
RemoveWithValues.matchMissingValuesTipText ( )  :  String
RemoveWithValues.modifyHeaderTipText ( )  :  String
RemoveWithValues.nominalIndicesTipText ( )  :  String
RemoveWithValues.RemoveWithValues ( )
RemoveWithValues.setAttributeIndex ( String p1 )  :  void
RemoveWithValues.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
RemoveWithValues.setInvertSelection ( boolean p1 )  :  void
RemoveWithValues.setMatchMissingValues ( boolean p1 )  :  void
RemoveWithValues.setModifyHeader ( boolean p1 )  :  void
RemoveWithValues.setNominalIndices ( String p1 )  :  void
RemoveWithValues.setNominalIndicesArr ( int[ ] p1 )  :  void
RemoveWithValues.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
RemoveWithValues.setSplitPoint ( double p1 )  :  void
RemoveWithValues.splitPointTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, Renderer2DModelEditor.class
package org.openscience.cdk.applications.swing.editor
Renderer2DModelEditor.actionPerformed ( ActionEvent e )  :  void
Renderer2DModelEditor.applyChanges ( )  :  void
Renderer2DModelEditor.Renderer2DModelEditor ( JFrame frame )
Renderer2DModelEditor.setModel ( Renderer2DModel model )  :  void

cdk-1.0.1.jar, RepeatedHillClimber.class
package weka.classifiers.bayes.net.search.global
RepeatedHillClimber.getOptions ( )  :  String[ ]
RepeatedHillClimber.getRuns ( )  :  int
RepeatedHillClimber.getSeed ( )  :  int
RepeatedHillClimber.globalInfo ( )  :  String
RepeatedHillClimber.listOptions ( )  :  Enumeration
RepeatedHillClimber.RepeatedHillClimber ( )
RepeatedHillClimber.runsTipText ( )  :  String
RepeatedHillClimber.search ( BayesNet p1, Instances p2 )  :  void
RepeatedHillClimber.seedTipText ( )  :  String
RepeatedHillClimber.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
RepeatedHillClimber.setRuns ( int p1 )  :  void
RepeatedHillClimber.setSeed ( int p1 )  :  void
package weka.classifiers.bayes.net.search.local
RepeatedHillClimber.getOptions ( )  :  String[ ]
RepeatedHillClimber.getRuns ( )  :  int
RepeatedHillClimber.getSeed ( )  :  int
RepeatedHillClimber.globalInfo ( )  :  String
RepeatedHillClimber.listOptions ( )  :  Enumeration
RepeatedHillClimber.RepeatedHillClimber ( )
RepeatedHillClimber.runsTipText ( )  :  String
RepeatedHillClimber.search ( BayesNet p1, Instances p2 )  :  void
RepeatedHillClimber.seedTipText ( )  :  String
RepeatedHillClimber.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
RepeatedHillClimber.setRuns ( int p1 )  :  void
RepeatedHillClimber.setSeed ( int p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ReplaceMissingValues.class
package weka.filters.unsupervised.attribute
ReplaceMissingValues.batchFinished ( )  :  boolean
ReplaceMissingValues.globalInfo ( )  :  String
ReplaceMissingValues.input ( Instance p1 )  :  boolean
ReplaceMissingValues.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
ReplaceMissingValues.ReplaceMissingValues ( )
ReplaceMissingValues.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean

cdk-1.0.1.jar, REPTree.class
package weka.classifiers.trees
REPTree.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
REPTree.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
REPTree.enumerateMeasures ( )  :  Enumeration
REPTree.getMaxDepth ( )  :  int
REPTree.getMeasure ( String p1 )  :  double
REPTree.getMinNum ( )  :  double
REPTree.getMinVarianceProp ( )  :  double
REPTree.getNoPruning ( )  :  boolean
REPTree.getNumFolds ( )  :  int
REPTree.getOptions ( )  :  String[ ]
REPTree.getSeed ( )  :  int
REPTree.globalInfo ( )  :  String
REPTree.graph ( )  :  String
REPTree.graphType ( )  :  int
REPTree.listOptions ( )  :  Enumeration
REPTree.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
REPTree.maxDepthTipText ( )  :  String
REPTree.minNumTipText ( )  :  String
REPTree.minVariancePropTipText ( )  :  String
REPTree.nextID ( ) [static]  :  long
REPTree.noPruningTipText ( )  :  String
REPTree.numFoldsTipText ( )  :  String
REPTree.numNodes ( )  :  int
REPTree.REPTree ( )
REPTree.resetID ( ) [static]  :  void
REPTree.seedTipText ( )  :  String
REPTree.setMaxDepth ( int p1 )  :  void
REPTree.setMinNum ( double p1 )  :  void
REPTree.setMinVarianceProp ( double p1 )  :  void
REPTree.setNoPruning ( boolean p1 )  :  void
REPTree.setNumFolds ( int p1 )  :  void
REPTree.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
REPTree.setSeed ( int p1 )  :  void
REPTree.toSource ( String p1 )  :  String
REPTree.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, Resample.class
package weka.filters.supervised.instance
Resample.batchFinished ( )  :  boolean
Resample.biasToUniformClassTipText ( )  :  String
Resample.getBiasToUniformClass ( )  :  double
Resample.getOptions ( )  :  String[ ]
Resample.getRandomSeed ( )  :  int
Resample.getSampleSizePercent ( )  :  double
Resample.globalInfo ( )  :  String
Resample.input ( Instance p1 )  :  boolean
Resample.listOptions ( )  :  Enumeration
Resample.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Resample.randomSeedTipText ( )  :  String
Resample.Resample ( )
Resample.sampeSizePercentTipText ( )  :  String
Resample.setBiasToUniformClass ( double p1 )  :  void
Resample.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
Resample.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
Resample.setRandomSeed ( int p1 )  :  void
Resample.setSampleSizePercent ( double p1 )  :  void
package weka.filters.unsupervised.instance
Resample.batchFinished ( )  :  boolean
Resample.getOptions ( )  :  String[ ]
Resample.getRandomSeed ( )  :  int
Resample.getSampleSizePercent ( )  :  double
Resample.globalInfo ( )  :  String
Resample.input ( Instance p1 )  :  boolean
Resample.listOptions ( )  :  Enumeration
Resample.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Resample.randomSeedTipText ( )  :  String
Resample.Resample ( )
Resample.sampleSizePercentTipText ( )  :  String
Resample.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
Resample.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
Resample.setRandomSeed ( int p1 )  :  void
Resample.setSampleSizePercent ( double p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ResidualModelSelection.class
package weka.classifiers.trees.lmt
ResidualModelSelection.cleanup ( )  :  void
ResidualModelSelection.ResidualModelSelection ( int p1 )
ResidualModelSelection.selectModel ( Instances p1 )  :  ClassifierSplitModel
ResidualModelSelection.selectModel ( Instances p1, double[ ][ ] p2, double[ ][ ] p3 )  :  ClassifierSplitModel
ResidualModelSelection.selectModel ( Instances p1, Instances p2 )  :  ClassifierSplitModel

cdk-1.0.1.jar, ResidualSplit.class
package weka.classifiers.trees.lmt
ResidualSplit.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
ResidualSplit.buildClassifier ( Instances p1, double[ ][ ] p2, double[ ][ ] p3 )  :  void
ResidualSplit.checkModel ( int p1 )  :  boolean
ResidualSplit.entropy ( double[ ][ ] p1, double[ ][ ] p2 )  :  double
ResidualSplit.entropyGain ( )  :  double
ResidualSplit.getSplitPoint ( )  :  boolean
ResidualSplit.leftSide ( Instances p1 )  :  String
ResidualSplit.ResidualSplit ( int p1 )
ResidualSplit.rightSide ( int p1, Instances p2 )  :  String
ResidualSplit.sourceExpression ( int p1, Instances p2 )  :  String
ResidualSplit.weights ( Instance p1 )  :  double[ ]
ResidualSplit.whichSubset ( Instance p1 )  :  int

cdk-1.0.1.jar, ResultHistoryPanel.class
package weka.gui
ResultHistoryPanel.addObject ( String p1, Object p2 )  :  void
ResultHistoryPanel.addResult ( String p1, StringBuffer p2 )  :  void
ResultHistoryPanel.getList ( )  :  JList
ResultHistoryPanel.getNameAtIndex ( int p1 )  :  String
ResultHistoryPanel.getNamedBuffer ( String p1 )  :  StringBuffer
ResultHistoryPanel.getNamedObject ( String p1 )  :  Object
ResultHistoryPanel.getSelectedBuffer ( )  :  StringBuffer
ResultHistoryPanel.getSelectedName ( )  :  String
ResultHistoryPanel.getSelectedObject ( )  :  Object
ResultHistoryPanel.getSelectionModel ( )  :  ListSelectionModel
ResultHistoryPanel.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
ResultHistoryPanel.openFrame ( String p1 )  :  void
ResultHistoryPanel.removeResult ( String p1 )  :  void
ResultHistoryPanel.ResultHistoryPanel ( JTextComponent p1 )
ResultHistoryPanel.setHandleRightClicks ( boolean p1 )  :  void
ResultHistoryPanel.setSingle ( String p1 )  :  void
ResultHistoryPanel.updateResult ( String p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ResultListener.class
package weka.experiment
ResultListener.acceptResult ( ResultProducer p1, Object[ ] p2, Object[ ] p3 ) [abstract]  :  void
ResultListener.determineColumnConstraints ( ResultProducer p1 ) [abstract]  :  String[ ]
ResultListener.isResultRequired ( ResultProducer p1, Object[ ] p2 ) [abstract]  :  boolean
ResultListener.postProcess ( ResultProducer p1 ) [abstract]  :  void
ResultListener.preProcess ( ResultProducer p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, ResultProducer.class
package weka.experiment
ResultProducer.doRun ( int p1 ) [abstract]  :  void
ResultProducer.doRunKeys ( int p1 ) [abstract]  :  void
ResultProducer.getCompatibilityState ( ) [abstract]  :  String
ResultProducer.getKeyNames ( ) [abstract]  :  String[ ]
ResultProducer.getKeyTypes ( ) [abstract]  :  Object[ ]
ResultProducer.getResultNames ( ) [abstract]  :  String[ ]
ResultProducer.getResultTypes ( ) [abstract]  :  Object[ ]
ResultProducer.postProcess ( ) [abstract]  :  void
ResultProducer.preProcess ( ) [abstract]  :  void
ResultProducer.setAdditionalMeasures ( String[ ] p1 ) [abstract]  :  void
ResultProducer.setInstances ( Instances p1 ) [abstract]  :  void
ResultProducer.setResultListener ( ResultListener p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, Resultset.class
package weka.experiment
PairedTTester.Resultset.add ( Instance p1 )  :  void
PairedTTester.Resultset.dataset ( Instance p1 )  :  FastVector
PairedTTester.Resultset.matchesTemplate ( Instance p1 )  :  boolean
PairedTTester.Resultset.PairedTTester.Resultset ( PairedTTester p1, Instance p2 )
PairedTTester.Resultset.sort ( int p1 )  :  void
PairedTTester.Resultset.templateString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, ResultsPanel.class
package weka.gui.experiment
ResultsPanel.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
ResultsPanel.performTest ( )  :  void
ResultsPanel.ResultsPanel ( )
ResultsPanel.saveBuffer ( )  :  void
ResultsPanel.setComboSizes ( )  :  void
ResultsPanel.setDatasetKeyFromDialog ( )  :  void
ResultsPanel.setDisplayedFromDialog ( )  :  void
ResultsPanel.setExperiment ( Experiment p1 )  :  void
ResultsPanel.setInstances ( Instances p1 )  :  void
ResultsPanel.setInstancesFromDatabaseTable ( String p1 )  :  void
ResultsPanel.setInstancesFromDBaseQuery ( )  :  void
ResultsPanel.setInstancesFromExp ( Experiment p1 )  :  void
ResultsPanel.setInstancesFromFile ( File p1 )  :  void
ResultsPanel.setOutputFormatFromDialog ( )  :  void
ResultsPanel.setResultKeyFromDialog ( )  :  void
ResultsPanel.setTestBaseFromDialog ( )  :  void
ResultsPanel.setTTester ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, Ridor.class
package weka.classifiers.rules
Ridor.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
Ridor.classifyInstance ( Instance p1 )  :  double
Ridor.enumerateMeasures ( )  :  Enumeration
Ridor.foldsTipText ( )  :  String
Ridor.getFolds ( )  :  int
Ridor.getMajorityClass ( )  :  boolean
Ridor.getMeasure ( String p1 )  :  double
Ridor.getMinNo ( )  :  double
Ridor.getOptions ( )  :  String[ ]
Ridor.getSeed ( )  :  int
Ridor.getShuffle ( )  :  int
Ridor.getWholeDataErr ( )  :  boolean
Ridor.globalInfo ( )  :  String
Ridor.listOptions ( )  :  Enumeration
Ridor.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Ridor.majorityClassTipText ( )  :  String
Ridor.minNoTipText ( )  :  String
Ridor.Ridor ( )
Ridor.seedTipText ( )  :  String
Ridor.setFolds ( int p1 )  :  void
Ridor.setMajorityClass ( boolean p1 )  :  void
Ridor.setMinNo ( double p1 )  :  void
Ridor.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
Ridor.setSeed ( int p1 )  :  void
Ridor.setShuffle ( int p1 )  :  void
Ridor.setWholeDataErr ( boolean p1 )  :  void
Ridor.shuffleTipText ( )  :  String
Ridor.toString ( )  :  String
Ridor.wholeDataErrTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, RingBond.class
package org.openscience.cdk.isomorphism.matchers.smarts
RingBond.matches ( IBond bond )  :  boolean
RingBond.RingBond ( )

cdk-1.0.1.jar, RingIdentifierAtom.class
package org.openscience.cdk.isomorphism.matchers.smarts
RingIdentifierAtom.getAtom ( )  :  IQueryAtom
RingIdentifierAtom.getRingBond ( )  :  IQueryBond
RingIdentifierAtom.matches ( IAtom atom )  :  boolean
RingIdentifierAtom.RingIdentifierAtom ( )
RingIdentifierAtom.setAtom ( IQueryAtom atom )  :  void
RingIdentifierAtom.setRingBond ( IQueryBond bond )  :  void

cdk-1.0.1.jar, RingMembershipAtom.class
package org.openscience.cdk.isomorphism.matchers.smarts
RingMembershipAtom.matches ( IAtom atom )  :  boolean
RingMembershipAtom.RingMembershipAtom ( int num )

cdk-1.0.1.jar, RipperRule.class
package weka.classifiers.rules
JRip.RipperRule.copy ( )  :  Object
JRip.RipperRule.covers ( Instance p1 )  :  boolean
JRip.RipperRule.getConsequent ( )  :  double
JRip.RipperRule.grow ( Instances p1 )  :  void
JRip.RipperRule.hasAntds ( )  :  boolean
JRip.RipperRule.JRip.RipperRule ( JRip p1 )
JRip.RipperRule.prune ( Instances p1, boolean p2 )  :  void
JRip.RipperRule.setConsequent ( double p1 )  :  void
JRip.RipperRule.size ( )  :  double
JRip.RipperRule.toString ( Attribute p1 )  :  String

cdk-1.0.1.jar, RKeyAdapter.class
package weka.gui
ResultHistoryPanel.RKeyAdapter.ResultHistoryPanel.RKeyAdapter ( )

cdk-1.0.1.jar, RModel.class
package org.openscience.cdk.qsar.model.R
RModel.build ( ) [abstract]  :  void
RModel.getModelName ( )  :  String
RModel.loadModel ( String p1 ) [abstract]  :  void
RModel.loadModel ( String p1, String p2 ) [abstract]  :  void
RModel.predict ( ) [abstract]  :  void
RModel.RModel ( )
RModel.RModel ( String[ ] args )
RModel.saveModel ( String modelname, String filename ) [static]  :  void
RModel.setModelName ( String newName )  :  void
RModel.setParameters ( String p1, Object p2 ) [abstract]  :  void
package org.openscience.cdk.qsar.model.R2
RModel.build ( ) [abstract]  :  void
RModel.finalize ( )  :  void
RModel.getModelName ( )  :  String
RModel.getModelObject ( )  :  JRI.RList
RModel.getRengine ( ) [static]  :  JRI.Rengine
RModel.getUniqueVariableName ( String prefix )  :  String
RModel.isOfClass ( String objectName, String objectClass )  :  boolean
RModel.loadModel ( String p1 ) [abstract]  :  void
RModel.loadModel ( String p1, String p2 ) [abstract]  :  void
RModel.loadParametersIntoRSession ( )  :  String
RModel.predict ( ) [abstract]  :  void
RModel.removeObject ( String objectName )  :  void
RModel.RModel ( )
RModel.saveModel ( String modelName, String fileName )  :  void
RModel.setModelName ( String newName )  :  void
RModel.setParameters ( String p1, Object p2 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, RMouseAdapter.class
package weka.gui
ResultHistoryPanel.RMouseAdapter.ResultHistoryPanel.RMouseAdapter ( )

cdk-1.0.1.jar, RTSI.class
package weka.core
RTSI.find ( String p1 ) [static]  :  Vector
RTSI.find ( String p1, Class p2 ) [static]  :  Vector
RTSI.find ( String p1, String p2 ) [static]  :  Vector
RTSI.getURL ( String p1, String p2 ) [static]  :  URL
RTSI.hasInterface ( Class p1, Class p2 ) [static]  :  boolean
RTSI.isSubclass ( Class p1, Class p2 ) [static]  :  boolean
RTSI.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
RTSI.RTSI ( )

cdk-1.0.1.jar, Rule.class
package weka.associations.tertius
Rule.bodyContains ( Literal p1 )  :  boolean
Rule.calculateConfirmation ( )  :  void
Rule.calculateOptimistic ( )  :  void
Rule.clone ( )  :  Object
Rule.counterInstance ( Instance p1 )  :  boolean
Rule.equivalentTo ( Rule p1 )  :  boolean
Rule.getConfirmation ( )  :  double
Rule.getExpectedFrequency ( )  :  double
Rule.getExpectedNumber ( )  :  double
Rule.getFPRate ( )  :  double
Rule.getObservedFrequency ( )  :  double
Rule.getObservedNumber ( )  :  int
Rule.getOptimistic ( )  :  double
Rule.getTPRate ( )  :  double
Rule.hasFalseHead ( )  :  boolean
Rule.hasTrueBody ( )  :  boolean
Rule.headContains ( Literal p1 )  :  boolean
Rule.isEmpty ( )  :  boolean
Rule.numLiterals ( )  :  int
Rule.overFrequencyThreshold ( double p1 )  :  boolean
Rule.refine ( ArrayList p1 )  :  SimpleLinkedList
Rule.rocToString ( )  :  String
Rule.Rule ( boolean p1, int p2, boolean p3, boolean p4, boolean p5, boolean p6 )
Rule.Rule ( Instances p1, boolean p2, int p3, boolean p4, boolean p5, boolean p6, boolean p7 )
Rule.sameClauseAs ( Rule p1 )  :  boolean
Rule.subsumes ( Rule p1 )  :  boolean
Rule.toString ( )  :  String
Rule.upDate ( Instances p1 )  :  void
Rule.valuesToString ( )  :  String
package weka.classifiers.rules
Rule.copy ( )  :  Object
Rule.covers ( Instance p1 ) [abstract]  :  boolean
Rule.getConsequent ( ) [abstract]  :  double
Rule.grow ( Instances p1 ) [abstract]  :  void
Rule.hasAntds ( ) [abstract]  :  boolean
Rule.Rule ( )
Rule.size ( ) [abstract]  :  double
package weka.classifiers.trees.m5
Rule.absDev ( int p1, Instances p2 ) [static]  :  double
Rule.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
Rule.classifyInstance ( Instance p1 )  :  double
Rule.getM5RootNode ( )  :  RuleNode
Rule.getMinNumInstances ( )  :  double
Rule.getRegressionTree ( )  :  boolean
Rule.getSmoothing ( )  :  boolean
Rule.getUnpruned ( )  :  boolean
Rule.getUseTree ( )  :  boolean
Rule.notCoveredInstances ( )  :  Instances
Rule.Rule ( )
Rule.setMinNumInstances ( double p1 )  :  void
Rule.setRegressionTree ( boolean p1 )  :  void
Rule.setSaveInstances ( boolean p1 )  :  void
Rule.setSmoothing ( boolean p1 )  :  void
Rule.setUnpruned ( boolean p1 )  :  void
Rule.setUseTree ( boolean p1 )  :  void
Rule.stdDev ( int p1, Instances p2 ) [static]  :  double
Rule.topOfTree ( )  :  RuleNode
Rule.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, RuleGeneration.class
package weka.associations
RuleGeneration.aSubsumesB ( RuleItem p1, RuleItem p2 ) [static]  :  boolean
RuleGeneration.binomialDistribution ( double p1, double p2, double p3 ) [static]  :  double
RuleGeneration.change ( )  :  boolean
RuleGeneration.count ( )  :  int
RuleGeneration.expectation ( double p1, int p2, double[ ] p3, Hashtable p4 ) [static]  :  double
RuleGeneration.generateRules ( int p1, double[ ] p2, Hashtable p3, double p4, Instances p5, TreeSet p6, int p7 )  :  TreeSet
RuleGeneration.removeRedundant ( RuleItem p1 )  :  boolean
RuleGeneration.RuleGeneration ( ItemSet p1 )
RuleGeneration.singleConsequence ( Instances p1, int p2, FastVector p3 ) [static]  :  FastVector

