Binary compatibility report for the HDF-Java library between 2.3 and 2.4 versions

Test Info


Library NameHDF-Java
Version #12.3
Version #22.4

Test Results


Total Java ARchives8
Total Methods / Classes2773 / 212
VerdictIncompatible
(47%)

Problem Summary


SeverityCount
Added Methods-194
Removed MethodsHigh1109
Problems with
Data Types
High75
Medium1
Low38
Problems with
Methods
High12
Medium16
Low11
Other Changes
in Data Types
-68

Added Methods (194)


h5srb.jar, H5SRB.class
package ncsa.hdf.srb
H5SRB.callServerInit ( String p1 ) [static]  :  void
H5SRB.getFileFieldSeparator ( ) [static]  :  String
H5SRB.getFileList ( Vector p1 ) [static]  :  int
H5SRB.getServerInfo ( ) [static]  :  String[ ]
H5SRB.h5ObjRequest ( Object p1, int p2 ) [static]  :  int
H5SRB.H5SRB ( )

h5srb.jar, H5SrbCompoundDS.class
package ncsa.hdf.srb
H5SrbCompoundDS.close ( int p1 )  :  void
H5SrbCompoundDS.copy ( Group p1, String p2, long[ ] p3, Object p4 )  :  Dataset
H5SrbCompoundDS.getDatatype ( )  :  Datatype
H5SrbCompoundDS.getMetadata ( )  :  List
H5SrbCompoundDS.getPalette ( )  :  byte[ ][ ]
H5SrbCompoundDS.getPaletteRefs ( )  :  byte[ ]
H5SrbCompoundDS.H5SrbCompoundDS ( FileFormat p1, String p2, String p3 )
H5SrbCompoundDS.H5SrbCompoundDS ( FileFormat p1, String p2, String p3, long[ ] p4 )
H5SrbCompoundDS.hasAttribute ( )  :  boolean
H5SrbCompoundDS.init ( )  :  void
H5SrbCompoundDS.open ( )  :  int
H5SrbCompoundDS.read ( )  :  Object
H5SrbCompoundDS.readBytes ( )  :  byte[ ]
H5SrbCompoundDS.readPalette ( int p1 )  :  byte[ ][ ]
H5SrbCompoundDS.removeMetadata ( Object p1 )  :  void
H5SrbCompoundDS.setMemberCount ( int p1 )  :  void
H5SrbCompoundDS.write ( Object p1 )  :  void
H5SrbCompoundDS.writeMetadata ( Object p1 )  :  void

h5srb.jar, H5SrbDatatype.class
package ncsa.hdf.srb
H5SrbDatatype.close ( int p1 )  :  void
H5SrbDatatype.fromNative ( int p1 )  :  void
H5SrbDatatype.getDatatypeDescription ( )  :  String
H5SrbDatatype.H5SrbDatatype ( int p1 )
H5SrbDatatype.H5SrbDatatype ( int p1, int p2, int p3, int p4 )
H5SrbDatatype.hasAttribute ( )  :  boolean
H5SrbDatatype.isUnsigned ( )  :  boolean
H5SrbDatatype.toNative ( )  :  int

h5srb.jar, H5SrbFile.class
package ncsa.hdf.srb
H5SrbFile.close ( )  :  void
H5SrbFile.copy ( HObject p1, Group p2, String p3 )  :  TreeNode
H5SrbFile.createDatatype ( int p1, int p2, int p3, int p4 )  :  Datatype
H5SrbFile.createDatatype ( int p1, int p2, int p3, int p4, String p5 )  :  Datatype
H5SrbFile.createGroup ( String p1, Group p2 )  :  Group
H5SrbFile.createImage ( String p1, Group p2, Datatype p3, long[ ] p4, long[ ] p5, long[ ] p6, int p7, int p8, int p9, Object p10 )  :  Dataset
H5SrbFile.createInstance ( String p1, int p2 )  :  FileFormat
H5SrbFile.createLink ( Group p1, String p2, HObject p3 )  :  HObject
H5SrbFile.createScalarDS ( String p1, Group p2, Datatype p3, long[ ] p4, long[ ] p5, long[ ] p6, int p7, Object p8 )  :  Dataset
H5SrbFile.delete ( HObject p1 )  :  void
H5SrbFile.get ( String p1 )  :  HObject
H5SrbFile.getLibversion ( )  :  String
H5SrbFile.getPath ( )  :  String
H5SrbFile.getRootNode ( )  :  TreeNode
H5SrbFile.H5SrbFile ( )
H5SrbFile.H5SrbFile ( String p1 )
H5SrbFile.isThisType ( FileFormat p1 )  :  boolean
H5SrbFile.isThisType ( String p1 )  :  boolean
H5SrbFile.open ( )  :  int
H5SrbFile.writeAttribute ( HObject p1, Attribute p2, boolean p3 )  :  void

h5srb.jar, H5SrbGroup.class
package ncsa.hdf.srb
H5SrbGroup.close ( int p1 )  :  void
H5SrbGroup.getMetadata ( )  :  List
H5SrbGroup.H5SrbGroup ( FileFormat p1, String p2, String p3, Group p4 )
H5SrbGroup.H5SrbGroup ( FileFormat p1, String p2, String p3, Group p4, long[ ] p5 )
H5SrbGroup.hasAttribute ( )  :  boolean
H5SrbGroup.init ( )  :  void
H5SrbGroup.open ( )  :  int
H5SrbGroup.removeMetadata ( Object p1 )  :  void
H5SrbGroup.writeMetadata ( Object p1 )  :  void

h5srb.jar, H5SrbScalarDS.class
package ncsa.hdf.srb
H5SrbScalarDS.close ( int p1 )  :  void
H5SrbScalarDS.copy ( Group p1, String p2, long[ ] p3, Object p4 )  :  Dataset
H5SrbScalarDS.getDatatype ( )  :  Datatype
H5SrbScalarDS.getMetadata ( )  :  List
H5SrbScalarDS.getPalette ( )  :  byte[ ][ ]
H5SrbScalarDS.getPaletteRefs ( )  :  byte[ ]
H5SrbScalarDS.H5SrbScalarDS ( FileFormat p1, String p2, String p3 )
H5SrbScalarDS.H5SrbScalarDS ( FileFormat p1, String p2, String p3, long[ ] p4 )
H5SrbScalarDS.hasAttribute ( )  :  boolean
H5SrbScalarDS.init ( )  :  void
H5SrbScalarDS.open ( )  :  int
H5SrbScalarDS.read ( )  :  Object
H5SrbScalarDS.readBytes ( )  :  byte[ ]
H5SrbScalarDS.readPalette ( int p1 )  :  byte[ ][ ]
H5SrbScalarDS.removeMetadata ( Object p1 )  :  void
H5SrbScalarDS.setPalette ( byte[ ] p1 )  :  void
H5SrbScalarDS.write ( Object p1 )  :  void
H5SrbScalarDS.writeMetadata ( Object p1 )  :  void

h5srb.jar, SRBFileDialog.class
package ncsa.hdf.srb
SRBFileDialog.testFileContent ( String p1 )  :  void
SRBFileDialog.testFileList ( )  :  void

jhdf.jar, HDFLibrary.class
package ncsa.hdf.hdflib
HDFLibrary.HDdont_atexit ( ) [static]  :  int

jhdf4obj.jar, H4Datatype.class
package ncsa.hdf.object.h4
H4Datatype.close ( int p1 )  :  void
H4Datatype.hasAttribute ( )  :  boolean

jhdf4obj.jar, H4File.class
package ncsa.hdf.object.h4
H4File.copy ( HObject p1, Group p2, String p3 )  :  TreeNode
H4File.createDatatype ( int p1, int p2, int p3, int p4, String p5 )  :  Datatype
H4File.createFile ( String p1, int p2 )  :  FileFormat
H4File.createInstance ( String p1, int p2 )  :  FileFormat
H4File.createLink ( Group p1, String p2, HObject p3 )  :  HObject

jhdf4obj.jar, H4GRImage.class
package ncsa.hdf.object.h4
H4GRImage.hasAttribute ( )  :  boolean

jhdf4obj.jar, H4Group.class
package ncsa.hdf.object.h4
H4Group.hasAttribute ( )  :  boolean

jhdf4obj.jar, H4SDS.class
package ncsa.hdf.object.h4
H4SDS.hasAttribute ( )  :  boolean

jhdf4obj.jar, H4Vdata.class
package ncsa.hdf.object.h4
H4Vdata.hasAttribute ( )  :  boolean

jhdf5.jar, H5.class
package ncsa.hdf.hdf5lib
H5.H5Acopy ( int p1, int p2 ) [static]  :  int
H5.H5Dgetdir_ext ( String[ ] p1, int p2 ) [static]  :  int
H5.H5Dread_reg_ref ( int p1, int p2, int p3, int p4, int p5, String[ ] p6 ) [static]  :  int
H5.H5Dread_string ( int p1, int p2, int p3, int p4, int p5, String[ ] p6 ) [static]  :  int
H5.H5Dwrite_double ( int p1, int p2, int p3, int p4, int p5, double[ ] p6 ) [static]  :  int
H5.H5Dwrite_float ( int p1, int p2, int p3, int p4, int p5, float[ ] p6 ) [static]  :  int
H5.H5Dwrite_int ( int p1, int p2, int p3, int p4, int p5, int[ ] p6 ) [static]  :  int
H5.H5Dwrite_long ( int p1, int p2, int p3, int p4, int p5, long[ ] p6 ) [static]  :  int
H5.H5Dwrite_short ( int p1, int p2, int p3, int p4, int p5, short[ ] p6 ) [static]  :  int
H5.H5DwriteString ( int p1, int p2, int p3, int p4, int p5, String[ ] p6 ) [static]  :  int
H5.H5Pclose_class ( int p1 ) [static]  :  int
H5.H5Pcopy_prop ( int p1, int p2, String p3 ) [static]  :  int
H5.H5Pcreate_list ( int p1 ) [static]  :  int
H5.H5Pequal ( int p1, int p2 ) [static]  :  int
H5.H5Pexist ( int p1, String p2 ) [static]  :  int
H5.H5Pget ( int p1, String p2 ) [static]  :  int
H5.H5Pget_class_name ( int p1 ) [static]  :  String
H5.H5Pget_class_parent ( int p1 ) [static]  :  int
H5.H5Pget_nprops ( int p1 ) [static]  :  long
H5.H5Pget_size ( int p1, String p2 ) [static]  :  long
H5.H5Pisa_class ( int p1, int p2 ) [static]  :  int
H5.H5Premove ( int p1, String p2 ) [static]  :  int
H5.H5Pset ( int p1, String p2, int p3 ) [static]  :  int
H5.H5Pset_deflate ( int p1, int p2 ) [static]  :  int
H5.H5Punregister ( int p1, String p2 ) [static]  :  int
H5.H5Tenum_insert ( int p1, String p2, int p3 ) [static]  :  int

jhdf5obj.jar, H5CompoundDS.class
package ncsa.hdf.object.h5
H5CompoundDS.clear ( )  :  void
H5CompoundDS.create ( String p1, Group p2, long[ ] p3, long[ ] p4, long[ ] p5, int p6, String[ ] p7, Datatype[ ] p8, int[ ] p9, int[ ][ ] p10, Object p11 ) [static]  :  Dataset
H5CompoundDS.getSize ( int p1 )  :  int
H5CompoundDS.hasAttribute ( )  :  boolean
H5CompoundDS.isString ( int p1 )  :  boolean

jhdf5obj.jar, H5Datatype.class
package ncsa.hdf.object.h5
H5Datatype.convertEnumValueToName ( int p1, Object p2, String[ ] p3 ) [static]  :  String[ ]
H5Datatype.H5Datatype ( FileFormat p1, String p2, String p3 )
H5Datatype.hasAttribute ( )  :  boolean

jhdf5obj.jar, H5File.class
package ncsa.hdf.object.h5
H5File.createCompoundDS ( String p1, Group p2, long[ ] p3, long[ ] p4, long[ ] p5, int p6, String[ ] p7, Datatype[ ] p8, int[ ] p9, Object p10 )  :  Dataset
H5File.createFile ( String p1, int p2 )  :  FileFormat
H5File.createInstance ( String p1, int p2 )  :  FileFormat
H5File.open ( int p1 )  :  int

jhdf5obj.jar, H5Group.class
package ncsa.hdf.object.h5
H5Group.clear ( )  :  void
H5Group.getNumberOfMembersInFile ( )  :  int
H5Group.hasAttribute ( )  :  boolean

jhdf5obj.jar, H5ScalarDS.class
package ncsa.hdf.object.h5
H5ScalarDS.clear ( )  :  void
H5ScalarDS.hasAttribute ( )  :  boolean

jhdfobj.jar, Attribute.class
package ncsa.hdf.object
Attribute.Attribute ( String p1, Datatype p2, long[ ] p3, Object p4 )

jhdfobj.jar, CompoundDS.class
package ncsa.hdf.object
CompoundDS.copy ( Group p1, String p2, long[ ] p3, Object p4 )  :  Dataset *DEPRECATED*
CompoundDS.getMemberTypes ( )  :  Datatype[ ]
CompoundDS.getSelectedMemberTypes ( )  :  Datatype[ ]

jhdfobj.jar, DataFormat.class
package ncsa.hdf.object
DataFormat.hasAttribute ( ) [abstract]  :  boolean

jhdfobj.jar, Dataset.class
package ncsa.hdf.object
Dataset.clear ( )  :  void
Dataset.convertFromUnsignedC ( Object p1, Object p2 ) [static]  :  Object
Dataset.convertToUnsignedC ( Object p1, Object p2 ) [static]  :  Object
Dataset.getConvertByteToString ( )  :  boolean
Dataset.getSize ( int p1 )  :  int
Dataset.isString ( int p1 )  :  boolean
Dataset.setConvertByteToString ( boolean p1 )  :  void