cdk-1.0.1.jar, RuleItem.class
package weka.associations
RuleItem.accuracy ( )  :  double
RuleItem.compareTo ( Object p1 )  :  int
RuleItem.consequence ( )  :  ItemSet
RuleItem.equals ( Object p1 )  :  boolean
RuleItem.generateRuleItem ( ItemSet p1, ItemSet p2, Instances p3, int p4, int p5, double[ ] p6, Hashtable p7 )  :  RuleItem
RuleItem.premise ( )  :  ItemSet
RuleItem.RuleItem ( )
RuleItem.RuleItem ( ItemSet p1, ItemSet p2, int p3, int p4, double[ ] p5, Hashtable p6 )
RuleItem.RuleItem ( RuleItem p1 )

cdk-1.0.1.jar, RuleNode.class
package weka.classifiers.trees.m5
RuleNode.assignIDs ( int p1 )  :  int
RuleNode.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
RuleNode.classifyInstance ( Instance p1 )  :  double
RuleNode.findBestLeaf ( double[ ] p1, RuleNode[ ] p2 )  :  void
RuleNode.getMinNumInstances ( )  :  double
RuleNode.getModel ( )  :  PreConstructedLinearModel
RuleNode.getNumInstances ( )  :  int
RuleNode.getRegressionTree ( )  :  boolean
RuleNode.graph ( StringBuffer p1 )  :  void
RuleNode.graphTree ( StringBuffer p1 )  :  void
RuleNode.installLinearModels ( )  :  void
RuleNode.installSmoothedModels ( )  :  void
RuleNode.isLeaf ( )  :  boolean
RuleNode.leftNode ( )  :  RuleNode
RuleNode.nodeToString ( )  :  String
RuleNode.numberOfLinearModels ( )  :  int
RuleNode.numLeaves ( int p1 )  :  int
RuleNode.parentNode ( )  :  RuleNode
RuleNode.printAllModels ( )  :  void
RuleNode.printLeafModels ( )  :  String
RuleNode.printNodeLinearModel ( )  :  String
RuleNode.prune ( )  :  void
RuleNode.returnLeaves ( FastVector[ ] p1 )  :  void
RuleNode.rightNode ( )  :  RuleNode
RuleNode.rootMeanSquaredError ( )  :  double
RuleNode.RuleNode ( double p1, double p2, RuleNode p3 )
RuleNode.setMinNumInstances ( double p1 )  :  void
RuleNode.setRegressionTree ( boolean p1 )  :  void
RuleNode.setSaveInstances ( boolean p1 )  :  void
RuleNode.smoothingOriginal ( double p1, double p2, double p3 ) [static]  :  double
RuleNode.split ( )  :  void
RuleNode.splitAtt ( )  :  int
RuleNode.splitVal ( )  :  double
RuleNode.toString ( )  :  String
RuleNode.treeToString ( int p1 )  :  String

cdk-1.0.1.jar, RuleStats.class
package weka.classifiers.rules
RuleStats.addAndUpdate ( Rule p1 )  :  void
RuleStats.combinedDL ( double p1, double p2 )  :  double
RuleStats.countData ( )  :  void
RuleStats.countData ( int p1, Instances p2, double[ ][ ] p3 )  :  void
RuleStats.dataDL ( double p1, double p2, double p3, double p4, double p5 ) [static]  :  double
RuleStats.getData ( )  :  Instances
RuleStats.getDistributions ( int p1 )  :  double[ ]
RuleStats.getFiltered ( int p1 )  :  Instances[ ]
RuleStats.getRuleset ( )  :  FastVector
RuleStats.getRulesetSize ( )  :  int
RuleStats.getSimpleStats ( int p1 )  :  double[ ]
RuleStats.minDataDLIfDeleted ( int p1, double p2, boolean p3 )  :  double
RuleStats.minDataDLIfExists ( int p1, double p2, boolean p3 )  :  double
RuleStats.numAllConditions ( Instances p1 ) [static]  :  double
RuleStats.partition ( Instances p1, int p2 ) [static]  :  Instances[ ]
RuleStats.potential ( int p1, double p2, double[ ] p3, double[ ] p4, boolean p5 )  :  double
RuleStats.reduceDL ( double p1, boolean p2 )  :  void
RuleStats.relativeDL ( int p1, double p2, boolean p3 )  :  double
RuleStats.removeLast ( )  :  void
RuleStats.rmCoveredBySuccessives ( Instances p1, FastVector p2, int p3 ) [static]  :  Instances
RuleStats.RuleStats ( )
RuleStats.RuleStats ( Instances p1, FastVector p2 )
RuleStats.setData ( Instances p1 )  :  void
RuleStats.setMDLTheoryWeight ( double p1 )  :  void
RuleStats.setNumAllConds ( double p1 )  :  void
RuleStats.setRuleset ( FastVector p1 )  :  void
RuleStats.stratify ( Instances p1, int p2, Random p3 ) [static]  :  Instances
RuleStats.subsetDL ( double p1, double p2, double p3 ) [static]  :  double
RuleStats.theoryDL ( int p1 )  :  double

cdk-1.0.1.jar, RunNumberPanel.class
package weka.gui.experiment
RunNumberPanel.getLower ( )  :  int
RunNumberPanel.getUpper ( )  :  int
RunNumberPanel.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
RunNumberPanel.RunNumberPanel ( )
RunNumberPanel.RunNumberPanel ( Experiment p1 )
RunNumberPanel.setExperiment ( Experiment p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, RunPanel.class
package weka.gui.experiment
RunPanel.actionPerformed ( ActionEvent p1 )  :  void
RunPanel.logMessage ( String p1 )  :  void
RunPanel.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
RunPanel.RunPanel ( )
RunPanel.RunPanel ( Experiment p1 )
RunPanel.setExperiment ( Experiment p1 )  :  void
RunPanel.setResultsPanel ( ResultsPanel p1 )  :  void
RunPanel.statusMessage ( String p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, SaveBuffer.class
package weka.gui
SaveBuffer.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
SaveBuffer.save ( StringBuffer p1 )  :  boolean
SaveBuffer.SaveBuffer ( Logger p1, Component p2 )

cdk-1.0.1.jar, Saver.class
package weka.core.converters
Saver.filePrefix ( ) [abstract]  :  String
Saver.getFileExtension ( ) [abstract]  :  String
Saver.getWriteMode ( ) [abstract]  :  int
Saver.retrieveDir ( ) [abstract]  :  String
Saver.setDestination ( File p1 ) [abstract]  :  void
Saver.setDestination ( OutputStream p1 ) [abstract]  :  void
Saver.setDir ( String p1 ) [abstract]  :  void
Saver.setDirAndPrefix ( String p1, String p2 ) [abstract]  :  void
Saver.setFile ( File p1 ) [abstract]  :  void
Saver.setFilePrefix ( String p1 ) [abstract]  :  void
Saver.setInstances ( Instances p1 ) [abstract]  :  void
Saver.setRetrieval ( int p1 ) [abstract]  :  void
Saver.writeBatch ( ) [abstract]  :  void
Saver.writeIncremental ( Instance p1 ) [abstract]  :  void
package weka.gui.beans
Saver.acceptDataSet ( DataSetEvent p1 )  :  void
Saver.acceptInstance ( InstanceEvent p1 )  :  void
Saver.acceptTestSet ( TestSetEvent p1 )  :  void
Saver.acceptTrainingSet ( TrainingSetEvent p1 )  :  void
Saver.getSaver ( )  :  Saver
Saver.getWrappedAlgorithm ( )  :  Object
Saver.globalInfo ( )  :  String
Saver.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Saver.saveBatch ( )  :  void
Saver.Saver ( )
Saver.setSaver ( Saver p1 )  :  void
Saver.setWrappedAlgorithm ( Object p1 )  :  void
Saver.stop ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, SaverBeanInfo.class
package weka.gui.beans
SaverBeanInfo.getBeanDescriptor ( )  :  BeanDescriptor
SaverBeanInfo.SaverBeanInfo ( )

cdk-1.0.1.jar, SaverCustomizer.class
package weka.gui.beans
SaverCustomizer.addPropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
SaverCustomizer.removePropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
SaverCustomizer.SaverCustomizer ( )
SaverCustomizer.setObject ( Object p1 )  :  void
SaverCustomizer.setParentFrame ( JFrame p1 )  :  void
SaverCustomizer.setUpFile ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ScatterPlotMatrix.class
package weka.gui.beans
ScatterPlotMatrix.appearanceDesign ( )  :  void
ScatterPlotMatrix.appearanceFinal ( )  :  void
ScatterPlotMatrix.globalInfo ( )  :  String
ScatterPlotMatrix.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
ScatterPlotMatrix.performRequest ( String p1 )  :  void
ScatterPlotMatrix.ScatterPlotMatrix ( )
ScatterPlotMatrix.setInstances ( Instances p1 )  :  void
ScatterPlotMatrix.setUpFinal ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, ScatterPlotMatrixBeanInfo.class
package weka.gui.beans
ScatterPlotMatrixBeanInfo.getEventSetDescriptors ( )  :  EventSetDescriptor[ ]
ScatterPlotMatrixBeanInfo.ScatterPlotMatrixBeanInfo ( )

cdk-1.0.1.jar, Scoreable.class
package weka.classifiers.bayes.net.search.local
Scoreable.logScore ( int p1 ) [abstract]  :  double

cdk-1.0.1.jar, SearchAlgorithm.class
package weka.classifiers.bayes.net.search
SearchAlgorithm.addArcMakesSense ( BayesNet p1, Instances p2, int p3, int p4 )  :  boolean
SearchAlgorithm.buildStructure ( BayesNet p1, Instances p2 )  :  void
SearchAlgorithm.doMarkovBlanketCorrection ( BayesNet p1, Instances p2 )  :  void
SearchAlgorithm.getMarkovBlanketClassifier ( )  :  boolean
SearchAlgorithm.getOptions ( )  :  String[ ]
SearchAlgorithm.initAsNaiveBayesTipText ( )  :  String
SearchAlgorithm.isArc ( BayesNet p1, int p2, int p3 )  :  boolean
SearchAlgorithm.listOptions ( )  :  Enumeration
SearchAlgorithm.markovBlanketClassifierTipText ( )  :  String
SearchAlgorithm.maxNrOfParentsTipText ( )  :  String
SearchAlgorithm.reverseArcMakesSense ( BayesNet p1, Instances p2, int p3, int p4 )  :  boolean
SearchAlgorithm.search ( BayesNet p1, Instances p2 )  :  void
SearchAlgorithm.SearchAlgorithm ( )
SearchAlgorithm.setMarkovBlanketClassifier ( boolean p1 )  :  void
SearchAlgorithm.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
SearchAlgorithm.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, SelectedTag.class
package weka.core
SelectedTag.equals ( Object p1 )  :  boolean
SelectedTag.getSelectedTag ( )  :  Tag
SelectedTag.getTags ( )  :  Tag[ ]
SelectedTag.SelectedTag ( int p1, Tag[ ] p2 )

cdk-1.0.1.jar, SelectedTagEditor.class
package weka.gui
SelectedTagEditor.getAsText ( )  :  String
SelectedTagEditor.getJavaInitializationString ( )  :  String
SelectedTagEditor.getTags ( )  :  String[ ]
SelectedTagEditor.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
SelectedTagEditor.SelectedTagEditor ( )
SelectedTagEditor.setAsText ( String p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, SerialInstanceListener.class
package weka.gui.streams
SerialInstanceListener.secondInstanceProduced ( InstanceEvent p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, SerializedInstancesLoader.class
package weka.core.converters
SerializedInstancesLoader.getDataSet ( )  :  Instances
SerializedInstancesLoader.getFileDescription ( )  :  String
SerializedInstancesLoader.getFileExtension ( )  :  String
SerializedInstancesLoader.getNextInstance ( )  :  Instance
SerializedInstancesLoader.getStructure ( )  :  Instances
SerializedInstancesLoader.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
SerializedInstancesLoader.reset ( )  :  void
SerializedInstancesLoader.retrieveFile ( )  :  File
SerializedInstancesLoader.SerializedInstancesLoader ( )
SerializedInstancesLoader.setFile ( File p1 )  :  void
SerializedInstancesLoader.setSource ( File p1 )  :  void
SerializedInstancesLoader.setSource ( InputStream p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, SerializedInstancesSaver.class
package weka.core.converters
SerializedInstancesSaver.getFileDescription ( )  :  String
SerializedInstancesSaver.globalInfo ( )  :  String
SerializedInstancesSaver.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
SerializedInstancesSaver.resetOptions ( )  :  void
SerializedInstancesSaver.SerializedInstancesSaver ( )
SerializedInstancesSaver.setDestination ( File p1 )  :  void
SerializedInstancesSaver.writeBatch ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, SerializedObject.class
package weka.core
SerializedObject.equals ( Object p1 )  :  boolean
SerializedObject.getObject ( )  :  Object
SerializedObject.hashCode ( )  :  int
SerializedObject.SerializedObject ( Object p1 )
SerializedObject.SerializedObject ( Object p1, boolean p2 )

cdk-1.0.1.jar, SerialUIDChanger.class
package weka.core.xml
SerialUIDChanger.binaryToKOML ( String p1, String p2 ) [static]  :  void
SerialUIDChanger.changeUID ( long p1, long p2, String p3, String p4 ) [static]  :  void
SerialUIDChanger.checkKOML ( ) [static]  :  boolean
SerialUIDChanger.isKOML ( String p1 ) [static]  :  boolean
SerialUIDChanger.komlToBinary ( String p1, String p2 ) [static]  :  void
SerialUIDChanger.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
SerialUIDChanger.readBinary ( String p1 ) [static]  :  Object
SerialUIDChanger.SerialUIDChanger ( )
SerialUIDChanger.writeBinary ( String p1, Object p2 ) [static]  :  void

cdk-1.0.1.jar, SetInstancesPanel.class
package weka.gui
SetInstancesPanel.addPropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
SetInstancesPanel.getInstances ( )  :  Instances
SetInstancesPanel.getSummary ( )  :  InstancesSummaryPanel
SetInstancesPanel.removePropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
SetInstancesPanel.setInstances ( Instances p1 )  :  void
SetInstancesPanel.setInstancesFromFile ( File p1 )  :  void
SetInstancesPanel.setInstancesFromFileQ ( )  :  void
SetInstancesPanel.setInstancesFromURL ( URL p1 )  :  void
SetInstancesPanel.setInstancesFromURLQ ( )  :  void
SetInstancesPanel.SetInstancesPanel ( )

cdk-1.0.1.jar, SetupModePanel.class
package weka.gui.experiment
SetupModePanel.addPropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
SetupModePanel.getExperiment ( )  :  Experiment
SetupModePanel.SetupModePanel ( )
SetupModePanel.switchToAdvanced ( Experiment p1 )  :  void
SetupModePanel.switchToSimple ( Experiment p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, SetupPanel.class
package weka.gui.experiment
SetupPanel.addPropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
SetupPanel.getExperiment ( )  :  Experiment
SetupPanel.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
SetupPanel.removeNotesFrame ( )  :  void
SetupPanel.removePropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
SetupPanel.setExperiment ( Experiment p1 )  :  void
SetupPanel.SetupPanel ( )
SetupPanel.SetupPanel ( Experiment p1 )

cdk-1.0.1.jar, SigmoidUnit.class
package weka.classifiers.functions.neural
SigmoidUnit.errorValue ( NeuralNode p1 )  :  double
SigmoidUnit.outputValue ( NeuralNode p1 )  :  double
SigmoidUnit.SigmoidUnit ( )
SigmoidUnit.updateWeights ( NeuralNode p1, double p2, double p3 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, SimpleCharStream.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts
SimpleCharStream.adjustBeginLineColumn ( int newLine, int newCol )  :  void
SimpleCharStream.backup ( int amount )  :  void
SimpleCharStream.BeginToken ( )  :  char
SimpleCharStream.Done ( )  :  void
SimpleCharStream.ExpandBuff ( boolean wrapAround )  :  void
SimpleCharStream.FillBuff ( )  :  void
SimpleCharStream.getBeginColumn ( )  :  int
SimpleCharStream.getBeginLine ( )  :  int
SimpleCharStream.getColumn ( )  :  int *DEPRECATED*
SimpleCharStream.getEndColumn ( )  :  int
SimpleCharStream.getEndLine ( )  :  int
SimpleCharStream.GetImage ( )  :  String
SimpleCharStream.getLine ( )  :  int *DEPRECATED*
SimpleCharStream.GetSuffix ( int len )  :  char[ ]
SimpleCharStream.readChar ( )  :  char
SimpleCharStream.ReInit ( InputStream dstream )  :  void
SimpleCharStream.ReInit ( InputStream dstream, int startline, int startcolumn )  :  void
SimpleCharStream.ReInit ( InputStream dstream, int startline, int startcolumn, int buffersize )  :  void
SimpleCharStream.ReInit ( Reader dstream )  :  void
SimpleCharStream.ReInit ( Reader dstream, int startline, int startcolumn )  :  void
SimpleCharStream.ReInit ( Reader dstream, int startline, int startcolumn, int buffersize )  :  void
SimpleCharStream.SimpleCharStream ( InputStream dstream )
SimpleCharStream.SimpleCharStream ( InputStream dstream, int startline, int startcolumn )
SimpleCharStream.SimpleCharStream ( InputStream dstream, int startline, int startcolumn, int buffersize )
SimpleCharStream.SimpleCharStream ( Reader dstream )
SimpleCharStream.SimpleCharStream ( Reader dstream, int startline, int startcolumn )
SimpleCharStream.SimpleCharStream ( Reader dstream, int startline, int startcolumn, int buffersize )
SimpleCharStream.UpdateLineColumn ( char c )  :  void
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
SimpleCharStream.adjustBeginLineColumn ( int newLine, int newCol )  :  void
SimpleCharStream.backup ( int amount )  :  void
SimpleCharStream.BeginToken ( )  :  char
SimpleCharStream.Done ( )  :  void
SimpleCharStream.ExpandBuff ( boolean wrapAround )  :  void
SimpleCharStream.FillBuff ( )  :  void
SimpleCharStream.getBeginColumn ( )  :  int
SimpleCharStream.getBeginLine ( )  :  int
SimpleCharStream.getColumn ( )  :  int *DEPRECATED*
SimpleCharStream.getEndColumn ( )  :  int
SimpleCharStream.getEndLine ( )  :  int
SimpleCharStream.GetImage ( )  :  String
SimpleCharStream.getLine ( )  :  int *DEPRECATED*
SimpleCharStream.GetSuffix ( int len )  :  char[ ]
SimpleCharStream.readChar ( )  :  char
SimpleCharStream.ReInit ( InputStream dstream )  :  void
SimpleCharStream.ReInit ( InputStream dstream, int startline, int startcolumn )  :  void
SimpleCharStream.ReInit ( InputStream dstream, int startline, int startcolumn, int buffersize )  :  void
SimpleCharStream.ReInit ( Reader dstream )  :  void
SimpleCharStream.ReInit ( Reader dstream, int startline, int startcolumn )  :  void
SimpleCharStream.ReInit ( Reader dstream, int startline, int startcolumn, int buffersize )  :  void
SimpleCharStream.SimpleCharStream ( InputStream dstream )
SimpleCharStream.SimpleCharStream ( InputStream dstream, int startline, int startcolumn )
SimpleCharStream.SimpleCharStream ( InputStream dstream, int startline, int startcolumn, int buffersize )
SimpleCharStream.SimpleCharStream ( Reader dstream )
SimpleCharStream.SimpleCharStream ( Reader dstream, int startline, int startcolumn )
SimpleCharStream.SimpleCharStream ( Reader dstream, int startline, int startcolumn, int buffersize )
SimpleCharStream.UpdateLineColumn ( char c )  :  void

cdk-1.0.1.jar, SimpleCLI.class
package weka.gui
SimpleCLI.actionPerformed ( ActionEvent p1 )  :  void
SimpleCLI.doHistory ( KeyEvent p1 )  :  void
SimpleCLI.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
SimpleCLI.runCommand ( String p1 )  :  void
SimpleCLI.SimpleCLI ( )
SimpleCLI.splitOptions ( String p1 ) [static]  :  String[ ]

cdk-1.0.1.jar, SimpleEstimator.class
package weka.classifiers.bayes.net.estimate
SimpleEstimator.distributionForInstance ( BayesNet p1, Instance p2 )  :  double[ ]
SimpleEstimator.estimateCPTs ( BayesNet p1 )  :  void
SimpleEstimator.initCPTs ( BayesNet p1 )  :  void
SimpleEstimator.SimpleEstimator ( )
SimpleEstimator.updateClassifier ( BayesNet p1, Instance p2 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, SimpleKMeans.class
package weka.clusterers
SimpleKMeans.buildClusterer ( Instances p1 )  :  void
SimpleKMeans.clusterInstance ( Instance p1 )  :  int
SimpleKMeans.getClusterCentroids ( )  :  Instances
SimpleKMeans.getClusterNominalCounts ( )  :  int[ ][ ][ ]
SimpleKMeans.getClusterSizes ( )  :  int[ ]
SimpleKMeans.getClusterStandardDevs ( )  :  Instances
SimpleKMeans.getNumClusters ( )  :  int
SimpleKMeans.getOptions ( )  :  String[ ]
SimpleKMeans.getSeed ( )  :  int
SimpleKMeans.getSquaredError ( )  :  double
SimpleKMeans.globalInfo ( )  :  String
SimpleKMeans.listOptions ( )  :  Enumeration
SimpleKMeans.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
SimpleKMeans.numberOfClusters ( )  :  int
SimpleKMeans.numClustersTipText ( )  :  String
SimpleKMeans.seedTipText ( )  :  String
SimpleKMeans.setNumClusters ( int p1 )  :  void
SimpleKMeans.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
SimpleKMeans.setSeed ( int p1 )  :  void
SimpleKMeans.SimpleKMeans ( )
SimpleKMeans.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, SimpleLinearRegression.class
package weka.classifiers.functions
SimpleLinearRegression.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
SimpleLinearRegression.classifyInstance ( Instance p1 )  :  double
SimpleLinearRegression.foundUsefulAttribute ( )  :  boolean
SimpleLinearRegression.getAttributeIndex ( )  :  int
SimpleLinearRegression.getIntercept ( )  :  double
SimpleLinearRegression.getSlope ( )  :  double
SimpleLinearRegression.globalInfo ( )  :  String
SimpleLinearRegression.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
SimpleLinearRegression.setSuppressErrorMessage ( boolean p1 )  :  void
SimpleLinearRegression.SimpleLinearRegression ( )
SimpleLinearRegression.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, SimpleLinearRegressionModel.class
package org.openscience.cdk.qsar.model.weka
SimpleLinearRegressionModel.build ( )  :  void
SimpleLinearRegressionModel.getPredictPredicted ( )  :  Object[ ]
SimpleLinearRegressionModel.predict ( )  :  void
SimpleLinearRegressionModel.setParameters ( Object[ ][ ] newX )  :  void
SimpleLinearRegressionModel.setParameters ( String path )  :  void
SimpleLinearRegressionModel.SimpleLinearRegressionModel ( int[ ] typAttrib, Object[ ] y, Object[ ][ ] x, String[ ] attrib )
SimpleLinearRegressionModel.SimpleLinearRegressionModel ( Object[ ] y, Object[ ][ ] x )
SimpleLinearRegressionModel.SimpleLinearRegressionModel ( String pathTest )

cdk-1.0.1.jar, SimpleLinkedList.class
package weka.associations.tertius
SimpleLinkedList.add ( Object p1 )  :  void
SimpleLinkedList.addAll ( SimpleLinkedList p1 )  :  void
SimpleLinkedList.addFirst ( Object p1 )  :  void
SimpleLinkedList.clear ( )  :  void
SimpleLinkedList.getFirst ( )  :  Object
SimpleLinkedList.getLast ( )  :  Object
SimpleLinkedList.inverseIterator ( )  :  SimpleLinkedList.LinkedListInverseIterator
SimpleLinkedList.isEmpty ( )  :  boolean
SimpleLinkedList.iterator ( )  :  SimpleLinkedList.LinkedListIterator
SimpleLinkedList.merge ( SimpleLinkedList p1, Comparator p2 )  :  void
SimpleLinkedList.removeFirst ( )  :  Object
SimpleLinkedList.SimpleLinkedList ( )
SimpleLinkedList.size ( )  :  int
SimpleLinkedList.sort ( Comparator p1 )  :  void
SimpleLinkedList.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, SimpleLogistic.class
package weka.classifiers.functions
SimpleLogistic.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
SimpleLogistic.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
SimpleLogistic.enumerateMeasures ( )  :  Enumeration
SimpleLogistic.errorOnProbabilitiesTipText ( )  :  String
SimpleLogistic.getErrorOnProbabilities ( )  :  boolean
SimpleLogistic.getHeuristicStop ( )  :  int
SimpleLogistic.getMaxBoostingIterations ( )  :  int
SimpleLogistic.getMeasure ( String p1 )  :  double
SimpleLogistic.getNumBoostingIterations ( )  :  int
SimpleLogistic.getNumRegressions ( )  :  int
SimpleLogistic.getOptions ( )  :  String[ ]
SimpleLogistic.getUseCrossValidation ( )  :  boolean
SimpleLogistic.globalInfo ( )  :  String
SimpleLogistic.heuristicStopTipText ( )  :  String
SimpleLogistic.listOptions ( )  :  Enumeration
SimpleLogistic.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
SimpleLogistic.maxBoostingIterationsTipText ( )  :  String
SimpleLogistic.measureAttributesUsed ( )  :  double
SimpleLogistic.numBoostingIterationsTipText ( )  :  String
SimpleLogistic.setErrorOnProbabilities ( boolean p1 )  :  void
SimpleLogistic.setHeuristicStop ( int p1 )  :  void
SimpleLogistic.setMaxBoostingIterations ( int p1 )  :  void
SimpleLogistic.setNumBoostingIterations ( int p1 )  :  void
SimpleLogistic.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
SimpleLogistic.setUseCrossValidation ( boolean p1 )  :  void
SimpleLogistic.SimpleLogistic ( )
SimpleLogistic.SimpleLogistic ( int p1, boolean p2, boolean p3 )
SimpleLogistic.toString ( )  :  String
SimpleLogistic.useCrossValidationTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, SimpleNode.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
SimpleNode.childrenAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object
SimpleNode.clone ( )  :  Object
SimpleNode.dump ( String prefix )  :  void
SimpleNode.getId ( )  :  int
SimpleNode.getParser ( )  :  SMARTSParser
SimpleNode.jjtAccept ( SMARTSParserVisitor visitor, Object data )  :  Object
SimpleNode.jjtAddChild ( Node n, int i )  :  void
SimpleNode.jjtClose ( )  :  void
SimpleNode.jjtGetChild ( int i )  :  Node
SimpleNode.jjtGetNumChildren ( )  :  int
SimpleNode.jjtGetParent ( )  :  Node
SimpleNode.jjtOpen ( )  :  void
SimpleNode.jjtRemoveChild ( int i )  :  void
SimpleNode.jjtSetParent ( Node n )  :  void
SimpleNode.setId ( int id )  :  void
SimpleNode.setParser ( SMARTSParser parser )  :  void
SimpleNode.SimpleNode ( int i )
SimpleNode.SimpleNode ( SMARTSParser p, int i )
SimpleNode.toString ( )  :  String
SimpleNode.toString ( String prefix )  :  String

cdk-1.0.1.jar, SimpleSetupPanel.class
package weka.gui.experiment
SimpleSetupPanel.addPropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
SimpleSetupPanel.getExperiment ( )  :  Experiment
SimpleSetupPanel.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
SimpleSetupPanel.removeNotesFrame ( )  :  void
SimpleSetupPanel.removePropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
SimpleSetupPanel.setExperiment ( Experiment p1 )  :  boolean
SimpleSetupPanel.setModePanel ( SetupModePanel p1 )  :  void
SimpleSetupPanel.setSelectedItem ( JComboBox p1, String p2 )  :  void
SimpleSetupPanel.SimpleSetupPanel ( )
SimpleSetupPanel.SimpleSetupPanel ( Experiment p1 )

cdk-1.0.1.jar, SimulatedAnnealing.class
package weka.classifiers.bayes.net.search.global
SimulatedAnnealing.buildStructure ( BayesNet p1, Instances p2 )  :  void
SimulatedAnnealing.deltaTipText ( )  :  String
SimulatedAnnealing.getDelta ( )  :  double
SimulatedAnnealing.getOptions ( )  :  String[ ]
SimulatedAnnealing.getRuns ( )  :  int
SimulatedAnnealing.getSeed ( )  :  int
SimulatedAnnealing.getTStart ( )  :  double
SimulatedAnnealing.globalInfo ( )  :  String
SimulatedAnnealing.listOptions ( )  :  Enumeration
SimulatedAnnealing.runsTipText ( )  :  String
SimulatedAnnealing.seedTipText ( )  :  String
SimulatedAnnealing.setDelta ( double p1 )  :  void
SimulatedAnnealing.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
SimulatedAnnealing.setRuns ( int p1 )  :  void
SimulatedAnnealing.setSeed ( int p1 )  :  void
SimulatedAnnealing.setTStart ( double p1 )  :  void
SimulatedAnnealing.SimulatedAnnealing ( )
SimulatedAnnealing.TStartTipText ( )  :  String
package weka.classifiers.bayes.net.search.local
SimulatedAnnealing.buildStructure ( BayesNet p1, Instances p2 )  :  void
SimulatedAnnealing.deltaTipText ( )  :  String
SimulatedAnnealing.getDelta ( )  :  double
SimulatedAnnealing.getOptions ( )  :  String[ ]
SimulatedAnnealing.getRuns ( )  :  int
SimulatedAnnealing.getSeed ( )  :  int
SimulatedAnnealing.getTStart ( )  :  double
SimulatedAnnealing.globalInfo ( )  :  String
SimulatedAnnealing.listOptions ( )  :  Enumeration
SimulatedAnnealing.runsTipText ( )  :  String
SimulatedAnnealing.seedTipText ( )  :  String
SimulatedAnnealing.setDelta ( double p1 )  :  void
SimulatedAnnealing.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
SimulatedAnnealing.setRuns ( int p1 )  :  void
SimulatedAnnealing.setSeed ( int p1 )  :  void
SimulatedAnnealing.setTStart ( double p1 )  :  void
SimulatedAnnealing.SimulatedAnnealing ( )
SimulatedAnnealing.TStartTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, SingleClassifierEnhancer.class
package weka.classifiers
SingleClassifierEnhancer.classifierTipText ( )  :  String
SingleClassifierEnhancer.defaultClassifierString ( )  :  String
SingleClassifierEnhancer.getClassifier ( )  :  Classifier
SingleClassifierEnhancer.getClassifierSpec ( )  :  String
SingleClassifierEnhancer.getOptions ( )  :  String[ ]
SingleClassifierEnhancer.listOptions ( )  :  Enumeration
SingleClassifierEnhancer.setClassifier ( Classifier p1 )  :  void
SingleClassifierEnhancer.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
SingleClassifierEnhancer.SingleClassifierEnhancer ( )

cdk-1.0.1.jar, SingleIndex.class
package weka.core
SingleIndex.getIndex ( )  :  int
SingleIndex.getSingleIndex ( )  :  String
SingleIndex.indexToString ( int p1 ) [static]  :  String
SingleIndex.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
SingleIndex.setSingleIndex ( String p1 )  :  void
SingleIndex.setUpper ( int p1 )  :  void
SingleIndex.setValue ( )  :  void
SingleIndex.SingleIndex ( )
SingleIndex.SingleIndex ( String p1 )
SingleIndex.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, SingularValueDecomposition.class
package weka.core.matrix
SingularValueDecomposition.cond ( )  :  double
SingularValueDecomposition.getS ( )  :  Matrix
SingularValueDecomposition.getSingularValues ( )  :  double[ ]
SingularValueDecomposition.getU ( )  :  Matrix
SingularValueDecomposition.getV ( )  :  Matrix
SingularValueDecomposition.norm2 ( )  :  double
SingularValueDecomposition.rank ( )  :  int
SingularValueDecomposition.SingularValueDecomposition ( Matrix p1 )

cdk-1.0.1.jar, SmallestRingAtom.class
package org.openscience.cdk.isomorphism.matchers.smarts
SmallestRingAtom.matches ( IAtom atom )  :  boolean
SmallestRingAtom.SmallestRingAtom ( int size )

cdk-1.0.1.jar, Smarts2MQLVisitor.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser.visitor
Smarts2MQLVisitor.Smarts2MQLVisitor ( )
Smarts2MQLVisitor.visit ( ASTAliphatic node, Object data )  :  Object
Smarts2MQLVisitor.visit ( ASTAnyAtom node, Object data )  :  Object
Smarts2MQLVisitor.visit ( ASTAromatic node, Object data )  :  Object
Smarts2MQLVisitor.visit ( ASTAtom node, Object data )  :  Object
Smarts2MQLVisitor.visit ( ASTAtomicMass node, Object data )  :  Object
Smarts2MQLVisitor.visit ( ASTAtomicNumber node, Object data )  :  Object
Smarts2MQLVisitor.visit ( ASTCharge node, Object data )  :  Object
Smarts2MQLVisitor.visit ( ASTChirality node, Object data )  :  Object
Smarts2MQLVisitor.visit ( ASTElement node, Object data )  :  Object
Smarts2MQLVisitor.visit ( ASTExplicitAtom node, Object data )  :  Object
Smarts2MQLVisitor.visit ( ASTExplicitConnectivity node, Object data )  :  Object
Smarts2MQLVisitor.visit ( ASTExplicitHighAndBond node, Object data )  :  Object
Smarts2MQLVisitor.visit ( ASTExplicitHighAndExpression node, Object data )  :  Object
Smarts2MQLVisitor.visit ( ASTGroup node, Object data )  :  Object
Smarts2MQLVisitor.visit ( ASTImplicitHCount node, Object data )  :  Object
Smarts2MQLVisitor.visit ( ASTImplicitHighAndBond node, Object data )  :  Object
Smarts2MQLVisitor.visit ( ASTImplicitHighAndExpression node, Object data )  :  Object
Smarts2MQLVisitor.visit ( ASTLowAndBond node, Object data )  :  Object
Smarts2MQLVisitor.visit ( ASTLowAndExpression node, Object data )  :  Object
Smarts2MQLVisitor.visit ( ASTNotBond node, Object data )  :  Object
Smarts2MQLVisitor.visit ( ASTNotExpression node, Object data )  :  Object
Smarts2MQLVisitor.visit ( ASTOrBond node, Object data )  :  Object
Smarts2MQLVisitor.visit ( ASTOrExpression node, Object data )  :  Object
Smarts2MQLVisitor.visit ( ASTReaction node, Object data )  :  Object
Smarts2MQLVisitor.visit ( ASTRecursiveSmartsExpression node, Object data )  :  Object
Smarts2MQLVisitor.visit ( ASTRingConnectivity node, Object data )  :  Object
Smarts2MQLVisitor.visit ( ASTRingIdentifier node, Object data )  :  Object
Smarts2MQLVisitor.visit ( ASTRingMembership node, Object data )  :  Object
Smarts2MQLVisitor.visit ( ASTSimpleBond node, Object data )  :  Object
Smarts2MQLVisitor.visit ( ASTSmallestRingSize node, Object data )  :  Object
Smarts2MQLVisitor.visit ( ASTSmarts node, Object data )  :  Object
Smarts2MQLVisitor.visit ( ASTStart node, Object data )  :  Object
Smarts2MQLVisitor.visit ( ASTTotalConnectivity node, Object data )  :  Object
Smarts2MQLVisitor.visit ( ASTTotalHCount node, Object data )  :  Object
Smarts2MQLVisitor.visit ( ASTValence node, Object data )  :  Object
Smarts2MQLVisitor.visit ( SimpleNode node, Object data )  :  Object

cdk-1.0.1.jar, SmartsDumpVisitor.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser.visitor
SmartsDumpVisitor.SmartsDumpVisitor ( )
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTAliphatic node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTAnyAtom node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTAromatic node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTAtom node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTAtomicMass node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTAtomicNumber node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTCharge node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTChirality node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTElement node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTExplicitAtom node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTExplicitConnectivity node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTExplicitHighAndBond node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTExplicitHighAndExpression node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTGroup node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTImplicitHCount node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTImplicitHighAndBond node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTImplicitHighAndExpression node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTLowAndBond node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTLowAndExpression node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTNotBond node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTNotExpression node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTOrBond node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTOrExpression node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTPrimitiveAtomExpression node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTReaction node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTRecursiveSmartsExpression node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTRingConnectivity node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTRingIdentifier node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTRingMembership node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTSimpleBond node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTSmallestRingSize node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTSmarts node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTStart node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTTotalConnectivity node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTTotalHCount node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( ASTValence node, Object data )  :  Object
SmartsDumpVisitor.visit ( SimpleNode node, Object data )  :  Object

cdk-1.0.1.jar, SMARTSParser.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts
SMARTSParser.AromaticAtms ( )  :  void
SMARTSParser.AtomExpression ( )  :  void
SMARTSParser.AtomicNumber ( )  :  void
SMARTSParser.BondExpression ( )  :  void
SMARTSParser.ChargeAtom ( )  :  void
SMARTSParser.ConsumeToken ( )  :  void
SMARTSParser.Degree ( )  :  void
SMARTSParser.disable_tracing ( )  :  void
SMARTSParser.Element ( )  :  void
SMARTSParser.enable_tracing ( )  :  void
SMARTSParser.EndBracket ( )  :  void
SMARTSParser.EndColumn ( )  :  void
SMARTSParser.generateParseException ( )  :  ParseException
SMARTSParser.getNextToken ( )  :  Token
SMARTSParser.getToken ( int index )  :  Token
SMARTSParser.ImplicitHCount ( )  :  void
SMARTSParser.MassAtom ( )  :  void
SMARTSParser.OneCharElement ( )  :  void
SMARTSParser.Operator ( )  :  void
SMARTSParser.OperatorAtom ( )  :  void
SMARTSParser.Parse ( )  :  QueryAtomContainer
SMARTSParser.parse ( String stringToParse ) [static]  :  QueryAtomContainer
SMARTSParser.Recursion ( )  :  void
SMARTSParser.ReInit ( InputStream stream )  :  void
SMARTSParser.ReInit ( Reader stream )  :  void
SMARTSParser.ReInit ( SMARTSParserTokenManager tm )  :  void
SMARTSParser.RingAtom ( )  :  void
SMARTSParser.SMARTS ( )  :  void
SMARTSParser.SMARTSParser ( InputStream stream )
SMARTSParser.SMARTSParser ( Reader stream )
SMARTSParser.SMARTSParser ( SMARTSParserTokenManager tm )
SMARTSParser.StartBracket ( )  :  void
SMARTSParser.StartColumn ( )  :  void
SMARTSParser.TotalConnectionAtom ( )  :  void
SMARTSParser.TotalHCount ( )  :  void
SMARTSParser.TotalRingConnection ( )  :  void
SMARTSParser.TwoCharElement ( )  :  void
SMARTSParser.ValenyAtom ( )  :  void
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
SMARTSParser.Aliphatic ( )  :  void
SMARTSParser.AnyAtom ( )  :  void
SMARTSParser.Aromatic ( )  :  void
SMARTSParser.AtomExpression ( )  :  ASTAtom
SMARTSParser.AtomicMass ( )  :  void
SMARTSParser.AtomicNumber ( )  :  void
SMARTSParser.Charge ( )  :  void
SMARTSParser.Chirality ( )  :  void
SMARTSParser.disable_tracing ( )  :  void
SMARTSParser.enable_tracing ( )  :  void
SMARTSParser.ExplicitAtomExpression ( )  :  void
SMARTSParser.ExplicitConnectivity ( )  :  void
SMARTSParser.ExplicitHighAndBond ( )  :  void
SMARTSParser.ExplicitHighAndExpression ( )  :  void
SMARTSParser.generateParseException ( )  :  ParseException
SMARTSParser.getNextToken ( )  :  Token
SMARTSParser.getToken ( int index )  :  Token
SMARTSParser.GroupExpression ( )  :  void
SMARTSParser.ImplicitHCount ( )  :  void
SMARTSParser.ImplicitHighAndBond ( )  :  void
SMARTSParser.ImplicitHighAndExpression ( )  :  void
SMARTSParser.LowAndBond ( )  :  void
SMARTSParser.LowAndExpression ( )  :  void
SMARTSParser.NoHydrogenElement ( )  :  void
SMARTSParser.NotBond ( )  :  void
SMARTSParser.NotExpression ( )  :  void
SMARTSParser.OrBond ( )  :  void
SMARTSParser.OrExpression ( )  :  void
SMARTSParser.parse ( String smarts ) [static]  :  QueryAtomContainer
SMARTSParser.PrimitiveAtomExpression ( )  :  void
SMARTSParser.ReactionExpression ( )  :  void
SMARTSParser.RecursiveSmartsExpression ( )  :  void
SMARTSParser.ReInit ( InputStream stream )  :  void
SMARTSParser.ReInit ( Reader stream )  :  void
SMARTSParser.ReInit ( SMARTSParserTokenManager tm )  :  void
SMARTSParser.RingConnectivity ( )  :  void
SMARTSParser.RingIdentifier ( )  :  void
SMARTSParser.RingMembership ( )  :  void
SMARTSParser.SimpleBond ( )  :  void
SMARTSParser.SmallestRingSize ( )  :  void
SMARTSParser.SmartsExpression ( )  :  void
SMARTSParser.SMARTSParser ( InputStream stream )
SMARTSParser.SMARTSParser ( Reader stream )
SMARTSParser.SMARTSParser ( SMARTSParserTokenManager tm )
SMARTSParser.Start ( )  :  ASTStart
SMARTSParser.TotalConnectivity ( )  :  void
SMARTSParser.TotalHCount ( )  :  void
SMARTSParser.Valence ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, SMARTSParserTokenManager.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts
SMARTSParserTokenManager.getNextToken ( )  :  Token
SMARTSParserTokenManager.jjFillToken ( )  :  Token
SMARTSParserTokenManager.ReInit ( SimpleCharStream stream )  :  void
SMARTSParserTokenManager.ReInit ( SimpleCharStream stream, int lexState )  :  void
SMARTSParserTokenManager.setDebugStream ( PrintStream ds )  :  void
SMARTSParserTokenManager.SMARTSParserTokenManager ( SimpleCharStream stream )
SMARTSParserTokenManager.SMARTSParserTokenManager ( SimpleCharStream stream, int lexState )
SMARTSParserTokenManager.SwitchTo ( int lexState )  :  void
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
SMARTSParserTokenManager.getNextToken ( )  :  Token
SMARTSParserTokenManager.jjFillToken ( )  :  Token
SMARTSParserTokenManager.ReInit ( SimpleCharStream stream )  :  void
SMARTSParserTokenManager.ReInit ( SimpleCharStream stream, int lexState )  :  void
SMARTSParserTokenManager.setDebugStream ( PrintStream ds )  :  void
SMARTSParserTokenManager.SMARTSParserTokenManager ( SimpleCharStream stream )
SMARTSParserTokenManager.SMARTSParserTokenManager ( SimpleCharStream stream, int lexState )
SMARTSParserTokenManager.SwitchTo ( int lexState )  :  void