jhdfobj.jar, Datatype.class
package ncsa.hdf.object
Datatype.Datatype ( FileFormat p1, String p2, String p3 )
Datatype.getBasetype ( )  :  Datatype
Datatype.getEnumMembers ( )  :  String
Datatype.setEnumMembers ( String p1 )  :  void

jhdfobj.jar, FileFormat.class
package ncsa.hdf.object
FileFormat.createCompoundDS ( String p1, Group p2, long[ ] p3, long[ ] p4, long[ ] p5, int p6, String[ ] p7, Datatype[ ] p8, int[ ] p9, Object p10 )  :  Dataset
FileFormat.createFile ( String p1, int p2 )  :  FileFormat
FileFormat.createInstance ( String p1, int p2 ) [abstract]  :  FileFormat
FileFormat.getNumberOfMembers ( )  :  int
FileFormat.removeFileFormat ( String p1 ) [static]  :  FileFormat

jhdfobj.jar, Group.class
package ncsa.hdf.object
Group.clear ( )  :  void
Group.setName ( String p1 )  :  void

jhdfobj.jar, HObject.class
package ncsa.hdf.object
HObject.debug ( Object p1 )  :  void
HObject.getFullName ( )  :  String

jhdfobj.jar, ScalarDS.class
package ncsa.hdf.object
ScalarDS.convertFromUnsignedC ( )  :  Object
ScalarDS.convertToUnsignedC ( )  :  Object
ScalarDS.getFillValue ( )  :  Object
ScalarDS.isEnumConverted ( )  :  boolean
ScalarDS.isImageDisplay ( )  :  boolean
ScalarDS.setEnumConverted ( boolean p1 )  :  void
ScalarDS.setIsImage ( boolean p1 )  :  void
ScalarDS.setIsImageDisplay ( boolean p1 )  :  void

jhdfview.jar, DefaultPaletteView.class
package ncsa.hdf.view
DefaultPaletteView.DefaultPaletteView ( ViewManager p1, ImageView p2 )
DefaultPaletteView.dispose ( )  :  void

jhdfview.jar, HDFView.class
package ncsa.hdf.view
HDFView.HDFView ( String p1, List p2, int p3, int p4, int p5, int p6 )

jhdfview.jar, NewAttributeDialog.class
package ncsa.hdf.view
NewAttributeDialog.NewAttributeDialog ( Dialog p1, HObject p2, Enumeration p3 )

jhdfview.jar, NewTableDataDialog.class
package ncsa.hdf.view
NewTableDataDialog.itemStateChanged ( ItemEvent p1 )  :  void

jhdfview.jar, Tools.class
package ncsa.hdf.view
Tools.autoContrastApply ( Object p1, Object p2, double[ ] p3, boolean p4 ) [static]  :  Object
Tools.autoContrastCompute ( Object p1, double[ ] p2, boolean p3 ) [static]  :  int
Tools.autoContrastComputeMinMax ( Object p1, Object p2 ) [static]  :  int
Tools.autoContrastComputeSliderRange ( double[ ] p1, double[ ] p2, double[ ] p3 ) [static]  :  int
Tools.autoContrastConvertImageBuffer ( Object p1, byte[ ] p2, boolean p3 ) [static]  :  int
Tools.computeStatistics ( Object p1, double[ ] p2, Object p3 ) [static]  :  int
Tools.createReverseGrayPalette ( ) [static]  :  byte[ ][ ]
Tools.debug ( Object p1, Object p2 ) [static]  :  void
Tools.findMinMax ( Object p1, double[ ] p2, Object p3 ) [static]  :  int
Tools.getBytes ( Object p1, double[ ] p2, byte[ ] p3 ) [static]  :  byte[ ]
Tools.getBytes ( Object p1, double[ ] p2, int p3, int p4, boolean p5, byte[ ] p6 ) [static]  :  byte[ ]
Tools.getBytes ( Object p1, double[ ] p2, int p3, int p4, boolean p5, Object p6, byte[ ] p7 ) [static]  :  byte[ ]
Tools.getBytes ( Object p1, double[ ] p2, Object p3, byte[ ] p4 ) [static]  :  byte[ ]

jhdfview.jar, UserOptionsDialog.class
package ncsa.hdf.view
UserOptionsDialog.setVisible ( boolean p1 )  :  void

jhdfview.jar, ViewProperties.class
package ncsa.hdf.view
ViewProperties.getAutocontrastIcon ( ) [static]  :  Icon
ViewProperties.getBrightIcon ( ) [static]  :  Icon
ViewProperties.isAutoContrast ( ) [static]  :  boolean
ViewProperties.isConvertEnum ( ) [static]  :  boolean
ViewProperties.setAutoContrast ( boolean p1 ) [static]  :  void
ViewProperties.setConvertEnum ( boolean p1 ) [static]  :  void

to the top

Removed Methods (1109)


jargon.jar, AnalyzeVolumeSliceExample.class
AnalyzeVolumeSliceExample.AnalyzeVolumeSliceExample ( )
AnalyzeVolumeSliceExample.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void

jargon.jar, BinaryDataFormat.class
package edu.sdsc.grid.io
BinaryDataFormat.BinaryDataFormat ( )
BinaryDataFormat.BinaryDataFormat ( BinaryDataFormat p1 )
BinaryDataFormat.doubleValue ( byte[ ] p1 )  :  double
BinaryDataFormat.doubleValue ( byte[ ] p1, int p2 )  :  double
BinaryDataFormat.doubleValues ( byte[ ] p1, double[ ] p2, int p3 )  :  void
BinaryDataFormat.encodeDouble ( double p1, byte[ ] p2 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeDouble ( double p1, byte[ ] p2, int p3 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeDoubles ( double[ ] p1, int p2, byte[ ] p3 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeFloat ( double p1, byte[ ] p2 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeFloat ( double p1, byte[ ] p2, int p3 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeFloat ( float p1, byte[ ] p2 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeFloat ( float p1, byte[ ] p2, int p3 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeFloats ( float[ ] p1, int p2, byte[ ] p3 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeInt ( int p1, byte[ ] p2 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeInt ( int p1, byte[ ] p2, int p3 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeInts ( int[ ] p1, int p2, byte[ ] p3 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeLong ( long p1, byte[ ] p2 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeLong ( long p1, byte[ ] p2, int p3 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeLongDouble ( double p1, byte[ ] p2 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeLongDouble ( double p1, byte[ ] p2, int p3 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeLongDoubles ( double[ ] p1, int p2, byte[ ] p3 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeLongLong ( long p1, byte[ ] p2 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeLongLong ( long p1, byte[ ] p2, int p3 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeLongLongs ( long[ ] p1, int p2, byte[ ] p3 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeLongs ( long[ ] p1, int p2, byte[ ] p3 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeShort ( int p1, byte[ ] p2 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeShort ( int p1, byte[ ] p2, int p3 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeShort ( short p1, byte[ ] p2 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeShort ( short p1, byte[ ] p2, int p3 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeShorts ( short[ ] p1, int p2, byte[ ] p3 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeUnsignedInt ( int p1, byte[ ] p2 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeUnsignedInt ( int p1, byte[ ] p2, int p3 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeUnsignedInt ( long p1, byte[ ] p2 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeUnsignedInt ( long p1, byte[ ] p2, int p3 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeUnsignedInts ( int[ ] p1, int p2, byte[ ] p3 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeUnsignedLong ( long p1, byte[ ] p2 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeUnsignedLong ( long p1, byte[ ] p2, int p3 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeUnsignedLongLong ( long p1, byte[ ] p2 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeUnsignedLongLong ( long p1, byte[ ] p2, int p3 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeUnsignedLongLongs ( long[ ] p1, int p2, byte[ ] p3 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeUnsignedLongs ( long[ ] p1, int p2, byte[ ] p3 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeUnsignedShort ( int p1, byte[ ] p2 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeUnsignedShort ( int p1, byte[ ] p2, int p3 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeUnsignedShort ( short p1, byte[ ] p2 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeUnsignedShort ( short p1, byte[ ] p2, int p3 )  :  int
BinaryDataFormat.encodeUnsignedShorts ( short[ ] p1, int p2, byte[ ] p3 )  :  int
BinaryDataFormat.equals ( BinaryDataFormat p1 )  :  boolean
BinaryDataFormat.equals ( Object p1 )  :  boolean
BinaryDataFormat.finalize ( )  :  void
BinaryDataFormat.floatValue ( byte[ ] p1 )  :  float
BinaryDataFormat.floatValue ( byte[ ] p1, int p2 )  :  float
BinaryDataFormat.floatValues ( byte[ ] p1, float[ ] p2, int p3 )  :  void
BinaryDataFormat.getDoubleSize ( )  :  int
BinaryDataFormat.getFloatSize ( )  :  int
BinaryDataFormat.getIntSize ( )  :  int
BinaryDataFormat.getLongDoubleSize ( )  :  int
BinaryDataFormat.getLongLongSize ( )  :  int
BinaryDataFormat.getLongSize ( )  :  int
BinaryDataFormat.getShortSize ( )  :  int
BinaryDataFormat.intValue ( byte[ ] p1 )  :  int
BinaryDataFormat.intValue ( byte[ ] p1, int p2 )  :  int
BinaryDataFormat.intValues ( byte[ ] p1, int[ ] p2, int p3 )  :  void
BinaryDataFormat.isLBFByteOrder ( )  :  boolean
BinaryDataFormat.isMBFByteOrder ( )  :  boolean
BinaryDataFormat.longDoubleValue ( byte[ ] p1 )  :  double
BinaryDataFormat.longDoubleValue ( byte[ ] p1, int p2 )  :  double
BinaryDataFormat.longDoubleValues ( byte[ ] p1, double[ ] p2, int p3 )  :  void
BinaryDataFormat.longLongValue ( byte[ ] p1 )  :  long
BinaryDataFormat.longLongValue ( byte[ ] p1, int p2 )  :  long
BinaryDataFormat.longLongValues ( byte[ ] p1, long[ ] p2, int p3 )  :  void
BinaryDataFormat.longValue ( byte[ ] p1 )  :  long
BinaryDataFormat.longValue ( byte[ ] p1, int p2 )  :  long
BinaryDataFormat.longValues ( byte[ ] p1, long[ ] p2, int p3 )  :  void
BinaryDataFormat.setDoubleSize ( int p1 )  :  void
BinaryDataFormat.setFloatSize ( int p1 )  :  void
BinaryDataFormat.setIntSize ( int p1 )  :  void
BinaryDataFormat.setLBFByteOrder ( )  :  void
BinaryDataFormat.setLongDoubleSize ( int p1 )  :  void
BinaryDataFormat.setLongLongSize ( int p1 )  :  void
BinaryDataFormat.setLongSize ( int p1 )  :  void
BinaryDataFormat.setMBFByteOrder ( )  :  void
BinaryDataFormat.setShortSize ( int p1 )  :  void
BinaryDataFormat.shortValue ( byte[ ] p1 )  :  short
BinaryDataFormat.shortValue ( byte[ ] p1, int p2 )  :  short
BinaryDataFormat.shortValues ( byte[ ] p1, short[ ] p2, int p3 )  :  void
BinaryDataFormat.unsignedIntValue ( byte[ ] p1 )  :  long
BinaryDataFormat.unsignedIntValue ( byte[ ] p1, int p2 )  :  long
BinaryDataFormat.unsignedIntValues ( byte[ ] p1, int[ ] p2, int p3 )  :  void
BinaryDataFormat.unsignedLongLongValue ( byte[ ] p1 )  :  long
BinaryDataFormat.unsignedLongLongValue ( byte[ ] p1, int p2 )  :  long
BinaryDataFormat.unsignedLongLongValues ( byte[ ] p1, long[ ] p2, int p3 )  :  void
BinaryDataFormat.unsignedLongValue ( byte[ ] p1 )  :  long
BinaryDataFormat.unsignedLongValue ( byte[ ] p1, int p2 )  :  long
BinaryDataFormat.unsignedLongValues ( byte[ ] p1, long[ ] p2, int p3 )  :  void
BinaryDataFormat.unsignedShortValue ( byte[ ] p1 )  :  int
BinaryDataFormat.unsignedShortValue ( byte[ ] p1, int p2 )  :  int
BinaryDataFormat.unsignedShortValues ( byte[ ] p1, short[ ] p2, int p3 )  :  void

jargon.jar, FactoryTest.class
FactoryTest.FactoryTest ( )
FactoryTest.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void

jargon.jar, FileFactory.class
package edu.sdsc.grid.io
FileFactory.FileFactory ( )
FileFactory.newFile ( GeneralFile p1, String p2 ) [static]  :  GeneralFile
FileFactory.newFile ( GeneralFileSystem p1, String p2 ) [static]  :  GeneralFile
FileFactory.newFile ( GeneralFileSystem p1, String p2, String p3 ) [static]  :  GeneralFile
FileFactory.newFile ( URI p1 ) [static]  :  GeneralFile
FileFactory.newFile ( URI p1, String p2 ) [static]  :  GeneralFile
FileFactory.newFileInputStream ( GeneralFile p1 ) [static]  :  GeneralFileInputStream
FileFactory.newFileOutputStream ( GeneralFile p1 ) [static]  :  GeneralFileOutputStream
FileFactory.newFileSystem ( GeneralAccount p1 ) [static]  :  GeneralFileSystem
FileFactory.newRandomAccessFile ( GeneralFile p1, String p2 ) [static]  :  GeneralRandomAccessFile