cdk-1.0.1.jar, SMARTSParserVisitor.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
SMARTSParserVisitor.visit ( ASTAliphatic p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
SMARTSParserVisitor.visit ( ASTAnyAtom p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
SMARTSParserVisitor.visit ( ASTAromatic p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
SMARTSParserVisitor.visit ( ASTAtom p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
SMARTSParserVisitor.visit ( ASTAtomicMass p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
SMARTSParserVisitor.visit ( ASTAtomicNumber p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
SMARTSParserVisitor.visit ( ASTCharge p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
SMARTSParserVisitor.visit ( ASTChirality p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
SMARTSParserVisitor.visit ( ASTElement p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
SMARTSParserVisitor.visit ( ASTExplicitAtom p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
SMARTSParserVisitor.visit ( ASTExplicitConnectivity p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
SMARTSParserVisitor.visit ( ASTExplicitHighAndBond p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
SMARTSParserVisitor.visit ( ASTExplicitHighAndExpression p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
SMARTSParserVisitor.visit ( ASTGroup p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
SMARTSParserVisitor.visit ( ASTImplicitHCount p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
SMARTSParserVisitor.visit ( ASTImplicitHighAndBond p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
SMARTSParserVisitor.visit ( ASTImplicitHighAndExpression p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
SMARTSParserVisitor.visit ( ASTLowAndBond p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
SMARTSParserVisitor.visit ( ASTLowAndExpression p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
SMARTSParserVisitor.visit ( ASTNotBond p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
SMARTSParserVisitor.visit ( ASTNotExpression p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
SMARTSParserVisitor.visit ( ASTOrBond p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
SMARTSParserVisitor.visit ( ASTOrExpression p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
SMARTSParserVisitor.visit ( ASTReaction p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
SMARTSParserVisitor.visit ( ASTRecursiveSmartsExpression p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
SMARTSParserVisitor.visit ( ASTRingConnectivity p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
SMARTSParserVisitor.visit ( ASTRingIdentifier p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
SMARTSParserVisitor.visit ( ASTRingMembership p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
SMARTSParserVisitor.visit ( ASTSimpleBond p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
SMARTSParserVisitor.visit ( ASTSmallestRingSize p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
SMARTSParserVisitor.visit ( ASTSmarts p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
SMARTSParserVisitor.visit ( ASTStart p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
SMARTSParserVisitor.visit ( ASTTotalConnectivity p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
SMARTSParserVisitor.visit ( ASTTotalHCount p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
SMARTSParserVisitor.visit ( ASTValence p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object
SMARTSParserVisitor.visit ( SimpleNode p1, Object p2 ) [abstract]  :  Object

cdk-1.0.1.jar, SMARTSQueryTool.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts
SMARTSQueryTool.countMatches ( )  :  int
SMARTSQueryTool.getMatchingAtoms ( )  :  List
SMARTSQueryTool.getSmarts ( )  :  String
SMARTSQueryTool.matches ( IAtomContainer atomContainer )  :  boolean
SMARTSQueryTool.setSmarts ( String smarts )  :  void
SMARTSQueryTool.SMARTSQueryTool ( String smarts )
SMARTSQueryTool.SMARTSQueryTool ( String smarts, boolean useJJTree )

cdk-1.0.1.jar, SmartsQueryVisitor.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser.visitor
SmartsQueryVisitor.getRoot ( Node node )  :  ASTStart
SmartsQueryVisitor.SmartsQueryVisitor ( )
SmartsQueryVisitor.visit ( ASTAliphatic node, Object data )  :  Object
SmartsQueryVisitor.visit ( ASTAnyAtom node, Object data )  :  Object
SmartsQueryVisitor.visit ( ASTAromatic node, Object data )  :  Object
SmartsQueryVisitor.visit ( ASTAtom node, Object data )  :  Object
SmartsQueryVisitor.visit ( ASTAtomicMass node, Object data )  :  Object
SmartsQueryVisitor.visit ( ASTAtomicNumber node, Object data )  :  Object
SmartsQueryVisitor.visit ( ASTCharge node, Object data )  :  Object
SmartsQueryVisitor.visit ( ASTChirality node, Object data )  :  Object
SmartsQueryVisitor.visit ( ASTElement node, Object data )  :  Object
SmartsQueryVisitor.visit ( ASTExplicitAtom node, Object data )  :  Object
SmartsQueryVisitor.visit ( ASTExplicitConnectivity node, Object data )  :  Object
SmartsQueryVisitor.visit ( ASTExplicitHighAndBond node, Object data )  :  Object
SmartsQueryVisitor.visit ( ASTExplicitHighAndExpression node, Object data )  :  Object
SmartsQueryVisitor.visit ( ASTGroup node, Object data )  :  Object
SmartsQueryVisitor.visit ( ASTImplicitHCount node, Object data )  :  Object
SmartsQueryVisitor.visit ( ASTImplicitHighAndBond node, Object data )  :  Object
SmartsQueryVisitor.visit ( ASTImplicitHighAndExpression node, Object data )  :  Object
SmartsQueryVisitor.visit ( ASTLowAndBond node, Object data )  :  Object
SmartsQueryVisitor.visit ( ASTLowAndExpression node, Object data )  :  Object
SmartsQueryVisitor.visit ( ASTNotBond node, Object data )  :  Object
SmartsQueryVisitor.visit ( ASTNotExpression node, Object data )  :  Object
SmartsQueryVisitor.visit ( ASTOrBond node, Object data )  :  Object
SmartsQueryVisitor.visit ( ASTOrExpression node, Object data )  :  Object
SmartsQueryVisitor.visit ( ASTReaction node, Object data )  :  Object
SmartsQueryVisitor.visit ( ASTRecursiveSmartsExpression node, Object data )  :  Object
SmartsQueryVisitor.visit ( ASTRingConnectivity node, Object data )  :  Object
SmartsQueryVisitor.visit ( ASTRingIdentifier node, Object data )  :  Object
SmartsQueryVisitor.visit ( ASTRingMembership node, Object data )  :  Object
SmartsQueryVisitor.visit ( ASTSimpleBond node, Object data )  :  Object
SmartsQueryVisitor.visit ( ASTSmallestRingSize node, Object data )  :  Object
SmartsQueryVisitor.visit ( ASTSmarts node, Object data )  :  Object
SmartsQueryVisitor.visit ( ASTStart node, Object data )  :  Object
SmartsQueryVisitor.visit ( ASTTotalConnectivity node, Object data )  :  Object
SmartsQueryVisitor.visit ( ASTTotalHCount node, Object data )  :  Object
SmartsQueryVisitor.visit ( ASTValence node, Object data )  :  Object
SmartsQueryVisitor.visit ( SimpleNode node, Object data )  :  Object

cdk-1.0.1.jar, SMO.class
package weka.classifiers.functions
SMO.attributeNames ( )  :  String[ ][ ][ ]
SMO.bias ( )  :  double[ ][ ]
SMO.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
SMO.buildLogisticModelsTipText ( )  :  String
SMO.cacheSizeTipText ( )  :  String
SMO.classAttributeNames ( )  :  String[ ]
SMO.cTipText ( )  :  String
SMO.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
SMO.epsilonTipText ( )  :  String
SMO.exponentTipText ( )  :  String
SMO.featureSpaceNormalizationTipText ( )  :  String
SMO.filterTypeTipText ( )  :  String
SMO.gammaTipText ( )  :  String
SMO.getBuildLogisticModels ( )  :  boolean
SMO.getC ( )  :  double
SMO.getCacheSize ( )  :  int
SMO.getEpsilon ( )  :  double
SMO.getExponent ( )  :  double
SMO.getFeatureSpaceNormalization ( )  :  boolean
SMO.getFilterType ( )  :  SelectedTag
SMO.getGamma ( )  :  double
SMO.getLowerOrderTerms ( )  :  boolean
SMO.getNumFolds ( )  :  int
SMO.getOptions ( )  :  String[ ]
SMO.getRandomSeed ( )  :  int
SMO.getToleranceParameter ( )  :  double
SMO.getUseRBF ( )  :  boolean
SMO.globalInfo ( )  :  String
SMO.listOptions ( )  :  Enumeration
SMO.lowerOrderTermsTipText ( )  :  String
SMO.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
SMO.numClassAttributeValues ( )  :  int
SMO.numFoldsTipText ( )  :  String
SMO.obtainVotes ( Instance p1 )  :  int[ ]
SMO.pairwiseCoupling ( double[ ][ ] p1, double[ ][ ] p2 )  :  double[ ]
SMO.randomSeedTipText ( )  :  String
SMO.setBuildLogisticModels ( boolean p1 )  :  void
SMO.setC ( double p1 )  :  void
SMO.setCacheSize ( int p1 )  :  void
SMO.setEpsilon ( double p1 )  :  void
SMO.setExponent ( double p1 )  :  void
SMO.setFeatureSpaceNormalization ( boolean p1 )  :  void
SMO.setFilterType ( SelectedTag p1 )  :  void
SMO.setGamma ( double p1 )  :  void
SMO.setLowerOrderTerms ( boolean p1 )  :  void
SMO.setNumFolds ( int p1 )  :  void
SMO.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
SMO.setRandomSeed ( int p1 )  :  void
SMO.setToleranceParameter ( double p1 )  :  void
SMO.setUseRBF ( boolean p1 )  :  void
SMO.SMO ( )
SMO.sparseIndices ( )  :  int[ ][ ][ ]
SMO.sparseWeights ( )  :  double[ ][ ][ ]
SMO.toleranceParameterTipText ( )  :  String
SMO.toString ( )  :  String
SMO.turnChecksOff ( )  :  void
SMO.turnChecksOn ( )  :  void
SMO.useRBFTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, SMOModel.class
package org.openscience.cdk.qsar.model.weka
SMOModel.attributeNames ( )  :  String[ ][ ][ ]
SMOModel.bias ( )  :  double[ ][ ]
SMOModel.build ( )  :  void
SMOModel.classAttributeNames ( )  :  String[ ]
SMOModel.getBuildLogisticModels ( )  :  boolean
SMOModel.getC ( )  :  double
SMOModel.getCacheSize ( )  :  int
SMOModel.getEpsilon ( )  :  double
SMOModel.getExponent ( )  :  double
SMOModel.getFeatureSpaceNormalization ( )  :  boolean
SMOModel.getGamma ( )  :  double
SMOModel.getLowerOrderTerms ( )  :  boolean
SMOModel.getNumFolds ( )  :  int
SMOModel.getOptions ( )  :  String[ ]
SMOModel.getProbabilities ( )  :  Object[ ][ ]
SMOModel.getRandomSeed ( )  :  int
SMOModel.getToleranceParameter ( )  :  double
SMOModel.getUserRBF ( )  :  boolean
SMOModel.numClassAttributeValues ( )  :  int
SMOModel.probabilities ( )  :  void
SMOModel.setData ( String filename )  :  void
SMOModel.setData ( String[ ] attrib, int[ ] typAttrib, String[ ] classAttrib, Object[ ] y, Object[ ][ ] x )  :  void
SMOModel.setOptions ( String[ ] options )  :  void
SMOModel.setParameters ( Object[ ][ ] newX )  :  void
SMOModel.setParameters ( String path )  :  void
SMOModel.SMOModel ( )
SMOModel.sparseIndices ( )  :  int[ ][ ][ ]
SMOModel.sparseWeights ( )  :  double[ ][ ][ ]

cdk-1.0.1.jar, SMOreg.class
package weka.classifiers.functions
SMOreg.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
SMOreg.cacheSizeTipText ( )  :  String
SMOreg.checkAlphas ( )  :  void
SMOreg.checkOptimality ( )  :  void
SMOreg.checkSets ( )  :  void
SMOreg.classifyInstance ( Instance p1 )  :  double
SMOreg.cTipText ( )  :  String
SMOreg.displayB ( )  :  void
SMOreg.displayStat ( int p1, int p2 )  :  void
SMOreg.epsilonTipText ( )  :  String
SMOreg.epsTipText ( )  :  String
SMOreg.examineExample ( int p1 )  :  int
SMOreg.exponentTipText ( )  :  String
SMOreg.featureSpaceNormalizationTipText ( )  :  String
SMOreg.filterTypeTipText ( )  :  String
SMOreg.gammaTipText ( )  :  String
SMOreg.getC ( )  :  double
SMOreg.getCacheSize ( )  :  int
SMOreg.getEps ( )  :  double
SMOreg.getEpsilon ( )  :  double
SMOreg.getExponent ( )  :  double
SMOreg.getFeatureSpaceNormalization ( )  :  boolean
SMOreg.getFilterType ( )  :  SelectedTag
SMOreg.getGamma ( )  :  double
SMOreg.getLowerOrderTerms ( )  :  boolean
SMOreg.getOptions ( )  :  String[ ]
SMOreg.getToleranceParameter ( )  :  double
SMOreg.getUseRBF ( )  :  boolean
SMOreg.globalInfo ( )  :  String
SMOreg.listOptions ( )  :  Enumeration
SMOreg.lowerOrderTermsTipText ( )  :  String
SMOreg.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
SMOreg.objFun ( )  :  double
SMOreg.objFun ( int p1, int p2, double p3, double p4, double p5, double p6 )  :  double
SMOreg.setC ( double p1 )  :  void
SMOreg.setCacheSize ( int p1 )  :  void
SMOreg.setEps ( double p1 )  :  void
SMOreg.setEpsilon ( double p1 )  :  void
SMOreg.setExponent ( double p1 )  :  void
SMOreg.setFeatureSpaceNormalization ( boolean p1 )  :  void
SMOreg.setFilterType ( SelectedTag p1 )  :  void
SMOreg.setGamma ( double p1 )  :  void
SMOreg.setLowerOrderTerms ( boolean p1 )  :  void
SMOreg.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
SMOreg.setToleranceParameter ( double p1 )  :  void
SMOreg.setUseRBF ( boolean p1 )  :  void
SMOreg.SMOreg ( )
SMOreg.takeStep ( int p1, int p2 )  :  boolean
SMOreg.toleranceParameterTipText ( )  :  String
SMOreg.toString ( )  :  String
SMOreg.turnChecksOff ( )  :  void
SMOreg.turnChecksOn ( )  :  void
SMOreg.useRBFTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, SMOregModel.class
package org.openscience.cdk.qsar.model.weka
SMOregModel.build ( )  :  void
SMOregModel.classifyInstance ( )  :  void
SMOregModel.getC ( )  :  double
SMOregModel.getCacheSize ( )  :  int
SMOregModel.getClassification ( )  :  Object[ ]
SMOregModel.getEps ( )  :  double
SMOregModel.getEpsilon ( )  :  double
SMOregModel.getExponent ( )  :  double
SMOregModel.getFeatureSpaceNormalization ( )  :  boolean
SMOregModel.getGamma ( )  :  double
SMOregModel.getLowerOrderTerms ( )  :  boolean
SMOregModel.getToleranceParameter ( )  :  double
SMOregModel.getUserRBF ( )  :  boolean
SMOregModel.setData ( int[ ] typAttrib, Object[ ] y, Object[ ][ ] x, String[ ] attrib )  :  void
SMOregModel.setData ( Object[ ] y, Object[ ][ ] x )  :  void
SMOregModel.setData ( String filename )  :  void
SMOregModel.setParameters ( Object[ ][ ] newX )  :  void
SMOregModel.setParameters ( String path )  :  void
SMOregModel.SMOregModel ( )

cdk-1.0.1.jar, SMOset.class
package weka.classifiers.functions.supportVector
SMOset.contains ( int p1 )  :  boolean
SMOset.delete ( int p1 )  :  void
SMOset.getNext ( int p1 )  :  int
SMOset.insert ( int p1 )  :  void
SMOset.numElements ( )  :  int
SMOset.printElements ( )  :  void
SMOset.SMOset ( int p1 )

cdk-1.0.1.jar, Sourcable.class
package weka.classifiers
Sourcable.toSource ( String p1 ) [abstract]  :  String

cdk-1.0.1.jar, SparseInstance.class
package weka.core
SparseInstance.attributeSparse ( int p1 )  :  Attribute
SparseInstance.copy ( )  :  Object
SparseInstance.index ( int p1 )  :  int
SparseInstance.isMissing ( int p1 )  :  boolean
SparseInstance.locateIndex ( int p1 )  :  int
SparseInstance.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
SparseInstance.mergeInstance ( Instance p1 )  :  Instance
SparseInstance.numAttributes ( )  :  int
SparseInstance.numValues ( )  :  int
SparseInstance.replaceMissingValues ( double[ ] p1 )  :  void
SparseInstance.setValue ( int p1, double p2 )  :  void
SparseInstance.setValueSparse ( int p1, double p2 )  :  void
SparseInstance.SparseInstance ( )
SparseInstance.SparseInstance ( double p1, double[ ] p2 )
SparseInstance.SparseInstance ( double p1, double[ ] p2, int[ ] p3, int p4 )
SparseInstance.SparseInstance ( Instance p1 )
SparseInstance.SparseInstance ( int p1 )
SparseInstance.SparseInstance ( SparseInstance p1 )
SparseInstance.toDoubleArray ( )  :  double[ ]
SparseInstance.toString ( )  :  String
SparseInstance.value ( int p1 )  :  double

cdk-1.0.1.jar, SparseToNonSparse.class
package weka.filters.unsupervised.instance
SparseToNonSparse.globalInfo ( )  :  String
SparseToNonSparse.input ( Instance p1 )  :  boolean
SparseToNonSparse.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
SparseToNonSparse.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
SparseToNonSparse.SparseToNonSparse ( )

cdk-1.0.1.jar, SpecialFunctions.class
package weka.core
SpecialFunctions.lnFactorial ( double p1 ) [static]  :  double
SpecialFunctions.log2Binomial ( double p1, double p2 ) [static]  :  double
SpecialFunctions.log2Multinomial ( double p1, double[ ] p2 ) [static]  :  double
SpecialFunctions.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
SpecialFunctions.SpecialFunctions ( )

cdk-1.0.1.jar, SplashWindow.class
package weka.gui
SplashWindow.disposeSplash ( ) [static]  :  void
SplashWindow.invokeMain ( String p1, String[ ] p2 ) [static]  :  void
SplashWindow.invokeMethod ( String p1, String p2, String[ ] p3 ) [static]  :  void
SplashWindow.paint ( Graphics p1 )  :  void
SplashWindow.splash ( Image p1 ) [static]  :  void
SplashWindow.splash ( URL p1 ) [static]  :  void
SplashWindow.update ( Graphics p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, SplitCriterion.class
package weka.classifiers.trees.j48
SplitCriterion.SplitCriterion ( )
SplitCriterion.splitCritValue ( Distribution p1 )  :  double
SplitCriterion.splitCritValue ( Distribution p1, Distribution p2 )  :  double
SplitCriterion.splitCritValue ( Distribution p1, Distribution p2, Distribution p3 )  :  double
SplitCriterion.splitCritValue ( Distribution p1, Distribution p2, int p3 )  :  double

cdk-1.0.1.jar, SplitEvaluate.class
package weka.classifiers.trees.m5
SplitEvaluate.attrSplit ( int p1, Instances p2 ) [abstract]  :  void
SplitEvaluate.copy ( ) [abstract]  :  SplitEvaluate
SplitEvaluate.maxImpurity ( ) [abstract]  :  double
SplitEvaluate.position ( ) [abstract]  :  int
SplitEvaluate.splitAttr ( ) [abstract]  :  int
SplitEvaluate.splitValue ( ) [abstract]  :  double

cdk-1.0.1.jar, SplitEvaluator.class
package weka.experiment
SplitEvaluator.getKey ( ) [abstract]  :  Object[ ]
SplitEvaluator.getKeyNames ( ) [abstract]  :  String[ ]
SplitEvaluator.getKeyTypes ( ) [abstract]  :  Object[ ]
SplitEvaluator.getRawResultOutput ( ) [abstract]  :  String
SplitEvaluator.getResult ( Instances p1, Instances p2 ) [abstract]  :  Object[ ]
SplitEvaluator.getResultNames ( ) [abstract]  :  String[ ]
SplitEvaluator.getResultTypes ( ) [abstract]  :  Object[ ]
SplitEvaluator.setAdditionalMeasures ( String[ ] p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, Splitter.class
package weka.classifiers.trees.adtree
Splitter.attributeString ( Instances p1 ) [abstract]  :  String
Splitter.branchInstanceGoesDown ( Instance p1 ) [abstract]  :  int
Splitter.clone ( ) [abstract]  :  Object
Splitter.comparisonString ( int p1, Instances p2 ) [abstract]  :  String
Splitter.equalTo ( Splitter p1 ) [abstract]  :  boolean
Splitter.getChildForBranch ( int p1 ) [abstract]  :  PredictionNode
Splitter.getNumOfBranches ( ) [abstract]  :  int
Splitter.instancesDownBranch ( int p1, Instances p2 ) [abstract]  :  ReferenceInstances
Splitter.setChildForBranch ( int p1, PredictionNode p2 ) [abstract]  :  void
Splitter.Splitter ( )

cdk-1.0.1.jar, SpreadSubsample.class
package weka.filters.supervised.instance
SpreadSubsample.adjustWeightsTipText ( )  :  String
SpreadSubsample.batchFinished ( )  :  boolean
SpreadSubsample.distributionSpreadTipText ( )  :  String
SpreadSubsample.getAdjustWeights ( )  :  boolean
SpreadSubsample.getDistributionSpread ( )  :  double
SpreadSubsample.getMaxCount ( )  :  double
SpreadSubsample.getOptions ( )  :  String[ ]
SpreadSubsample.getRandomSeed ( )  :  int
SpreadSubsample.globalInfo ( )  :  String
SpreadSubsample.input ( Instance p1 )  :  boolean
SpreadSubsample.listOptions ( )  :  Enumeration
SpreadSubsample.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
SpreadSubsample.maxCountTipText ( )  :  String
SpreadSubsample.randomSeedTipText ( )  :  String
SpreadSubsample.setAdjustWeights ( boolean p1 )  :  void
SpreadSubsample.setDistributionSpread ( double p1 )  :  void
SpreadSubsample.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
SpreadSubsample.setMaxCount ( double p1 )  :  void
SpreadSubsample.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
SpreadSubsample.setRandomSeed ( int p1 )  :  void
SpreadSubsample.SpreadSubsample ( )

cdk-1.0.1.jar, Stacking.class
package weka.classifiers.meta
Stacking.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
Stacking.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
Stacking.generateMetaLevel ( Instances p1, Random p2 )  :  void
Stacking.getMetaClassifier ( )  :  Classifier
Stacking.getNumFolds ( )  :  int
Stacking.getOptions ( )  :  String[ ]
Stacking.globalInfo ( )  :  String
Stacking.listOptions ( )  :  Enumeration
Stacking.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Stacking.metaClassifierTipText ( )  :  String
Stacking.metaFormat ( Instances p1 )  :  Instances
Stacking.metaInstance ( Instance p1 )  :  Instance
Stacking.metaOption ( )  :  String
Stacking.numFoldsTipText ( )  :  String
Stacking.processMetaOptions ( String[ ] p1 )  :  void
Stacking.setMetaClassifier ( Classifier p1 )  :  void
Stacking.setNumFolds ( int p1 )  :  void
Stacking.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
Stacking.Stacking ( )
Stacking.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, StackingC.class
package weka.classifiers.meta
StackingC.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
StackingC.generateMetaLevel ( Instances p1, Random p2 )  :  void
StackingC.globalInfo ( )  :  String
StackingC.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
StackingC.metaOption ( )  :  String
StackingC.processMetaOptions ( String[ ] p1 )  :  void
StackingC.StackingC ( )
StackingC.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, Standardize.class
package weka.filters.unsupervised.attribute
Standardize.batchFinished ( )  :  boolean
Standardize.globalInfo ( )  :  String
Standardize.input ( Instance p1 )  :  boolean
Standardize.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Standardize.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
Standardize.Standardize ( )

cdk-1.0.1.jar, StartSetHandler.class
package weka.attributeSelection
StartSetHandler.getStartSet ( ) [abstract]  :  String
StartSetHandler.setStartSet ( String p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, StartUpListener.class
package weka.gui.beans
StartUpListener.startUpComplete ( ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, Statistics.class
package weka.core
Statistics.binomialStandardError ( double p1, int p2 ) [static]  :  double
Statistics.chiSquaredProbability ( double p1, double p2 ) [static]  :  double
Statistics.FProbability ( double p1, int p2, int p3 ) [static]  :  double
Statistics.incompleteBeta ( double p1, double p2, double p3 ) [static]  :  double
Statistics.lnGamma ( double p1 ) [static]  :  double
Statistics.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Statistics.normalInverse ( double p1 ) [static]  :  double
Statistics.normalProbability ( double p1 ) [static]  :  double
Statistics.Statistics ( )

cdk-1.0.1.jar, Stats.class
package weka.classifiers.trees.j48
Stats.addErrs ( double p1, double p2, float p3 ) [static]  :  double
Stats.Stats ( )
package weka.experiment
Stats.add ( double p1 )  :  void
Stats.add ( double p1, double p2 )  :  void
Stats.calculateDerived ( )  :  void
Stats.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Stats.Stats ( )
Stats.subtract ( double p1 )  :  void
Stats.subtract ( double p1, double p2 )  :  void
Stats.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, StereoBond.class
package org.openscience.cdk.isomorphism.matchers.smarts
StereoBond.matches ( IBond bond )  :  boolean
StereoBond.StereoBond ( )

cdk-1.0.1.jar, Stopwords.class
package weka.core
Stopwords.isStopword ( String p1 ) [static]  :  boolean
Stopwords.Stopwords ( )

cdk-1.0.1.jar, StratifiedRemoveFolds.class
package weka.filters.supervised.instance
StratifiedRemoveFolds.batchFinished ( )  :  boolean
StratifiedRemoveFolds.foldTipText ( )  :  String
StratifiedRemoveFolds.getFold ( )  :  int
StratifiedRemoveFolds.getInvertSelection ( )  :  boolean
StratifiedRemoveFolds.getNumFolds ( )  :  int
StratifiedRemoveFolds.getOptions ( )  :  String[ ]
StratifiedRemoveFolds.getSeed ( )  :  long
StratifiedRemoveFolds.globalInfo ( )  :  String
StratifiedRemoveFolds.invertSelectionTipText ( )  :  String
StratifiedRemoveFolds.listOptions ( )  :  Enumeration
StratifiedRemoveFolds.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
StratifiedRemoveFolds.numFoldsTipText ( )  :  String
StratifiedRemoveFolds.seedTipText ( )  :  String
StratifiedRemoveFolds.setFold ( int p1 )  :  void
StratifiedRemoveFolds.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
StratifiedRemoveFolds.setInvertSelection ( boolean p1 )  :  void
StratifiedRemoveFolds.setNumFolds ( int p1 )  :  void
StratifiedRemoveFolds.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
StratifiedRemoveFolds.setSeed ( long p1 )  :  void
StratifiedRemoveFolds.StratifiedRemoveFolds ( )

cdk-1.0.1.jar, StringCompare.class
package weka.core
RTSI.StringCompare.compare ( Object p1, Object p2 )  :  int
RTSI.StringCompare.equals ( Object p1 )  :  boolean
RTSI.StringCompare.RTSI.StringCompare ( RTSI p1 )

cdk-1.0.1.jar, StringToNominal.class
package weka.filters.unsupervised.attribute
StringToNominal.attributeIndexTipText ( )  :  String
StringToNominal.batchFinished ( )  :  boolean
StringToNominal.getAttributeIndex ( )  :  String
StringToNominal.getOptions ( )  :  String[ ]
StringToNominal.globalInfo ( )  :  String
StringToNominal.input ( Instance p1 )  :  boolean
StringToNominal.listOptions ( )  :  Enumeration
StringToNominal.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
StringToNominal.setAttributeIndex ( String p1 )  :  void
StringToNominal.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
StringToNominal.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
StringToNominal.StringToNominal ( )

cdk-1.0.1.jar, StringToWordVector.class
package weka.filters.unsupervised.attribute
StringToWordVector.attributeNamePrefixTipText ( )  :  String
StringToWordVector.batchFinished ( )  :  boolean
StringToWordVector.delimitersTipText ( )  :  String
StringToWordVector.getAttributeNamePrefix ( )  :  String
StringToWordVector.getDelimiters ( )  :  String
StringToWordVector.getIDFTransform ( )  :  boolean
StringToWordVector.getLowerCaseTokens ( )  :  boolean
StringToWordVector.getNormalizeDocLength ( )  :  boolean
StringToWordVector.getOnlyAlphabeticTokens ( )  :  boolean
StringToWordVector.getOptions ( )  :  String[ ]
StringToWordVector.getOutputWordCounts ( )  :  boolean
StringToWordVector.getSelectedRange ( )  :  Range
StringToWordVector.getTFTransform ( )  :  boolean
StringToWordVector.getUseStoplist ( )  :  boolean
StringToWordVector.getWordsToKeep ( )  :  int
StringToWordVector.globalInfo ( )  :  String
StringToWordVector.IDFTransformTipText ( )  :  String
StringToWordVector.input ( Instance p1 )  :  boolean
StringToWordVector.listOptions ( )  :  Enumeration
StringToWordVector.lowerCaseTokensTipText ( )  :  String
StringToWordVector.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
StringToWordVector.normalizeDocLengthTipText ( )  :  String
StringToWordVector.onlyAlphabeticTokensTipText ( )  :  String
StringToWordVector.outputWordCountsTipText ( )  :  String
StringToWordVector.setAttributeNamePrefix ( String p1 )  :  void
StringToWordVector.setDelimiters ( String p1 )  :  void
StringToWordVector.setIDFTransform ( boolean p1 )  :  void
StringToWordVector.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
StringToWordVector.setLowerCaseTokens ( boolean p1 )  :  void
StringToWordVector.setNormalizeDocLength ( boolean p1 )  :  void
StringToWordVector.setOnlyAlphabeticTokens ( boolean p1 )  :  void
StringToWordVector.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
StringToWordVector.setOutputWordCounts ( boolean p1 )  :  void
StringToWordVector.setSelectedRange ( String p1 )  :  void
StringToWordVector.setTFTransform ( boolean p1 )  :  void
StringToWordVector.setUseStoplist ( boolean p1 )  :  void
StringToWordVector.setWordsToKeep ( int p1 )  :  void
StringToWordVector.StringToWordVector ( )
StringToWordVector.StringToWordVector ( int p1 )
StringToWordVector.TFTransformTipText ( )  :  String
StringToWordVector.useStoplistTipText ( )  :  String
StringToWordVector.wordsToKeepTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, StripChart.class
package weka.gui.beans
StripChart.acceptDataPoint ( ChartEvent p1 )  :  void
StripChart.acceptDataPoint ( double[ ] p1 )  :  void
StripChart.acceptInstance ( InstanceEvent p1 )  :  void
StripChart.connectionAllowed ( EventSetDescriptor p1 )  :  boolean
StripChart.connectionAllowed ( String p1 )  :  boolean
StripChart.connectionNotification ( String p1, Object p2 )  :  void
StripChart.disconnectionNotification ( String p1, Object p2 )  :  void
StripChart.enumerateRequests ( )  :  Enumeration
StripChart.getRefreshFreq ( )  :  int
StripChart.getVisual ( )  :  BeanVisual
StripChart.getXLabelFreq ( )  :  int
StripChart.globalInfo ( )  :  String
StripChart.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
StripChart.performRequest ( String p1 )  :  void
StripChart.refreshFreqTipText ( )  :  String
StripChart.setLog ( Logger p1 )  :  void
StripChart.setRefreshFreq ( int p1 )  :  void
StripChart.setVisual ( BeanVisual p1 )  :  void
StripChart.setXLabelFreq ( int p1 )  :  void
StripChart.showChart ( )  :  void
StripChart.stop ( )  :  void
StripChart.StripChart ( )
StripChart.updateChart ( double[ ] p1 )  :  void
StripChart.useDefaultVisual ( )  :  void
StripChart.xLabelFreqTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, StripChartBeanInfo.class
package weka.gui.beans
StripChartBeanInfo.getBeanDescriptor ( )  :  BeanDescriptor
StripChartBeanInfo.getEventSetDescriptors ( )  :  EventSetDescriptor[ ]
StripChartBeanInfo.getPropertyDescriptors ( )  :  PropertyDescriptor[ ]
StripChartBeanInfo.StripChartBeanInfo ( )

cdk-1.0.1.jar, StripChartCustomizer.class
package weka.gui.beans
StripChartCustomizer.addPropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
StripChartCustomizer.removePropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
StripChartCustomizer.setObject ( Object p1 )  :  void
StripChartCustomizer.StripChartCustomizer ( )

cdk-1.0.1.jar, SubsetEvaluator.class
package weka.attributeSelection
SubsetEvaluator.evaluateSubset ( BitSet p1 ) [abstract]  :  double
SubsetEvaluator.SubsetEvaluator ( )

cdk-1.0.1.jar, SubstructureFinder.class
package org.openscience.cdk.applications
SubstructureFinder.main ( String[ ] args ) [static]  :  void
SubstructureFinder.SubstructureFinder ( )

cdk-1.0.1.jar, Summarizable.class
package weka.core
Summarizable.toSummaryString ( ) [abstract]  :  String

cdk-1.0.1.jar, SVMAttributeEval.class
package weka.attributeSelection
SVMAttributeEval.attsToEliminatePerIterationTipText ( )  :  String
SVMAttributeEval.buildEvaluator ( Instances p1 )  :  void
SVMAttributeEval.complexityParameterTipText ( )  :  String
SVMAttributeEval.epsilonParameterTipText ( )  :  String
SVMAttributeEval.evaluateAttribute ( int p1 )  :  double
SVMAttributeEval.filterTypeTipText ( )  :  String
SVMAttributeEval.getAttsToEliminatePerIteration ( )  :  int
SVMAttributeEval.getComplexityParameter ( )  :  double
SVMAttributeEval.getEpsilonParameter ( )  :  double
SVMAttributeEval.getFilterType ( )  :  SelectedTag
SVMAttributeEval.getOptions ( )  :  String[ ]
SVMAttributeEval.getPercentThreshold ( )  :  int
SVMAttributeEval.getPercentToEliminatePerIteration ( )  :  int
SVMAttributeEval.getToleranceParameter ( )  :  double
SVMAttributeEval.globalInfo ( )  :  String
SVMAttributeEval.listOptions ( )  :  Enumeration
SVMAttributeEval.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
SVMAttributeEval.percentThresholdTipText ( )  :  String
SVMAttributeEval.percentToEliminatePerIterationTipText ( )  :  String
SVMAttributeEval.resetOptions ( )  :  void
SVMAttributeEval.setAttsToEliminatePerIteration ( int p1 )  :  void
SVMAttributeEval.setComplexityParameter ( double p1 )  :  void
SVMAttributeEval.setEpsilonParameter ( double p1 )  :  void
SVMAttributeEval.setFilterType ( SelectedTag p1 )  :  void
SVMAttributeEval.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
SVMAttributeEval.setPercentThreshold ( int p1 )  :  void
SVMAttributeEval.setPercentToEliminatePerIteration ( int p1 )  :  void
SVMAttributeEval.setToleranceParameter ( double p1 )  :  void
SVMAttributeEval.SVMAttributeEval ( )
SVMAttributeEval.toleranceParameterTipText ( )  :  String
SVMAttributeEval.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, SwapValues.class
package weka.filters.unsupervised.attribute
SwapValues.attributeIndexTipText ( )  :  String
SwapValues.firstValueIndexTipText ( )  :  String
SwapValues.getAttributeIndex ( )  :  String
SwapValues.getFirstValueIndex ( )  :  String
SwapValues.getOptions ( )  :  String[ ]
SwapValues.getSecondValueIndex ( )  :  String
SwapValues.globalInfo ( )  :  String
SwapValues.input ( Instance p1 )  :  boolean
SwapValues.listOptions ( )  :  Enumeration
SwapValues.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
SwapValues.secondValueIndexTipText ( )  :  String
SwapValues.setAttributeIndex ( String p1 )  :  void
SwapValues.setFirstValueIndex ( String p1 )  :  void
SwapValues.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
SwapValues.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
SwapValues.setSecondValueIndex ( String p1 )  :  void
SwapValues.SwapValues ( )

cdk-1.0.1.jar, SymmetricalUncertAttributeEval.class
package weka.attributeSelection
SymmetricalUncertAttributeEval.buildEvaluator ( Instances p1 )  :  void
SymmetricalUncertAttributeEval.evaluateAttribute ( int p1 )  :  double
SymmetricalUncertAttributeEval.getMissingMerge ( )  :  boolean
SymmetricalUncertAttributeEval.getOptions ( )  :  String[ ]
SymmetricalUncertAttributeEval.globalInfo ( )  :  String
SymmetricalUncertAttributeEval.listOptions ( )  :  Enumeration
SymmetricalUncertAttributeEval.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
SymmetricalUncertAttributeEval.missingMergeTipText ( )  :  String
SymmetricalUncertAttributeEval.resetOptions ( )  :  void
SymmetricalUncertAttributeEval.setMissingMerge ( boolean p1 )  :  void
SymmetricalUncertAttributeEval.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
SymmetricalUncertAttributeEval.SymmetricalUncertAttributeEval ( )
SymmetricalUncertAttributeEval.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, SysErrLog.class
package weka.gui
SysErrLog.getTimestamp ( ) [static]  :  String
SysErrLog.logMessage ( String p1 )  :  void
SysErrLog.statusMessage ( String p1 )  :  void
SysErrLog.SysErrLog ( )

cdk-1.0.1.jar, SystemInfo.class
package weka.core
SystemInfo.getSystemInfo ( )  :  Hashtable
SystemInfo.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
SystemInfo.SystemInfo ( )
SystemInfo.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, TableEntry.class
package weka.classifiers.lazy.kstar
KStarCache.TableEntry.KStarCache.TableEntry ( KStarCache p1, int p2, double p3, double p4, double p5, KStarCache.TableEntry p6 )

cdk-1.0.1.jar, TableMap.class
package weka.gui
TableMap.getColumnClass ( int p1 )  :  Class
TableMap.getColumnCount ( )  :  int
TableMap.getColumnName ( int p1 )  :  String
TableMap.getModel ( )  :  TableModel
TableMap.getRowCount ( )  :  int
TableMap.getValueAt ( int p1, int p2 )  :  Object
TableMap.isCellEditable ( int p1, int p2 )  :  boolean
TableMap.setModel ( TableModel p1 )  :  void
TableMap.setValueAt ( Object p1, int p2, int p3 )  :  void
TableMap.tableChanged ( TableModelEvent p1 )  :  void
TableMap.TableMap ( )

cdk-1.0.1.jar, TableSorter.class
package weka.gui
TableSorter.addMouseListenerToHeaderInTable ( JTable p1 )  :  void
TableSorter.checkModel ( )  :  void
TableSorter.compare ( int p1, int p2 )  :  int
TableSorter.compareRowsByColumn ( int p1, int p2, int p3 )  :  int
TableSorter.getModelValueAt ( int p1, int p2 )  :  Object
TableSorter.getValueAt ( int p1, int p2 )  :  Object
TableSorter.n2sort ( )  :  void
TableSorter.reallocateIndexes ( )  :  void
TableSorter.setModel ( TableModel p1 )  :  void
TableSorter.setValueAt ( Object p1, int p2, int p3 )  :  void
TableSorter.shuttlesort ( int[ ] p1, int[ ] p2, int p3, int p4 )  :  void
TableSorter.sort ( Object p1 )  :  void
TableSorter.sortByColumn ( int p1 )  :  void
TableSorter.sortByColumn ( int p1, boolean p2 )  :  void
TableSorter.swap ( int p1, int p2 )  :  void
TableSorter.tableChanged ( TableModelEvent p1 )  :  void
TableSorter.TableSorter ( )
TableSorter.TableSorter ( TableModel p1 )

cdk-1.0.1.jar, TabuSearch.class
package weka.classifiers.bayes.net.search.global
TabuSearch.getOptions ( )  :  String[ ]
TabuSearch.getRuns ( )  :  int
TabuSearch.getTabuList ( )  :  int
TabuSearch.globalInfo ( )  :  String
TabuSearch.listOptions ( )  :  Enumeration
TabuSearch.runsTipText ( )  :  String
TabuSearch.search ( BayesNet p1, Instances p2 )  :  void
TabuSearch.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
TabuSearch.setRuns ( int p1 )  :  void
TabuSearch.setTabuList ( int p1 )  :  void
TabuSearch.tabuListTipText ( )  :  String
TabuSearch.TabuSearch ( )
package weka.classifiers.bayes.net.search.local
TabuSearch.getOptions ( )  :  String[ ]
TabuSearch.getRuns ( )  :  int
TabuSearch.getTabuList ( )  :  int
TabuSearch.globalInfo ( )  :  String
TabuSearch.listOptions ( )  :  Enumeration
TabuSearch.runsTipText ( )  :  String
TabuSearch.search ( BayesNet p1, Instances p2 )  :  void
TabuSearch.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
TabuSearch.setRuns ( int p1 )  :  void
TabuSearch.setTabuList ( int p1 )  :  void
TabuSearch.tabuListTipText ( )  :  String
TabuSearch.TabuSearch ( )

cdk-1.0.1.jar, Tag.class
package weka.core
Tag.getID ( )  :  int
Tag.getReadable ( )  :  String
Tag.Tag ( int p1, String p2 )

cdk-1.0.1.jar, TAN.class
package weka.classifiers.bayes.net.search.global
TAN.buildStructure ( BayesNet p1, Instances p2 )  :  void
TAN.getOptions ( )  :  String[ ]
TAN.globalInfo ( )  :  String
TAN.listOptions ( )  :  Enumeration
TAN.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
TAN.TAN ( )
package weka.classifiers.bayes.net.search.local
TAN.buildStructure ( BayesNet p1, Instances p2 )  :  void
TAN.getOptions ( )  :  String[ ]
TAN.globalInfo ( )  :  String
TAN.listOptions ( )  :  Enumeration
TAN.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
TAN.TAN ( )

cdk-1.0.1.jar, Task.class
package weka.experiment
Task.execute ( ) [abstract]  :  void
Task.getTaskStatus ( ) [abstract]  :  TaskStatusInfo

cdk-1.0.1.jar, TaskLogger.class
package weka.gui
TaskLogger.taskFinished ( ) [abstract]  :  void
TaskLogger.taskStarted ( ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, TaskStatusInfo.class
package weka.experiment
TaskStatusInfo.getExecutionStatus ( )  :  int
TaskStatusInfo.getStatusMessage ( )  :  String
TaskStatusInfo.getTaskResult ( )  :  Object
TaskStatusInfo.setExecutionStatus ( int p1 )  :  void
TaskStatusInfo.setStatusMessage ( String p1 )  :  void
TaskStatusInfo.setTaskResult ( Object p1 )  :  void
TaskStatusInfo.TaskStatusInfo ( )

cdk-1.0.1.jar, TemplateHandler.class
package org.openscience.cdk.layout
TemplateHandler.addMolecule ( IMolecule molecule )  :  void
TemplateHandler.mapTemplateExact ( IMolecule molecule )  :  boolean
TemplateHandler.mapTemplates ( IMolecule molecule )  :  boolean
TemplateHandler.removeMolecule ( IMolecule molecule )  :  IMolecule