jargon.jar, GeneralAccount.class
package edu.sdsc.grid.io
GeneralAccount.clone ( )  :  Object
GeneralAccount.equals ( Object p1 ) [abstract]  :  boolean
GeneralAccount.finalize ( )  :  void
GeneralAccount.GeneralAccount ( String p1 )
GeneralAccount.getHomeDirectory ( )  :  String
GeneralAccount.setHomeDirectory ( String p1 ) [abstract]  :  void

jargon.jar, GeneralFile.class
package edu.sdsc.grid.io
GeneralFile.canRead ( )  :  boolean
GeneralFile.canWrite ( )  :  boolean
GeneralFile.compareTo ( GeneralFile p1 )  :  int
GeneralFile.compareTo ( Object p1 )  :  int
GeneralFile.copyFrom ( GeneralFile p1 )  :  void
GeneralFile.copyFrom ( GeneralFile p1, boolean p2 )  :  void
GeneralFile.copyTo ( GeneralFile p1 )  :  void
GeneralFile.copyTo ( GeneralFile p1, boolean p2 )  :  void
GeneralFile.createNewFile ( )  :  boolean
GeneralFile.createTempFile ( String p1, String p2 ) [static]  :  GeneralFile
GeneralFile.createTempFile ( String p1, String p2, GeneralFile p3 ) [static]  :  GeneralFile
GeneralFile.delete ( )  :  boolean
GeneralFile.deleteOnExit ( )  :  void
GeneralFile.equals ( Object p1 )  :  boolean
GeneralFile.exists ( )  :  boolean
GeneralFile.finalize ( )  :  void
GeneralFile.GeneralFile ( GeneralFileSystem p1, String p2, String p3 )
GeneralFile.GeneralFile ( URI p1 )
GeneralFile.getAbsoluteFile ( )  :  GeneralFile
GeneralFile.getAbsolutePath ( )  :  String
GeneralFile.getCanonicalFile ( )  :  GeneralFile
GeneralFile.getCanonicalPath ( )  :  String
GeneralFile.getFileSystem ( )  :  GeneralFileSystem
GeneralFile.getName ( )  :  String
GeneralFile.getParent ( )  :  String
GeneralFile.getParentFile ( )  :  GeneralFile
GeneralFile.getPath ( )  :  String
GeneralFile.getPathSeparator ( )  :  String
GeneralFile.getPathSeparatorChar ( )  :  char
GeneralFile.isAbsolute ( )  :  boolean
GeneralFile.isDirectory ( )  :  boolean
GeneralFile.isFile ( )  :  boolean
GeneralFile.isHidden ( )  :  boolean
GeneralFile.lastModified ( )  :  long
GeneralFile.length ( )  :  long
GeneralFile.list ( )  :  String[ ]
GeneralFile.list ( MetaDataCondition[ ] p1 )  :  String[ ]
GeneralFile.listFiles ( )  :  GeneralFile[ ]
GeneralFile.listRoots ( ) [static]  :  GeneralFile[ ]
GeneralFile.mkdir ( )  :  boolean
GeneralFile.mkdirs ( )  :  boolean
GeneralFile.modifyMetaData ( MetaDataRecordList p1 )  :  void
GeneralFile.query ( MetaDataCondition[ ] p1, MetaDataSelect[ ] p2 )  :  MetaDataRecordList[ ]
GeneralFile.query ( MetaDataSelect[ ] p1 )  :  MetaDataRecordList[ ]
GeneralFile.query ( String[ ] p1 )  :  MetaDataRecordList[ ]
GeneralFile.renameTo ( GeneralFile p1 )  :  boolean
GeneralFile.setDirectory ( String p1 )  :  void
GeneralFile.setFileName ( String p1 )  :  void
GeneralFile.setFileSystem ( GeneralFileSystem p1 )  :  void
GeneralFile.setLastModified ( long p1 )  :  boolean
GeneralFile.setReadOnly ( )  :  boolean
GeneralFile.toString ( )  :  String
GeneralFile.toURI ( )  :  URI
GeneralFile.toURL ( )  :  URL

jargon.jar, GeneralFileInputStream.class
package edu.sdsc.grid.io
GeneralFileInputStream.available ( ) [abstract]  :  int
GeneralFileInputStream.close ( ) [abstract]  :  void
GeneralFileInputStream.finalize ( )  :  void
GeneralFileInputStream.GeneralFileInputStream ( GeneralFile p1 )
GeneralFileInputStream.GeneralFileInputStream ( GeneralFileSystem p1, String p2 )
GeneralFileInputStream.open ( GeneralFile p1 ) [abstract]  :  void
GeneralFileInputStream.read ( ) [abstract]  :  int
GeneralFileInputStream.read ( byte[ ] p1 )  :  int
GeneralFileInputStream.read ( byte[ ] p1, int p2, int p3 ) [abstract]  :  int
GeneralFileInputStream.skip ( long p1 ) [abstract]  :  long

jargon.jar, GeneralFileOutputStream.class
package edu.sdsc.grid.io
GeneralFileOutputStream.close ( ) [abstract]  :  void
GeneralFileOutputStream.finalize ( )  :  void
GeneralFileOutputStream.GeneralFileOutputStream ( GeneralFile p1 )
GeneralFileOutputStream.GeneralFileOutputStream ( GeneralFileSystem p1, String p2 )
GeneralFileOutputStream.open ( GeneralFile p1 ) [abstract]  :  void
GeneralFileOutputStream.write ( byte[ ] p1 )  :  void
GeneralFileOutputStream.write ( byte[ ] p1, int p2, int p3 ) [abstract]  :  void
GeneralFileOutputStream.write ( int p1 )  :  void

jargon.jar, GeneralFileSystem.class
package edu.sdsc.grid.io
GeneralFileSystem.clone ( )  :  Object
GeneralFileSystem.equals ( Object p1 ) [abstract]  :  boolean
GeneralFileSystem.finalize ( )  :  void
GeneralFileSystem.GeneralFileSystem ( )
GeneralFileSystem.getAccount ( )  :  GeneralAccount
GeneralFileSystem.getHomeDirectory ( )  :  String
GeneralFileSystem.getRootDirectories ( ) [abstract]  :  String[ ]
GeneralFileSystem.query ( MetaDataCondition[ ] p1, MetaDataSelect[ ] p2 ) [abstract]  :  MetaDataRecordList[ ]
GeneralFileSystem.query ( MetaDataCondition[ ] p1, MetaDataSelect[ ] p2, int p3 ) [abstract]  :  MetaDataRecordList[ ]
GeneralFileSystem.setAccount ( GeneralAccount p1 ) [abstract]  :  void
GeneralFileSystem.toString ( )  :  String

jargon.jar, GeneralRandomAccessFile.class
package edu.sdsc.grid.io
GeneralRandomAccessFile.close ( ) [abstract]  :  void
GeneralRandomAccessFile.finalize ( )  :  void
GeneralRandomAccessFile.GeneralRandomAccessFile ( GeneralFile p1, String p2 )
GeneralRandomAccessFile.getBinaryDataFormat ( )  :  BinaryDataFormat
GeneralRandomAccessFile.getFD ( )  :  int
GeneralRandomAccessFile.getFile ( )  :  GeneralFile
GeneralRandomAccessFile.getFilePointer ( ) [abstract]  :  long
GeneralRandomAccessFile.isClosed ( )  :  boolean
GeneralRandomAccessFile.length ( ) [abstract]  :  long
GeneralRandomAccessFile.open ( GeneralFile p1 ) [abstract]  :  void
GeneralRandomAccessFile.read ( ) [abstract]  :  int
GeneralRandomAccessFile.read ( byte[ ] p1 )  :  int
GeneralRandomAccessFile.read ( byte[ ] p1, int p2, int p3 )  :  int
GeneralRandomAccessFile.readBoolean ( )  :  boolean
GeneralRandomAccessFile.readBooleans ( boolean[ ] p1, int p2 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.readByte ( )  :  byte
GeneralRandomAccessFile.readBytes ( byte[ ] p1, int p2, int p3 ) [abstract]  :  int
GeneralRandomAccessFile.readChar ( )  :  char
GeneralRandomAccessFile.readDouble ( )  :  double
GeneralRandomAccessFile.readDoubles ( double[ ] p1, int p2 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.readFloat ( )  :  float
GeneralRandomAccessFile.readFloats ( float[ ] p1, int p2 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.readFully ( byte[ ] p1 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.readFully ( byte[ ] p1, int p2, int p3 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.readInt ( )  :  int
GeneralRandomAccessFile.readInts ( int[ ] p1, int p2 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.readLine ( )  :  String
GeneralRandomAccessFile.readLong ( )  :  long
GeneralRandomAccessFile.readLongDouble ( )  :  double
GeneralRandomAccessFile.readLongDoubles ( double[ ] p1, int p2 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.readLongLong ( )  :  long
GeneralRandomAccessFile.readLongLongs ( long[ ] p1, int p2 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.readLongs ( long[ ] p1, int p2 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.readShort ( )  :  short
GeneralRandomAccessFile.readShorts ( short[ ] p1, int p2 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.readUnsignedByte ( )  :  int
GeneralRandomAccessFile.readUnsignedInt ( )  :  long
GeneralRandomAccessFile.readUnsignedInts ( int[ ] p1, int p2 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.readUnsignedLong ( )  :  long
GeneralRandomAccessFile.readUnsignedLongLong ( )  :  long
GeneralRandomAccessFile.readUnsignedLongLongs ( long[ ] p1, int p2 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.readUnsignedLongs ( long[ ] p1, int p2 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.readUnsignedShort ( )  :  int
GeneralRandomAccessFile.readUnsignedShorts ( short[ ] p1, int p2 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.readUTF ( )  :  String
GeneralRandomAccessFile.rwCheck ( GeneralFile p1, String p2 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.seek ( long p1 ) [abstract]  :  void
GeneralRandomAccessFile.seek ( long p1, int p2 ) [abstract]  :  void
GeneralRandomAccessFile.setBinaryDataFormat ( BinaryDataFormat p1 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.setLength ( long p1 ) [abstract]  :  void
GeneralRandomAccessFile.skipBytes ( int p1 )  :  int
GeneralRandomAccessFile.write ( byte[ ] p1 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.write ( byte[ ] p1, int p2, int p3 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.write ( int p1 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.write ( String p1 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.writeBoolean ( boolean p1 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.writeBooleans ( boolean[ ] p1, int p2 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.writeByte ( int p1 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.writeBytes ( byte[ ] p1, int p2, int p3 ) [abstract]  :  void
GeneralRandomAccessFile.writeBytes ( String p1 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.writeChar ( int p1 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.writeChars ( String p1 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.writeDouble ( double p1 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.writeDoubles ( double[ ] p1, int p2 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.writeFloat ( float p1 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.writeFloats ( float[ ] p1, int p2 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.writeInt ( int p1 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.writeInts ( int[ ] p1, int p2 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.writeLong ( long p1 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.writeLongDouble ( double p1 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.writeLongDoubles ( double[ ] p1, int p2 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.writeLongLong ( long p1 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.writeLongLongs ( long[ ] p1, int p2 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.writeLongs ( long[ ] p1, int p2 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.writeShort ( int p1 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.writeShorts ( short[ ] p1, int p2 )  :  void
GeneralRandomAccessFile.writeUTF ( String p1 )  :  void

jargon.jar, Host.class
package edu.sdsc.grid.io
Host.castToByte ( byte[ ] p1 ) [static]  :  short
Host.castToByte ( byte[ ] p1, int p2 ) [static]  :  short
Host.castToDouble ( byte[ ] p1 ) [static]  :  double
Host.castToDouble ( byte[ ] p1, int p2 ) [static]  :  double
Host.castToFloat ( byte[ ] p1 ) [static]  :  float
Host.castToFloat ( byte[ ] p1, int p2 ) [static]  :  float
Host.castToInt ( byte[ ] p1 ) [static]  :  int
Host.castToInt ( byte[ ] p1, int p2 ) [static]  :  int
Host.castToLong ( byte[ ] p1 ) [static]  :  long
Host.castToLong ( byte[ ] p1, int p2 ) [static]  :  long
Host.castToLongDouble ( byte[ ] p1 ) [static]  :  double
Host.castToLongDouble ( byte[ ] p1, int p2 ) [static]  :  double
Host.castToLongLong ( byte[ ] p1 ) [static]  :  long
Host.castToLongLong ( byte[ ] p1, int p2 ) [static]  :  long
Host.castToShort ( byte[ ] p1 ) [static]  :  short
Host.castToShort ( byte[ ] p1, int p2 ) [static]  :  short
Host.castToUnsignedInt ( byte[ ] p1 ) [static]  :  long
Host.castToUnsignedInt ( byte[ ] p1, int p2 ) [static]  :  long
Host.castToUnsignedLong ( byte[ ] p1 ) [static]  :  long
Host.castToUnsignedLong ( byte[ ] p1, int p2 ) [static]  :  long
Host.castToUnsignedLongLong ( byte[ ] p1 ) [static]  :  long
Host.castToUnsignedLongLong ( byte[ ] p1, int p2 ) [static]  :  long
Host.castToUnsignedShort ( byte[ ] p1 ) [static]  :  int
Host.castToUnsignedShort ( byte[ ] p1, int p2 ) [static]  :  int
Host.copyDouble ( double p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyDouble ( double p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.copyFloat ( double p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyFloat ( double p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.copyFloat ( float p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyFloat ( float p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.copyInt ( byte p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyInt ( byte p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.copyInt ( int p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyInt ( int p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.copyInt ( long p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyInt ( long p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.copyInt ( short p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyInt ( short p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.copyLong ( byte p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyLong ( byte p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.copyLong ( int p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyLong ( int p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.copyLong ( long p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyLong ( long p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.copyLong ( short p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyLong ( short p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.copyLongDouble ( double p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyLongDouble ( double p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.copyLongLong ( byte p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyLongLong ( byte p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.copyLongLong ( int p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyLongLong ( int p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.copyLongLong ( long p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyLongLong ( long p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.copyLongLong ( short p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyLongLong ( short p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.copyShort ( byte p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyShort ( byte p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.copyShort ( int p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyShort ( int p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.copyShort ( long p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyShort ( long p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.copyShort ( short p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyShort ( short p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.copyUnsignedInt ( byte p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyUnsignedInt ( byte p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.copyUnsignedInt ( int p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyUnsignedInt ( int p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.copyUnsignedInt ( long p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyUnsignedInt ( long p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.copyUnsignedInt ( short p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyUnsignedInt ( short p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.copyUnsignedLong ( byte p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyUnsignedLong ( byte p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.copyUnsignedLong ( int p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyUnsignedLong ( int p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.copyUnsignedLong ( long p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyUnsignedLong ( long p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.copyUnsignedLong ( short p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyUnsignedLong ( short p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.copyUnsignedLongLong ( byte p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyUnsignedLongLong ( byte p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.copyUnsignedLongLong ( int p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyUnsignedLongLong ( int p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.copyUnsignedLongLong ( long p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyUnsignedLongLong ( long p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.copyUnsignedLongLong ( short p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyUnsignedLongLong ( short p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.copyUnsignedShort ( byte p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyUnsignedShort ( byte p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.copyUnsignedShort ( int p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyUnsignedShort ( int p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.copyUnsignedShort ( long p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyUnsignedShort ( long p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.copyUnsignedShort ( short p1, byte[ ] p2 ) [static]  :  void
Host.copyUnsignedShort ( short p1, byte[ ] p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.getCompilerAlignment ( int p1 ) [static]  :  int
Host.getName ( int p1 ) [static]  :  String
Host.getSignificantBits ( int p1 ) [static]  :  int
Host.getStorageSize ( int p1 ) [static]  :  byte
Host.Host ( )
Host.isLBFByteOrder ( ) [static]  :  boolean
Host.isMBFByteOrder ( ) [static]  :  boolean
Host.print ( ) [static]  :  void
Host.swap ( byte[ ] p1, int p2 ) [static]  :  void
Host.swap ( byte[ ] p1, int p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.swapMultiple ( byte[ ] p1, int p2, int p3 ) [static]  :  void
Host.swapMultiple ( byte[ ] p1, int p2, int p3, int p4 ) [static]  :  void