cdk-1.0.1.jar, Tertius.class
package weka.associations
Tertius.buildAssociations ( Instances p1 )  :  void
Tertius.classificationTipText ( )  :  String
Tertius.classIndexTipText ( )  :  String
Tertius.confirmationThresholdTipText ( )  :  String
Tertius.confirmationValuesTipText ( )  :  String
Tertius.disabled_getEquivalent ( )  :  boolean
Tertius.disabled_getPartFile ( )  :  File
Tertius.disabled_getSameClause ( )  :  boolean
Tertius.disabled_getSubsumption ( )  :  boolean
Tertius.disabled_setEquivalent ( boolean p1 )  :  void
Tertius.disabled_setPartFile ( File p1 )  :  void
Tertius.disabled_setSameClause ( boolean p1 )  :  void
Tertius.disabled_setSubsumption ( boolean p1 )  :  void
Tertius.equivalentTipText ( )  :  String
Tertius.frequencyThresholdTipText ( )  :  String
Tertius.getClassification ( )  :  boolean
Tertius.getClassIndex ( )  :  int
Tertius.getConfirmationThreshold ( )  :  double
Tertius.getConfirmationValues ( )  :  int
Tertius.getFrequencyThreshold ( )  :  double
Tertius.getHornClauses ( )  :  boolean
Tertius.getMissingValues ( )  :  SelectedTag
Tertius.getNegation ( )  :  SelectedTag
Tertius.getNoiseThreshold ( )  :  double
Tertius.getNumberLiterals ( )  :  int
Tertius.getOptions ( )  :  String[ ]
Tertius.getRepeatLiterals ( )  :  boolean
Tertius.getRocAnalysis ( )  :  boolean
Tertius.getValuesOutput ( )  :  SelectedTag
Tertius.globalInfo ( )  :  String
Tertius.hornClausesTipText ( )  :  String
Tertius.listOptions ( )  :  Enumeration
Tertius.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Tertius.missingValuesTipText ( )  :  String
Tertius.negationTipText ( )  :  String
Tertius.noiseThresholdTipText ( )  :  String
Tertius.numberLiteralsTipText ( )  :  String
Tertius.partFileTipText ( )  :  String
Tertius.repeatLiteralsTipText ( )  :  String
Tertius.resetOptions ( )  :  void
Tertius.rocAnalysisTipText ( )  :  String
Tertius.run ( )  :  void
Tertius.sameClauseTipText ( )  :  String
Tertius.search ( )  :  void
Tertius.setClassification ( boolean p1 )  :  void
Tertius.setClassIndex ( int p1 )  :  void
Tertius.setConfirmationThreshold ( double p1 )  :  void
Tertius.setConfirmationValues ( int p1 )  :  void
Tertius.setFrequencyThreshold ( double p1 )  :  void
Tertius.setHornClauses ( boolean p1 )  :  void
Tertius.setMissingValues ( SelectedTag p1 )  :  void
Tertius.setNegation ( SelectedTag p1 )  :  void
Tertius.setNoiseThreshold ( double p1 )  :  void
Tertius.setNumberLiterals ( int p1 )  :  void
Tertius.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
Tertius.setRepeatLiterals ( boolean p1 )  :  void
Tertius.setRocAnalysis ( boolean p1 )  :  void
Tertius.setValuesOutput ( SelectedTag p1 )  :  void
Tertius.subsumptionTipText ( )  :  String
Tertius.Tertius ( )
Tertius.toString ( )  :  String
Tertius.valuesOutputTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, Test.class
package weka.datagenerators
Test.equalTo ( Test p1 )  :  boolean
Test.getNot ( )  :  Test
Test.passesTest ( Instance p1 )  :  boolean
Test.toPrologString ( )  :  String
Test.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, TestMatrix.class
package Jama.test
TestMatrix.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
TestMatrix.TestMatrix ( )

cdk-1.0.1.jar, TestSetEvent.class
package weka.gui.beans
TestSetEvent.getMaxSetNumber ( )  :  int
TestSetEvent.getSetNumber ( )  :  int
TestSetEvent.getTestSet ( )  :  Instances
TestSetEvent.isStructureOnly ( )  :  boolean
TestSetEvent.TestSetEvent ( Object p1, Instances p2 )

cdk-1.0.1.jar, TestSetListener.class
package weka.gui.beans
TestSetListener.acceptTestSet ( TestSetEvent p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, TestSetMaker.class
package weka.gui.beans
TestSetMaker.acceptDataSet ( DataSetEvent p1 )  :  void
TestSetMaker.eventGeneratable ( String p1 )  :  boolean
TestSetMaker.globalInfo ( )  :  String
TestSetMaker.notifyTestSetProduced ( TestSetEvent p1 )  :  void
TestSetMaker.stop ( )  :  void
TestSetMaker.TestSetMaker ( )

cdk-1.0.1.jar, TestSetMakerBeanInfo.class
package weka.gui.beans
TestSetMakerBeanInfo.TestSetMakerBeanInfo ( )

cdk-1.0.1.jar, TestSetProducer.class
package weka.gui.beans
TestSetProducer.addTestSetListener ( TestSetListener p1 ) [abstract]  :  void
TestSetProducer.removeTestSetListener ( TestSetListener p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, TextEvent.class
package weka.gui.beans
TextEvent.getText ( )  :  String
TextEvent.getTextTitle ( )  :  String
TextEvent.TextEvent ( Object p1, String p2, String p3 )

cdk-1.0.1.jar, TextListener.class
package weka.gui.beans
TextListener.acceptText ( TextEvent p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, TextViewer.class
package weka.gui.beans
TextViewer.acceptDataSet ( DataSetEvent p1 )  :  void
TextViewer.acceptTestSet ( TestSetEvent p1 )  :  void
TextViewer.acceptText ( TextEvent p1 )  :  void
TextViewer.acceptTrainingSet ( TrainingSetEvent p1 )  :  void
TextViewer.addPropertyChangeListener ( String p1, PropertyChangeListener p2 )  :  void
TextViewer.addVetoableChangeListener ( String p1, VetoableChangeListener p2 )  :  void
TextViewer.appearanceDesign ( )  :  void
TextViewer.appearanceFinal ( )  :  void
TextViewer.enumerateRequests ( )  :  Enumeration
TextViewer.getBeanContext ( )  :  BeanContext
TextViewer.getVisual ( )  :  BeanVisual
TextViewer.globalInfo ( )  :  String
TextViewer.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
TextViewer.performRequest ( String p1 )  :  void
TextViewer.removePropertyChangeListener ( String p1, PropertyChangeListener p2 )  :  void
TextViewer.removeVetoableChangeListener ( String p1, VetoableChangeListener p2 )  :  void
TextViewer.setBeanContext ( BeanContext p1 )  :  void
TextViewer.setUpFinal ( )  :  void
TextViewer.setVisual ( BeanVisual p1 )  :  void
TextViewer.showResults ( )  :  void
TextViewer.TextViewer ( )
TextViewer.useDefaultVisual ( )  :  void

cdk-1.0.1.jar, TextViewerBeanInfo.class
package weka.gui.beans
TextViewerBeanInfo.getEventSetDescriptors ( )  :  EventSetDescriptor[ ]
TextViewerBeanInfo.TextViewerBeanInfo ( )

cdk-1.0.1.jar, ThresholdCurve.class
package weka.classifiers.evaluation
ThresholdCurve.getCurve ( FastVector p1 )  :  Instances
ThresholdCurve.getCurve ( FastVector p1, int p2 )  :  Instances
ThresholdCurve.getNPointPrecision ( Instances p1, int p2 ) [static]  :  double
ThresholdCurve.getROCArea ( Instances p1 ) [static]  :  double
ThresholdCurve.getThresholdInstance ( Instances p1, double p2 ) [static]  :  int
ThresholdCurve.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
ThresholdCurve.ThresholdCurve ( )

cdk-1.0.1.jar, ThresholdDataEvent.class
package weka.gui.beans
ThresholdDataEvent.getDataSet ( )  :  PlotData2D
ThresholdDataEvent.ThresholdDataEvent ( Object p1, PlotData2D p2 )

cdk-1.0.1.jar, ThresholdDataListener.class
package weka.gui.beans
ThresholdDataListener.acceptDataSet ( ThresholdDataEvent p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, ThresholdSelector.class
package weka.classifiers.meta
ThresholdSelector.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
ThresholdSelector.defaultClassifierString ( )  :  String
ThresholdSelector.designatedClassTipText ( )  :  String
ThresholdSelector.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
ThresholdSelector.evaluationModeTipText ( )  :  String
ThresholdSelector.findThreshold ( FastVector p1 )  :  void
ThresholdSelector.getDesignatedClass ( )  :  SelectedTag
ThresholdSelector.getEvaluationMode ( )  :  SelectedTag
ThresholdSelector.getNumXValFolds ( )  :  int
ThresholdSelector.getOptions ( )  :  String[ ]
ThresholdSelector.getPredictions ( Instances p1, int p2, int p3 )  :  FastVector
ThresholdSelector.getRangeCorrection ( )  :  SelectedTag
ThresholdSelector.globalInfo ( )  :  String
ThresholdSelector.graph ( )  :  String
ThresholdSelector.graphType ( )  :  int
ThresholdSelector.listOptions ( )  :  Enumeration
ThresholdSelector.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
ThresholdSelector.numXValFoldsTipText ( )  :  String
ThresholdSelector.rangeCorrectionTipText ( )  :  String
ThresholdSelector.setDesignatedClass ( SelectedTag p1 )  :  void
ThresholdSelector.setEvaluationMode ( SelectedTag p1 )  :  void
ThresholdSelector.setNumXValFolds ( int p1 )  :  void
ThresholdSelector.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
ThresholdSelector.setRangeCorrection ( SelectedTag p1 )  :  void
ThresholdSelector.ThresholdSelector ( )
ThresholdSelector.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, ThresholdVisualizePanel.class
package weka.gui.visualize
ThresholdVisualizePanel.getROCString ( )  :  String
ThresholdVisualizePanel.setROCString ( String p1 )  :  void
ThresholdVisualizePanel.setUpComboBoxes ( Instances p1 )  :  void
ThresholdVisualizePanel.ThresholdVisualizePanel ( )

cdk-1.0.1.jar, TimeSeriesDelta.class
package weka.filters.unsupervised.attribute
TimeSeriesDelta.globalInfo ( )  :  String
TimeSeriesDelta.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
TimeSeriesDelta.mergeInstances ( Instance p1, Instance p2 )  :  Instance
TimeSeriesDelta.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
TimeSeriesDelta.TimeSeriesDelta ( )

cdk-1.0.1.jar, TimeSeriesTranslate.class
package weka.filters.unsupervised.attribute
TimeSeriesTranslate.globalInfo ( )  :  String
TimeSeriesTranslate.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
TimeSeriesTranslate.mergeInstances ( Instance p1, Instance p2 )  :  Instance
TimeSeriesTranslate.setInputFormat ( Instances p1 )  :  boolean
TimeSeriesTranslate.TimeSeriesTranslate ( )

cdk-1.0.1.jar, Token.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts
Token.newToken ( int ofKind ) [static]  :  Token
Token.Token ( )
Token.toString ( )  :  String
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
Token.newToken ( int ofKind ) [static]  :  Token
Token.Token ( )
Token.toString ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, TokenMgrError.class
package org.openscience.cdk.smiles.smarts
TokenMgrError.addEscapes ( String str ) [static]  :  String
TokenMgrError.getMessage ( )  :  String
TokenMgrError.LexicalError ( boolean EOFSeen, int lexState, int errorLine, int errorColumn, String errorAfter, char curChar ) [static]  :  String
TokenMgrError.TokenMgrError ( )
TokenMgrError.TokenMgrError ( boolean EOFSeen, int lexState, int errorLine, int errorColumn, String errorAfter, char curChar, int reason )
TokenMgrError.TokenMgrError ( String message, int reason )
package org.openscience.cdk.smiles.smarts.parser
TokenMgrError.addEscapes ( String str ) [static]  :  String
TokenMgrError.getMessage ( )  :  String
TokenMgrError.LexicalError ( boolean EOFSeen, int lexState, int errorLine, int errorColumn, String errorAfter, char curChar ) [static]  :  String
TokenMgrError.TokenMgrError ( )
TokenMgrError.TokenMgrError ( boolean EOFSeen, int lexState, int errorLine, int errorColumn, String errorAfter, char curChar, int reason )
TokenMgrError.TokenMgrError ( String message, int reason )

cdk-1.0.1.jar, TrainingSetEvent.class
package weka.gui.beans
TrainingSetEvent.getMaxSetNumber ( )  :  int
TrainingSetEvent.getSetNumber ( )  :  int
TrainingSetEvent.getTrainingSet ( )  :  Instances
TrainingSetEvent.isStructureOnly ( )  :  boolean
TrainingSetEvent.TrainingSetEvent ( Object p1, Instances p2 )

cdk-1.0.1.jar, TrainingSetListener.class
package weka.gui.beans
TrainingSetListener.acceptTrainingSet ( TrainingSetEvent p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, TrainingSetMaker.class
package weka.gui.beans
TrainingSetMaker.acceptDataSet ( DataSetEvent p1 )  :  void
TrainingSetMaker.eventGeneratable ( String p1 )  :  boolean
TrainingSetMaker.globalInfo ( )  :  String
TrainingSetMaker.notifyTrainingSetProduced ( TrainingSetEvent p1 )  :  void
TrainingSetMaker.stop ( )  :  void
TrainingSetMaker.TrainingSetMaker ( )

cdk-1.0.1.jar, TrainingSetMakerBeanInfo.class
package weka.gui.beans
TrainingSetMakerBeanInfo.TrainingSetMakerBeanInfo ( )

cdk-1.0.1.jar, TrainingSetProducer.class
package weka.gui.beans
TrainingSetProducer.addTrainingSetListener ( TrainingSetListener p1 ) [abstract]  :  void
TrainingSetProducer.removeTrainingSetListener ( TrainingSetListener p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, TrainTestSplitMaker.class
package weka.gui.beans
TrainTestSplitMaker.acceptDataSet ( DataSetEvent p1 )  :  void
TrainTestSplitMaker.acceptTestSet ( TestSetEvent p1 )  :  void
TrainTestSplitMaker.acceptTrainingSet ( TrainingSetEvent p1 )  :  void
TrainTestSplitMaker.enumerateRequests ( )  :  Enumeration
TrainTestSplitMaker.eventGeneratable ( String p1 )  :  boolean
TrainTestSplitMaker.getSeed ( )  :  int
TrainTestSplitMaker.getTrainPercent ( )  :  int
TrainTestSplitMaker.globalInfo ( )  :  String
TrainTestSplitMaker.notifyTestSetProduced ( TestSetEvent p1 )  :  void
TrainTestSplitMaker.notifyTrainingSetProduced ( TrainingSetEvent p1 )  :  void
TrainTestSplitMaker.performRequest ( String p1 )  :  void
TrainTestSplitMaker.seedTipText ( )  :  String
TrainTestSplitMaker.setSeed ( int p1 )  :  void
TrainTestSplitMaker.setTrainPercent ( int p1 )  :  void
TrainTestSplitMaker.stop ( )  :  void
TrainTestSplitMaker.trainPercentTipText ( )  :  String
TrainTestSplitMaker.TrainTestSplitMaker ( )

cdk-1.0.1.jar, TrainTestSplitMakerBeanInfo.class
package weka.gui.beans
TrainTestSplitMakerBeanInfo.getBeanDescriptor ( )  :  BeanDescriptor
TrainTestSplitMakerBeanInfo.getPropertyDescriptors ( )  :  PropertyDescriptor[ ]
TrainTestSplitMakerBeanInfo.TrainTestSplitMakerBeanInfo ( )

cdk-1.0.1.jar, TrainTestSplitMakerCustomizer.class
package weka.gui.beans
TrainTestSplitMakerCustomizer.addPropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
TrainTestSplitMakerCustomizer.removePropertyChangeListener ( PropertyChangeListener p1 )  :  void
TrainTestSplitMakerCustomizer.setObject ( Object p1 )  :  void
TrainTestSplitMakerCustomizer.TrainTestSplitMakerCustomizer ( )

cdk-1.0.1.jar, Tree.class
package weka.classifiers.trees
REPTree.Tree.backfitHoldOutInstance ( Instance p1, double p2, REPTree.Tree p3 )  :  void
REPTree.Tree.backfitHoldOutSet ( Instances p1 )  :  void
REPTree.Tree.buildTree ( int[ ][ ] p1, double[ ][ ] p2, Instances p3, double p4, double[ ] p5, Instances p6, double p7, double p8, int p9, int p10 )  :  void
REPTree.Tree.distribution ( double[ ][ ] p1, double[ ][ ][ ] p2, int p3, int[ ] p4, double[ ] p5, double[ ][ ] p6, Instances p7 )  :  double
REPTree.Tree.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
REPTree.Tree.gain ( double[ ][ ] p1, double p2 )  :  double
REPTree.Tree.insertHoldOutInstance ( Instance p1, double p2, REPTree.Tree p3 )  :  void
REPTree.Tree.insertHoldOutSet ( Instances p1 )  :  void
REPTree.Tree.leafString ( REPTree.Tree p1 )  :  String
REPTree.Tree.numericDistribution ( double[ ][ ] p1, double[ ][ ][ ] p2, int p3, int[ ] p4, double[ ] p5, double[ ][ ] p6, Instances p7, double[ ] p8 )  :  double
REPTree.Tree.numNodes ( )  :  int
REPTree.Tree.priorVal ( double[ ][ ] p1 )  :  double
REPTree.Tree.reducedErrorPrune ( )  :  double
REPTree.Tree.REPTree.Tree ( REPTree p1 )
REPTree.Tree.singleVariance ( double p1, double p2, double p3 )  :  double
REPTree.Tree.sourceExpression ( int p1 )  :  String
REPTree.Tree.splitData ( int[ ][ ][ ] p1, double[ ][ ][ ] p2, int p3, double p4, int[ ][ ] p5, double[ ][ ] p6, Instances p7 )  :  void
REPTree.Tree.toGraph ( StringBuffer p1, int p2, REPTree.Tree p3 )  :  int
REPTree.Tree.toSource ( String p1, REPTree.Tree p2 )  :  StringBuffer[ ]
REPTree.Tree.toString ( int p1, REPTree.Tree p2 )  :  String
REPTree.Tree.variance ( double[ ] p1, double[ ] p2, double[ ] p3 )  :  double

cdk-1.0.1.jar, TreeBuild.class
package weka.gui.treevisualizer
TreeBuild.create ( Reader p1 )  :  Node
TreeBuild.TreeBuild ( )

cdk-1.0.1.jar, TreeDisplayEvent.class
package weka.gui.treevisualizer
TreeDisplayEvent.getCommand ( )  :  int
TreeDisplayEvent.getID ( )  :  String
TreeDisplayEvent.TreeDisplayEvent ( int p1, String p2 )

cdk-1.0.1.jar, TreeDisplayListener.class
package weka.gui.treevisualizer
TreeDisplayListener.userCommand ( TreeDisplayEvent p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, TreeVisualizer.class
package weka.gui.treevisualizer
TreeVisualizer.actionPerformed ( ActionEvent p1 )  :  void
TreeVisualizer.fitToScreen ( )  :  void
TreeVisualizer.itemStateChanged ( ItemEvent p1 )  :  void
TreeVisualizer.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
TreeVisualizer.mouseClicked ( MouseEvent p1 )  :  void
TreeVisualizer.mouseDragged ( MouseEvent p1 )  :  void
TreeVisualizer.mouseEntered ( MouseEvent p1 )  :  void
TreeVisualizer.mouseExited ( MouseEvent p1 )  :  void
TreeVisualizer.mouseMoved ( MouseEvent p1 )  :  void
TreeVisualizer.mousePressed ( MouseEvent p1 )  :  void
TreeVisualizer.mouseReleased ( MouseEvent p1 )  :  void
TreeVisualizer.paintComponent ( Graphics p1 )  :  void
TreeVisualizer.setHighlight ( String p1 )  :  void
TreeVisualizer.TreeVisualizer ( TreeDisplayListener p1, Node p2, NodePlace p3 )
TreeVisualizer.TreeVisualizer ( TreeDisplayListener p1, String p2, NodePlace p3 )

cdk-1.0.1.jar, TwoClassStats.class
package weka.classifiers.evaluation
TwoClassStats.getConfusionMatrix ( )  :  ConfusionMatrix
TwoClassStats.getFallout ( )  :  double
TwoClassStats.getFalseNegative ( )  :  double
TwoClassStats.getFalsePositive ( )  :  double
TwoClassStats.getFalsePositiveRate ( )  :  double
TwoClassStats.getFMeasure ( )  :  double
TwoClassStats.getPrecision ( )  :  double
TwoClassStats.getRecall ( )  :  double
TwoClassStats.getTrueNegative ( )  :  double
TwoClassStats.getTruePositive ( )  :  double
TwoClassStats.getTruePositiveRate ( )  :  double
TwoClassStats.setFalseNegative ( double p1 )  :  void
TwoClassStats.setFalsePositive ( double p1 )  :  void
TwoClassStats.setTrueNegative ( double p1 )  :  void
TwoClassStats.setTruePositive ( double p1 )  :  void
TwoClassStats.toString ( )  :  String
TwoClassStats.TwoClassStats ( double p1, double p2, double p3, double p4 )

cdk-1.0.1.jar, TwoWayNominalSplit.class
package weka.classifiers.trees.adtree
TwoWayNominalSplit.attributeString ( Instances p1 )  :  String
TwoWayNominalSplit.branchInstanceGoesDown ( Instance p1 )  :  int
TwoWayNominalSplit.clone ( )  :  Object
TwoWayNominalSplit.comparisonString ( int p1, Instances p2 )  :  String
TwoWayNominalSplit.equalTo ( Splitter p1 )  :  boolean
TwoWayNominalSplit.getChildForBranch ( int p1 )  :  PredictionNode
TwoWayNominalSplit.getNumOfBranches ( )  :  int
TwoWayNominalSplit.instancesDownBranch ( int p1, Instances p2 )  :  ReferenceInstances
TwoWayNominalSplit.setChildForBranch ( int p1, PredictionNode p2 )  :  void
TwoWayNominalSplit.TwoWayNominalSplit ( int p1, int p2 )

cdk-1.0.1.jar, TwoWayNumericSplit.class
package weka.classifiers.trees.adtree
TwoWayNumericSplit.attributeString ( Instances p1 )  :  String
TwoWayNumericSplit.branchInstanceGoesDown ( Instance p1 )  :  int
TwoWayNumericSplit.clone ( )  :  Object
TwoWayNumericSplit.comparisonString ( int p1, Instances p2 )  :  String
TwoWayNumericSplit.equalTo ( Splitter p1 )  :  boolean
TwoWayNumericSplit.getChildForBranch ( int p1 )  :  PredictionNode
TwoWayNumericSplit.getNumOfBranches ( )  :  int
TwoWayNumericSplit.instancesDownBranch ( int p1, Instances p2 )  :  ReferenceInstances
TwoWayNumericSplit.setChildForBranch ( int p1, PredictionNode p2 )  :  void
TwoWayNumericSplit.TwoWayNumericSplit ( int p1, double p2 )

cdk-1.0.1.jar, UnassignedClassException.class
package weka.core
UnassignedClassException.UnassignedClassException ( )
UnassignedClassException.UnassignedClassException ( String p1 )

cdk-1.0.1.jar, UnassignedDatasetException.class
package weka.core
UnassignedDatasetException.UnassignedDatasetException ( )
UnassignedDatasetException.UnassignedDatasetException ( String p1 )

cdk-1.0.1.jar, Undoable.class
package weka.core
Undoable.addUndoPoint ( ) [abstract]  :  void
Undoable.canUndo ( ) [abstract]  :  boolean
Undoable.clearUndo ( ) [abstract]  :  void
Undoable.isUndoEnabled ( ) [abstract]  :  boolean
Undoable.setUndoEnabled ( boolean p1 ) [abstract]  :  void
Undoable.undo ( ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, UnsupervisedAttributeEvaluator.class
package weka.attributeSelection
UnsupervisedAttributeEvaluator.UnsupervisedAttributeEvaluator ( )

cdk-1.0.1.jar, UnsupervisedSubsetEvaluator.class
package weka.attributeSelection
UnsupervisedSubsetEvaluator.UnsupervisedSubsetEvaluator ( )

cdk-1.0.1.jar, UnsupportedAttributeTypeException.class
package weka.core
UnsupportedAttributeTypeException.UnsupportedAttributeTypeException ( )
UnsupportedAttributeTypeException.UnsupportedAttributeTypeException ( String p1 )

cdk-1.0.1.jar, UnsupportedClassTypeException.class
package weka.core
UnsupportedClassTypeException.UnsupportedClassTypeException ( )
UnsupportedClassTypeException.UnsupportedClassTypeException ( String p1 )

cdk-1.0.1.jar, UpdateableClassifier.class
package weka.classifiers
UpdateableClassifier.updateClassifier ( Instance p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, UserClassifier.class
package weka.classifiers.trees
UserClassifier.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
UserClassifier.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
UserClassifier.globalInfo ( )  :  String
UserClassifier.graph ( )  :  String
UserClassifier.graphType ( )  :  int
UserClassifier.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
UserClassifier.toString ( )  :  String
UserClassifier.UserClassifier ( )
UserClassifier.userCommand ( TreeDisplayEvent p1 )  :  void
UserClassifier.userDataEvent ( VisualizePanelEvent p1 )  :  void

cdk-1.0.1.jar, UserRequestAcceptor.class
package weka.gui.beans
UserRequestAcceptor.enumerateRequests ( ) [abstract]  :  Enumeration
UserRequestAcceptor.performRequest ( String p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, Utils.class
package weka.core
Utils.arrayToString ( Object p1 ) [static]  :  String
Utils.backQuoteChars ( String p1 ) [static]  :  String
Utils.checkForRemainingOptions ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Utils.convertNewLines ( String p1 ) [static]  :  String
Utils.correlation ( double[ ] p1, double[ ] p2, int p3 ) [static]  :  double
Utils.doubleToString ( double p1, int p2 ) [static]  :  String
Utils.doubleToString ( double p1, int p2, int p3 ) [static]  :  String
Utils.eq ( double p1, double p2 ) [static]  :  boolean
Utils.forName ( Class p1, String p2, String[ ] p3 ) [static]  :  Object
Utils.getArrayClass ( Class p1 ) [static]  :  Class
Utils.getArrayDimensions ( Class p1 ) [static]  :  int
Utils.getArrayDimensions ( Object p1 ) [static]  :  int
Utils.getFlag ( char p1, String[ ] p2 ) [static]  :  boolean
Utils.getFlag ( String p1, String[ ] p2 ) [static]  :  boolean
Utils.getOption ( char p1, String[ ] p2 ) [static]  :  String
Utils.getOption ( String p1, String[ ] p2 ) [static]  :  String
Utils.gr ( double p1, double p2 ) [static]  :  boolean
Utils.grOrEq ( double p1, double p2 ) [static]  :  boolean
Utils.info ( int[ ] p1 ) [static]  :  double
Utils.joinOptions ( String[ ] p1 ) [static]  :  String
Utils.kthSmallestValue ( double[ ] p1, int p2 ) [static]  :  double
Utils.kthSmallestValue ( int[ ] p1, int p2 ) [static]  :  double
Utils.log2 ( double p1 ) [static]  :  double
Utils.logs2probs ( double[ ] p1 ) [static]  :  double[ ]
Utils.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Utils.maxIndex ( double[ ] p1 ) [static]  :  int
Utils.maxIndex ( int[ ] p1 ) [static]  :  int
Utils.mean ( double[ ] p1 ) [static]  :  double
Utils.minIndex ( double[ ] p1 ) [static]  :  int
Utils.minIndex ( int[ ] p1 ) [static]  :  int
Utils.normalize ( double[ ] p1 ) [static]  :  void
Utils.normalize ( double[ ] p1, double p2 ) [static]  :  void
Utils.padLeft ( String p1, int p2 ) [static]  :  String
Utils.padRight ( String p1, int p2 ) [static]  :  String
Utils.partitionOptions ( String[ ] p1 ) [static]  :  String[ ]
Utils.probRound ( double p1, Random p2 ) [static]  :  int
Utils.quote ( String p1 ) [static]  :  String
Utils.readProperties ( String p1 ) [static]  :  Properties
Utils.removeSubstring ( String p1, String p2 ) [static]  :  String
Utils.replaceSubstring ( String p1, String p2, String p3 ) [static]  :  String
Utils.round ( double p1 ) [static]  :  int
Utils.roundDouble ( double p1, int p2 ) [static]  :  double
Utils.sm ( double p1, double p2 ) [static]  :  boolean
Utils.smOrEq ( double p1, double p2 ) [static]  :  boolean
Utils.sort ( double[ ] p1 ) [static]  :  int[ ]
Utils.sort ( int[ ] p1 ) [static]  :  int[ ]
Utils.splitOptions ( String p1 ) [static]  :  String[ ]
Utils.stableSort ( double[ ] p1 ) [static]  :  int[ ]
Utils.sum ( double[ ] p1 ) [static]  :  double
Utils.sum ( int[ ] p1 ) [static]  :  int
Utils.unbackQuoteChars ( String p1 ) [static]  :  String
Utils.Utils ( )
Utils.variance ( double[ ] p1 ) [static]  :  double
Utils.xlogx ( int p1 ) [static]  :  double

cdk-1.0.1.jar, Values.class
package weka.classifiers.trees.m5
Values.toString ( )  :  String
Values.Values ( int p1, int p2, int p3, Instances p4 )

cdk-1.0.1.jar, VaryNode.class
package weka.classifiers.bayes.net
VaryNode.getCounts ( int[ ] p1, int[ ] p2, int[ ] p3, int p4, int p5, ADNode p6, boolean p7 )  :  void
VaryNode.print ( String p1 )  :  void
VaryNode.VaryNode ( int p1 )

cdk-1.0.1.jar, Version.class
package weka.core
Version.compareTo ( Object p1 )  :  int
Version.equals ( Object p1 )  :  boolean
Version.isNewer ( Object p1 )  :  boolean
Version.isOlder ( Object p1 )  :  boolean
Version.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Version.Version ( )

cdk-1.0.1.jar, VFI.class
package weka.classifiers.misc
VFI.biasTipText ( )  :  String
VFI.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
VFI.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
VFI.getBias ( )  :  double
VFI.getOptions ( )  :  String[ ]
VFI.getWeightByConfidence ( )  :  boolean
VFI.globalInfo ( )  :  String
VFI.listOptions ( )  :  Enumeration
VFI.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
VFI.setBias ( double p1 )  :  void
VFI.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
VFI.setWeightByConfidence ( boolean p1 )  :  void
VFI.toString ( )  :  String
VFI.VFI ( )
VFI.weightByConfidenceTipText ( )  :  String

cdk-1.0.1.jar, ViewerDialog.class
package weka.gui
ViewerDialog.createDialog ( )  :  void
ViewerDialog.getInstances ( )  :  Instances
ViewerDialog.setButtons ( )  :  void
ViewerDialog.setInstances ( Instances p1 )  :  void
ViewerDialog.showDialog ( )  :  int
ViewerDialog.showDialog ( Instances p1 )  :  int
ViewerDialog.stateChanged ( ChangeEvent p1 )  :  void
ViewerDialog.ViewerDialog ( Frame p1 )

cdk-1.0.1.jar, Visible.class
package weka.gui.beans
Visible.getVisual ( ) [abstract]  :  BeanVisual
Visible.setVisual ( BeanVisual p1 ) [abstract]  :  void
Visible.useDefaultVisual ( ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, VisualizableErrorEvent.class
package weka.gui.beans
VisualizableErrorEvent.getDataSet ( )  :  PlotData2D
VisualizableErrorEvent.VisualizableErrorEvent ( Object p1, PlotData2D p2 )

cdk-1.0.1.jar, VisualizableErrorListener.class
package weka.gui.beans
VisualizableErrorListener.acceptDataSet ( VisualizableErrorEvent p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, VisualizePanel.class
package weka.gui.visualize
VisualizePanel.addActionListener ( ActionListener p1 )  :  void
VisualizePanel.addPlot ( PlotData2D p1 )  :  void
VisualizePanel.getCIndex ( )  :  int
VisualizePanel.getInstances ( )  :  Instances
VisualizePanel.getName ( )  :  String
VisualizePanel.getSIndex ( )  :  int
VisualizePanel.getXIndex ( )  :  int
VisualizePanel.getYIndex ( )  :  int
VisualizePanel.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
VisualizePanel.newColorAttribute ( int p1, Instances p2 )  :  void
VisualizePanel.setColourIndex ( int p1 )  :  void
VisualizePanel.setInstances ( Instances p1 )  :  void
VisualizePanel.setLog ( Logger p1 )  :  void
VisualizePanel.setMasterPlot ( PlotData2D p1 )  :  void
VisualizePanel.setName ( String p1 )  :  void
VisualizePanel.setShapes ( FastVector p1 )  :  void
VisualizePanel.setSIndex ( int p1 )  :  void
VisualizePanel.setUpComboBoxes ( Instances p1 )  :  void
VisualizePanel.setXIndex ( int p1 )  :  void
VisualizePanel.setYIndex ( int p1 )  :  void
VisualizePanel.VisualizePanel ( )
VisualizePanel.VisualizePanel ( VisualizePanelListener p1 )

cdk-1.0.1.jar, VisualizePanelEvent.class
package weka.gui.visualize
VisualizePanelEvent.getAttribute1 ( )  :  int
VisualizePanelEvent.getAttribute2 ( )  :  int
VisualizePanelEvent.getInstances1 ( )  :  Instances
VisualizePanelEvent.getInstances2 ( )  :  Instances
VisualizePanelEvent.getValues ( )  :  FastVector
VisualizePanelEvent.VisualizePanelEvent ( FastVector p1, Instances p2, Instances p3, int p4, int p5 )

cdk-1.0.1.jar, VisualizePanelListener.class
package weka.gui.visualize
VisualizePanelListener.userDataEvent ( VisualizePanelEvent p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, VisualizeUtils.class
package weka.gui.visualize
VisualizeUtils.processColour ( String p1, Color p2 ) [static]  :  Color
VisualizeUtils.VisualizeUtils ( )

cdk-1.0.1.jar, Vote.class
package weka.classifiers.meta
Vote.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
Vote.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
Vote.globalInfo ( )  :  String
Vote.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Vote.toString ( )  :  String
Vote.Vote ( )

cdk-1.0.1.jar, VotedPerceptron.class
package weka.classifiers.functions
VotedPerceptron.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
VotedPerceptron.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
VotedPerceptron.exponentTipText ( )  :  String
VotedPerceptron.getExponent ( )  :  double
VotedPerceptron.getMaxK ( )  :  int
VotedPerceptron.getNumIterations ( )  :  int
VotedPerceptron.getOptions ( )  :  String[ ]
VotedPerceptron.getSeed ( )  :  int
VotedPerceptron.globalInfo ( )  :  String
VotedPerceptron.listOptions ( )  :  Enumeration
VotedPerceptron.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
VotedPerceptron.maxKTipText ( )  :  String
VotedPerceptron.numIterationsTipText ( )  :  String
VotedPerceptron.seedTipText ( )  :  String
VotedPerceptron.setExponent ( double p1 )  :  void
VotedPerceptron.setMaxK ( int p1 )  :  void
VotedPerceptron.setNumIterations ( int p1 )  :  void
VotedPerceptron.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
VotedPerceptron.setSeed ( int p1 )  :  void
VotedPerceptron.toString ( )  :  String
VotedPerceptron.VotedPerceptron ( )

cdk-1.0.1.jar, Weka.class
package org.openscience.cdk.libio.weka
Weka.getPrediction ( Object[ ][ ] value )  :  Object[ ]
Weka.getPrediction ( String pathARFF )  :  Object[ ]
Weka.getPredictionCDK ( String pathARFF )  :  Object[ ]
Weka.setDataset ( String pathTable, Object object )  :  Instances
Weka.setDataset ( String[ ] attrib, int[ ] typAttrib, Object[ ] y, Object[ ][ ] x, Classifier classifier )  :  Instances
Weka.setDataset ( String[ ] attrib, int[ ] typAttrib, String[ ] classAttrib, Object[ ] y, Object[ ][ ] x, Object object )  :  Instances
Weka.setDatasetCDK ( String pathTable, Object object )  :  Instances
Weka.Weka ( )

cdk-1.0.1.jar, WekaException.class
package weka.core
WekaException.WekaException ( )
WekaException.WekaException ( String p1 )

cdk-1.0.1.jar, WekaTaskMonitor.class
package weka.gui
WekaTaskMonitor.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
WekaTaskMonitor.taskFinished ( )  :  void
WekaTaskMonitor.taskStarted ( )  :  void
WekaTaskMonitor.WekaTaskMonitor ( )

cdk-1.0.1.jar, WekaWrapper.class
package weka.gui.beans
WekaWrapper.getWrappedAlgorithm ( ) [abstract]  :  Object
WekaWrapper.setWrappedAlgorithm ( Object p1 ) [abstract]  :  void

cdk-1.0.1.jar, Winnow.class
package weka.classifiers.functions
Winnow.alphaTipText ( )  :  String
Winnow.balancedTipText ( )  :  String
Winnow.betaTipText ( )  :  String
Winnow.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
Winnow.classifyInstance ( Instance p1 )  :  double
Winnow.defaultWeightTipText ( )  :  String
Winnow.getAlpha ( )  :  double
Winnow.getBalanced ( )  :  boolean
Winnow.getBeta ( )  :  double
Winnow.getDefaultWeight ( )  :  double
Winnow.getNumIterations ( )  :  int
Winnow.getOptions ( )  :  String[ ]
Winnow.getSeed ( )  :  int
Winnow.getThreshold ( )  :  double
Winnow.globalInfo ( )  :  String
Winnow.listOptions ( )  :  Enumeration
Winnow.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Winnow.numIterationsTipText ( )  :  String
Winnow.seedTipText ( )  :  String
Winnow.setAlpha ( double p1 )  :  void
Winnow.setBalanced ( boolean p1 )  :  void
Winnow.setBeta ( double p1 )  :  void
Winnow.setDefaultWeight ( double p1 )  :  void
Winnow.setNumIterations ( int p1 )  :  void
Winnow.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
Winnow.setSeed ( int p1 )  :  void
Winnow.setThreshold ( double p1 )  :  void
Winnow.thresholdTipText ( )  :  String
Winnow.toString ( )  :  String
Winnow.updateClassifier ( Instance p1 )  :  void
Winnow.Winnow ( )

cdk-1.0.1.jar, WrapperSubsetEval.class
package weka.attributeSelection
WrapperSubsetEval.buildEvaluator ( Instances p1 )  :  void
WrapperSubsetEval.classifierTipText ( )  :  String
WrapperSubsetEval.evaluateSubset ( BitSet p1 )  :  double
WrapperSubsetEval.foldsTipText ( )  :  String
WrapperSubsetEval.getClassifier ( )  :  Classifier
WrapperSubsetEval.getFolds ( )  :  int
WrapperSubsetEval.getOptions ( )  :  String[ ]
WrapperSubsetEval.getSeed ( )  :  int
WrapperSubsetEval.getThreshold ( )  :  double
WrapperSubsetEval.globalInfo ( )  :  String
WrapperSubsetEval.listOptions ( )  :  Enumeration
WrapperSubsetEval.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
WrapperSubsetEval.resetOptions ( )  :  void
WrapperSubsetEval.seedTipText ( )  :  String
WrapperSubsetEval.setClassifier ( Classifier p1 )  :  void
WrapperSubsetEval.setFolds ( int p1 )  :  void
WrapperSubsetEval.setOptions ( String[ ] p1 )  :  void
WrapperSubsetEval.setSeed ( int p1 )  :  void
WrapperSubsetEval.setThreshold ( double p1 )  :  void
WrapperSubsetEval.thresholdTipText ( )  :  String
WrapperSubsetEval.toString ( )  :  String
WrapperSubsetEval.WrapperSubsetEval ( )

cdk-1.0.1.jar, XMLBasicSerialization.class
package weka.core.xml
XMLBasicSerialization.clear ( )  :  void
XMLBasicSerialization.readCollection ( Element p1 )  :  Object
XMLBasicSerialization.readCostMatrixOld ( Element p1 )  :  Object
XMLBasicSerialization.readDefaultListModel ( Element p1 )  :  Object
XMLBasicSerialization.readMap ( Element p1 )  :  Object
XMLBasicSerialization.readMatrix ( Element p1 )  :  Object
XMLBasicSerialization.readMatrixOld ( Element p1 )  :  Object
XMLBasicSerialization.writeCollection ( Element p1, Object p2, String p3 )  :  Element
XMLBasicSerialization.writeCostMatrixOld ( Element p1, Object p2, String p3 )  :  Element
XMLBasicSerialization.writeDefaultListModel ( Element p1, Object p2, String p3 )  :  Element
XMLBasicSerialization.writeMap ( Element p1, Object p2, String p3 )  :  Element
XMLBasicSerialization.writeMatrix ( Element p1, Object p2, String p3 )  :  Element
XMLBasicSerialization.writeMatrixOld ( Element p1, Object p2, String p3 )  :  Element
XMLBasicSerialization.XMLBasicSerialization ( )

cdk-1.0.1.jar, XMLBeans.class
package weka.gui.beans.xml
XMLBeans.addBeanConnectionRelation ( MetaBean p1, String p2 )  :  void
XMLBeans.addBeanInstances ( Vector p1 )  :  void
XMLBeans.clear ( )  :  void
XMLBeans.createBeanConnection ( int p1, int p2, String p3, boolean p4 )  :  BeanConnection
XMLBeans.getBeanConnectionRelation ( MetaBean p1 )  :  Vector
XMLBeans.getBeanInstancesForIDs ( Vector p1 )  :  Vector
XMLBeans.getDataType ( )  :  int
XMLBeans.getIDsForBeanInstances ( Vector p1 )  :  Vector
XMLBeans.readBeanConnection ( Element p1 )  :  Object
XMLBeans.readBeanInstance ( Element p1 )  :  Object
XMLBeans.readBeanVisual ( Element p1 )  :  Object
XMLBeans.readColor ( Element p1 )  :  Object
XMLBeans.readColorUIResource ( Element p1 )  :  Object
XMLBeans.readDimension ( Element p1 )  :  Object
XMLBeans.readFont ( Element p1 )  :  Object
XMLBeans.readFontUIResource ( Element p1 )  :  Object
XMLBeans.readLoader ( Element p1 )  :  Object
XMLBeans.readMetaBean ( Element p1 )  :  Object
XMLBeans.readPoint ( Element p1 )  :  Object
XMLBeans.readPostProcess ( Object p1 )  :  Object
XMLBeans.readPreProcess ( Document p1 )  :  Document
XMLBeans.readSaver ( Element p1 )  :  Object
XMLBeans.rebuildBeanConnections ( Vector p1, Object p2 )  :  void
XMLBeans.removeUserToolBarBeans ( Vector p1 )  :  void
XMLBeans.setBeanConnection ( BeanConnection p1, Vector p2 )  :  void
XMLBeans.setDataType ( int p1 )  :  void
XMLBeans.writeBeanConnection ( Element p1, Object p2, String p3 )  :  Element
XMLBeans.writeBeanInstance ( Element p1, Object p2, String p3 )  :  Element
XMLBeans.writeBeanLoader ( Element p1, Object p2, String p3 )  :  Element
XMLBeans.writeBeanSaver ( Element p1, Object p2, String p3 )  :  Element
XMLBeans.writeBeanVisual ( Element p1, Object p2, String p3 )  :  Element
XMLBeans.writeColor ( Element p1, Object p2, String p3 )  :  Element
XMLBeans.writeColorUIResource ( Element p1, Object p2, String p3 )  :  Element
XMLBeans.writeDimension ( Element p1, Object p2, String p3 )  :  Element
XMLBeans.writeFont ( Element p1, Object p2, String p3 )  :  Element
XMLBeans.writeFontUIResource ( Element p1, Object p2, String p3 )  :  Element
XMLBeans.writeLoader ( Element p1, Object p2, String p3 )  :  Element
XMLBeans.writeMetaBean ( Element p1, Object p2, String p3 )  :  Element
XMLBeans.writePoint ( Element p1, Object p2, String p3 )  :  Element
XMLBeans.writePostProcess ( Object p1 )  :  void
XMLBeans.writePreProcess ( Object p1 )  :  Object
XMLBeans.writeSaver ( Element p1, Object p2, String p3 )  :  Element
XMLBeans.XMLBeans ( JComponent p1, BeanContextSupport p2 )
XMLBeans.XMLBeans ( JComponent p1, BeanContextSupport p2, int p3 )