jargon.jar, JargonGui.class
package edu.sdsc.grid.gui
JargonGui.actionPerformed ( ActionEvent p1 )  :  void
JargonGui.getCopyBuffer ( )  :  GeneralFile
JargonGui.getRoots ( )  :  GeneralFile[ ]
JargonGui.getSelects ( )  :  MetaDataSelect[ ]
JargonGui.JargonGui ( GeneralFile p1 )
JargonGui.JargonGui ( GeneralFile p1, MetaDataSelect[ ] p2 )
JargonGui.JargonGui ( GeneralFile[ ] p1 )
JargonGui.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
JargonGui.useDefaultPopupMenu ( boolean p1 )  :  void

jargon.jar, JargonTreeCellEditor.class
package edu.sdsc.grid.gui
JargonTreeCellEditor.addCellEditorListener ( CellEditorListener p1 )  :  void
JargonTreeCellEditor.cancelCellEditing ( )  :  void
JargonTreeCellEditor.finalize ( )  :  void
JargonTreeCellEditor.getCellEditorValue ( )  :  Object
JargonTreeCellEditor.getTreeCellEditorComponent ( JTree p1, Object p2, boolean p3, boolean p4, boolean p5, int p6 )  :  Component
JargonTreeCellEditor.isCellEditable ( EventObject p1 )  :  boolean
JargonTreeCellEditor.JargonTreeCellEditor ( )
JargonTreeCellEditor.removeCellEditorListener ( CellEditorListener p1 )  :  void
JargonTreeCellEditor.shouldSelectCell ( EventObject p1 )  :  boolean
JargonTreeCellEditor.stopCellEditing ( )  :  boolean

jargon.jar, JargonTreeCellRenderer.class
package edu.sdsc.grid.gui
JargonTreeCellRenderer.getTreeCellRendererComponent ( JTree p1, Object p2, boolean p3, boolean p4, boolean p5, int p6, boolean p7 )  :  Component
JargonTreeCellRenderer.JargonTreeCellRenderer ( )

jargon.jar, JargonTreeModel.class
package edu.sdsc.grid.gui
JargonTreeModel.addTreeModelListener ( TreeModelListener p1 )  :  void
JargonTreeModel.fireTreeStructureChanged ( Object p1 )  :  void
JargonTreeModel.getChild ( Object p1, int p2 )  :  Object
JargonTreeModel.getChildCount ( Object p1 )  :  int
JargonTreeModel.getIndexOfChild ( Object p1, Object p2 )  :  int
JargonTreeModel.getRoot ( )  :  Object
JargonTreeModel.isLeaf ( Object p1 )  :  boolean
JargonTreeModel.JargonTreeModel ( GeneralFile p1 )
JargonTreeModel.JargonTreeModel ( GeneralFile[ ] p1 )
JargonTreeModel.removeTreeModelListener ( TreeModelListener p1 )  :  void
JargonTreeModel.setRoot ( Object p1 )  :  void
JargonTreeModel.valueForPathChanged ( TreePath p1, Object p2 )  :  void

jargon.jar, LocalAccount.class
package edu.sdsc.grid.io.local
LocalAccount.equals ( Object p1 )  :  boolean
LocalAccount.LocalAccount ( )
LocalAccount.LocalAccount ( String p1 )
LocalAccount.setHomeDirectory ( String p1 )  :  void

jargon.jar, LocalFile.class
package edu.sdsc.grid.io.local
LocalFile.canRead ( )  :  boolean
LocalFile.canWrite ( )  :  boolean
LocalFile.compareTo ( GeneralFile p1 )  :  int
LocalFile.compareTo ( Object p1 )  :  int
LocalFile.copyFrom ( GeneralFile p1 )  :  void
LocalFile.copyFrom ( GeneralFile p1, boolean p2 )  :  void
LocalFile.copyTo ( GeneralFile p1 )  :  void
LocalFile.copyTo ( GeneralFile p1, boolean p2 )  :  void
LocalFile.createNewFile ( )  :  boolean
LocalFile.createTempFile ( String p1, String p2 ) [static]  :  GeneralFile
LocalFile.createTempFile ( String p1, String p2, GeneralFile p3 ) [static]  :  GeneralFile
LocalFile.delete ( )  :  boolean
LocalFile.deleteOnExit ( )  :  void
LocalFile.equals ( Object p1 )  :  boolean
LocalFile.exists ( )  :  boolean
LocalFile.finalize ( )  :  void
LocalFile.getAbsoluteFile ( )  :  GeneralFile
LocalFile.getAbsolutePath ( )  :  String
LocalFile.getCanonicalFile ( )  :  GeneralFile
LocalFile.getCanonicalPath ( )  :  String
LocalFile.getFile ( )  :  File
LocalFile.getHomeDirectory ( )  :  String
LocalFile.getMetaData ( )  :  Properties
LocalFile.getName ( )  :  String
LocalFile.getParent ( )  :  String
LocalFile.getParentFile ( )  :  GeneralFile
LocalFile.getPath ( )  :  String
LocalFile.getPathSeparator ( )  :  String
LocalFile.getPathSeparatorChar ( )  :  char
LocalFile.hashCode ( )  :  int
LocalFile.isAbsolute ( )  :  boolean
LocalFile.isDirectory ( )  :  boolean
LocalFile.isFile ( )  :  boolean
LocalFile.isHidden ( )  :  boolean
LocalFile.lastModified ( )  :  long
LocalFile.length ( )  :  long
LocalFile.list ( )  :  String[ ]
LocalFile.list ( FilenameFilter p1 )  :  String[ ]
LocalFile.listFiles ( )  :  GeneralFile[ ]
LocalFile.listFiles ( FileFilter p1 )  :  GeneralFile[ ]
LocalFile.listFiles ( FilenameFilter p1 )  :  GeneralFile[ ]
LocalFile.listIterator ( )  :  Iterator
LocalFile.listRoots ( ) [static]  :  GeneralFile[ ]
LocalFile.LocalFile ( File p1 )
LocalFile.LocalFile ( File p1, String p2 )
LocalFile.LocalFile ( LocalFile p1, String p2 )
LocalFile.LocalFile ( String p1 )
LocalFile.LocalFile ( String p1, String p2 )
LocalFile.LocalFile ( URI p1 )
LocalFile.mkdir ( )  :  boolean
LocalFile.mkdirs ( )  :  boolean
LocalFile.renameTo ( GeneralFile p1 )  :  boolean
LocalFile.setDirectory ( String p1 )  :  void
LocalFile.setFileName ( String p1 )  :  void
LocalFile.setLastModified ( long p1 )  :  boolean
LocalFile.setReadOnly ( )  :  boolean
LocalFile.toString ( )  :  String
LocalFile.toURI ( )  :  URI
LocalFile.toURL ( )  :  URL

jargon.jar, LocalFileInputStream.class
package edu.sdsc.grid.io.local
LocalFileInputStream.available ( )  :  int
LocalFileInputStream.close ( )  :  void
LocalFileInputStream.finalize ( )  :  void
LocalFileInputStream.LocalFileInputStream ( LocalFile p1 )
LocalFileInputStream.LocalFileInputStream ( String p1 )
LocalFileInputStream.open ( GeneralFile p1 )  :  void
LocalFileInputStream.read ( )  :  int
LocalFileInputStream.read ( byte[ ] p1 )  :  int
LocalFileInputStream.read ( byte[ ] p1, int p2, int p3 )  :  int
LocalFileInputStream.skip ( long p1 )  :  long

jargon.jar, LocalFileOutputStream.class
package edu.sdsc.grid.io.local
LocalFileOutputStream.close ( )  :  void
LocalFileOutputStream.finalize ( )  :  void
LocalFileOutputStream.LocalFileOutputStream ( LocalFile p1 )
LocalFileOutputStream.LocalFileOutputStream ( String p1 )
LocalFileOutputStream.open ( GeneralFile p1 )  :  void
LocalFileOutputStream.write ( byte[ ] p1 )  :  void
LocalFileOutputStream.write ( byte[ ] p1, int p2, int p3 )  :  void
LocalFileOutputStream.write ( int p1 )  :  void

jargon.jar, LocalFileSystem.class
package edu.sdsc.grid.io.local
LocalFileSystem.equals ( Object p1 )  :  boolean
LocalFileSystem.getRootDirectories ( )  :  String[ ]
LocalFileSystem.LocalFileSystem ( )
LocalFileSystem.LocalFileSystem ( LocalAccount p1 )
LocalFileSystem.query ( MetaDataCondition[ ] p1, MetaDataSelect[ ] p2 )  :  MetaDataRecordList[ ]
LocalFileSystem.query ( MetaDataCondition[ ] p1, MetaDataSelect[ ] p2, int p3 )  :  MetaDataRecordList[ ]
LocalFileSystem.setAccount ( GeneralAccount p1 )  :  void

jargon.jar, LocalMetaDataRecordList.class
package edu.sdsc.grid.io.local
LocalMetaDataRecordList.getAllResults ( )  :  MetaDataRecordList[ ]
LocalMetaDataRecordList.getMoreResults ( )  :  MetaDataRecordList[ ]
LocalMetaDataRecordList.getMoreResults ( int p1 )  :  MetaDataRecordList[ ]
LocalMetaDataRecordList.isQueryComplete ( )  :  boolean
LocalMetaDataRecordList.LocalMetaDataRecordList ( )

jargon.jar, LocalRandomAccessFile.class
package edu.sdsc.grid.io.local
LocalRandomAccessFile.close ( )  :  void
LocalRandomAccessFile.getFilePointer ( )  :  long
LocalRandomAccessFile.getRandomAccessFile ( )  :  RandomAccessFile
LocalRandomAccessFile.length ( )  :  long
LocalRandomAccessFile.LocalRandomAccessFile ( File p1, String p2 )
LocalRandomAccessFile.LocalRandomAccessFile ( LocalFile p1, String p2 )
LocalRandomAccessFile.LocalRandomAccessFile ( String p1, String p2 )
LocalRandomAccessFile.open ( GeneralFile p1 )  :  void
LocalRandomAccessFile.read ( )  :  int
LocalRandomAccessFile.readBytes ( byte[ ] p1, int p2, int p3 )  :  int
LocalRandomAccessFile.seek ( long p1 )  :  void
LocalRandomAccessFile.seek ( long p1, int p2 )  :  void
LocalRandomAccessFile.setLength ( long p1 )  :  void
LocalRandomAccessFile.skipBytes ( int p1 )  :  int
LocalRandomAccessFile.write ( int p1 )  :  void
LocalRandomAccessFile.writeBytes ( byte[ ] p1, int p2, int p3 )  :  void

jargon.jar, MetaDataCondition.class
package edu.sdsc.grid.io
MetaDataCondition.equals ( Object p1 )  :  boolean
MetaDataCondition.finalize ( )  :  void
MetaDataCondition.getCount ( )  :  int
MetaDataCondition.getField ( )  :  MetaDataField
MetaDataCondition.getFieldName ( )  :  String
MetaDataCondition.getFieldType ( )  :  int
MetaDataCondition.getFloatValue ( )  :  float
MetaDataCondition.getFloatValue ( int p1 )  :  float
MetaDataCondition.getIntValue ( )  :  int
MetaDataCondition.getIntValue ( int p1 )  :  int
MetaDataCondition.getOperator ( )  :  int
MetaDataCondition.getOperatorString ( int p1 ) [static]  :  String
MetaDataCondition.getOperatorStrings ( ) [static]  :  String[ ]
MetaDataCondition.getStringValue ( )  :  String
MetaDataCondition.getStringValue ( int p1 )  :  String
MetaDataCondition.getStyle ( )  :  int
MetaDataCondition.getTableValue ( )  :  MetaDataTable
MetaDataCondition.toString ( )  :  String

jargon.jar, MetaDataField.class
package edu.sdsc.grid.io
MetaDataField.addProtocol ( Protocol p1 )  :  void
MetaDataField.compareTo ( Object p1 )  :  int
MetaDataField.equals ( Object p1 )  :  boolean
MetaDataField.getDescription ( )  :  String
MetaDataField.getName ( )  :  String
MetaDataField.getType ( )  :  int
MetaDataField.MetaDataField ( String p1, String p2, int p3, Protocol p4 )
MetaDataField.toString ( )  :  String
MetaDataField.usesProtocol ( Protocol p1 )  :  boolean

jargon.jar, MetaDataGroup.class
package edu.sdsc.grid.io
MetaDataGroup.add ( MetaDataField p1 )  :  void
MetaDataGroup.compareTo ( Object p1 )  :  int
MetaDataGroup.getDescription ( )  :  String
MetaDataGroup.getField ( String p1 )  :  MetaDataField
MetaDataGroup.getFieldCount ( )  :  int
MetaDataGroup.getFields ( )  :  MetaDataField[ ]
MetaDataGroup.getFields ( boolean p1 )  :  MetaDataField[ ]
MetaDataGroup.getName ( )  :  String
MetaDataGroup.MetaDataGroup ( String p1, String p2 )
MetaDataGroup.toString ( )  :  String

jargon.jar, MetaDataRecordList.class
package edu.sdsc.grid.io
MetaDataRecordList.addRecord ( MetaDataField p1, float p2 )  :  void
MetaDataRecordList.addRecord ( MetaDataField p1, int p2 )  :  void
MetaDataRecordList.addRecord ( MetaDataField p1, MetaDataTable p2 )  :  void
MetaDataRecordList.addRecord ( MetaDataField p1, Object p2 )  :  boolean
MetaDataRecordList.addRecord ( MetaDataField p1, String p2 )  :  void
MetaDataRecordList.finalize ( )  :  void
MetaDataRecordList.getAllResults ( MetaDataRecordList[ ] p1 ) [static]  :  MetaDataRecordList[ ]
MetaDataRecordList.getField ( int p1 )  :  MetaDataField
MetaDataRecordList.getFieldCount ( )  :  int
MetaDataRecordList.getFieldIndex ( String p1 )  :  int
MetaDataRecordList.getFieldName ( int p1 )  :  String
MetaDataRecordList.getFields ( )  :  MetaDataField[ ]
MetaDataRecordList.getFieldType ( int p1 )  :  int
MetaDataRecordList.getFloatValue ( int p1 )  :  float
MetaDataRecordList.getIntValue ( int p1 )  :  int
MetaDataRecordList.getMoreResults ( ) [abstract]  :  MetaDataRecordList[ ]
MetaDataRecordList.getMoreResults ( int p1 ) [abstract]  :  MetaDataRecordList[ ]
MetaDataRecordList.getRecordCount ( )  :  int
MetaDataRecordList.getStringValue ( int p1 )  :  String
MetaDataRecordList.getTableValue ( int p1 )  :  MetaDataTable
MetaDataRecordList.getValue ( int p1 )  :  Object
MetaDataRecordList.getValue ( MetaDataField p1 )  :  Object
MetaDataRecordList.getValue ( String p1 )  :  Object
MetaDataRecordList.isQueryComplete ( ) [abstract]  :  boolean
MetaDataRecordList.MetaDataRecordList ( MetaDataField p1, float p2 )
MetaDataRecordList.MetaDataRecordList ( MetaDataField p1, int p2 )
MetaDataRecordList.MetaDataRecordList ( MetaDataField p1, MetaDataTable p2 )
MetaDataRecordList.MetaDataRecordList ( MetaDataField p1, String p2 )
MetaDataRecordList.MetaDataRecordList ( MetaDataField[ ] p1, Object[ ] p2 )
MetaDataRecordList.removeRecord ( int p1 )  :  void
MetaDataRecordList.removeRecord ( MetaDataField p1 )  :  void
MetaDataRecordList.setValue ( int p1, float p2 )  :  void
MetaDataRecordList.setValue ( int p1, int p2 )  :  void
MetaDataRecordList.setValue ( int p1, MetaDataTable p2 )  :  void
MetaDataRecordList.setValue ( int p1, String p2 )  :  void
MetaDataRecordList.setValue ( MetaDataField p1, float p2 )  :  boolean
MetaDataRecordList.setValue ( MetaDataField p1, int p2 )  :  boolean
MetaDataRecordList.setValue ( MetaDataField p1, MetaDataTable p2 )  :  boolean
MetaDataRecordList.setValue ( MetaDataField p1, String p2 )  :  boolean
MetaDataRecordList.toString ( )  :  String

jargon.jar, MetaDataSelect.class
package edu.sdsc.grid.io
MetaDataSelect.equals ( Object p1 )  :  boolean
MetaDataSelect.getField ( )  :  MetaDataField
MetaDataSelect.getFieldName ( )  :  String
MetaDataSelect.getOperation ( )  :  int
MetaDataSelect.toString ( )  :  String

jargon.jar, MetaDataSet.class
package edu.sdsc.grid.io
MetaDataSet.add ( MetaDataGroup p1 ) [static]  :  void
MetaDataSet.getField ( String p1 ) [static]  :  MetaDataField
MetaDataSet.getMetaDataGroups ( ) [static]  :  MetaDataGroup[ ]
MetaDataSet.getMetaDataGroups ( boolean p1 ) [static]  :  MetaDataGroup[ ]
MetaDataSet.mergeConditions ( MetaDataCondition p1, MetaDataCondition p2 ) [static]  :  MetaDataCondition[ ]
MetaDataSet.mergeConditions ( MetaDataCondition p1, MetaDataCondition[ ] p2 ) [static]  :  MetaDataCondition[ ]
MetaDataSet.mergeConditions ( MetaDataCondition[ ] p1, MetaDataCondition[ ] p2 ) [static]  :  MetaDataCondition[ ]
MetaDataSet.mergeSelects ( MetaDataSelect p1, MetaDataSelect p2 ) [static]  :  MetaDataSelect[ ]
MetaDataSet.mergeSelects ( MetaDataSelect p1, MetaDataSelect[ ] p2 ) [static]  :  MetaDataSelect[ ]
MetaDataSet.mergeSelects ( MetaDataSelect[ ] p1, MetaDataSelect[ ] p2 ) [static]  :  MetaDataSelect[ ]
MetaDataSet.MetaDataSet ( )
MetaDataSet.newCondition ( String p1, int p2, float p3 ) [static]  :  MetaDataCondition
MetaDataSet.newCondition ( String p1, int p2, float p3, float p4 ) [static]  :  MetaDataCondition
MetaDataSet.newCondition ( String p1, int p2, float[ ] p3 ) [static]  :  MetaDataCondition
MetaDataSet.newCondition ( String p1, int p2, int p3 ) [static]  :  MetaDataCondition
MetaDataSet.newCondition ( String p1, int p2, int p3, int p4 ) [static]  :  MetaDataCondition
MetaDataSet.newCondition ( String p1, int p2, int[ ] p3 ) [static]  :  MetaDataCondition
MetaDataSet.newCondition ( String p1, int p2, String p3 ) [static]  :  MetaDataCondition
MetaDataSet.newCondition ( String p1, int p2, String p3, String p4 ) [static]  :  MetaDataCondition
MetaDataSet.newCondition ( String p1, int p2, String[ ] p3 ) [static]  :  MetaDataCondition
MetaDataSet.newCondition ( String p1, MetaDataTable p2 ) [static]  :  MetaDataCondition
MetaDataSet.newSelection ( MetaDataGroup p1 ) [static]  :  MetaDataSelect[ ]
MetaDataSet.newSelection ( String p1 ) [static]  :  MetaDataSelect
MetaDataSet.newSelection ( String p1, int p2 ) [static]  :  MetaDataSelect
MetaDataSet.newSelection ( String[ ] p1 ) [static]  :  MetaDataSelect[ ]

jargon.jar, MetaDataTable.class
package edu.sdsc.grid.io
MetaDataTable.addRow ( String[ ] p1, int p2 )  :  void
MetaDataTable.equals ( Object p1 )  :  boolean
MetaDataTable.getColumnCount ( )  :  int
MetaDataTable.getFloatValue ( int p1, int p2 )  :  float
MetaDataTable.getIntValue ( int p1, int p2 )  :  int
MetaDataTable.getOperator ( int p1 )  :  int
MetaDataTable.getOperators ( )  :  int[ ]
MetaDataTable.getRowCount ( )  :  int
MetaDataTable.getStringValue ( int p1, int p2 )  :  String
MetaDataTable.MetaDataTable ( int[ ] p1, String[ ][ ] p2 )
MetaDataTable.removeRow ( int p1 )  :  void
MetaDataTable.toString ( )  :  String

jargon.jar, MetaDataTest.class
MetaDataTest.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
MetaDataTest.MetaDataTest ( )
MetaDataTest.MetaDataTest ( GeneralFile p1 )
MetaDataTest.MetaDataTest ( String[ ] p1 )
MetaDataTest.printQueryResults ( MetaDataRecordList[ ] p1 ) [static]  :  void

jargon.jar, MetaDataValueEnum.class
package edu.sdsc.grid.io
MetaDataValueEnum.getDescription ( )  :  String
MetaDataValueEnum.getValue ( )  :  String

jargon.jar, Protocol.class
package edu.sdsc.grid.io
Protocol.equals ( Object p1 ) [abstract]  :  boolean
Protocol.getHelp ( )  :  String
Protocol.getMetaDataSet ( )  :  MetaDataSet
Protocol.getName ( )  :  String
Protocol.Protocol ( String p1, String p2 )
Protocol.toString ( )  :  String

jargon.jar, RemoteAccount.class
package edu.sdsc.grid.io
RemoteAccount.finalize ( )  :  void
RemoteAccount.getHost ( )  :  String
RemoteAccount.getPassword ( )  :  String
RemoteAccount.getPort ( )  :  int
RemoteAccount.getUserName ( )  :  String
RemoteAccount.RemoteAccount ( String p1, int p2, String p3, String p4, String p5 )
RemoteAccount.setHost ( String p1 )  :  void
RemoteAccount.setPassword ( String p1 )  :  void
RemoteAccount.setPort ( int p1 )  :  void
RemoteAccount.setUserName ( String p1 )  :  void

jargon.jar, RemoteFile.class
package edu.sdsc.grid.io
RemoteFile.RemoteFile ( RemoteFile p1, String p2 )
RemoteFile.RemoteFile ( RemoteFileSystem p1, String p2 )
RemoteFile.RemoteFile ( RemoteFileSystem p1, String p2, String p3 )
RemoteFile.RemoteFile ( URI p1 )

jargon.jar, RemoteFileInputStream.class
package edu.sdsc.grid.io
RemoteFileInputStream.RemoteFileInputStream ( GeneralFile p1 )
RemoteFileInputStream.RemoteFileInputStream ( GeneralFileSystem p1, String p2 )

jargon.jar, RemoteFileOutputStream.class
package edu.sdsc.grid.io
RemoteFileOutputStream.RemoteFileOutputStream ( GeneralFile p1 )
RemoteFileOutputStream.RemoteFileOutputStream ( GeneralFileSystem p1, String p2 )

jargon.jar, RemoteFileSystem.class
package edu.sdsc.grid.io
RemoteFileSystem.getHost ( )  :  String
RemoteFileSystem.getPort ( )  :  int
RemoteFileSystem.getUserName ( )  :  String
RemoteFileSystem.RemoteFileSystem ( )

jargon.jar, RemoteRandomAccessFile.class
package edu.sdsc.grid.io
RemoteRandomAccessFile.RemoteRandomAccessFile ( RemoteFile p1, String p2 )

jargon.jar, Sls.class
Sls.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Sls.Sls ( )

jargon.jar, SRBAccount.class
package edu.sdsc.grid.io.srb
SRBAccount.equals ( Object p1 )  :  boolean
SRBAccount.finalize ( )  :  void
SRBAccount.getCertificateAuthority ( )  :  String
SRBAccount.getDefaultStorageResource ( )  :  String
SRBAccount.getDomainName ( )  :  String
SRBAccount.getExecFile ( )  :  String
SRBAccount.getMcatZone ( )  :  String
SRBAccount.getOptions ( )  :  int
SRBAccount.getProxyDomainName ( )  :  String
SRBAccount.getProxyMcatZone ( )  :  String
SRBAccount.getProxyUserName ( )  :  String
SRBAccount.getVersion ( ) [static]  :  String
SRBAccount.setCertificateAuthority ( String p1 )  :  void
SRBAccount.setDefaultStorageResource ( String p1 )  :  void
SRBAccount.setDomainName ( String p1 )  :  void
SRBAccount.setExecFile ( String p1 )  :  void
SRBAccount.setHomeDirectory ( String p1 )  :  void
SRBAccount.setMcatZone ( String p1 )  :  void
SRBAccount.setOptions ( int p1 )  :  void
SRBAccount.setProxyDomainName ( String p1 )  :  void
SRBAccount.setProxyMcatZone ( String p1 )  :  void
SRBAccount.setProxyUserName ( String p1 )  :  void
SRBAccount.setUserInfo ( LocalFile p1 )  :  void
SRBAccount.setVersion ( String p1 ) [static]  :  void
SRBAccount.SRBAccount ( )
SRBAccount.SRBAccount ( File p1 )
SRBAccount.SRBAccount ( LocalFile p1 )
SRBAccount.SRBAccount ( String p1 )
SRBAccount.SRBAccount ( String p1, int p2, String p3, String p4, String p5, String p6, String p7 )
SRBAccount.SRBAccount ( String p1, int p2, String p3, String p4, String p5, String p6, String p7, String p8 )