cdk-1.0.1.jar, XMLClassifier.class
package weka.classifiers.xml
XMLClassifier.clear ( )  :  void
XMLClassifier.XMLClassifier ( )

cdk-1.0.1.jar, XMLDocument.class
package weka.core.xml
XMLDocument.clear ( )  :  void
XMLDocument.getBuilder ( )  :  DocumentBuilder
XMLDocument.getChildTags ( Node p1 ) [static]  :  Vector
XMLDocument.getContent ( Element p1 ) [static]  :  String
XMLDocument.getDocType ( )  :  String
XMLDocument.getDocument ( )  :  Document
XMLDocument.getFactory ( )  :  DocumentBuilderFactory
XMLDocument.getRootNode ( )  :  String
XMLDocument.getValidating ( )  :  boolean
XMLDocument.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
XMLDocument.newDocument ( String p1, String p2 )  :  Document
XMLDocument.print ( )  :  void
XMLDocument.read ( File p1 )  :  Document
XMLDocument.read ( InputStream p1 )  :  Document
XMLDocument.read ( Reader p1 )  :  Document
XMLDocument.read ( String p1 )  :  Document
XMLDocument.setDocType ( String p1 )  :  void
XMLDocument.setDocument ( Document p1 )  :  void
XMLDocument.setRootNode ( String p1 )  :  void
XMLDocument.setValidating ( boolean p1 )  :  void
XMLDocument.toString ( )  :  String
XMLDocument.toString ( StringBuffer p1, Node p2, int p3 )  :  StringBuffer
XMLDocument.write ( File p1 )  :  void
XMLDocument.write ( OutputStream p1 )  :  void
XMLDocument.write ( String p1 )  :  void
XMLDocument.write ( Writer p1 )  :  void
XMLDocument.XMLDocument ( )
XMLDocument.XMLDocument ( File p1 )
XMLDocument.XMLDocument ( InputStream p1 )
XMLDocument.XMLDocument ( Reader p1 )
XMLDocument.XMLDocument ( String p1 )

cdk-1.0.1.jar, XMLExperiment.class
package weka.experiment.xml
XMLExperiment.clear ( )  :  void
XMLExperiment.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
XMLExperiment.readPostProcess ( Object p1 )  :  Object
XMLExperiment.readPropertyNode ( Element p1 )  :  Object
XMLExperiment.writePostProcess ( Object p1 )  :  void
XMLExperiment.writePropertyNode ( Element p1, Object p2, String p3 )  :  Element
XMLExperiment.XMLExperiment ( )

cdk-1.0.1.jar, XMLOptions.class
package weka.core.xml
XMLOptions.fixHyphens ( Document p1 )  :  Document
XMLOptions.getDocument ( )  :  Document
XMLOptions.getQuotesLevel ( Node p1 )  :  int
XMLOptions.getValidating ( )  :  boolean
XMLOptions.getXMLDocument ( )  :  XMLDocument
XMLOptions.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
XMLOptions.setValidating ( boolean p1 )  :  void
XMLOptions.toArray ( )  :  String[ ]
XMLOptions.toCommandLine ( )  :  String
XMLOptions.toCommandLine ( String p1, Element p2, int p3 )  :  String
XMLOptions.toString ( )  :  String
XMLOptions.XMLOptions ( )
XMLOptions.XMLOptions ( File p1 )
XMLOptions.XMLOptions ( InputStream p1 )
XMLOptions.XMLOptions ( Reader p1 )
XMLOptions.XMLOptions ( String p1 )

cdk-1.0.1.jar, XMLSerialization.class
package weka.core.xml
XMLSerialization.addElement ( Element p1, String p2, String p3, boolean p4 )  :  Element
XMLSerialization.addElement ( Element p1, String p2, String p3, boolean p4, int p5 )  :  Element
XMLSerialization.addElement ( Element p1, String p2, String p3, boolean p4, int p5, boolean p6 )  :  Element
XMLSerialization.booleanToString ( boolean p1 )  :  String
XMLSerialization.clear ( )  :  void
XMLSerialization.determineClass ( String p1 )  :  Class
XMLSerialization.determineDescriptor ( String p1, String p2 )  :  PropertyDescriptor
XMLSerialization.fromXML ( Document p1 )  :  Object
XMLSerialization.getArrayDimensions ( Element p1 )  :  int[ ]
XMLSerialization.getDescriptorByName ( Object p1, String p2 )  :  PropertyDescriptor
XMLSerialization.getDescriptors ( Object p1 )  :  Hashtable
XMLSerialization.getPath ( Element p1 )  :  String
XMLSerialization.getPrimitive ( Element p1 )  :  Object
XMLSerialization.getVersion ( )  :  String
XMLSerialization.invokeReadFromXML ( Element p1 )  :  Object
XMLSerialization.invokeWriteToXML ( Element p1, Object p2, String p3 )  :  Element
XMLSerialization.isPrimitiveArray ( Class p1 )  :  boolean
XMLSerialization.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
XMLSerialization.overrideClassname ( Object p1 )  :  String
XMLSerialization.overrideClassname ( String p1 )  :  String
XMLSerialization.read ( File p1 )  :  Object
XMLSerialization.read ( InputStream p1 )  :  Object
XMLSerialization.read ( Reader p1 )  :  Object
XMLSerialization.read ( String p1 )  :  Object
XMLSerialization.readBooleanFromXML ( Element p1 )  :  boolean
XMLSerialization.readByteFromXML ( Element p1 )  :  byte
XMLSerialization.readCharFromXML ( Element p1 )  :  char
XMLSerialization.readDoubleFromXML ( Element p1 )  :  double
XMLSerialization.readFloatFromXML ( Element p1 )  :  float
XMLSerialization.readFromXML ( Element p1 )  :  Object
XMLSerialization.readFromXML ( Object p1, String p2, Element p3 )  :  Object
XMLSerialization.readIntFromXML ( Element p1 )  :  int
XMLSerialization.readLongFromXML ( Element p1 )  :  long
XMLSerialization.readPostProcess ( Object p1 )  :  Object
XMLSerialization.readPreProcess ( Document p1 )  :  Document
XMLSerialization.readShortFromXML ( Element p1 )  :  short
XMLSerialization.stringToBoolean ( String p1 )  :  boolean
XMLSerialization.toXML ( Object p1 )  :  XMLDocument
XMLSerialization.trace ( Throwable p1, String p2 )  :  void
XMLSerialization.write ( File p1, Object p2 )  :  void
XMLSerialization.write ( OutputStream p1, Object p2 )  :  void
XMLSerialization.write ( String p1, Object p2 )  :  void
XMLSerialization.write ( Writer p1, Object p2 )  :  void
XMLSerialization.writeBooleanToXML ( Element p1, boolean p2, String p3 )  :  Element
XMLSerialization.writeByteToXML ( Element p1, byte p2, String p3 )  :  Element
XMLSerialization.writeCharToXML ( Element p1, char p2, String p3 )  :  Element
XMLSerialization.writeDoubleToXML ( Element p1, double p2, String p3 )  :  Element
XMLSerialization.writeFloatToXML ( Element p1, float p2, String p3 )  :  Element
XMLSerialization.writeIntToXML ( Element p1, int p2, String p3 )  :  Element
XMLSerialization.writeLongToXML ( Element p1, long p2, String p3 )  :  Element
XMLSerialization.writePostProcess ( Object p1 )  :  void
XMLSerialization.writePreProcess ( Object p1 )  :  Object
XMLSerialization.writeShortToXML ( Element p1, short p2, String p3 )  :  Element
XMLSerialization.writeToXML ( Element p1, Object p2, String p3 )  :  Element
XMLSerialization.XMLSerialization ( )

cdk-1.0.1.jar, XMLSerializationMethodHandler.class
package weka.core.xml
XMLSerializationMethodHandler.addMethods ( )  :  void
XMLSerializationMethodHandler.addMethods ( MethodHandler p1, Method p2, Method[ ] p3 )  :  void
XMLSerializationMethodHandler.clear ( )  :  void
XMLSerializationMethodHandler.findReadMethod ( Object p1, String p2 ) [static]  :  Method
XMLSerializationMethodHandler.findWriteMethod ( Object p1, String p2 ) [static]  :  Method
XMLSerializationMethodHandler.read ( )  :  MethodHandler
XMLSerializationMethodHandler.register ( Object p1, Class p2, String p3 )  :  void
XMLSerializationMethodHandler.toString ( )  :  String
XMLSerializationMethodHandler.write ( )  :  MethodHandler
XMLSerializationMethodHandler.XMLSerializationMethodHandler ( Object p1 )

cdk-1.0.1.jar, YongSplitInfo.class
package weka.classifiers.trees.m5
YongSplitInfo.attrSplit ( int p1, Instances p2 )  :  void
YongSplitInfo.copy ( )  :  SplitEvaluate
YongSplitInfo.initialize ( int p1, int p2, int p3 )  :  void
YongSplitInfo.maxImpurity ( )  :  double
YongSplitInfo.position ( )  :  int
YongSplitInfo.splitAttr ( )  :  int
YongSplitInfo.splitValue ( )  :  double
YongSplitInfo.toString ( Instances p1 )  :  String
YongSplitInfo.YongSplitInfo ( int p1, int p2, int p3 )

cdk-1.0.1.jar, ZeroR.class
package weka.classifiers.rules
ZeroR.buildClassifier ( Instances p1 )  :  void
ZeroR.classifyInstance ( Instance p1 )  :  double
ZeroR.distributionForInstance ( Instance p1 )  :  double[ ]
ZeroR.globalInfo ( )  :  String
ZeroR.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
ZeroR.toString ( )  :  String
ZeroR.ZeroR ( )

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Problems with Data Types, High Severity (820)

cdk-1.0.1.jar
package Jama.test
[+] TestMatrix (1)

package org.openscience.cdk.applications
[+] SubstructureFinder (1)

package org.openscience.cdk.applications.swing.editor
[+] Renderer2DModelEditor (1)

package org.openscience.cdk.isomorphism.matchers.smarts
[+] AliphaticSymbolAtom (1)
[+] AromaticSymbolAtom (1)
[+] AtomicNumberAtom (1)
[+] ExplicitConnectionAtom (1)
[+] LogicalOperatorAtom (1)
[+] LogicalOperatorBond (1)
[+] RingBond (1)
[+] RingIdentifierAtom (1)
[+] RingMembershipAtom (1)
[+] SmallestRingAtom (1)
[+] StereoBond (1)

package org.openscience.cdk.libio.weka
[+] Weka (1)

package org.openscience.cdk.math
[+] PermutationGenerator (1)

package org.openscience.cdk.qsar.model.R
[+] CNNClassificationModel (1)
[+] CNNClassificationModelFit (1)
[+] CNNClassificationModelPredict (1)
[+] CNNRegressionModel (1)
[+] CNNRegressionModelFit (1)
[+] CNNRegressionModelPredict (1)
[+] CNNRegressionModelSummary (1)
[+] LinearRegressionModel (1)
[+] LinearRegressionModelFit (1)
[+] LinearRegressionModelPredict (1)
[+] LinearRegressionModelSummary (1)
[+] PLSRegressionModel (1)
[+] PLSRegressionModelFit (1)
[+] PLSRegressionModelPredict (1)
[+] RModel (1)

package org.openscience.cdk.qsar.model.R2
[+] CNNRegressionModel (1)
[+] LinearRegressionModel (1)
[+] RModel (1)

package org.openscience.cdk.qsar.model.weka
[+] DensityBasedClustererModel (1)
[+] EMCluster (1)
[+] FilterSupervisedResample (1)
[+] FilterUnSupervisedRandomize (1)
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[+] EntropySplitCrit (1)
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[+] NBTreeModelSelection (1)
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[+] ArffSaver (1)
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[+] C45Saver (1)
[+] ConverterUtils (1)
[+] CSVLoader (1)
[+] CSVSaver (1)
[+] DatabaseConnection (1)
[+] DatabaseConverter (1)
[+] DatabaseLoader (1)
[+] DatabaseSaver (1)
[+] FileSourcedConverter (1)
[+] Loader (1)
[+] Saver (1)
[+] SerializedInstancesLoader (1)
[+] SerializedInstancesSaver (1)

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[+] Maths (1)
[+] Matrix (1)
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[+] SingularValueDecomposition (1)

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[+] XMLSerializationMethodHandler (1)

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[+] Generator (1)
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[+] DNConditionalEstimator (1)
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[+] KDConditionalEstimator (1)
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[+] KKConditionalEstimator (1)
[+] MahalanobisEstimator (1)
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[+] NNConditionalEstimator (1)
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[+] PoissonEstimator (1)

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[+] AveragingResultProducer (1)
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[+] DatabaseResultProducer (1)
[+] DatabaseUtils (1)
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[+] PairedStatsCorrected (1)
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[+] XMLExperiment (1)

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[+] AllFilter (1)
[+] Filter (1)
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[+] AttributeSelection (1)
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[+] Discretize (1)
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package weka.filters.supervised.instance
[+] Resample (1)
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package weka.filters.unsupervised.attribute
[+] AbstractTimeSeries (1)
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[+] AddExpression (1)
[+] AddNoise (1)
[+] ChangeDateFormat (1)
[+] ClusterMembership (1)
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[+] Discretize (1)
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[+] RemoveType (1)
[+] RemoveUseless (1)
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[+] TimeSeriesTranslate (1)

package weka.filters.unsupervised.instance
[+] NonSparseToSparse (1)
[+] Normalize (1)
[+] Randomize (1)
[+] RemoveFolds (1)
[+] RemoveMisclassified (1)
[+] RemovePercentage (1)
[+] RemoveRange (1)
[+] RemoveWithValues (1)
[+] Resample (1)
[+] SparseToNonSparse (1)

package weka.gui
[+] AttributeListPanel (1)
[+] AttributeSelectionPanel (1)
[+] AttributeSummaryPanel (1)
[+] AttributeVisualizationPanel (1)
[+] ComponentHelper (1)
[+] CostMatrixEditor (1)
[+] CustomPanelSupplier (1)
[+] DatabaseConnectionDialog (1)
[+] ExtensionFileFilter (1)
[+] FileEditor (1)
[+] GenericArrayEditor (1)
[+] GenericObjectEditor (1)
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[+] GenericObjectEditor.JTreePopupMenu (1)
[+] GenericPropertiesCreator (1)
[+] GUIChooser (1)
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[+] InstancesSummaryPanel (1)
[+] JTableHelper (1)
[+] ListSelectorDialog (1)
[+] Loader (1)
[+] Logger (1)
[+] LogPanel (1)
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[+] PropertyDialog (1)
[+] PropertyPanel (1)
[+] PropertySelectorDialog (1)
[+] PropertySheetPanel (1)
[+] ResultHistoryPanel (1)
[+] ResultHistoryPanel.RKeyAdapter (1)
[+] ResultHistoryPanel.RMouseAdapter (1)
[+] SaveBuffer (1)
[+] SelectedTagEditor (1)
[+] SetInstancesPanel (1)
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[+] SysErrLog (1)
[+] TableMap (1)
[+] TableSorter (1)
[+] TaskLogger (1)
[+] ViewerDialog (1)
[+] WekaTaskMonitor (1)

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[+] ArffPanel (1)
[+] ArffTable (1)
[+] ArffTableCellRenderer (1)
[+] ArffTableModel (1)
[+] ArffTableSorter (1)
[+] ArffViewer (1)
[+] ArffViewerMainPanel (1)
[+] FileChooser (1)

package weka.gui.beans
[+] AbstractDataSink (1)
[+] AbstractDataSinkBeanInfo (1)
[+] AbstractDataSource (1)
[+] AbstractDataSourceBeanInfo (1)
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[+] AbstractTestSetProducer (1)
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[+] AttributeSummarizer (1)
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[+] BatchClustererListener (1)
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[+] ClassAssignerCustomizer (1)
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[+] ClustererCustomizer (1)
[+] ClustererPerformanceEvaluator (1)
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[+] CrossValidationFoldMakerBeanInfo (1)
[+] CrossValidationFoldMakerCustomizer (1)
[+] CustomizerCloseRequester (1)
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[+] DataSourceListener (1)
[+] DataVisualizer (1)
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[+] FilterBeanInfo (1)
[+] FilterCustomizer (1)
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[+] GraphListener (1)
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[+] GraphViewerBeanInfo (1)
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[+] IncrementalClassifierEvaluatorBeanInfo (1)
[+] IncrementalClassifierEvent (1)
[+] IncrementalClassifierListener (1)
[+] InstanceEvent (1)
[+] InstanceListener (1)
[+] KnowledgeFlow (1)
[+] KnowledgeFlowApp (1)
[+] KnowledgeFlowApp.BeanLayout (1)
[+] Loader (1)
[+] LoaderBeanInfo (1)
[+] LoaderCustomizer (1)
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[+] ModelPerformanceChart (1)
[+] ModelPerformanceChartBeanInfo (1)
[+] PredictionAppender (1)
[+] PredictionAppenderBeanInfo (1)
[+] PredictionAppenderCustomizer (1)
[+] Saver (1)
[+] SaverBeanInfo (1)
[+] SaverCustomizer (1)
[+] ScatterPlotMatrix (1)
[+] ScatterPlotMatrixBeanInfo (1)
[+] StartUpListener (1)
[+] StripChart (1)
[+] StripChartBeanInfo (1)
[+] StripChartCustomizer (1)
[+] TestSetEvent (1)
[+] TestSetListener (1)
[+] TestSetMaker (1)
[+] TestSetMakerBeanInfo (1)
[+] TestSetProducer (1)
[+] TextEvent (1)
[+] TextListener (1)
[+] TextViewer (1)
[+] TextViewerBeanInfo (1)
[+] ThresholdDataEvent (1)
[+] ThresholdDataListener (1)
[+] TrainingSetEvent (1)
[+] TrainingSetListener (1)
[+] TrainingSetMaker (1)
[+] TrainingSetMakerBeanInfo (1)
[+] TrainingSetProducer (1)
[+] TrainTestSplitMaker (1)
[+] TrainTestSplitMakerBeanInfo (1)
[+] TrainTestSplitMakerCustomizer (1)
[+] UserRequestAcceptor (1)
[+] Visible (1)
[+] VisualizableErrorEvent (1)
[+] VisualizableErrorListener (1)
[+] WekaWrapper (1)

package weka.gui.beans.xml
[+] XMLBeans (1)

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[+] BoundaryPanel (1)
[+] BoundaryPanel.PlotThread (1)
[+] BoundaryPanelDistributed (1)
[+] BoundaryVisualizer (1)
[+] DataGenerator (1)
[+] KDDataGenerator (1)
[+] RemoteBoundaryVisualizerSubTask (1)
[+] RemoteResult (1)

package weka.gui.experiment
[+] AlgorithmListPanel (1)
[+] AlgorithmListPanel.ObjectCellRenderer (1)
[+] DatasetListPanel (1)
[+] DistributeExperimentPanel (1)
[+] Experimenter (1)
[+] ExperimenterDefaults (1)
[+] GeneratorPropertyIteratorPanel (1)
[+] HostListPanel (1)
[+] OutputFormatDialog (1)
[+] ResultsPanel (1)
[+] RunNumberPanel (1)
[+] RunPanel (1)
[+] SetupModePanel (1)
[+] SetupPanel (1)
[+] SimpleSetupPanel (1)

package weka.gui.explorer
[+] AssociationsPanel (1)
[+] AttributeSelectionPanel (1)
[+] ClassifierPanel (1)
[+] ClustererPanel (1)
[+] Explorer (1)
[+] PreprocessPanel (1)

package weka.gui.graphvisualizer
[+] BIFFormatException (1)
[+] BIFParser (1)
[+] DotParser (1)
[+] GraphEdge (1)
[+] GraphNode (1)
[+] GraphVisualizer (1)
[+] HierarchicalBCEngine (1)
[+] LayoutCompleteEvent (1)
[+] LayoutCompleteEventListener (1)
[+] LayoutEngine (1)

package weka.gui.streams
[+] InstanceCounter (1)
[+] InstanceEvent (1)
[+] InstanceJoiner (1)
[+] InstanceListener (1)
[+] InstanceLoader (1)
[+] InstanceProducer (1)
[+] InstanceSavePanel (1)
[+] InstanceTable (1)
[+] InstanceViewer (1)
[+] SerialInstanceListener (1)

package weka.gui.treevisualizer
[+] Colors (1)
[+] Edge (1)
[+] NamedColor (1)
[+] Node (1)
[+] NodePlace (1)
[+] PlaceNode1 (1)
[+] PlaceNode2 (1)
[+] TreeBuild (1)
[+] TreeDisplayEvent (1)
[+] TreeDisplayListener (1)
[+] TreeVisualizer (1)

package weka.gui.visualize
[+] AttributePanel (1)
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