jargon.jar, SRBContainer.class
package edu.sdsc.grid.io.srb
SRBContainer.canRead ( )  :  boolean
SRBContainer.canWrite ( )  :  boolean
SRBContainer.compareTo ( GeneralFile p1 )  :  int
SRBContainer.compareTo ( Object p1 )  :  int
SRBContainer.copyFrom ( GeneralFile p1, boolean p2, boolean p3 )  :  void
SRBContainer.copyFromLocal ( LocalFile p1 )  :  void *DEPRECATED*
SRBContainer.copyFromLocal ( String p1 )  :  void *DEPRECATED*
SRBContainer.copyTo ( GeneralFile p1, boolean p2, boolean p3 )  :  void
SRBContainer.copyToLocal ( LocalFile p1 )  :  void *DEPRECATED*
SRBContainer.copyToLocal ( String p1 )  :  void *DEPRECATED*
SRBContainer.copyToRemote ( RemoteFile p1 )  :  void *DEPRECATED*
SRBContainer.createNewFile ( )  :  boolean
SRBContainer.createTempFile ( String p1, String p2 ) [static]  :  GeneralFile
SRBContainer.createTempFile ( String p1, String p2, GeneralFile p3 ) [static]  :  GeneralFile
SRBContainer.delete ( )  :  boolean
SRBContainer.delete ( boolean p1 )  :  boolean
SRBContainer.equals ( Object p1 )  :  boolean
SRBContainer.exists ( )  :  boolean
SRBContainer.getAbsoluteFile ( )  :  GeneralFile
SRBContainer.getCanonicalFile ( )  :  GeneralFile
SRBContainer.getContainerMaxSize ( )  :  long
SRBContainer.getDataType ( )  :  String
SRBContainer.getParentFile ( )  :  GeneralFile
SRBContainer.getPermissions ( )  :  String
SRBContainer.getPermissions ( boolean p1 )  :  MetaDataRecordList[ ]
SRBContainer.getResource ( )  :  String
SRBContainer.include ( GeneralFile p1 )  :  void
SRBContainer.isContainer ( )  :  boolean
SRBContainer.isDirectory ( )  :  boolean
SRBContainer.isFile ( )  :  boolean
SRBContainer.isHidden ( )  :  boolean
SRBContainer.lastModified ( )  :  long
SRBContainer.length ( )  :  long
SRBContainer.list ( )  :  String[ ]
SRBContainer.mkdir ( )  :  boolean
SRBContainer.query ( MetaDataSelect[ ] p1 )  :  MetaDataRecordList[ ]
SRBContainer.query ( MetaDataSelect[ ] p1, int p2 )  :  MetaDataRecordList[ ]
SRBContainer.renameTo ( GeneralFile p1 )  :  boolean
SRBContainer.replicate ( String p1 )  :  void
SRBContainer.setContainerMaxSize ( long p1 )  :  void
SRBContainer.SRBContainer ( SRBFile p1, String p2 )
SRBContainer.SRBContainer ( SRBFile p1, String p2, long p3 )
SRBContainer.SRBContainer ( SRBFileSystem p1, String p2 )
SRBContainer.SRBContainer ( SRBFileSystem p1, String p2, long p3 )
SRBContainer.SRBContainer ( SRBFileSystem p1, String p2, String p3 )
SRBContainer.SRBContainer ( SRBFileSystem p1, String p2, String p3, long p4 )
SRBContainer.SRBContainer ( URI p1 )

jargon.jar, SRBException.class
package edu.sdsc.grid.io.srb
SRBException.getStandardMessage ( )  :  String
SRBException.getStandardMessage ( int p1 ) [static]  :  String
SRBException.getType ( )  :  int
SRBException.SRBException ( int p1 )
SRBException.SRBException ( String p1 )
SRBException.SRBException ( String p1, int p2 )

jargon.jar, SRBFile.class
package edu.sdsc.grid.io.srb
SRBFile.backup ( String p1 )  :  void
SRBFile.canRead ( )  :  boolean
SRBFile.canWrite ( )  :  boolean
SRBFile.changePermissions ( String p1, String p2, String p3 )  :  void
SRBFile.checksum ( )  :  String
SRBFile.checksum ( boolean p1 )  :  String
SRBFile.compareTo ( GeneralFile p1 )  :  int
SRBFile.compareTo ( Object p1 )  :  int
SRBFile.copyFrom ( GeneralFile p1 )  :  void
SRBFile.copyFrom ( GeneralFile p1, boolean p2 )  :  void
SRBFile.copyFrom ( GeneralFile p1, boolean p2, boolean p3 )  :  void
SRBFile.copyFromLocal ( LocalFile p1 )  :  void *DEPRECATED*
SRBFile.copyFromLocal ( String p1 )  :  void *DEPRECATED*
SRBFile.copyTo ( GeneralFile p1 )  :  void
SRBFile.copyTo ( GeneralFile p1, boolean p2 )  :  void
SRBFile.copyTo ( GeneralFile p1, boolean p2, boolean p3 )  :  void
SRBFile.copyToLocal ( LocalFile p1 )  :  void *DEPRECATED*
SRBFile.copyToLocal ( String p1 )  :  void *DEPRECATED*
SRBFile.copyToRemote ( RemoteFile p1 )  :  void *DEPRECATED*
SRBFile.createNewFile ( )  :  boolean
SRBFile.createTempFile ( String p1, String p2 ) [static]  :  GeneralFile
SRBFile.createTempFile ( String p1, String p2, GeneralFile p3 ) [static]  :  GeneralFile
SRBFile.delete ( )  :  boolean
SRBFile.delete ( boolean p1 )  :  boolean
SRBFile.deleteOnExit ( )  :  void
SRBFile.equals ( Object p1 )  :  boolean
SRBFile.executeProxyCommand ( String p1, String p2 )  :  InputStream
SRBFile.exists ( )  :  boolean
SRBFile.fileCopyStatus ( )  :  long
SRBFile.finalize ( )  :  void
SRBFile.getAbsoluteFile ( )  :  GeneralFile
SRBFile.getAbsolutePath ( )  :  String
SRBFile.getCanonicalFile ( )  :  GeneralFile
SRBFile.getCanonicalPath ( )  :  String
SRBFile.getCatalogType ( )  :  int
SRBFile.getDataType ( )  :  String
SRBFile.getFileSystem ( )  :  GeneralFileSystem
SRBFile.getName ( )  :  String
SRBFile.getParent ( )  :  String
SRBFile.getParentFile ( )  :  GeneralFile
SRBFile.getPath ( )  :  String
SRBFile.getPathSeparator ( )  :  String
SRBFile.getPathSeparatorChar ( )  :  char
SRBFile.getPermissions ( )  :  String
SRBFile.getPermissions ( boolean p1 )  :  MetaDataRecordList[ ]
SRBFile.getReplicaNumber ( )  :  int
SRBFile.getResource ( )  :  String
SRBFile.getStat ( )  :  long[ ]
SRBFile.hashCode ( )  :  int
SRBFile.isAbsolute ( )  :  boolean
SRBFile.isDirectory ( )  :  boolean
SRBFile.isFile ( )  :  boolean
SRBFile.isHidden ( )  :  boolean
SRBFile.lastModified ( )  :  long
SRBFile.length ( )  :  long
SRBFile.link ( SRBFile p1 )  :  void
SRBFile.list ( )  :  String[ ]
SRBFile.list ( MetaDataCondition[ ] p1 )  :  String[ ]
SRBFile.listRoots ( ) [static]  :  GeneralFile[ ]
SRBFile.mkdir ( )  :  boolean
SRBFile.mkdirs ( )  :  boolean
SRBFile.modifyMetaData ( MetaDataRecordList p1 )  :  void
SRBFile.query ( MetaDataCondition[ ] p1, MetaDataSelect[ ] p2 )  :  MetaDataRecordList[ ]
SRBFile.query ( MetaDataCondition[ ] p1, MetaDataSelect[ ] p2, int p3 )  :  MetaDataRecordList[ ]
SRBFile.query ( MetaDataSelect p1 )  :  MetaDataRecordList[ ]
SRBFile.query ( MetaDataSelect[ ] p1 )  :  MetaDataRecordList[ ]
SRBFile.query ( MetaDataSelect[ ] p1, int p2 )  :  MetaDataRecordList[ ]
SRBFile.query ( String p1 )  :  MetaDataRecordList[ ]
SRBFile.query ( String[ ] p1 )  :  MetaDataRecordList[ ]
SRBFile.register ( String p1, long p2 )  :  void
SRBFile.renameTo ( GeneralFile p1 )  :  boolean
SRBFile.replicate ( String p1 )  :  void
SRBFile.setDataType ( String p1 )  :  void
SRBFile.setDirectory ( String p1 )  :  void
SRBFile.setFileName ( String p1 )  :  void
SRBFile.setFileSystem ( GeneralFileSystem p1 )  :  void
SRBFile.setLastModified ( long p1 )  :  boolean
SRBFile.setReadOnly ( )  :  boolean
SRBFile.setReplicaNumber ( int p1 )  :  void
SRBFile.setResource ( String p1 )  :  void
SRBFile.SRBFile ( SRBFile p1, String p2 )
SRBFile.SRBFile ( SRBFileSystem p1, String p2 )
SRBFile.SRBFile ( SRBFileSystem p1, String p2, String p3 )
SRBFile.SRBFile ( URI p1 )
SRBFile.toString ( )  :  String
SRBFile.toURI ( )  :  URI
SRBFile.toURL ( )  :  URL

jargon.jar, SRBFileInputStream.class
package edu.sdsc.grid.io.srb
SRBFileInputStream.available ( )  :  int
SRBFileInputStream.close ( )  :  void
SRBFileInputStream.open ( GeneralFile p1 )  :  void
SRBFileInputStream.read ( )  :  int
SRBFileInputStream.read ( byte[ ] p1, int p2, int p3 )  :  int
SRBFileInputStream.skip ( long p1 )  :  long
SRBFileInputStream.SRBFileInputStream ( SRBFile p1 )
SRBFileInputStream.SRBFileInputStream ( SRBFileSystem p1, String p2 )

jargon.jar, SRBFileOutputStream.class
package edu.sdsc.grid.io.srb
SRBFileOutputStream.close ( )  :  void
SRBFileOutputStream.open ( GeneralFile p1 )  :  void
SRBFileOutputStream.SRBFileOutputStream ( SRBFile p1 )
SRBFileOutputStream.SRBFileOutputStream ( SRBFileSystem p1, String p2 )
SRBFileOutputStream.write ( byte[ ] p1, int p2, int p3 )  :  void

jargon.jar, SRBFileSystem.class
package edu.sdsc.grid.io.srb
SRBFileSystem.close ( )  :  void
SRBFileSystem.equals ( Object p1 )  :  boolean
SRBFileSystem.executeProxyCommand ( String p1, String p2 )  :  InputStream
SRBFileSystem.executeProxyCommand ( String p1, String p2, String p3, int p4 )  :  InputStream
SRBFileSystem.executeProxyCommand ( String p1, String p2, String p3, String p4, int p5 )  :  InputStream
SRBFileSystem.finalize ( )  :  void
SRBFileSystem.getAccount ( )  :  GeneralAccount
SRBFileSystem.getDefaultStorageResource ( )  :  String
SRBFileSystem.getDomainName ( )  :  String
SRBFileSystem.getExecFile ( )  :  String
SRBFileSystem.getMcatZone ( )  :  String
SRBFileSystem.getOptions ( )  :  int
SRBFileSystem.getPassword ( )  :  String
SRBFileSystem.getProxyDomainName ( )  :  String
SRBFileSystem.getProxyMcatZone ( )  :  String
SRBFileSystem.getProxyUserName ( )  :  String
SRBFileSystem.getQueryRecordsWanted ( )  :  int
SRBFileSystem.getRootDirectories ( )  :  String[ ]
SRBFileSystem.getVersion ( )  :  String
SRBFileSystem.isConnected ( )  :  boolean
SRBFileSystem.query ( MetaDataCondition[ ] p1, MetaDataSelect[ ] p2 )  :  MetaDataRecordList[ ]
SRBFileSystem.query ( MetaDataCondition[ ] p1, MetaDataSelect[ ] p2, int p3 )  :  MetaDataRecordList[ ]
SRBFileSystem.query ( MetaDataCondition[ ] p1, MetaDataSelect[ ] p2, int p3, boolean p4 )  :  MetaDataRecordList[ ]
SRBFileSystem.query ( MetaDataCondition[ ] p1, MetaDataSelect[ ] p2, int p3, boolean p4, boolean p5 )  :  MetaDataRecordList[ ]
SRBFileSystem.query ( MetaDataSelect p1 )  :  MetaDataRecordList[ ]
SRBFileSystem.query ( MetaDataSelect[ ] p1 )  :  MetaDataRecordList[ ]
SRBFileSystem.query ( MetaDataSelect[ ] p1, int p2 )  :  MetaDataRecordList[ ]
SRBFileSystem.query ( String p1 )  :  MetaDataRecordList[ ]
SRBFileSystem.query ( String[ ] p1 )  :  MetaDataRecordList[ ]
SRBFileSystem.setAccount ( GeneralAccount p1 )  :  void
SRBFileSystem.setFirewallPorts ( int p1, int p2 )  :  void
SRBFileSystem.setQueryRecordsWanted ( int p1 )  :  void
SRBFileSystem.srbDeleteValue ( int p1, String p2 )  :  void
SRBFileSystem.SRBFileSystem ( )
SRBFileSystem.SRBFileSystem ( SRBAccount p1 )
SRBFileSystem.srbIngestToken ( String p1, String p2, String p3 )  :  void
SRBFileSystem.srbModifyRescInfo ( int p1, String p2, int p3, String p4, String p5, String p6, String p7 )  :  void
SRBFileSystem.srbModifyUser ( int p1, String p2, String p3, int p4 )  :  void
SRBFileSystem.srbModifyZone ( int p1, String p2, String p3, String p4, String p5, String p6, String p7, int p8 )  :  void
SRBFileSystem.srbRegisterLocation ( String p1, String p2, String p3, String p4, String p5 )  :  void
SRBFileSystem.srbRegisterLogicalResource ( String p1, String p2, String p3, String p4 )  :  void
SRBFileSystem.srbRegisterReplicateResourceInfo ( String p1, String p2, String p3, String p4 )  :  void
SRBFileSystem.srbRegisterResource ( String p1, String p2, String p3, String p4, String p5, int p6 )  :  void
SRBFileSystem.srbRegisterUser ( int p1, String p2, String p3, String p4, String p5, String p6, String p7, String p8 )  :  void
SRBFileSystem.srbRegisterUserGrp ( int p1, String p2, String p3, String p4, String p5, String p6, String p7 )  :  void
SRBFileSystem.toString ( )  :  String

jargon.jar, SRBMetaDataRecordList.class
package edu.sdsc.grid.io.srb
SRBMetaDataRecordList.finalize ( )  :  void
SRBMetaDataRecordList.getMoreResults ( )  :  MetaDataRecordList[ ]
SRBMetaDataRecordList.getMoreResults ( int p1 )  :  MetaDataRecordList[ ]
SRBMetaDataRecordList.isQueryComplete ( )  :  boolean
SRBMetaDataRecordList.SRBMetaDataRecordList ( MetaDataField p1, float p2 )
SRBMetaDataRecordList.SRBMetaDataRecordList ( MetaDataField p1, int p2 )
SRBMetaDataRecordList.SRBMetaDataRecordList ( MetaDataField p1, MetaDataTable p2 )
SRBMetaDataRecordList.SRBMetaDataRecordList ( MetaDataField p1, String p2 )

jargon.jar, SRBProtocol.class
package edu.sdsc.grid.io.srb
SRBProtocol.equals ( Object p1 )  :  boolean
SRBProtocol.SRBProtocol ( )

jargon.jar, SRBRandomAccessFile.class
package edu.sdsc.grid.io.srb
SRBRandomAccessFile.close ( )  :  void
SRBRandomAccessFile.getFilePointer ( )  :  long
SRBRandomAccessFile.getFileSystem ( )  :  GeneralFileSystem
SRBRandomAccessFile.length ( )  :  long
SRBRandomAccessFile.open ( GeneralFile p1 )  :  void
SRBRandomAccessFile.read ( )  :  int
SRBRandomAccessFile.readBytes ( byte[ ] p1, int p2, int p3 )  :  int
SRBRandomAccessFile.rwCheck ( GeneralFile p1, String p2 )  :  void
SRBRandomAccessFile.seek ( long p1 )  :  void
SRBRandomAccessFile.seek ( long p1, int p2 )  :  void
SRBRandomAccessFile.setFileSystem ( GeneralFileSystem p1 )  :  void
SRBRandomAccessFile.setLength ( long p1 )  :  void
SRBRandomAccessFile.SRBRandomAccessFile ( SRBFile p1, String p2 )
SRBRandomAccessFile.SRBRandomAccessFile ( SRBFileSystem p1, String p2, String p3 )
SRBRandomAccessFile.toString ( )  :  String
SRBRandomAccessFile.writeBytes ( byte[ ] p1, int p2, int p3 )  :  void

jargon.jar, Srm.class
Srm.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Srm.recursiveDelete ( GeneralFile p1 ) [static]  :  boolean
Srm.Srm ( )

jargon.jar, Test.class
Test.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
Test.Test ( )

jargon.jar, TransferStatusPanel.class
package edu.sdsc.grid.gui
TransferStatusPanel.getDestinations ( )  :  GeneralFile[ ]
TransferStatusPanel.getOverwrite ( )  :  int
TransferStatusPanel.getSleepLength ( )  :  int
TransferStatusPanel.getSources ( )  :  GeneralFile[ ]
TransferStatusPanel.main ( String[ ] p1 ) [static]  :  void
TransferStatusPanel.run ( )  :  void
TransferStatusPanel.setOverwrite ( int p1 )  :  void
TransferStatusPanel.setSleepLength ( int p1 )  :  void
TransferStatusPanel.start ( )  :  void
TransferStatusPanel.TransferStatusPanel ( GeneralFile p1 )
TransferStatusPanel.TransferStatusPanel ( GeneralFile p1, GeneralFile p2 )
TransferStatusPanel.TransferStatusPanel ( GeneralFile[ ] p1 )
TransferStatusPanel.TransferStatusPanel ( GeneralFile[ ] p1, GeneralFile[ ] p2 )

jh5srb.jar, H5SRB.class
package ncsa.hdf.srb.h5srb
H5SRB.h5ObjRequest ( String[ ] p1, Object p2, int p3 ) [static]  :  int
H5SRB.H5SRB ( )

jh5srb.jar, H5SrbCompoundDS.class
package ncsa.hdf.srb.obj
H5SrbCompoundDS.close ( int p1 )  :  void
H5SrbCompoundDS.copy ( Group p1, String p2, long[ ] p3, Object p4 )  :  Dataset
H5SrbCompoundDS.getDatatype ( )  :  Datatype
H5SrbCompoundDS.getMetadata ( )  :  List
H5SrbCompoundDS.getPalette ( )  :  byte[ ][ ]
H5SrbCompoundDS.getPaletteRefs ( )  :  byte[ ]
H5SrbCompoundDS.H5SrbCompoundDS ( FileFormat p1, String p2, String p3 )
H5SrbCompoundDS.H5SrbCompoundDS ( FileFormat p1, String p2, String p3, long[ ] p4 )
H5SrbCompoundDS.init ( )  :  void
H5SrbCompoundDS.init ( int p1, long[ ] p2, int p3, int p4, int p5, int p6 )  :  void
H5SrbCompoundDS.open ( )  :  int
H5SrbCompoundDS.read ( )  :  Object
H5SrbCompoundDS.readBytes ( )  :  byte[ ]
H5SrbCompoundDS.readPalette ( int p1 )  :  byte[ ][ ]
H5SrbCompoundDS.removeMetadata ( Object p1 )  :  void
H5SrbCompoundDS.setMemberCount ( int p1 )  :  void
H5SrbCompoundDS.write ( Object p1 )  :  void
H5SrbCompoundDS.writeMetadata ( Object p1 )  :  void

jh5srb.jar, H5SrbDatatype.class
package ncsa.hdf.srb.obj
H5SrbDatatype.fromNative ( int p1 )  :  void
H5SrbDatatype.getDatatypeDescription ( )  :  String
H5SrbDatatype.H5SrbDatatype ( int p1 )
H5SrbDatatype.H5SrbDatatype ( int p1, int p2, int p3, int p4 )
H5SrbDatatype.isUnsigned ( )  :  boolean
H5SrbDatatype.toNative ( )  :  int

jh5srb.jar, H5SrbFile.class
package ncsa.hdf.srb.obj
H5SrbFile.close ( )  :  void
H5SrbFile.copy ( HObject p1, Group p2 )  :  TreeNode
H5SrbFile.create ( String p1 )  :  FileFormat
H5SrbFile.createCompoundDS ( String p1, Group p2, long[ ] p3, String[ ] p4, Datatype[ ] p5, int[ ] p6, Object p7 )  :  Dataset
H5SrbFile.createDatatype ( int p1, int p2, int p3, int p4 )  :  Datatype
H5SrbFile.createGroup ( String p1, Group p2 )  :  Group
H5SrbFile.createImage ( String p1, Group p2, Datatype p3, long[ ] p4, long[ ] p5, long[ ] p6, int p7, int p8, int p9, Object p10 )  :  Dataset
H5SrbFile.createScalarDS ( String p1, Group p2, Datatype p3, long[ ] p4, long[ ] p5, long[ ] p6, int p7, Object p8 )  :  Dataset
H5SrbFile.delete ( HObject p1 )  :  void
H5SrbFile.getFilePath ( )  :  String
H5SrbFile.getLibversion ( )  :  String
H5SrbFile.getRootNode ( )  :  TreeNode
H5SrbFile.getSrbInfo ( )  :  String[ ]
H5SrbFile.H5SrbFile ( )
H5SrbFile.H5SrbFile ( String p1 )
H5SrbFile.H5SrbFile ( String[ ] p1, String p2 )
H5SrbFile.isReadOnly ( )  :  boolean
H5SrbFile.isThisType ( FileFormat p1 )  :  boolean
H5SrbFile.isThisType ( String p1 )  :  boolean
H5SrbFile.open ( )  :  int
H5SrbFile.open ( String p1, int p2 )  :  FileFormat
H5SrbFile.writeAttribute ( HObject p1, Attribute p2, boolean p3 )  :  void

jh5srb.jar, H5SrbGroup.class
package ncsa.hdf.srb.obj
H5SrbGroup.close ( int p1 )  :  void
H5SrbGroup.getMetadata ( )  :  List
H5SrbGroup.H5SrbGroup ( FileFormat p1, String p2, String p3, Group p4 )
H5SrbGroup.H5SrbGroup ( FileFormat p1, String p2, String p3, Group p4, long[ ] p5 )
H5SrbGroup.init ( )  :  void
H5SrbGroup.open ( )  :  int
H5SrbGroup.removeMetadata ( Object p1 )  :  void
H5SrbGroup.writeMetadata ( Object p1 )  :  void

jh5srb.jar, H5SrbScalarDS.class
package ncsa.hdf.srb.obj
H5SrbScalarDS.close ( int p1 )  :  void
H5SrbScalarDS.copy ( Group p1, String p2, long[ ] p3, Object p4 )  :  Dataset
H5SrbScalarDS.getDatatype ( )  :  Datatype
H5SrbScalarDS.getMetadata ( )  :  List
H5SrbScalarDS.getPalette ( )  :  byte[ ][ ]
H5SrbScalarDS.getPaletteRefs ( )  :  byte[ ]
H5SrbScalarDS.H5SrbScalarDS ( FileFormat p1, String p2, String p3 )
H5SrbScalarDS.H5SrbScalarDS ( FileFormat p1, String p2, String p3, long[ ] p4 )
H5SrbScalarDS.init ( )  :  void
H5SrbScalarDS.init ( int p1, long[ ] p2, int p3, int p4, int p5, int p6 )  :  void
H5SrbScalarDS.open ( )  :  int
H5SrbScalarDS.read ( )  :  Object
H5SrbScalarDS.readBytes ( )  :  byte[ ]
H5SrbScalarDS.readPalette ( int p1 )  :  byte[ ][ ]
H5SrbScalarDS.removeMetadata ( Object p1 )  :  void
H5SrbScalarDS.setPalette ( byte[ ] p1 )  :  void
H5SrbScalarDS.write ( Object p1 )  :  void
H5SrbScalarDS.writeMetadata ( Object p1 )  :  void

jhdf.jar, FilePathname.class
package glguerin.io
FilePathname.FilePathname ( )
FilePathname.FilePathname ( File p1 )
FilePathname.FilePathname ( String p1 )
FilePathname.getPath ( )  :  String
FilePathname.setFrom ( File p1 )  :  void
FilePathname.setPath ( String p1 )  :  void

jhdf.jar, MacEscaping.class
package glguerin.mac.io
MacEscaping.containsMacEscapees ( String p1 ) [static]  :  boolean
MacEscaping.fromMacRoman ( int p1 ) [static]  :  char
MacEscaping.getOSTypeString ( int p1 ) [static]  :  String
MacEscaping.MacEscaping ( )
MacEscaping.platformUsesEscapes ( ) [static]  :  boolean
MacEscaping.toEscapedName ( String p1 ) [static]  :  String
MacEscaping.toLiteralName ( String p1 ) [static]  :  String

jhdf.jar, MacFilePathname.class
package glguerin.mac.io
MacFilePathname.append ( String p1 )  :  void
MacFilePathname.appendFrom ( MacFilePathname p1 )  :  void
MacFilePathname.appendMacPath ( String p1 )  :  void
MacFilePathname.getEscaping ( )  :  boolean
MacFilePathname.getLast ( )  :  String
MacFilePathname.getMacPath ( )  :  String
MacFilePathname.getPart ( int p1 )  :  String
MacFilePathname.getParts ( )  :  String[ ]
MacFilePathname.getPath ( )  :  String
MacFilePathname.MacFilePathname ( )
MacFilePathname.MacFilePathname ( File p1 )
MacFilePathname.MacFilePathname ( MacFilePathname p1 )
MacFilePathname.setEscaping ( boolean p1 )  :  boolean
MacFilePathname.setFrom ( MacFilePathname p1 )  :  void
MacFilePathname.toEscapedForm ( String p1 )  :  String
MacFilePathname.toLiteralForm ( String p1 )  :  String

jhdf.jar, MacPlatform.class
package glguerin.util
MacPlatform.getJDirectVersion ( ) [static]  :  int
MacPlatform.isMacOS ( ) [static]  :  boolean
MacPlatform.isMRJ ( ) [static]  :  boolean
MacPlatform.MacPlatform ( )

jhdf.jar, Native.class
package ncsa.hdf.hdflib
Native.javaFilePath ( String p1 ) [static]  :  String
Native.nativeFilePath ( File p1 ) [static]  :  String
Native.nativeFilePath ( String p1 ) [static]  :  String

jhdf.jar, Path.class
package glguerin.io
Path.append ( String p1 )  :  void
Path.appendAll ( String[ ] p1 )  :  void
Path.buildPath ( char p1, boolean p2, boolean p3 )  :  StringBuffer
Path.clear ( )  :  void
Path.ensureCapacity ( int p1 )  :  void
Path.equals ( Object p1 )  :  boolean
Path.getPart ( int p1, boolean p2 )  :  String
Path.getParts ( boolean p1 )  :  String[ ]
Path.getPath ( )  :  String
Path.hashCode ( )  :  int
Path.isAcceptablePart ( String p1 )  :  boolean
Path.last ( )  :  String
Path.part ( int p1 )  :  String
Path.partCount ( )  :  int
Path.Path ( )
Path.Path ( int p1 )
Path.Path ( String[ ] p1 )
Path.reverse ( )  :  void
Path.set ( String[ ] p1 )  :  void
Path.setFrom ( String p1, char p2 )  :  void
Path.setPath ( String p1 )  :  void
Path.split ( String p1, char p2 ) [static]  :  String[ ]
Path.swap ( String p1 )  :  String
Path.toEscapedForm ( String p1 )  :  String
Path.toLiteralForm ( String p1 )  :  String
Path.toString ( )  :  String
Path.trim ( )  :  String

jhdf5.jar, H5.class
package ncsa.hdf.hdf5lib
H5.H5Pset_deflate ( int p1, int p2 ) [static]  :  boolean

jhdfobj.jar, Attribute.class
package ncsa.hdf.object
Attribute.toString ( )  :  String

jhdfobj.jar, CompoundDS.class
package ncsa.hdf.object
CompoundDS.getMemberTypes ( )  :  int[ ]

jhdfobj.jar, Group.class
package ncsa.hdf.object
Group.setNumberOfMembersInFile ( int p1 )  :  void

jhdfobj.jar, HObject.class
package ncsa.hdf.object
HObject.hasAttribute ( )  :  boolean

jhdfobj.jar, ScalarDS.class
package ncsa.hdf.object
ScalarDS.convertFromUnsignedC ( )  :  void
ScalarDS.convertToUnsignedC ( )  :  void
ScalarDS.getNativeDataType ( )  :  int

jhdfview.jar, Chart.class
package ncsa.hdf.view
Chart.setXlabel ( String p1 )  :  void
Chart.setYlabel ( String p1 )  :  void

jhdfview.jar, HDFView.class
package ncsa.hdf.view
HDFView.HDFView ( String p1, String p2 )

jhdfview.jar, NewAttributeDialog.class
package ncsa.hdf.view
NewAttributeDialog.NewAttributeDialog ( Dialog p1, HObject p2 )

jhdfview.jar, Tools.class
package ncsa.hdf.view
Tools.getBytes ( Object p1, double[ ] p2 ) [static]  :  byte[ ]
Tools.getBytes ( Object p1, double[ ] p2, int p3, int p4, boolean p5 ) [static]  :  byte[ ]

jhdfview.jar, UserOptionsDialog.class
package ncsa.hdf.view
UserOptionsDialog.valueChanged ( ListSelectionEvent p1 )  :  void

to the top

Problems with Data Types, High Severity (75)


jargon.jar
[+] AnalyzeVolumeSliceExample (1)
[+] FactoryTest (1)
[+] MetaDataTest (1)
[+] Sls (1)
[+] Srm (1)
[+] Test (1)

package edu.sdsc.grid.gui
[+] JargonGui (1)
[+] JargonTreeCellEditor (1)
[+] JargonTreeCellRenderer (1)
[+] JargonTreeModel (1)
[+] TransferStatusPanel (1)

package edu.sdsc.grid.io
[+] BinaryDataFormat (1)
[+] FileFactory (1)
[+] GeneralAccount (1)
[+] GeneralFile (1)
[+] GeneralFileInputStream (1)
[+] GeneralFileOutputStream (1)
[+] GeneralFileSystem (1)
[+] GeneralRandomAccessFile (1)
[+] Host (1)
[+] MetaDataCondition (1)
[+] MetaDataField (1)
[+] MetaDataGroup (1)
[+] MetaDataRecordList (1)
[+] MetaDataSelect (1)
[+] MetaDataSet (1)
[+] MetaDataTable (1)
[+] MetaDataValueEnum (1)
[+] Protocol (1)
[+] RemoteAccount (1)
[+] RemoteFile (1)
[+] RemoteFileInputStream (1)
[+] RemoteFileOutputStream (1)
[+] RemoteFileSystem (1)
[+] RemoteRandomAccessFile (1)

package edu.sdsc.grid.io.local
[+] LocalAccount (1)
[+] LocalFile (1)
[+] LocalFileInputStream (1)
[+] LocalFileOutputStream (1)
[+] LocalFileSystem (1)
[+] LocalMetaDataRecordList (1)
[+] LocalRandomAccessFile (1)

package edu.sdsc.grid.io.srb
[+] SRBAccount (1)
[+] SRBContainer (1)
[+] SRBException (1)
[+] SRBFile (1)
[+] SRBFileInputStream (1)
[+] SRBFileOutputStream (1)
[+] SRBFileSystem (1)
[+] SRBMetaDataRecordList (1)
[+] SRBProtocol (1)
[+] SRBRandomAccessFile (1)

jh5srb.jar
package ncsa.hdf.srb.h5srb
[+] H5SRB (1)

package ncsa.hdf.srb.obj
[+] H5SrbCompoundDS (1)
[+] H5SrbDatatype (1)
[+] H5SrbFile (1)
[+] H5SrbGroup (1)
[+] H5SrbScalarDS (1)

jhdf.jar
package glguerin.io
[+] FilePathname (1)
[+] Path (1)

package glguerin.mac.io
[+] MacEscaping (1)
[+] MacFilePathname (1)

package glguerin.util
[+] MacPlatform (1)

package ncsa.hdf.hdflib
[+] Native (1)

jhdf5obj.jar
package ncsa.hdf.object.h5
[+] H5Group (1)

jhdfobj.jar
package ncsa.hdf.object
[+] CompoundDS (1)
[+] Datatype (2)
[+] FileFormat (4)
[+] HObject (1)
[+] ScalarDS (1)

jhdfview.jar
package ncsa.hdf.view
[+] UserOptionsDialog (1)

to the top

Problems with Methods, High Severity (12)


jhdf5obj.jar, H5File
package ncsa.hdf.object.h5
[+] H5File.copyAttributes ( HObject p1, HObject p2 )  :  void (1)
[+] H5File.copyAttributes ( int p1, int p2 )  :  void (1)
[+] H5File.createImageAttributes ( Dataset p1, int p2 ) [static]  :  void (1)

jhdfobj.jar, Datatype
package ncsa.hdf.object
[+] Datatype.close ( int p1 )  :  void (1)

jhdfobj.jar, FileFormat
package ncsa.hdf.object
[+] FileFormat.copy ( HObject p1, Group p2, String p3 )  :  TreeNode (1)
[+] FileFormat.createDatatype ( int p1, int p2, int p3, int p4, String p5 )  :  Datatype (1)
[+] FileFormat.createLink ( Group p1, String p2, HObject p3 )  :  HObject (1)
[+] FileFormat.get ( String p1 )  :  HObject (1)

jhdfobj.jar, ScalarDS
package ncsa.hdf.object
[+] ScalarDS.convertFromUnsignedC ( )  :  void (1)
[+] ScalarDS.convertToUnsignedC ( )  :  void (1)

jhdfview.jar, DefaultImageView
package ncsa.hdf.view
[+] DefaultImageView.createIndexedImage ( byte[ ] p1, byte[ ][ ] p2, int p3, int p4 ) [static]  :  Image (1)
[+] DefaultImageView.createTrueColorImage ( byte[ ] p1, boolean p2, int p3, int p4 ) [static]  :  Image (1)

to the top

Problems with Data Types, Medium Severity (1)


jhdfobj.jar
package ncsa.hdf.object
[+] FileFormat (1)

to the top

Problems with Methods, Medium Severity (16)


jhdf5obj.jar, H5File
package ncsa.hdf.object.h5
[+] H5File.copyAttributes ( HObject p1, HObject p2 )  :  void (1)
[+] H5File.copyAttributes ( int p1, int p2 )  :  void (1)

jhdfobj.jar, CompoundDS
package ncsa.hdf.object
[+] CompoundDS.getMemberOrders ( )  :  int[ ] (1)
[+] CompoundDS.getMemeberDims ( int p1 )  :  int[ ] (1)
[+] CompoundDS.getSelectedMemberOrders ( )  :  int[ ] (1)

jhdfobj.jar, FileFormat
package ncsa.hdf.object
[+] FileFormat.copy ( HObject p1, Group p2 ) [abstract]  :  TreeNode (1)
[+] FileFormat.create ( String p1 ) [abstract]  :  FileFormat (1)
[+] FileFormat.createCompoundDS ( String p1, Group p2, long[ ] p3, String[ ] p4, Datatype[ ] p5, int[ ] p6, Object p7 )  :  Dataset (1)
[+] FileFormat.getFID ( )  :  int (1)
[+] FileFormat.getFilePath ( ) [abstract]  :  String (1)
[+] FileFormat.getMaxMembers ( )  :  int (1)
[+] FileFormat.getStartMembers ( )  :  int (1)
[+] FileFormat.isReadOnly ( ) [abstract]  :  boolean (1)
[+] FileFormat.open ( String p1, int p2 ) [abstract]  :  FileFormat (1)
[+] FileFormat.setMaxMembers ( int p1 )  :  void (1)
[+] FileFormat.setStartMembers ( int p1 )  :  void (1)

to the top

Problems with Data Types, Low Severity (38)


jhdf.jar
package ncsa.hdf.hdflib
[+] HDFLibrary (1)

jhdf4obj.jar
package ncsa.hdf.object.h4
[+] H4Datatype (1)
[+] H4File (9)
[+] H4GRImage (2)
[+] H4Vdata (1)

jhdf5.jar
package ncsa.hdf.hdf5lib
[+] H5 (1)

jhdf5obj.jar
package ncsa.hdf.object.h5
[+] H5CompoundDS (1)
[+] H5File (6)
[+] H5Group (1)

jhdfobj.jar
package ncsa.hdf.object
[+] Attribute (1)
[+] CompoundDS (1)
[+] Dataset (2)
[+] FileFormat (8)
[+] Group (1)
[+] HObject (1)

jhdfview.jar
package ncsa.hdf.view
[+] ViewProperties (1)

to the top

Problems with Methods, Low Severity (12)


jh5srb.jar, SRBFileDialog
package ncsa.hdf.srb
[+] SRBFileDialog.SRBFileDialog ( Frame p1 ) (1)

jhdf5.jar, H5
package ncsa.hdf.hdf5lib
[+] H5.H5Fget_filesize ( int p1 ) [static]  :  long (1)
[+] H5.H5Fget_name ( int p1, String p2, int p3 ) [static]  :  long (1)
[+] H5.H5Iget_file_id ( int p1 ) [static]  :  int (1)
[+] H5.H5Premove_filter ( int p1, int p2 ) [static]  :  int (1)
[+] H5.H5Zget_filter_info ( int p1 ) [static]  :  int (1)

jhdf5obj.jar, H5File
package ncsa.hdf.object.h5
[+] H5File.createImageAttributes ( Dataset p1, int p2 ) [static]  :  void (1)

jhdfobj.jar, FileFormat
package ncsa.hdf.object
[+] FileFormat.copy ( HObject p1, Group p2 ) [abstract]  :  TreeNode (1)
[+] FileFormat.create ( String p1 ) [abstract]  :  FileFormat (1)
[+] FileFormat.getFilePath ( ) [abstract]  :  String (1)
[+] FileFormat.isReadOnly ( ) [abstract]  :  boolean (1)
[+] FileFormat.open ( String p1, int p2 ) [abstract]  :  FileFormat (1)

to the top

Other Changes in Data Types (68)


jh5srb.jar
package ncsa.hdf.srb
[+] SRBFileDialog (1)

jhdf4obj.jar
package ncsa.hdf.object.h4
[+] H4Datatype (1)
[+] H4File (1)
[+] H4GRImage (1)
[+] H4Group (1)
[+] H4SDS (1)
[+] H4Vdata (1)

jhdf5.jar
package ncsa.hdf.hdf5lib
[+] HDF5Constants (2)

jhdf5obj.jar
package ncsa.hdf.object.h5
[+] H5CompoundDS (1)
[+] H5Datatype (1)
[+] H5File (1)
[+] H5Group (1)
[+] H5ScalarDS (1)

jhdfobj.jar
package ncsa.hdf.object
[+] Attribute (1)
[+] CompoundDS (1)
[+] DataFormat (1)
[+] Dataset (5)
[+] Datatype (3)
[+] FileFormat (4)
[+] HObject (1)
[+] ScalarDS (2)

jhdfview.jar
package ncsa.hdf.view
[+] Chart (1)
[+] DataOptionDialog (1)
[+] DataView (4)
[+] DefaultImageView (1)
[+] DefaultMetaDataView (1)
[+] DefaultPaletteView (1)
[+] DefaultTableView (1)
[+] DefaultTextView (1)
[+] DefaultTreeView (1)
[+] FileConversionDialog (1)
[+] HDFView (1)
[+] MathConversionDialog (1)
[+] NewAttributeDialog (2)
[+] NewDatasetDialog (1)
[+] NewDatatypeDialog (1)
[+] NewFileDialog (1)
[+] NewGroupDialog (1)
[+] NewImageDialog (1)
[+] NewLinkDialog (1)
[+] NewTableDataDialog (1)
[+] Tools (10)
[+] UserOptionsDialog (1)
[+] ViewProperties (1)

to the top

Java ARchives (8)


jargon.jar
jh5srb.jar
jhdf.jar
jhdf4obj.jar
jhdf5.jar
jhdf5obj.jar
jhdfobj.jar
jhdfview.jar

to the top